Heatmap: Cluster_328 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01760	0.99	0.62	0.68	0.82	0.89	0.23	0.57	0.51	0.67	0.64	0.88	0.32	0.54	0.39	0.92	0.55	0.35	0.77	1.0	0.84
Gb_04072	0.71	0.68	0.57	0.62	0.65	0.38	0.53	0.53	0.44	0.48	1.0	0.37	0.43	0.32	0.94	0.46	0.43	0.54	0.91	0.44
Gb_06450	0.12	0.12	0.09	0.08	0.22	0.31	0.35	0.14	0.06	0.09	0.2	0.09	0.11	0.18	0.17	0.02	0.07	0.32	1.0	0.49
Gb_07176	1.0	0.92	0.67	0.98	0.83	0.41	0.59	0.41	0.28	0.3	0.5	0.3	0.41	0.34	0.5	0.28	0.23	0.62	0.97	0.47
Gb_07238	0.29	0.28	0.17	0.28	0.52	0.17	0.09	0.38	0.4	0.41	0.42	0.29	0.38	0.43	0.4	0.39	0.4	0.59	1.0	0.6
Gb_07577	0.65	0.56	0.46	0.48	0.44	0.37	0.52	0.4	0.52	0.39	0.35	0.17	0.34	0.34	0.34	0.33	0.22	0.39	1.0	0.31
Gb_08109	0.79	1.0	0.7	0.74	0.61	0.29	0.45	0.48	0.56	0.51	0.55	0.31	0.67	0.49	0.61	0.45	0.34	0.41	0.64	0.56
Gb_08350	0.95	0.69	0.73	0.77	0.73	0.3	0.58	0.6	0.92	0.85	0.78	0.5	0.74	0.61	0.84	0.49	0.39	0.96	1.0	0.99
Gb_09588	0.73	1.0	0.55	0.4	0.81	0.39	0.63	0.37	0.4	0.48	0.65	0.21	0.51	0.45	0.75	0.35	0.27	0.52	0.9	0.38
Gb_09852	0.53	0.43	0.27	0.4	0.64	0.31	0.37	0.38	0.42	0.38	0.53	0.3	0.36	0.35	0.57	0.24	0.19	0.35	1.0	0.52
Gb_10677	0.89	0.93	0.62	0.99	0.86	0.51	0.7	0.61	0.48	0.43	0.84	0.36	0.54	0.42	0.79	0.6	0.42	0.69	1.0	0.54
Gb_10919	0.63	0.34	0.32	0.54	0.57	0.17	0.19	0.38	0.35	0.36	0.72	0.34	0.3	0.25	0.75	0.47	0.35	0.66	1.0	0.42
Gb_10940	0.47	0.13	0.19	0.64	0.77	0.2	0.49	0.38	0.44	0.19	0.78	0.42	0.51	0.45	0.92	0.7	0.18	0.67	1.0	0.52
Gb_12058	0.76	0.76	0.58	0.7	0.72	0.25	0.56	0.48	0.57	0.61	1.0	0.29	0.53	0.43	0.97	0.51	0.36	0.51	0.89	0.47
Gb_12292	0.79	0.64	0.46	0.7	1.0	0.67	0.46	0.66	0.49	0.5	0.69	0.46	0.68	0.55	0.73	0.4	0.37	0.79	1.0	0.68
Gb_12467	0.18	0.03	0.04	0.22	0.2	0.15	0.36	0.21	0.25	0.23	0.27	0.15	0.11	0.12	0.32	0.38	0.54	0.54	1.0	0.92
Gb_13512	0.44	0.26	0.36	0.41	0.68	0.54	0.37	0.54	0.38	0.42	0.88	0.43	0.56	0.51	0.83	0.51	0.61	0.67	1.0	0.72
Gb_13742	0.34	0.13	0.23	0.41	0.41	0.09	1.0	0.33	0.45	0.37	0.78	0.3	0.91	0.94	0.79	0.71	0.53	0.31	0.24	0.5
Gb_13876	0.37	0.46	0.17	0.11	0.3	0.16	0.35	0.22	0.19	0.2	0.22	0.09	0.25	0.11	0.26	0.14	0.1	0.18	1.0	0.24
Gb_14217	0.71	1.0	0.61	0.61	0.56	0.22	0.61	0.43	0.49	0.42	0.43	0.25	0.46	0.37	0.42	0.57	0.32	0.4	0.49	0.57
Gb_14287	0.69	0.67	0.41	0.59	0.71	0.4	0.53	0.57	0.59	0.5	0.85	0.38	0.69	0.52	0.84	0.56	0.34	0.69	1.0	0.72
Gb_14336	0.73	1.0	0.81	0.81	0.71	0.32	0.52	0.62	0.63	0.53	0.85	0.44	0.63	0.73	0.84	0.71	0.52	0.5	0.65	0.44
Gb_15954	0.87	0.22	0.37	0.83	0.65	0.32	0.37	0.44	0.48	0.47	0.46	0.28	0.31	0.34	0.49	0.84	0.57	0.63	1.0	0.65
Gb_16096	0.97	0.37	0.51	0.53	0.74	0.06	0.43	0.37	0.57	0.46	0.9	0.41	0.27	0.19	0.84	0.37	0.26	0.37	1.0	0.52
Gb_16543	0.46	0.88	0.37	0.24	0.38	0.28	0.47	0.24	0.24	0.19	0.26	0.2	0.12	0.09	0.27	0.2	0.28	0.36	1.0	0.55
Gb_17619	0.64	1.0	0.39	0.34	0.54	0.16	0.36	0.35	0.43	0.32	0.52	0.23	0.65	0.41	0.57	0.59	0.26	0.47	0.49	0.64
Gb_19400	0.7	0.69	0.64	0.69	0.6	0.35	0.47	0.47	0.38	0.36	0.82	0.35	0.32	0.27	0.79	0.63	0.56	0.61	1.0	0.63
Gb_20476	0.43	0.56	0.4	0.48	0.6	0.41	0.52	0.45	0.46	0.44	0.52	0.35	0.51	0.49	0.6	0.4	0.41	0.61	1.0	0.71
Gb_21525	0.86	0.54	0.68	0.62	0.7	0.58	0.64	0.62	0.52	0.5	1.0	0.47	0.28	0.27	0.95	0.53	0.54	0.7	0.77	0.68
Gb_21771	0.06	0.11	0.04	0.18	0.15	0.22	0.14	0.18	0.18	0.15	0.27	0.16	0.16	0.13	0.22	0.17	0.23	0.33	1.0	0.2
Gb_21772	0.08	0.22	0.1	0.15	0.21	0.37	0.16	0.29	0.21	0.19	0.3	0.25	0.13	0.12	0.3	0.18	0.21	0.48	1.0	0.42
Gb_21773	0.19	0.21	0.13	0.23	0.4	0.41	0.27	0.41	0.3	0.31	0.42	0.32	0.32	0.28	0.5	0.31	0.36	0.8	1.0	0.64
Gb_21774	0.14	0.24	0.1	0.22	0.34	0.39	0.26	0.45	0.32	0.33	0.62	0.29	0.42	0.46	0.54	0.33	0.34	0.76	1.0	0.65
Gb_23809	0.09	1.0	0.28	0.17	0.28	0.04	0.47	0.17	0.15	0.14	0.13	0.14	0.17	0.12	0.2	0.13	0.03	0.15	0.52	0.25
Gb_23812	0.02	0.02	0.03	0.07	0.09	0.1	0.05	0.19	0.08	0.1	0.25	0.17	0.06	0.06	0.22	0.13	0.15	0.37	1.0	0.17
Gb_23980	0.41	0.58	0.36	0.33	0.71	0.27	0.36	0.3	0.25	0.24	0.37	0.26	0.21	0.19	0.42	0.36	0.32	0.61	1.0	0.49
Gb_24640	0.7	0.51	0.48	0.73	0.74	0.65	0.62	0.63	0.56	0.51	0.87	0.49	0.76	0.66	0.86	0.54	0.55	0.79	1.0	0.89
Gb_26927	0.61	0.55	0.35	0.65	0.64	0.9	0.78	0.64	0.52	0.5	1.0	0.38	0.54	0.42	1.0	0.45	0.39	0.58	0.94	0.68
Gb_27763	0.81	1.0	0.64	0.78	0.93	0.6	0.65	0.65	0.58	0.56	0.86	0.52	0.51	0.39	0.96	0.67	0.65	0.92	0.85	0.72
Gb_29397	0.61	0.81	0.66	0.5	0.69	0.44	0.69	0.52	0.73	0.68	0.76	0.42	0.59	0.54	0.82	0.55	0.55	0.65	1.0	0.95
Gb_29976	0.87	1.0	0.8	0.83	0.72	0.55	0.59	0.57	0.49	0.43	0.69	0.42	0.28	0.23	0.66	0.61	0.44	0.64	0.85	0.54
Gb_30424	0.71	0.62	0.6	0.68	0.8	0.41	0.51	0.64	0.69	0.63	0.97	0.5	0.46	0.5	1.0	0.62	0.51	0.63	0.88	0.68
Gb_30813	0.58	0.45	0.27	0.25	0.5	0.3	1.0	0.36	0.29	0.24	0.56	0.29	0.45	0.6	0.68	0.52	0.27	0.4	0.51	0.46
Gb_31926	0.52	0.37	0.22	0.37	0.59	0.22	0.64	0.36	0.35	0.37	0.75	0.27	0.29	0.29	0.77	0.5	0.32	0.44	1.0	0.45
Gb_32190	0.28	0.64	0.25	0.21	0.33	0.34	0.33	0.19	0.15	0.13	0.18	0.18	0.09	0.07	0.2	0.15	0.16	0.26	1.0	0.23
Gb_32844	0.58	1.0	0.53	0.62	0.44	0.44	0.66	0.47	0.55	0.54	0.83	0.35	0.57	0.54	0.76	0.42	0.33	0.31	0.58	0.61
Gb_33270	0.19	0.3	0.3	0.13	0.19	0.22	0.7	0.1	0.12	0.06	0.27	0.02	0.11	0.11	0.28	0.1	0.0	0.18	1.0	0.32
Gb_34264	0.43	0.6	0.32	0.35	0.49	0.2	0.64	0.39	0.56	0.48	0.9	0.29	0.36	0.31	0.85	0.88	0.49	0.46	1.0	0.5
Gb_34648	0.21	0.25	0.16	0.27	0.46	0.19	0.46	0.25	0.22	0.24	0.24	0.18	0.28	0.28	0.25	0.18	0.18	0.52	1.0	0.51
Gb_34733	0.44	0.28	0.24	0.24	0.38	0.1	0.24	0.32	0.26	0.28	0.76	0.16	0.34	0.25	0.71	0.24	0.23	0.51	1.0	0.14
Gb_35463	0.64	1.0	0.49	0.65	0.65	0.25	0.48	0.58	0.67	0.57	0.87	0.35	0.55	0.43	0.77	0.58	0.53	0.51	0.9	0.75
Gb_36160	0.24	0.24	0.27	0.28	0.21	0.35	0.43	0.35	0.27	0.25	1.0	0.23	0.59	0.38	0.57	0.41	0.3	0.29	0.46	0.24
Gb_37317	0.26	0.89	0.57	0.29	0.5	0.12	0.6	0.21	0.32	0.31	0.16	0.18	0.04	0.04	0.2	0.3	0.41	0.26	1.0	0.37
Gb_37944	0.69	0.52	0.45	0.47	0.65	0.76	0.74	0.61	0.66	0.61	1.0	0.39	0.49	0.45	0.94	0.64	0.59	0.64	0.81	0.79
Gb_38077	0.37	0.72	0.34	0.37	0.63	0.61	0.3	0.25	0.26	0.23	0.36	0.17	0.29	0.22	0.37	0.19	0.16	0.55	0.94	1.0
Gb_38162	0.38	0.48	0.4	0.28	0.33	0.18	0.55	0.43	0.48	0.34	0.82	0.25	0.55	0.32	1.0	0.63	0.19	0.35	0.43	0.49
Gb_39050	0.34	0.56	0.19	0.24	0.47	0.21	0.3	0.27	0.31	0.31	0.35	0.14	0.4	0.29	0.36	0.26	0.14	0.38	1.0	0.3
Gb_39446	0.57	0.53	0.29	0.5	0.82	0.29	0.72	0.45	0.57	0.49	0.85	0.29	0.42	0.41	0.86	0.5	0.41	0.76	1.0	0.85
Gb_39468	0.5	0.47	0.28	0.45	0.52	0.5	0.46	0.38	0.38	0.42	1.0	0.29	0.26	0.29	0.99	0.4	0.37	0.52	0.97	0.62
Gb_39769	0.59	0.33	0.42	0.64	0.69	0.25	0.39	0.5	0.59	0.48	0.62	0.36	0.43	0.4	0.58	0.79	0.64	0.62	1.0	0.42
Gb_40952	0.36	0.31	0.23	0.39	0.26	0.25	0.17	0.36	0.38	0.31	0.46	0.2	0.33	0.27	0.45	0.37	0.25	0.27	1.0	0.45
Gb_41056	0.48	0.44	0.36	0.34	0.41	0.38	0.51	0.44	0.59	0.52	0.65	0.32	0.47	0.41	0.7	0.53	0.37	0.5	0.83	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)