Heatmap: Cluster_99 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.42 0.32 0.29 0.48 0.64 0.62 0.09 0.78 0.54 0.69 0.87 0.81 1.0 0.78 0.83 0.36 0.58 0.29 0.36 0.16
0.13 0.1 0.16 0.28 0.17 0.14 0.14 0.63 0.53 0.36 0.71 0.41 0.67 0.58 0.59 1.0 0.9 0.16 0.05 0.04
0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.46 0.94 1.0 0.07 0.23 0.32 0.12 0.02 0.21 0.28 0.07 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.35 0.37 0.31 0.04 0.13 0.19 0.13 0.03 0.81 1.0 0.37 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.2 0.33 0.11 0.03 0.15 0.12 0.05 0.02 1.0 0.57 0.17 0.0 0.0
0.03 0.34 0.13 0.0 0.0 0.03 0.0 0.71 1.0 0.68 0.51 0.68 0.44 0.62 0.48 0.88 0.59 0.14 0.0 0.0
0.04 0.0 0.08 0.1 0.09 0.0 0.03 0.62 0.76 1.0 0.27 0.15 0.11 0.25 0.27 0.22 0.2 0.01 0.0 0.04
0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.03 0.81 0.75 1.0 0.6 0.11 0.04 0.23 0.42 0.23 0.24 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.76 0.97 1.0 0.86 0.26 0.25 0.32 0.63 0.0 0.29 0.0 0.07 0.0
0.16 0.15 0.15 0.16 0.33 0.03 0.3 0.41 0.79 1.0 0.45 0.34 0.35 0.37 0.38 0.59 0.73 0.07 0.13 0.07
0.0 0.01 0.0 0.06 0.45 0.14 0.0 1.0 0.86 0.87 0.43 0.34 0.85 0.69 0.45 0.36 0.59 0.83 0.28 0.41
0.0 0.01 0.0 0.06 0.4 0.15 0.0 1.0 0.79 0.86 0.44 0.44 0.42 0.33 0.48 0.37 0.6 0.86 0.63 0.32
0.01 0.02 0.02 0.02 0.07 0.02 0.0 0.77 0.95 1.0 0.05 0.02 0.54 0.12 0.03 0.22 0.46 0.11 0.0 0.0
0.04 0.13 0.19 0.06 0.09 0.0 0.02 0.43 1.0 0.71 0.4 0.34 0.2 0.53 0.28 0.81 0.6 0.1 0.01 0.06
0.06 0.0 0.01 0.3 0.14 0.02 0.0 0.6 1.0 0.66 0.08 0.44 0.39 0.45 0.08 0.38 1.0 0.08 0.0 0.0
0.38 0.38 0.41 0.59 0.51 0.17 0.03 1.0 0.94 0.74 0.83 0.65 0.47 0.43 0.78 0.98 1.0 0.28 0.17 0.07
0.04 0.02 0.03 0.1 0.03 0.01 0.0 0.85 0.8 0.94 0.88 0.68 0.3 0.2 0.61 0.45 1.0 0.07 0.0 0.0
0.03 0.06 0.02 0.03 0.02 0.0 0.05 0.27 0.76 0.37 0.34 0.15 0.52 1.0 0.3 0.67 0.17 0.05 0.02 0.03
0.05 0.0 0.07 0.0 0.04 0.15 0.14 0.42 0.36 0.42 0.15 0.03 0.08 0.03 0.0 0.57 1.0 0.08 0.04 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.24 0.75 0.75 0.56 0.27 0.27 0.35 0.55 1.0 0.85 0.06 0.0 0.09
0.02 0.03 0.15 0.08 0.11 0.17 0.29 0.94 0.85 1.0 0.65 0.85 0.28 0.36 0.31 0.2 0.65 0.08 0.01 0.29
0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.06 0.01 0.32 0.48 0.63 0.03 0.14 0.09 0.03 0.03 0.75 1.0 0.42 0.0 0.0
0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.0 0.35 0.48 0.88 0.03 0.09 0.03 0.01 0.02 0.57 1.0 0.43 0.0 0.0
0.14 0.21 0.18 0.11 0.18 0.05 0.02 0.47 0.8 1.0 0.17 0.13 0.5 0.38 0.14 0.51 0.5 0.05 0.03 0.03
0.0 0.05 0.02 0.05 0.01 0.24 0.0 0.32 0.82 0.77 0.41 0.02 0.72 1.0 0.35 0.54 0.21 0.2 0.0 0.0
0.05 0.0 0.03 0.0 0.01 0.05 0.12 0.38 1.0 0.92 0.44 0.02 0.25 0.02 0.29 0.1 0.11 0.03 0.25 0.04
0.05 0.02 0.05 0.01 0.09 0.01 0.0 0.55 0.99 1.0 0.73 0.62 0.56 0.95 0.66 0.84 0.85 0.18 0.0 0.29
0.01 0.2 0.04 0.03 0.03 0.14 0.15 0.74 0.63 0.55 0.72 1.0 0.52 0.61 0.57 0.58 0.59 0.12 0.83 0.05
0.25 0.26 0.39 0.21 0.11 0.15 0.04 0.53 0.61 0.47 0.52 0.39 0.5 0.59 0.45 1.0 0.65 0.15 0.01 0.02
0.1 0.12 0.15 0.24 0.18 0.14 0.12 0.54 0.58 0.39 0.49 0.52 0.81 0.7 0.46 1.0 0.95 0.2 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.32 0.56 1.0 0.42 0.88 0.0 0.55 0.0 0.31 0.82 0.26 0.18 0.26 0.0
0.01 0.03 0.05 0.01 0.05 0.0 0.0 0.16 0.26 0.44 0.03 0.03 0.1 0.02 0.03 0.62 1.0 0.05 0.02 0.0
0.05 0.01 0.06 0.21 0.23 0.08 0.3 0.76 0.49 0.79 1.0 0.53 0.65 0.47 0.61 0.1 0.92 0.1 0.03 0.15
0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.73 0.0 0.39 0.46 0.76 0.12 0.26 0.04 0.03 0.1 0.58 1.0 0.63 0.0 0.0
0.09 0.05 0.14 0.24 0.21 0.09 0.13 0.77 0.61 0.67 1.0 0.24 0.5 0.35 1.0 0.58 0.54 0.15 0.05 0.16
0.22 0.95 0.64 0.79 0.55 0.33 0.07 0.88 0.81 0.64 1.0 0.49 0.55 0.46 0.88 0.69 0.2 0.21 0.08 0.05
0.19 0.71 0.52 0.67 0.75 0.17 0.05 0.83 0.91 0.85 0.87 0.43 0.81 0.66 0.68 1.0 0.52 0.3 0.1 0.18
0.19 0.86 0.45 0.32 0.4 0.17 0.1 0.72 0.87 0.84 0.76 0.51 0.19 0.3 0.82 1.0 0.45 0.33 0.08 0.18
0.16 0.21 0.35 0.19 0.51 0.13 0.05 0.58 0.53 0.52 1.0 0.37 0.36 0.48 0.81 0.76 0.31 0.13 0.05 0.24
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.25 0.62 0.74 0.49 0.1 0.33 0.36 0.39 1.0 0.56 0.01 0.04 0.02
0.08 0.11 0.07 0.09 0.1 0.08 0.0 0.48 0.69 0.99 0.2 1.0 0.35 0.27 0.14 0.42 0.95 0.21 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.01 0.21 0.22 0.36 0.22 0.24 0.08 0.04 0.2 0.83 1.0 0.01 0.0 0.08
0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.05 0.0 0.38 0.42 0.37 0.04 0.16 0.38 0.21 0.03 0.26 1.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.21 0.0 0.44 0.63 0.72 0.34 0.4 0.23 0.17 0.25 0.67 1.0 0.18 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.16 0.24 0.37 0.02 0.0 0.07 0.03 0.03 0.36 1.0 0.01 0.0 0.0
0.3 0.07 0.23 0.31 0.5 0.14 0.05 0.97 0.72 1.0 0.97 0.99 0.61 0.45 0.71 0.08 0.62 0.18 0.02 0.2
0.01 0.0 0.01 0.15 0.63 0.5 0.0 1.0 0.66 0.86 0.63 0.64 0.27 0.4 0.42 0.38 0.52 0.55 0.13 0.5
0.01 0.0 0.01 0.22 0.78 0.58 0.0 1.0 0.67 0.83 0.52 0.8 0.47 0.54 0.46 0.38 0.61 0.64 0.3 0.44
0.6 0.46 0.56 0.55 0.7 0.24 0.25 0.72 0.52 0.54 0.54 0.42 1.0 0.88 0.5 0.31 0.37 0.45 0.32 0.18
0.07 0.07 0.14 0.07 0.11 0.04 0.01 0.78 0.93 1.0 0.22 0.37 0.36 0.2 0.11 0.7 0.45 0.41 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.25 0.8 0.67 0.37 0.04 1.0 0.99 0.33 0.93 0.72 0.0 0.0 0.0
0.03 0.05 0.01 0.14 0.03 0.02 0.0 0.47 0.6 0.85 0.09 0.15 0.19 0.09 0.07 0.9 1.0 0.02 0.0 0.0
0.04 0.02 0.03 0.05 0.03 0.03 0.0 0.29 0.44 0.71 0.09 0.12 0.11 0.04 0.07 0.31 1.0 0.08 0.0 0.0
0.1 0.04 0.04 0.24 0.13 0.04 0.0 0.53 0.65 0.91 0.26 0.13 0.02 0.01 0.09 0.33 1.0 0.17 0.0 0.01
0.16 0.48 0.2 0.25 0.24 0.1 0.01 0.63 0.46 0.51 0.27 0.37 0.28 0.35 0.16 1.0 0.68 0.63 0.01 0.45
0.1 0.36 0.19 0.06 0.1 0.13 0.01 0.54 0.57 0.41 0.4 0.25 0.55 0.52 0.39 1.0 0.54 0.15 0.03 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.73 1.0 0.08 0.39 0.52 0.2 0.08 0.32 0.45 0.0 0.0 0.0
0.09 0.11 0.08 0.18 0.18 0.19 0.04 0.66 0.48 0.7 0.46 1.0 0.38 0.45 0.48 0.6 0.35 0.23 0.35 0.17
0.22 0.08 0.15 0.25 0.32 0.17 0.01 0.61 0.95 0.84 0.62 0.61 0.5 0.52 0.52 0.75 1.0 0.07 0.01 0.11
0.02 0.02 0.02 0.06 0.07 0.18 0.0 0.23 0.27 0.52 0.04 0.48 0.1 0.1 0.05 0.55 1.0 0.15 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)