Heatmap: Cluster_208 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00021	0.09	0.05	0.0	0.0	0.04	0.04	0.01	0.15	0.05	0.06	0.25	0.05	1.0	0.32	0.06	0.02	0.01	0.01	0.0	0.02
Gb_01017	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.35	0.0	0.01	0.01	0.02	0.36	0.6	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_04545	0.2	0.2	0.48	0.06	0.08	0.26	0.91	1.0	0.06	0.07	0.16	0.18	0.64	0.76	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77
Gb_04998	0.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.03	0.62	0.29	0.24	0.25	0.66	0.44	1.0	0.74	0.35	0.0	0.01	0.0	0.0	0.11
Gb_05452	0.09	0.68	0.24	0.0	0.0	0.15	0.36	0.58	0.11	0.27	1.0	0.85	0.0	0.09	0.21	0.0	0.07	0.05	0.06	0.0
Gb_06771	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.01	0.38	0.0	0.0	0.01	0.02	0.35	0.64	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_06817	0.21	0.18	0.02	0.0	0.11	0.46	0.01	1.0	0.01	0.01	0.18	0.44	0.37	0.36	0.08	0.0	0.0	0.01	0.0	0.4
Gb_07441	0.28	0.17	0.47	0.22	0.16	0.41	0.0	0.4	0.06	0.09	0.17	0.4	0.27	0.28	0.09	0.05	0.07	0.62	0.02	1.0
Gb_08828	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.26	0.07	0.08	0.1	0.02	0.21	0.14	0.05	0.01	0.02	0.02	0.0	1.0
Gb_08868	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.09	0.02	0.02	0.19	0.02	1.0	0.3	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10892	1.0	0.04	0.18	0.0	0.02	0.02	0.17	0.56	0.08	0.08	0.29	0.31	0.96	0.42	0.19	0.0	0.0	0.05	0.09	0.79
Gb_11757	0.15	0.11	0.14	0.03	0.0	0.21	0.15	0.77	0.07	0.08	0.09	0.12	0.91	1.0	0.03	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01
Gb_12131	0.11	0.3	0.0	0.0	0.0	0.07	0.59	0.92	0.06	0.1	0.11	0.27	0.96	0.73	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_12510	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_12904	0.0	0.01	0.07	0.01	0.01	0.08	0.0	0.18	0.19	0.25	0.32	0.02	1.0	0.27	0.18	0.0	0.0	0.0	0.04	0.06
Gb_13226	0.0	0.01	0.01	0.04	0.0	0.0	0.08	0.16	0.05	0.04	0.17	0.06	1.0	0.64	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02
Gb_13899	0.12	0.14	0.1	0.03	0.06	1.0	0.02	0.46	0.21	0.25	0.41	0.21	0.48	0.45	0.31	0.11	0.15	0.14	0.04	0.15
Gb_14500	0.17	0.06	0.13	0.15	0.06	0.12	0.09	0.31	0.14	0.11	0.33	0.14	0.26	0.17	0.42	0.32	0.39	0.21	0.01	1.0
Gb_15442	0.1	0.07	0.1	0.0	0.02	0.05	0.02	0.56	0.07	0.08	0.14	0.07	1.0	0.42	0.08	0.0	0.01	0.01	0.0	0.23
Gb_16261	0.05	0.15	0.36	0.12	0.08	0.06	0.07	0.71	0.1	0.08	0.53	0.67	0.7	0.39	0.34	0.0	0.05	0.01	0.0	1.0
Gb_16676	0.36	0.22	0.51	0.24	0.09	0.19	0.15	1.0	0.12	0.17	0.35	0.2	0.96	0.71	0.19	0.0	0.01	0.01	0.01	0.15
Gb_16677	0.4	0.45	0.85	0.26	0.09	0.35	0.16	1.0	0.11	0.16	0.34	0.2	0.7	0.42	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17
Gb_17866	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18661	0.01	0.05	0.0	0.07	0.03	0.05	0.38	0.27	0.13	0.12	0.18	0.25	0.96	1.0	0.04	0.02	0.14	0.02	0.02	0.01
Gb_19052	0.17	0.32	0.03	0.15	0.1	0.04	0.36	0.17	0.06	0.04	0.08	0.05	0.24	0.2	0.1	0.0	0.02	0.04	0.04	1.0
Gb_19313	0.26	0.75	0.94	0.08	0.04	0.35	0.69	1.0	0.03	0.07	0.08	0.23	0.4	0.4	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.85
Gb_19660	0.22	0.81	0.01	0.0	0.03	0.15	0.72	1.0	0.04	0.04	0.29	0.34	0.57	0.49	0.11	0.0	0.01	0.0	0.0	0.34
Gb_19750	0.07	0.03	0.0	0.01	0.03	0.2	0.0	0.34	0.13	0.25	0.15	0.25	0.66	1.0	0.08	0.02	0.25	0.01	0.0	0.01
Gb_19877	0.01	0.0	0.0	0.06	0.07	0.07	0.1	0.33	0.3	0.27	0.23	0.26	0.37	0.37	0.21	0.13	0.12	0.12	0.0	1.0
Gb_19947	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.4	0.01	0.0	0.15	0.29	0.69	1.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.06	0.47
Gb_21110	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.13	0.02	0.02	0.12	0.05	1.0	0.75	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21735	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.18	0.14	0.2	0.31	1.0	0.26	0.11	0.04	0.11	0.01	0.0	0.0
Gb_23118	0.1	0.16	0.0	0.0	0.13	0.25	0.0	0.39	0.29	0.44	0.83	0.81	0.64	0.77	0.62	0.04	0.05	0.0	0.01	1.0
Gb_23954	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.07	0.28	0.08	0.0	0.32	0.0	0.71	0.16	0.19	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0
Gb_24262	0.12	0.17	0.13	0.09	0.01	0.0	0.21	0.84	0.76	0.52	0.0	1.0	0.02	0.04	0.0	0.02	0.66	0.02	0.07	0.0
Gb_24530	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.29	0.13	0.17	0.34	0.02	1.0	0.36	0.38	0.0	0.2	0.07	0.02	0.37
Gb_25091	0.14	0.36	0.27	0.07	0.01	0.19	0.49	1.0	0.05	0.05	0.12	0.2	0.51	0.52	0.06	0.01	0.02	0.0	0.01	0.5
Gb_25988	0.07	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.23	0.23	0.16	0.0	0.04	1.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25990	0.1	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.01	0.12	0.05	0.04	0.18	0.05	1.0	0.34	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05
Gb_26994	0.09	0.34	0.2	0.0	0.02	0.59	0.37	0.23	0.12	0.33	0.43	0.28	0.9	0.76	0.09	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0
Gb_27514	0.0	0.09	0.08	0.0	0.04	1.0	0.05	0.29	0.04	0.02	0.07	0.06	0.44	0.39	0.07	0.0	0.0	0.0	0.01	0.13
Gb_27541	0.56	0.28	0.46	0.21	0.11	0.26	0.08	1.0	0.15	0.18	0.29	0.52	0.71	0.58	0.14	0.02	0.14	0.11	0.04	0.08
Gb_28521	0.16	0.14	0.15	0.2	0.27	0.28	0.47	0.69	0.13	0.16	0.29	0.5	0.88	0.68	0.27	0.03	0.08	0.21	0.27	1.0
Gb_28522	0.19	0.35	0.33	0.28	0.28	0.39	0.58	0.88	0.17	0.21	0.38	0.72	0.74	0.58	0.33	0.02	0.1	0.25	0.52	1.0
Gb_28651	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.1	0.11	0.02	0.0	1.0	0.2	0.02	0.02	0.03	0.0	0.0	0.02
Gb_28661	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.1	0.11	0.23	0.23	0.31	0.09	0.0	1.0	0.22	0.03	0.01	0.03	0.0	0.0	0.29
Gb_28694	0.17	0.06	0.08	0.01	0.02	0.0	0.07	0.18	0.1	0.08	1.0	0.09	0.53	0.31	0.85	0.01	0.0	0.0	0.0	0.75
Gb_29691	0.04	0.0	0.02	0.0	0.0	0.13	0.07	0.17	0.07	0.02	0.06	0.01	1.0	0.69	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.19
Gb_29702	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	1.0	0.46	0.0	0.31	0.26	0.15	0.58	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87
Gb_30107	0.07	0.34	0.72	0.25	0.12	0.66	0.1	1.0	0.08	0.09	0.11	0.2	0.76	0.96	0.04	0.04	0.1	0.21	0.05	0.49
Gb_30463	0.58	0.62	0.07	0.02	0.04	0.38	0.17	0.46	0.1	0.16	0.16	0.27	0.83	0.95	0.05	0.01	0.06	0.03	0.0	1.0
Gb_30964	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31396	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31978	0.28	0.37	0.58	0.12	0.07	0.21	0.15	0.34	0.16	0.18	0.36	0.23	0.97	1.0	0.19	0.17	0.2	0.07	0.0	0.17
Gb_32647	0.45	0.06	0.17	0.18	0.17	0.03	0.02	0.32	0.02	0.1	0.0	0.0	0.08	0.26	0.0	0.0	0.0	0.37	0.09	1.0
Gb_32905	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.32	0.06	0.06	0.0	0.05	0.52	0.35	0.42	0.0	0.0	0.09	0.04	0.0
Gb_33742	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.17	0.32	0.52	0.0	1.0	0.43	0.0	0.91	0.0	0.0	0.19	0.0
Gb_34291	0.12	0.74	0.3	0.09	0.03	0.54	0.25	0.44	0.05	0.05	0.01	0.06	0.7	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.44
Gb_35192	0.06	0.65	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.74	0.0	0.05	0.2	0.85	0.02	0.03	0.0	0.0	0.09	0.04	0.0	0.0
Gb_35285	0.14	0.08	0.05	0.09	0.13	0.66	0.18	0.48	0.1	0.14	0.53	0.27	0.34	0.27	0.4	0.08	0.22	0.23	0.28	1.0
Gb_35679	0.4	0.17	0.28	0.03	0.03	0.14	0.05	0.35	0.19	0.2	0.16	0.23	0.34	0.24	0.06	0.01	0.09	0.07	0.04	1.0
Gb_35796	0.17	0.53	0.2	0.02	0.03	0.14	0.17	0.51	0.17	0.13	0.31	0.24	1.0	0.95	0.16	0.0	0.01	0.03	0.0	0.21
Gb_35889	0.11	0.4	0.24	0.02	0.03	0.1	0.17	0.33	0.12	0.12	0.16	0.1	0.9	1.0	0.06	0.0	0.03	0.03	0.0	0.07
Gb_37054	0.1	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.03	0.04	0.36	0.03	1.0	0.19	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37058	0.07	0.03	0.0	0.0	0.0	0.11	0.03	0.2	0.05	0.08	0.17	0.08	1.0	0.15	0.06	0.01	0.04	0.02	0.0	0.06
Gb_37538	0.05	0.0	0.0	0.11	0.1	0.19	0.0	1.0	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.0	0.0	0.04	0.07	0.48	0.0
Gb_37989	0.45	0.0	0.52	0.0	0.35	1.0	0.17	0.06	0.19	0.48	0.28	0.07	0.2	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40308	0.1	0.06	0.0	0.0	0.08	0.05	0.01	0.16	0.05	0.08	0.21	0.06	1.0	0.33	0.07	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05
Gb_40309	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.1	0.04	0.03	0.12	0.04	1.0	0.38	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)