Heatmap: Cluster_306 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00123	0.72	0.48	0.44	0.66	0.97	0.67	0.53	0.62	0.41	0.37	0.65	0.32	0.51	0.43	0.68	0.37	0.28	0.9	1.0	0.85
Gb_00228	0.73	0.49	0.5	0.75	0.82	0.26	0.23	0.55	0.35	0.33	0.36	0.34	0.32	0.28	0.36	0.5	0.39	1.0	0.91	0.52
Gb_02598	0.69	0.24	0.39	0.79	0.73	0.27	0.26	0.56	0.46	0.39	0.71	0.28	0.25	0.25	0.69	0.88	1.0	0.68	0.56	0.43
Gb_02688	0.69	0.48	0.56	0.66	1.0	0.39	0.33	0.47	0.3	0.31	0.57	0.37	0.22	0.21	0.59	0.28	0.41	0.81	0.6	0.76
Gb_02746	0.77	0.45	0.44	0.79	0.68	0.59	0.41	0.67	0.36	0.29	0.49	0.38	0.33	0.32	0.45	0.64	0.59	0.91	1.0	0.4
Gb_03511	0.7	0.48	0.53	0.8	0.78	0.42	0.48	0.55	0.31	0.34	0.68	0.31	0.23	0.25	0.73	0.42	0.41	1.0	0.9	0.28
Gb_05817	0.39	0.34	0.27	0.63	0.67	0.19	0.26	0.51	0.54	0.5	0.67	0.31	0.16	0.15	0.82	0.39	0.36	1.0	0.94	0.51
Gb_06048	0.62	0.44	0.42	0.7	0.99	0.36	0.35	0.58	0.41	0.43	0.71	0.44	0.52	0.52	0.66	0.42	0.41	0.7	1.0	0.55
Gb_06414	0.76	0.8	0.77	0.55	1.0	0.55	0.29	0.54	0.28	0.29	0.59	0.42	0.47	0.29	0.57	0.33	0.45	0.86	0.92	0.77
Gb_06494	0.92	0.45	0.57	0.89	0.97	0.6	0.38	0.67	0.47	0.46	0.65	0.43	0.26	0.34	0.56	0.76	0.84	0.75	1.0	0.5
Gb_08319	0.49	0.41	0.37	0.51	0.6	0.4	0.29	0.46	0.32	0.36	1.0	0.35	0.29	0.21	0.84	0.44	0.38	0.61	0.78	0.65
Gb_08438	0.08	0.27	0.09	0.08	0.26	0.05	0.0	0.3	0.41	0.36	0.42	0.14	0.14	0.12	0.52	0.06	0.04	0.63	1.0	0.27
Gb_08521	0.59	0.47	0.44	0.53	0.79	0.28	0.32	0.48	0.44	0.43	0.77	0.37	0.34	0.4	0.91	0.59	0.45	1.0	0.91	0.52
Gb_08966	1.0	0.81	0.75	0.73	0.95	0.22	0.41	0.54	0.54	0.52	0.74	0.42	0.39	0.35	0.72	0.38	0.37	0.74	0.89	0.76
Gb_09093	0.75	0.56	0.59	0.56	0.79	0.62	0.53	0.64	0.54	0.5	0.71	0.38	0.53	0.44	0.7	0.52	0.51	1.0	0.86	0.76
Gb_10651	0.54	0.73	0.48	0.48	0.6	0.18	0.12	0.34	0.31	0.35	0.39	0.21	0.17	0.16	0.43	0.43	0.22	0.57	1.0	0.38
Gb_10652	0.32	0.12	0.04	0.64	0.48	0.28	0.11	0.19	0.28	0.37	0.46	0.39	0.06	0.07	0.68	0.33	0.31	0.56	1.0	0.37
Gb_10654	0.66	0.64	0.33	0.51	0.72	0.27	0.17	0.35	0.34	0.39	0.53	0.35	0.14	0.17	0.46	0.53	0.27	0.54	1.0	0.57
Gb_10655	0.89	0.64	0.4	0.59	1.0	0.13	0.31	0.47	0.5	0.59	0.64	0.37	0.29	0.35	0.71	0.93	0.46	0.79	0.94	0.7
Gb_10656	0.89	0.64	0.41	0.65	0.97	0.23	0.32	0.48	0.54	0.56	0.73	0.4	0.27	0.31	0.91	0.97	0.44	0.95	0.78	1.0
Gb_11123	0.52	0.84	0.57	0.72	1.0	0.35	0.31	0.54	0.65	0.55	0.71	0.37	0.23	0.29	0.69	0.81	0.42	0.81	0.77	0.63
Gb_11352	0.71	0.46	0.53	0.42	0.7	0.52	0.54	0.61	0.53	0.49	1.0	0.41	0.19	0.18	1.0	0.68	0.8	0.99	0.79	0.87
Gb_12284	0.77	0.73	0.64	0.75	1.0	0.46	0.42	0.59	0.37	0.4	0.59	0.46	0.6	0.51	0.66	0.29	0.33	0.85	0.87	0.64
Gb_12910	0.62	0.27	0.34	0.52	0.52	0.24	0.32	0.34	0.35	0.31	0.79	0.22	0.14	0.13	0.83	0.46	0.42	0.69	0.6	1.0
Gb_13135	1.0	0.5	0.71	0.73	0.92	0.38	0.5	0.49	0.47	0.38	0.7	0.36	0.13	0.13	0.64	0.66	0.38	0.62	0.66	0.77
Gb_15046	0.65	0.47	0.6	0.77	1.0	0.57	0.24	0.55	0.36	0.37	0.67	0.34	0.3	0.25	0.65	0.23	0.32	0.95	0.88	0.51
Gb_15165	1.0	0.68	0.66	0.66	0.81	0.27	0.57	0.48	0.45	0.44	0.75	0.33	0.37	0.31	0.69	0.52	0.39	0.76	0.92	0.79
Gb_16705	1.0	0.76	0.87	0.67	0.99	0.33	0.51	0.6	0.5	0.54	0.79	0.38	0.49	0.42	0.76	0.57	0.52	0.93	0.84	0.63
Gb_17113	1.0	0.47	0.7	0.86	0.64	0.22	0.31	0.44	0.45	0.39	0.48	0.22	0.46	0.39	0.54	0.53	0.26	0.8	0.78	0.84
Gb_17287	0.8	0.52	0.42	0.62	1.0	0.42	0.52	0.46	0.31	0.27	0.43	0.33	0.33	0.3	0.42	0.35	0.27	0.81	0.7	0.46
Gb_17702	0.8	0.41	0.61	0.71	1.0	0.59	0.4	0.68	0.44	0.48	0.73	0.46	0.55	0.49	0.76	0.4	0.54	0.87	0.82	0.52
Gb_17781	0.17	0.04	0.2	0.06	0.13	0.1	0.57	0.29	0.17	0.36	0.73	0.14	0.36	0.15	0.65	0.07	0.06	0.55	1.0	0.73
Gb_18175	1.0	0.65	0.65	0.8	0.84	0.48	0.44	0.56	0.44	0.5	0.76	0.39	0.28	0.29	0.77	0.63	0.44	0.81	0.87	0.43
Gb_18277	0.0	0.0	0.02	0.0	0.07	0.13	0.04	0.11	0.09	0.03	0.04	0.01	0.13	0.2	0.04	0.1	0.0	0.19	1.0	0.13
Gb_19278	0.34	0.2	0.23	0.41	0.67	0.4	0.2	0.39	0.39	0.32	0.91	0.38	0.29	0.29	1.0	0.29	0.52	0.72	0.88	0.44
Gb_20084	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.06	0.07	0.06	0.04	0.28	0.0	0.17	0.12	0.47	0.06	0.02	0.13	1.0	0.86
Gb_20093	0.54	0.47	0.4	0.71	0.9	0.71	0.58	0.51	0.29	0.32	0.62	0.34	0.33	0.3	0.64	0.34	0.43	0.86	1.0	0.77
Gb_22022	0.71	0.69	0.45	0.62	1.0	0.28	0.32	0.4	0.39	0.3	0.39	0.23	0.37	0.33	0.38	0.46	0.32	0.58	0.67	0.37
Gb_23342	0.63	0.48	0.42	0.79	1.0	0.19	0.28	0.39	0.23	0.2	0.33	0.3	0.2	0.18	0.31	0.25	0.28	0.63	0.8	0.47
Gb_24020	1.0	0.57	0.57	0.84	0.93	0.43	0.45	0.6	0.41	0.38	0.54	0.4	0.6	0.48	0.52	0.3	0.32	0.86	0.99	0.41
Gb_24470	0.88	0.27	0.52	0.81	1.0	0.77	0.39	0.58	0.42	0.37	0.72	0.3	0.36	0.35	0.67	0.46	0.67	0.68	0.84	0.78
Gb_26401	0.88	0.47	0.42	1.0	0.96	0.76	0.28	0.73	0.58	0.51	0.78	0.47	0.3	0.24	0.7	0.9	0.77	0.91	0.82	0.58
Gb_27431	0.7	0.61	0.48	0.59	0.82	0.46	0.48	0.55	0.61	0.52	0.97	0.43	0.47	0.39	1.0	0.68	0.46	0.68	0.83	0.65
Gb_27539	0.87	0.34	0.49	0.95	0.89	0.43	0.55	0.64	0.48	0.49	0.93	0.36	0.39	0.37	0.97	0.62	0.8	0.81	1.0	0.36
Gb_27793	0.74	0.59	0.52	0.53	0.71	0.22	0.4	0.46	0.48	0.49	0.93	0.45	0.18	0.22	0.95	0.73	0.77	0.8	0.92	1.0
Gb_28476	0.43	0.77	0.6	0.34	0.81	0.48	0.23	0.44	0.39	0.45	0.73	0.39	0.29	0.36	0.68	0.74	0.39	0.8	1.0	0.76
Gb_28911	0.63	0.64	0.92	0.36	0.61	0.39	0.49	0.45	0.44	0.43	1.0	0.22	0.37	0.31	0.94	0.52	0.36	0.82	0.64	0.74
Gb_30719	1.0	0.61	0.67	0.81	0.92	0.32	0.37	0.57	0.5	0.44	0.78	0.39	0.36	0.3	0.79	0.51	0.42	0.62	0.85	0.48
Gb_31292	0.77	0.9	0.66	0.67	0.99	0.36	0.34	0.62	0.42	0.4	0.77	0.4	0.55	0.5	0.7	0.44	0.38	0.99	1.0	0.64
Gb_33879	0.49	0.31	0.42	0.57	0.75	0.43	0.62	0.51	0.32	0.43	0.45	0.37	0.21	0.15	0.51	0.27	0.31	1.0	0.85	0.6
Gb_34212	0.78	0.63	0.53	0.63	0.4	0.55	0.14	0.39	0.35	0.42	0.98	0.36	0.34	0.33	1.0	0.4	0.25	0.48	0.6	0.54
Gb_34568	0.78	0.79	0.63	0.73	1.0	0.37	0.26	0.56	0.54	0.52	0.95	0.43	0.3	0.25	0.84	0.5	0.4	0.58	0.85	0.82
Gb_35036	0.65	0.6	0.63	0.5	0.75	0.29	0.34	0.45	0.42	0.43	1.0	0.31	0.22	0.22	1.0	0.33	0.32	0.76	0.65	0.72
Gb_36371	0.34	0.2	0.22	0.3	0.54	0.14	0.21	0.35	0.32	0.35	1.0	0.16	0.14	0.15	0.91	0.45	0.4	0.49	0.65	0.29
Gb_36414	0.5	0.46	0.41	0.55	0.91	0.36	0.34	0.48	0.34	0.29	0.51	0.42	0.19	0.23	0.5	0.32	0.41	0.76	1.0	0.41
Gb_37366	0.37	0.0	0.06	0.42	0.33	0.0	0.31	0.07	0.0	0.07	0.68	0.0	0.0	0.05	0.23	0.0	0.07	0.29	1.0	0.87
Gb_38892	0.86	0.64	0.72	0.9	0.97	0.74	0.4	0.79	0.76	0.65	0.94	0.66	0.48	0.59	1.0	0.8	0.68	0.91	0.9	0.61
Gb_40103	0.9	0.52	0.71	0.52	1.0	0.38	0.42	0.56	0.5	0.47	0.62	0.35	0.53	0.5	0.61	0.48	0.48	0.98	0.86	0.7
Gb_40104	0.83	0.82	0.75	0.79	0.87	0.39	0.33	0.53	0.43	0.4	0.46	0.3	0.44	0.36	0.45	0.38	0.38	0.87	1.0	0.52
Gb_40358	0.97	0.63	0.53	0.91	1.0	0.82	0.36	0.68	0.47	0.38	0.79	0.33	0.69	0.48	0.77	0.35	0.33	0.88	0.72	0.51
Gb_41334	0.97	0.49	0.61	0.74	1.0	0.45	0.37	0.5	0.47	0.41	0.5	0.33	0.4	0.33	0.47	0.46	0.41	0.73	0.96	0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)