Heatmap: Cluster_248 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00238	0.51	-0.35	0.51	0.59	0.33	-1.16	-0.37	0.09	-0.56	-0.41	0.14	-0.31	0.12	0.17	-0.1	-1.26	-0.68	0.21	0.85	-0.29
Gb_00543	0.51	-0.46	0.29	0.18	0.33	-0.32	-0.44	-0.03	-0.29	-0.15	-0.02	-0.27	-0.0	-0.17	0.17	-0.4	-0.33	0.15	0.66	-0.11
Gb_00739	0.92	1.21	1.2	1.12	1.0	-1.39	-0.24	-0.46	-1.78	-2.13	-1.06	-1.22	-0.54	-0.92	-1.08	-1.9	-2.77	0.63	0.76	-0.76
Gb_01646	0.72	0.09	0.21	0.62	0.41	-0.47	0.15	-0.16	-0.6	-0.52	-0.0	-0.49	-0.02	-0.33	0.04	-0.54	-0.46	-0.07	0.27	0.12
Gb_01769	-0.05	0.07	0.24	0.24	0.27	-0.35	-0.02	0.01	-0.99	-0.71	-0.27	0.08	-0.21	-0.47	-0.09	-0.96	0.13	0.25	0.96	0.45
Gb_01849	1.23	-0.76	1.21	1.58	0.91	-1.54	-0.57	-0.3	-1.12	-1.35	-1.02	-0.81	-1.37	-1.24	-1.18	-0.46	-0.46	0.6	0.54	-1.1
Gb_03238	1.12	-0.31	0.75	0.49	0.29	-0.87	-0.82	0.13	-0.21	-0.35	-0.21	-0.65	-0.36	-0.53	-0.16	-0.11	-0.42	0.5	-0.18	0.03
Gb_03519	1.36	0.89	1.07	0.7	0.37	-0.46	-0.88	-0.04	-0.46	-0.74	-0.53	-1.04	-0.61	-1.19	-0.37	-0.87	-1.92	-0.14	0.62	-0.55
Gb_03757	0.88	0.4	1.23	0.48	0.24	-0.25	-0.55	0.1	-0.84	-1.03	-0.73	-0.56	0.08	-0.25	-0.66	-1.06	-0.98	0.11	0.68	-0.33
Gb_04114	0.55	0.37	0.73	0.89	0.21	-0.18	-0.18	-0.24	-0.81	-0.88	-0.34	-0.64	0.21	0.17	-0.13	-0.58	-1.04	0.14	0.42	-0.69
Gb_04480	1.22	0.13	0.96	0.7	0.49	-1.23	-0.42	-0.04	-0.6	-0.66	-0.02	-0.39	-0.56	-0.81	-0.13	-0.38	-0.93	-0.1	-0.04	0.05
Gb_05423	0.44	-0.53	-0.03	0.69	0.44	-0.62	-0.42	0.13	-0.09	-0.45	0.01	-0.5	0.21	0.01	0.08	-0.72	-0.52	-0.03	0.8	-0.2
Gb_05553	0.77	0.3	0.73	0.73	0.39	-1.05	-0.31	-0.16	-0.47	-0.44	-0.76	-0.65	-0.67	-0.76	-0.44	0.01	0.24	0.17	0.84	-0.97
Gb_06011	0.24	0.03	0.34	0.36	0.7	-0.16	-0.73	0.03	-0.31	-0.24	-0.04	-0.23	-0.85	-0.94	0.01	-0.43	-0.18	0.19	0.87	-0.08
Gb_06374	0.08	0.7	0.63	0.54	0.44	-0.2	-0.87	0.18	-0.74	-0.83	-0.3	-0.08	-0.65	-0.99	-0.23	-0.94	-0.02	0.18	0.85	0.07
Gb_07057	0.5	0.72	0.82	1.02	0.85	-0.46	-0.74	-0.3	-0.62	-0.95	-0.3	-0.42	-0.56	-1.25	-0.64	-0.91	-0.73	0.33	0.79	-0.67
Gb_07391	0.82	0.44	0.82	0.86	0.43	-0.3	-0.56	-0.06	-0.71	-0.67	-0.21	-0.65	-0.23	-0.63	-0.12	-1.1	-0.86	0.21	0.28	-0.08
Gb_07396	0.78	0.31	1.16	1.29	0.57	-0.31	-0.85	-0.08	-1.35	-1.34	-0.57	-0.46	0.02	0.01	-0.53	-1.09	-0.86	0.26	-0.17	-0.78
Gb_07697	0.87	-0.63	-0.01	1.36	0.55	-0.6	0.09	-0.23	-1.32	-1.48	-0.36	-0.82	-0.06	-0.45	-0.34	-0.71	-0.68	0.61	0.85	-0.35
Gb_07974	1.28	-0.35	0.8	1.18	0.2	-0.75	-0.98	0.09	-0.42	-0.42	-0.23	-0.63	-0.65	-0.81	-0.33	-0.57	-0.52	0.01	0.22	-0.11
Gb_08729	0.63	-0.08	0.54	0.58	0.46	-0.16	0.05	-0.03	-0.96	-0.81	-0.11	-0.83	-0.42	-0.54	0.03	-1.15	-0.34	0.13	0.85	0.15
Gb_08915	0.96	0.38	0.86	1.02	0.7	-0.23	-0.38	-0.32	-0.98	-1.06	-1.28	-0.28	0.0	-0.0	-1.37	-1.59	-0.84	0.1	0.63	-0.41
Gb_10183	1.16	0.57	0.4	0.39	-0.02	-0.67	-0.81	0.21	-0.47	-0.62	-0.33	-0.31	-0.63	-1.46	-0.47	-0.65	-1.39	0.42	0.6	0.78
Gb_10426	0.92	-0.26	-0.31	0.94	0.54	-1.22	-0.15	-0.24	-1.37	-1.37	-0.65	-1.5	0.27	0.36	-0.22	-0.84	-1.37	0.57	1.3	-0.13
Gb_10516	0.25	0.68	0.61	0.66	0.48	0.0	-0.85	0.11	-1.24	-1.15	-0.39	-0.64	0.14	0.14	-0.22	-0.79	-0.85	0.6	0.17	-0.07
Gb_11239	0.58	-0.44	0.41	0.31	0.57	-0.34	-0.93	-0.14	-1.01	-0.98	-0.23	-0.58	0.35	0.35	-0.34	-0.96	-0.22	-0.05	1.22	-0.03
Gb_11332	0.93	1.52	0.8	1.0	0.49	-1.21	-0.68	-0.51	-0.77	-0.85	-0.43	-1.55	-0.79	-1.2	-0.25	-1.25	-1.11	-0.63	0.91	-0.27
Gb_12779	0.87	-0.43	0.58	0.75	0.55	-0.09	-0.44	0.02	-1.19	-1.08	-0.48	-0.37	-0.26	-0.51	-0.48	-1.51	-1.1	0.5	1.18	-0.06
Gb_12851	0.27	1.15	0.83	0.98	0.72	-1.14	0.15	-0.24	-1.27	-1.53	-0.19	-0.59	-0.85	-1.35	-0.17	-1.77	-1.14	-0.3	1.09	-0.08
Gb_13065	-0.07	0.08	0.58	0.21	0.04	-0.5	-1.38	-0.04	-0.25	-0.2	0.2	-0.27	0.08	-0.64	0.17	-0.78	-0.12	0.1	0.97	0.26
Gb_13744	1.13	-0.01	1.18	0.45	0.29	-1.35	-1.09	0.04	-0.65	-0.67	0.08	-0.56	-0.57	-0.6	0.04	-0.42	-0.02	0.06	0.15	-0.29
Gb_13984	0.07	0.23	0.41	0.25	0.51	-0.2	0.08	0.1	-0.36	-0.42	0.02	-0.23	-0.01	-0.32	-0.02	-0.94	-0.75	0.09	0.78	-0.39
Gb_13986	0.73	0.34	0.7	0.57	0.29	-0.66	-0.08	-0.12	-0.75	-0.97	0.08	-0.52	-0.04	-0.37	0.11	-0.8	-0.79	-0.12	0.7	-0.22
Gb_14522	0.85	0.63	0.83	0.4	0.53	-0.24	-0.29	0.18	-0.95	-0.83	-0.0	-0.94	-1.24	-1.55	-0.22	-1.0	-1.2	0.08	1.12	-0.12
Gb_14947	0.88	-0.4	0.6	0.71	0.23	-0.61	-0.64	0.18	-0.76	-0.94	0.07	-0.45	-0.45	-0.64	0.08	-0.55	-0.2	0.48	0.51	-0.1
Gb_15216	-0.26	0.39	-0.16	-0.09	-0.06	-1.28	0.73	0.26	-0.06	-0.04	0.46	-0.3	0.59	-0.31	0.34	-1.41	-1.4	-0.87	1.0	-0.3
Gb_15615	0.41	-0.2	1.06	0.82	0.31	-0.7	-1.27	-0.1	-1.29	-1.29	-0.1	-0.61	0.2	0.11	-0.29	-1.7	-0.04	-0.13	0.95	0.21
Gb_15677	0.22	-0.07	0.18	-0.31	0.65	-0.34	-0.69	0.14	-0.44	-0.71	-0.14	-0.3	-0.45	-0.43	-0.22	-0.6	-0.19	0.71	1.25	-0.16
Gb_16051	0.5	0.64	0.71	0.38	0.23	-0.79	-0.42	0.12	-0.38	-0.51	-0.12	-0.29	-0.12	-0.11	-0.11	-0.52	-0.45	-0.12	0.7	-0.84
Gb_16059	0.33	0.06	0.53	0.19	0.14	-0.24	0.24	-0.06	-0.8	-0.67	0.46	-1.14	-0.92	-1.07	0.44	-0.62	-0.28	0.21	1.0	0.01
Gb_16397	0.72	-0.23	0.9	0.86	0.41	-1.48	-0.75	-0.05	-0.42	-0.52	-0.09	-0.34	-0.55	-0.7	-0.11	-0.17	0.0	0.18	0.42	-0.28
Gb_16466	0.6	0.33	0.07	0.36	0.2	0.06	0.24	0.06	-0.76	-0.91	-0.38	-0.58	0.28	-0.13	-0.15	-0.71	-0.66	0.33	0.56	-0.13
Gb_17228	0.67	0.32	0.26	0.58	0.82	-0.64	-0.98	0.09	-0.58	-0.79	-0.28	-0.98	-1.18	-1.18	-0.32	-0.54	-0.61	0.75	1.11	0.05
Gb_17674	0.49	-0.03	0.38	0.54	0.09	-0.81	0.13	-0.04	-0.26	-0.38	0.12	-0.76	-0.1	-0.3	0.3	-0.28	-0.3	0.09	0.41	-0.18
Gb_18172	0.61	0.13	0.53	0.25	0.29	-0.15	-0.22	0.19	-0.81	-0.96	-0.33	-0.26	-0.5	-0.61	-0.3	-1.31	-0.61	0.61	1.16	-0.1
Gb_18805	0.19	0.07	0.19	0.63	0.51	0.57	-0.16	0.11	-0.8	-0.83	-0.07	-0.41	-0.35	-0.14	-0.26	-0.99	-0.68	0.63	0.49	-0.36
Gb_19277	0.94	0.8	1.15	0.55	0.07	-0.27	0.01	-0.36	-0.53	-0.75	-1.06	-1.23	-1.28	-0.91	-0.64	-0.32	-0.48	-0.39	0.55	0.54
Gb_19314	1.06	0.27	0.88	0.94	0.45	-0.68	-0.4	0.09	-0.58	-0.58	-0.32	-0.39	-0.57	-0.68	-0.38	-0.98	-1.13	0.08	0.67	-0.88
Gb_19818	0.54	0.04	0.59	1.09	0.58	0.18	-0.33	-0.14	-1.45	-1.51	-0.35	-1.15	-0.17	-0.26	-0.51	-1.29	-0.52	0.63	0.31	0.37
Gb_20538	-0.05	0.47	0.31	0.12	0.42	-0.44	-0.09	-0.05	-0.19	-0.21	-0.24	-0.52	-0.29	-0.18	-0.15	0.05	-0.19	0.32	0.45	-0.11
Gb_20983	-0.15	0.19	0.35	-11.31	0.53	-0.17	-0.11	0.0	-0.54	-0.54	-0.09	-0.66	-0.19	0.03	0.05	-0.6	-0.11	0.35	1.31	0.26
Gb_21326	0.8	-0.24	0.08	1.39	0.25	-0.32	-0.31	-0.05	-1.07	-0.92	-0.63	-0.03	0.02	-0.29	-0.57	-1.49	-1.08	0.82	0.68	-0.65
Gb_21329	0.88	0.25	0.41	0.73	0.3	-0.17	-0.16	0.17	-0.82	-0.96	-0.26	-0.39	-0.19	-0.19	-0.13	-0.86	-0.82	0.09	0.62	-0.39
Gb_21429	0.89	-0.22	1.1	0.86	0.32	-0.86	-0.61	0.04	-0.61	-0.66	-0.23	-0.5	-0.38	-0.5	-0.38	-0.81	-0.26	-0.06	0.84	-0.77
Gb_22683	0.62	-0.08	0.45	-0.06	0.49	-1.06	-0.59	0.27	-0.34	-0.41	0.29	-0.23	0.02	-0.37	0.26	-1.0	-0.57	0.16	0.76	-0.21
Gb_23172	1.06	0.37	0.94	0.92	0.67	-0.81	-0.27	-0.16	-0.86	-0.77	-0.33	-0.65	-0.12	-0.22	-0.28	-1.12	-0.85	0.05	-0.18	-0.25
Gb_23422	0.42	0.32	-0.25	0.23	0.38	-0.44	0.43	-0.03	-0.84	-0.86	0.16	-0.74	-0.0	-0.35	0.1	-0.69	-0.84	0.34	0.99	-0.12
Gb_24728	1.18	-0.52	0.83	0.86	0.74	-1.05	-0.64	0.04	-0.89	-0.76	-0.54	-0.41	0.11	-0.3	-0.49	-1.08	-0.68	0.68	0.14	-0.63
Gb_25641	0.13	-0.01	-0.08	0.23	0.49	0.11	-0.46	0.07	-0.85	-0.9	-0.4	-0.61	-0.17	-0.01	-0.26	-0.43	-0.39	0.86	0.78	0.35
Gb_26485	0.78	0.89	0.82	0.9	0.4	-1.15	-0.15	-0.18	-0.79	-0.83	-0.45	-0.96	-0.76	-1.04	-0.32	-0.46	-0.18	0.09	0.45	-0.1
Gb_27862	0.88	0.14	0.34	0.44	0.65	0.37	-0.86	-0.03	-0.29	-0.72	-0.19	-1.01	-0.45	-0.78	-0.15	-0.75	-1.5	0.75	0.88	-0.86
Gb_28545	1.13	0.31	1.07	0.77	0.34	-0.66	-0.77	0.07	-0.93	-1.04	-0.28	-0.42	-0.59	-0.58	-0.11	-1.0	-0.8	0.14	0.66	-0.7
Gb_28560	0.75	-0.06	0.71	0.95	0.31	-0.12	-0.66	0.1	-0.6	-0.73	0.0	-0.21	-1.04	-1.41	0.02	-1.09	-0.61	0.46	0.33	0.21
Gb_28667	-0.11	0.51	0.46	0.18	0.47	-0.13	-0.14	0.02	-0.79	-0.67	-0.3	-0.19	-0.4	-0.57	-0.14	-0.42	-0.09	0.52	0.54	0.16
Gb_29531	0.53	0.2	0.48	0.68	0.87	0.18	-0.23	-0.04	-0.64	-0.6	-0.33	-0.25	-0.5	-0.93	-0.34	-0.73	-0.76	0.72	0.1	-0.41
Gb_29884	0.51	1.26	1.1	0.92	0.22	-0.14	-0.15	-0.74	-0.65	-0.79	-1.15	-1.09	-0.38	-0.89	-0.84	-1.3	-1.87	0.29	0.29	0.54
Gb_31789	-0.62	0.11	-0.23	0.15	-0.02	0.32	0.62	0.33	-0.03	0.06	0.18	-0.13	-0.43	-0.69	0.07	-0.66	-1.14	-0.05	1.11	-0.75
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.