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Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.68 -0.3 0.7 0.09 0.17 -0.48 -0.12 -0.06 -0.05 -0.01 0.47 -0.65 -0.12 -0.42 0.35 0.08 -0.32 0.13 -0.68 -0.57
0.22 0.65 1.19 0.43 0.0 -0.53 -0.25 0.16 -0.69 -0.61 0.06 -0.47 -0.26 -0.23 -0.05 -0.85 -0.9 -0.0 0.51 -0.37
0.25 0.61 1.08 0.37 0.67 -0.21 -0.91 -0.22 -0.95 -0.91 -0.89 -0.77 0.01 -0.04 -0.81 -0.6 -0.63 0.64 0.49 0.04
0.83 0.47 1.05 0.26 0.4 -0.7 -0.79 -0.22 -0.06 -0.24 -0.24 -0.64 -0.25 -0.63 -0.31 0.44 -0.32 0.3 -0.54 -0.91
0.51 0.43 0.86 -0.55 0.72 -0.65 -0.53 0.0 -0.39 -0.44 0.42 -0.56 -0.41 -0.54 0.28 -0.7 -0.41 0.16 0.0 0.15
1.02 -0.78 0.12 1.09 0.1 -0.95 -1.03 -0.06 -0.43 -0.64 0.13 -0.85 -0.92 -1.0 -0.02 0.63 0.78 0.46 -0.35 -0.63
0.94 0.12 0.61 1.12 0.39 -0.41 -0.6 0.12 -0.43 -0.35 -0.2 -0.69 0.05 -0.05 -0.27 -0.6 -0.37 -0.29 -0.3 -0.82
0.5 0.29 -0.05 0.05 0.5 -0.53 -0.37 0.03 0.26 -0.04 -0.05 -0.41 -0.01 -0.17 0.06 0.24 -0.12 0.08 -0.24 -0.64
1.3 0.18 0.75 0.01 -0.26 -3.23 -0.47 0.18 0.17 0.24 0.79 -1.46 -0.52 -0.74 0.16 -0.31 -0.04 -1.3 -0.7 0.37
0.54 -0.09 0.72 0.57 0.77 -0.05 -1.43 0.1 -0.64 -0.64 -0.21 -0.24 0.3 -0.23 -0.19 -0.98 -0.54 0.22 0.18 -0.16
0.48 0.66 0.41 0.21 0.33 -0.41 0.32 -0.14 -0.67 -0.84 0.15 -0.42 -1.04 -0.73 0.06 -0.7 -0.34 -0.16 0.58 0.49
0.77 -0.87 0.87 -0.41 0.42 -0.54 -0.18 0.14 0.04 -0.11 0.57 -1.19 0.05 -0.28 0.73 -0.57 -0.41 0.15 -1.33 -0.24
0.61 0.91 0.97 0.77 0.6 -0.52 -0.06 0.13 -0.79 -0.86 -0.16 -0.53 -0.48 -0.63 -0.21 -0.92 -0.48 -0.1 -0.17 -0.63
1.12 1.08 1.14 0.47 0.45 0.14 -1.66 -0.02 -1.28 -1.52 -0.31 -0.92 -0.67 -0.93 -0.12 -1.04 -0.7 0.56 -0.41 -0.26
0.73 -0.36 0.77 0.7 0.49 -0.3 -1.37 0.0 -0.06 -0.32 0.16 -0.48 -0.51 -0.94 0.14 0.14 -0.26 0.46 -0.34 -0.73
0.7 0.25 0.97 0.62 0.59 -0.21 -0.41 0.0 -0.45 -0.52 -0.28 -0.24 -1.4 -1.38 -0.24 -0.54 0.32 0.05 0.32 -0.66
0.29 1.24 1.48 0.04 0.1 -1.34 -0.06 -0.29 -0.55 -0.58 -0.05 -0.31 -0.21 -0.34 -0.08 -0.88 -0.96 -0.31 0.04 -0.43
0.56 0.42 0.91 1.02 0.07 -1.17 -0.66 -0.22 -0.19 -0.37 0.13 -0.47 -0.01 0.06 -0.11 0.28 -0.16 -0.36 -0.94 -1.21
1.03 1.25 1.77 0.26 0.16 -0.74 -2.01 -0.06 -0.83 -1.1 -0.53 -1.2 -0.36 -0.38 -0.27 -0.04 -0.41 -0.04 -1.08 -1.61
0.55 -0.03 0.43 1.36 0.53 -1.26 -1.32 -0.12 -0.66 -0.9 -0.18 0.19 -0.04 0.01 -0.42 -0.59 -0.31 0.37 -0.02 -0.33
0.68 0.13 0.95 0.69 0.56 -0.84 -0.81 0.11 -0.19 -0.51 -0.34 -0.67 0.04 -0.49 -0.44 -0.99 -0.55 0.24 0.31 -0.01
0.66 0.11 1.48 0.52 0.79 -0.04 -0.55 0.26 -0.77 -0.77 -0.35 0.01 -1.17 -1.13 -0.4 -1.12 -1.34 0.59 -0.29 -0.44
0.92 1.33 1.54 0.28 -0.05 -1.56 -1.74 -0.26 -0.52 -0.73 -0.13 -0.41 -0.63 -0.62 -0.32 0.42 0.17 -0.53 -1.39 -1.22
1.01 -0.04 0.84 0.82 0.25 -0.25 -0.63 0.15 -0.56 -0.78 -0.37 -0.54 0.61 0.4 -0.51 -0.95 -0.61 -0.15 -0.31 -0.95
0.96 0.63 0.77 0.96 0.49 -0.48 -0.75 -0.01 -0.39 -0.85 -0.23 -1.08 -0.15 -0.39 0.05 -0.5 -0.76 0.2 -0.28 -0.91
1.61 1.07 2.82 - 0.82 - - -0.22 -1.43 -0.9 - -1.0 -2.7 -3.92 - -1.72 -0.45 -0.23 0.72 -
0.23 -0.35 0.06 0.27 1.02 -1.33 -0.96 0.19 0.48 -0.04 0.1 -0.9 -1.22 -1.53 0.03 0.76 1.11 -0.11 -0.28 -1.55
0.23 -0.36 0.59 0.39 0.57 -0.22 -0.85 0.08 -0.52 -0.57 0.46 -0.16 -0.0 -0.18 0.24 -0.41 -0.36 0.28 -0.14 -0.11
1.16 0.83 1.54 0.74 -0.02 -1.84 -1.02 0.06 -0.72 -0.71 0.25 -0.89 -0.7 -1.24 0.27 -0.88 -0.76 -0.61 0.03 -0.75
0.17 0.19 1.25 0.74 0.18 -0.55 -0.5 0.33 -0.14 -0.01 0.18 -0.08 -1.15 -1.66 0.3 -0.72 -0.31 0.19 -0.02 -1.32
2.12 0.86 0.0 2.25 0.99 -0.88 -1.67 -0.08 -0.48 -1.23 -3.55 -2.23 -0.95 -2.75 -1.37 - -1.6 -1.28 -0.38 -1.8
0.53 0.49 0.62 0.38 0.18 -1.45 -1.61 0.29 -0.37 -0.16 0.46 -0.75 0.48 0.24 0.41 -0.43 -0.64 -0.08 -0.31 -0.74
0.39 0.52 0.51 -0.09 0.45 -0.63 -0.0 -0.03 -0.3 -0.34 0.16 -0.16 -0.9 -1.2 0.32 -0.04 -0.12 0.24 0.2 -0.22
0.62 -0.82 -0.23 -0.22 -0.33 -0.95 -1.48 0.18 0.91 0.76 0.11 -0.15 -0.93 -0.64 0.42 1.41 -0.06 -0.21 -1.38 -1.17
0.41 0.63 0.91 1.08 0.69 -1.64 -1.4 -0.08 -0.52 -0.64 -0.22 -0.53 0.12 0.32 -0.32 -0.48 -0.85 -0.21 0.18 -0.83
0.46 -2.18 -1.66 0.58 0.02 -1.07 -1.34 0.26 0.61 0.48 0.47 0.1 0.03 0.17 0.48 0.77 -0.15 -0.15 -1.61 -0.39
1.64 -0.08 0.83 0.34 0.49 -0.7 -0.32 0.14 -0.72 -0.63 -0.07 -0.66 -0.18 -0.67 -0.26 -1.13 -0.05 -0.34 -0.01 -0.8
0.63 -0.22 0.53 0.46 0.29 -0.43 -0.86 0.02 -0.17 -0.31 -0.02 -0.46 0.11 0.08 -0.02 -0.27 0.1 0.54 -0.4 -0.75
1.58 0.34 0.43 0.42 -0.03 -1.85 -0.87 0.09 0.02 -0.05 0.2 -1.44 -0.54 -0.58 0.17 0.49 -0.3 -0.01 -0.44 -1.88
0.31 0.72 0.63 0.41 0.11 -0.16 0.04 -0.07 -0.6 -0.48 0.19 -0.31 -0.46 -0.53 0.08 -0.6 -0.53 -0.24 0.54 -0.27
0.23 -0.81 0.12 0.42 0.09 -0.85 -1.02 0.25 -0.03 0.04 0.44 -0.24 0.29 0.25 0.45 -0.02 0.17 0.06 -0.28 -0.83
0.37 -0.57 0.12 0.33 0.26 -0.03 -0.71 -0.09 -0.53 -0.56 0.53 -0.75 -0.29 -0.34 0.58 -0.89 -0.02 0.52 0.04 0.55
0.62 0.52 0.61 0.47 0.28 -1.66 -1.09 0.12 -0.27 -0.35 0.21 -0.19 0.3 0.21 0.13 -0.13 -0.52 -0.44 0.02 -0.9
0.43 0.66 0.84 0.53 0.3 -0.44 -0.27 -0.02 -0.25 -0.25 -0.06 -0.02 -0.19 -0.29 -0.16 -0.59 -0.53 -0.18 0.08 -0.92
0.5 0.85 0.97 0.16 0.23 -0.51 0.22 0.01 -0.52 -0.52 -0.5 -0.33 -0.92 -0.92 -0.34 -0.77 0.14 0.02 0.66 -0.63
0.57 -0.48 0.15 0.56 0.55 0.39 -0.95 -0.0 -0.65 -0.65 -0.37 -0.44 0.25 -0.19 -0.36 -0.11 0.35 0.34 0.21 -0.55
0.72 -0.65 0.31 0.45 0.38 -0.51 -1.06 0.2 -0.41 -0.64 0.38 -0.56 -0.04 -0.06 0.35 0.26 0.35 0.15 -0.16 -1.25
1.15 0.52 0.78 0.53 0.22 -1.52 -1.05 -0.14 -0.2 -0.77 -0.07 -1.08 -0.12 0.07 0.07 0.66 -0.69 -0.04 -1.15 -0.37
1.01 0.28 0.84 0.67 0.57 -0.34 -0.88 -0.12 -0.34 -0.71 0.21 -0.77 -0.25 -0.22 0.16 -0.46 -0.71 0.14 -0.72 -0.65
0.59 -0.28 0.27 0.19 0.34 -0.64 -0.7 0.04 0.19 -0.16 0.39 -0.46 -0.62 -0.22 0.13 0.51 0.14 0.37 -1.32 -0.21
0.95 0.13 0.98 0.81 0.82 -1.63 -2.31 0.21 -0.22 -0.33 -0.56 -0.87 -0.14 -0.26 -0.6 -0.36 -0.43 0.52 -0.42 -0.31
0.57 0.63 0.83 0.22 0.37 -0.03 -0.4 0.18 -0.72 -0.72 -0.12 -0.31 -0.12 -0.62 -0.15 -1.12 -0.68 -0.01 0.54 -0.11
0.94 0.19 0.98 0.99 0.62 -2.21 -1.56 0.18 -0.25 -0.44 -0.05 -0.52 -1.07 -1.12 -0.05 -0.12 -0.05 0.53 -0.7 -0.59
0.59 -0.02 1.08 0.09 0.49 0.0 -0.92 -0.1 -0.42 -0.35 0.52 -0.58 0.09 -0.43 0.31 -0.41 -0.24 0.05 -1.47 -0.37
0.58 -0.36 -0.03 0.24 0.15 0.18 0.05 -0.1 -0.45 -0.42 0.07 -0.74 -0.39 -0.4 0.1 -0.34 -0.27 0.37 0.09 0.73
0.03 0.16 0.96 0.8 -0.35 -0.81 -0.06 0.02 -0.95 -0.78 0.48 -0.21 -0.16 -0.43 0.17 -0.41 -0.23 -0.37 0.55 -0.18
0.3 0.53 0.57 0.54 0.5 -0.49 -0.57 0.0 -0.43 -0.41 0.01 -0.26 -0.21 -0.12 -0.14 -0.72 -0.29 0.37 0.06 -0.33
0.99 -0.18 1.07 0.61 0.45 -1.54 -0.49 0.19 -0.73 -0.81 0.42 -0.55 -0.43 -0.52 0.36 -0.31 -0.45 -0.18 -0.2 -0.45
0.53 1.24 1.23 0.98 1.19 -0.87 -1.29 -0.46 -0.61 -0.59 -1.14 -0.57 0.18 -0.01 -1.05 -0.98 -0.95 -0.42 -0.34 -1.85
0.6 -0.53 0.29 0.75 0.01 0.3 -0.24 0.13 -0.52 -0.6 0.59 -0.34 -0.93 -1.06 0.36 -0.74 0.16 0.3 0.03 -0.35
0.46 0.51 0.69 0.58 0.18 -0.91 0.02 -0.18 -0.5 -0.58 -0.05 -0.35 -0.15 -0.19 -0.12 -0.92 -0.64 -0.07 0.67 -0.01
0.56 0.24 0.59 -0.16 0.02 -0.07 -0.25 0.1 -0.21 -0.21 0.3 -0.31 -0.49 -0.41 0.31 -0.18 -0.48 -0.01 0.1 -0.09
0.18 -0.35 0.23 0.24 0.04 -0.57 -0.51 0.28 -0.09 -0.14 0.32 -0.47 -0.1 -0.04 0.39 -0.02 0.02 0.29 0.12 -0.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.