Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00276	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86	0.12	0.2	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00777	1.0	0.71	0.2	0.0	0.21	0.0	0.33	0.3	0.12	0.56	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.35	0.3
Gb_00809	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01362	0.46	1.0	0.21	0.22	0.6	0.29	0.29	0.21	0.0	0.11	0.13	0.01	0.1	0.08	0.37	0.09	0.12	0.44	0.0	0.0
Gb_02646	0.0	0.0	0.07	0.2	0.18	0.0	0.0	0.34	0.36	0.17	0.99	0.0	0.0	0.0	1.0	0.07	0.0	0.17	0.38	0.0
Gb_03577	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.15	0.03	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04852	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93	0.0
Gb_05523	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_05709	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07155	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_08445	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08446	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.33	0.31	1.0	0.0	0.77	0.17	0.04	0.0	0.0	0.0	0.3	0.04	0.0
Gb_08453	0.02	0.01	0.01	0.27	0.19	0.57	0.0	0.63	0.18	0.11	0.02	0.23	0.15	0.15	0.0	0.23	1.0	0.0	0.03	0.03
Gb_08500	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.34	0.0	0.0	1.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.85	0.0
Gb_08718	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08791	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.26	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0
Gb_09199	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09420	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09806	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	1.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11600	0.37	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.4	1.0	0.22	0.35	0.55	0.0	0.42	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_12154	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13416	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13515	0.21	0.23	0.72	0.68	0.1	0.0	0.0	0.49	0.54	0.06	0.39	0.3	0.04	0.28	1.0	0.67	0.22	0.2	0.35	0.0
Gb_13647	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.12	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0
Gb_13962	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.36	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_13999	0.33	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.27	0.35	0.76	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.1
Gb_14776	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0
Gb_15839	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.41	0.24	0.0	0.0	0.53	0.08	0.76	0.0	0.0	0.0	0.07	0.17
Gb_15930	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.22	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.07
Gb_16025	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17590	0.45	0.33	0.27	0.0	0.16	0.0	0.0	1.0	0.27	0.12	0.0	0.03	0.27	0.58	0.38	0.73	0.0	0.11	0.82	0.0
Gb_18036	0.32	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.41	0.52	0.18	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.08	0.0
Gb_18666	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18816	0.41	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19137	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.28	1.0	0.0	0.06	0.18	0.08	0.74	0.0	0.0	0.0	0.09	0.19
Gb_20142	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_21363	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.44	0.35	0.19	0.0	0.31	0.18	0.0	0.0	0.09	0.2	0.91	0.0
Gb_21510	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21973	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.1	0.91	0.05	0.01	0.0	0.0	0.01	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	1.0	0.04
Gb_22312	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.15	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22509	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23332	0.23	0.18	0.21	0.0	0.0	0.05	0.15	0.31	0.59	0.55	0.48	0.11	0.11	0.12	1.0	0.53	0.45	0.18	0.14	0.0
Gb_24295	0.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0
Gb_24535	0.09	0.07	0.03	0.0	0.02	0.7	0.04	1.0	0.48	0.53	0.5	0.7	0.57	0.62	0.26	0.04	0.22	0.0	0.0	0.35
Gb_24557	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.04	0.54	0.69	1.0	0.02	0.59	0.13	0.21	0.03	0.02	0.02	0.01	0.0	0.11
Gb_24706	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.34	0.85	1.0	0.29	0.51	0.13	0.0	0.0	0.45	0.64	0.0	0.0	0.7	0.0
Gb_24886	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	1.0	0.0	0.22	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0
Gb_24956	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.35	0.72	1.0	0.02	0.86	0.07	0.13	0.04	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0
Gb_25200	0.23	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.18	1.0	0.26	0.04	0.77	0.02	0.06	0.08	0.77	0.0	0.1	0.0	0.33	0.0
Gb_25464	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0
Gb_25912	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.52	1.0	0.58	0.1	0.33	0.27	0.69	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01
Gb_26221	0.01	0.0	0.0	0.04	0.02	0.08	0.0	0.9	0.16	0.23	0.23	0.23	0.51	1.0	0.12	0.09	0.63	0.0	0.0	0.33
Gb_26446	0.08	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.46	0.25	0.87	0.05	0.23	0.64	0.57	0.74	0.16	0.11	0.95	0.56
Gb_27106	0.21	0.0	0.0	1.0	0.11	0.0	0.0	0.29	0.29	0.11	0.49	0.06	0.25	0.41	0.19	0.79	0.3	0.0	0.25	0.0
Gb_27828	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28130	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.21	0.0	0.49	0.26	0.2	0.85	0.21	0.41	0.72	0.78	0.22	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28508	0.02	0.0	0.0	0.06	0.0	0.37	0.0	0.96	0.36	0.18	0.66	1.0	0.55	0.8	0.93	0.39	0.62	0.04	0.0	0.01
Gb_28674	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29067	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.93	1.0	0.34	0.14	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0
Gb_29319	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	1.0	0.23	0.05	0.32	0.07	0.0	0.26	0.82	0.0	0.0	0.0	0.14	0.22
Gb_29607	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	1.0	0.16	0.0	0.47	0.0	0.74	0.51	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29831	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.26	0.23	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37
Gb_29863	0.11	1.0	0.0	0.73	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.08	0.0
Gb_30261	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30875	0.0	0.0	0.92	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.81	0.46	0.77	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_31088	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.25	1.0	0.44	0.0	0.52	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0
Gb_31304	0.49	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31676	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.11	0.8	0.01	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	1.0	0.12
Gb_32849	0.32	0.17	0.34	0.06	0.16	0.03	0.15	0.41	0.42	0.16	0.63	0.03	0.15	0.13	1.0	0.26	0.04	0.23	0.36	0.09
Gb_32946	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_33342	0.25	0.1	0.02	1.0	0.27	0.09	0.03	0.19	0.11	0.05	0.23	0.02	0.1	0.1	0.24	0.03	0.03	0.17	0.38	0.21
Gb_33453	0.05	0.11	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.37	0.32	1.0	0.89	0.02	0.24	0.19	0.5	0.13	0.05	0.0	0.3	0.0
Gb_33862	0.32	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.29	0.14	0.0	0.0	0.34	0.0	0.06	0.05	0.07	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0
Gb_34384	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0
Gb_34528	0.06	0.0	0.0	0.51	0.09	0.0	0.12	0.59	0.13	0.1	0.18	0.07	0.23	0.14	0.6	0.52	0.14	0.0	1.0	0.32
Gb_36000	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_36308	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	1.0	0.5	0.95	0.0	0.04	0.13	0.0	0.0	0.0	0.72	0.15	0.48	0.0
Gb_36908	0.17	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.05	0.15	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_37168	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	1.0	0.07	0.09	0.61	0.03	0.01	0.36	0.6	0.04	0.0	0.05	0.35	0.11
Gb_37878	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_38470	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.4	0.17	1.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39556	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.17	0.2	0.12	0.0	0.0	0.0	0.11	0.22	0.0	0.0	0.21	0.28	0.0
Gb_40189	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0
Gb_40703	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0	1.0	0.39	0.36	0.0	0.34	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53
Gb_41571	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.44	0.58	1.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)