Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01024	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01501	0.1	0.02	0.02	0.05	0.02	1.0	0.08	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02
Gb_01889	0.09	0.01	0.04	0.03	0.02	1.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	0.37
Gb_01910	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02049	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02059	0.07	0.0	0.0	0.45	0.63	1.0	0.09	0.48	0.72	0.62	0.43	0.16	0.03	0.03	0.28	0.0	0.1	0.32	0.15	0.13
Gb_02235	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02751	0.04	0.0	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03822	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.78	0.05	0.28	0.37	0.14	0.59	0.1	0.05	0.15	0.48	0.0	0.13	0.18	1.0	0.0
Gb_04153	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04436	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05532	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06744	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.08	0.01	0.02	0.06	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0
Gb_06745	0.05	0.0	0.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.1	0.19	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_06746	0.06	0.0	0.04	0.0	0.04	1.0	0.0	0.09	0.04	0.04	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06816	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07328	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08582	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.11	0.05	0.03	0.09	0.05	0.1	0.06	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08
Gb_09351	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13
Gb_10042	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.11	0.04	0.04	0.0	0.12	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04	0.12	0.01	0.0
Gb_10243	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	1.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11287	0.13	0.04	0.05	0.09	0.02	1.0	0.15	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.1	0.1	0.03
Gb_11424	0.0	0.0	0.0	1.0	0.43	0.0	0.04	0.07	0.12	0.0	0.18	0.0	0.09	0.07	0.01	0.0	0.07	0.0	0.04	0.07
Gb_11461	0.08	0.02	0.01	0.06	0.03	1.0	0.11	0.08	0.04	0.04	0.04	0.34	0.01	0.01	0.03	0.19	0.14	0.04	0.0	0.0
Gb_11796	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	1.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.81
Gb_12158	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12166	0.09	0.1	0.09	0.14	0.04	1.0	0.03	0.06	0.07	0.09	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.0	0.0	0.08	0.0	0.06
Gb_13273	0.06	0.0	0.02	0.9	0.12	0.0	0.08	0.29	0.1	0.05	1.0	0.02	0.18	0.13	0.38	0.03	0.0	0.0	0.0	0.54
Gb_14031	0.03	0.0	0.0	0.79	0.04	1.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.24	0.0	0.01
Gb_14426	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_15014	0.01	0.0	0.01	0.0	0.06	1.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.07
Gb_15692	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15697	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15727	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15733	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15791	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15960	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16402	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17941	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.09	0.01	0.01	0.04	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0
Gb_19468	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19469	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19609	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20083	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20158	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22264	0.0	0.03	0.0	0.01	0.01	1.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_22375	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23058	0.02	0.0	0.02	0.04	0.0	0.48	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	1.0
Gb_25663	0.11	0.0	0.33	0.0	0.18	1.0	0.0	0.41	0.05	0.26	0.0	0.34	0.27	0.71	0.07	0.13	0.15	0.69	0.0	0.04
Gb_26346	0.27	0.04	0.48	0.16	0.28	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.04
Gb_27701	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28293	0.1	0.11	0.13	0.11	0.28	1.0	0.01	0.2	0.07	0.11	0.09	0.08	0.24	0.16	0.06	0.08	0.14	0.38	0.22	1.0
Gb_28294	0.02	0.03	0.02	0.03	0.09	0.75	0.0	0.03	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.12	0.06	1.0
Gb_28495	0.61	0.0	0.0	0.51	0.32	0.0	0.08	0.77	0.34	0.17	0.35	0.0	1.0	0.06	0.78	0.0	0.0	0.0	0.44	0.73
Gb_29098	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_29623	0.24	0.04	0.07	0.08	0.08	1.0	0.12	0.13	0.05	0.06	0.04	0.06	0.02	0.02	0.04	0.06	0.08	0.26	0.08	0.66
Gb_29632	0.32	0.2	0.21	0.2	0.04	1.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_29905	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.25	0.0
Gb_30007	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.08	0.03	0.03	0.06	0.0	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.07	0.03
Gb_30296	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	1.0	0.0	0.03	0.09	0.04	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_31286	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31906	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32207	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32377	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.02	0.02	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_33677	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_33734	0.22	0.08	0.14	0.07	0.09	1.0	0.21	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.03	0.14	0.42
Gb_35581	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36053	0.01	0.0	0.0	0.06	0.01	1.0	0.33	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0
Gb_36276	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36778	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	1.0	0.06	0.02	0.02	0.02	0.08	0.03	0.02	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.39	0.41
Gb_37644	0.02	0.0	0.02	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.11	0.31
Gb_37645	0.07	0.0	0.04	0.0	0.0	1.0	0.24	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02
Gb_38206	0.02	0.01	0.04	0.0	0.02	1.0	0.06	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.06	0.07
Gb_38378	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38754	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39317	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39318	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39325	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_39462	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.18
Gb_39600	0.01	0.0	0.0	0.03	0.04	1.0	0.1	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.09	0.08	0.03
Gb_39867	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40079	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41197	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)