Heatmap: Cluster_330 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.17 0.28 0.27 0.13 0.18 0.17 0.48 0.19 0.12 0.11 0.49 0.11 0.12 0.09 0.52 0.07 0.06 0.26 0.3 1.0
0.61 0.51 0.42 0.61 0.68 0.18 0.24 0.34 0.29 0.3 0.3 0.24 0.38 0.33 0.29 0.27 0.27 0.41 0.16 1.0
0.66 0.44 0.92 0.16 0.73 0.45 0.32 0.12 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.89 0.27 1.0
0.42 0.41 0.48 0.46 0.79 0.53 0.4 0.41 0.28 0.26 0.31 0.24 0.17 0.16 0.3 0.24 0.3 1.0 0.65 0.98
0.75 0.7 0.56 0.44 0.82 0.51 0.79 0.4 0.29 0.51 0.32 0.29 0.29 0.31 0.34 0.29 0.31 0.82 0.65 1.0
0.73 0.47 0.46 0.46 0.62 0.37 0.78 0.31 0.22 0.26 0.23 0.36 0.3 0.39 0.18 0.09 0.15 0.71 0.72 1.0
0.23 0.26 0.39 0.51 0.39 0.53 0.68 0.15 0.06 0.07 0.03 0.08 0.03 0.03 0.04 0.04 0.06 0.43 0.77 1.0
0.27 0.17 0.21 0.57 0.54 0.22 0.27 0.04 0.02 0.02 0.08 0.09 0.02 0.02 0.07 0.04 0.06 0.09 1.0 0.96
0.42 0.51 0.33 0.31 0.81 0.15 0.41 0.19 0.16 0.24 0.33 0.14 0.07 0.09 0.27 0.12 0.16 0.63 0.73 1.0
0.62 0.34 0.67 0.92 0.75 1.0 0.38 0.45 0.2 0.24 0.35 0.23 0.2 0.19 0.31 0.11 0.26 0.84 0.38 1.0
0.35 0.31 0.22 0.15 0.36 0.19 0.33 0.08 0.09 0.1 0.06 0.09 0.03 0.05 0.07 0.13 0.2 0.29 0.28 1.0
0.3 0.37 0.31 0.4 0.37 0.33 0.35 0.17 0.09 0.1 0.2 0.15 0.02 0.02 0.15 0.17 0.15 0.22 0.19 1.0
0.68 0.63 0.57 0.75 0.69 0.41 0.45 0.38 0.3 0.3 0.37 0.26 0.42 0.43 0.37 0.46 0.4 0.65 0.67 1.0
0.16 0.15 0.17 0.14 0.25 0.18 0.49 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.04 0.19 0.3 1.0
0.21 0.08 0.11 0.06 0.11 1.0 0.08 0.04 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.11 0.02 1.0
0.62 0.82 0.8 0.38 0.65 0.05 0.37 0.13 0.06 0.08 0.04 0.14 0.02 0.03 0.1 0.1 0.34 0.44 0.92 1.0
0.39 0.68 0.59 0.39 0.45 0.09 0.22 0.12 0.06 0.06 0.03 0.14 0.04 0.05 0.05 0.12 0.14 0.29 0.36 1.0
0.36 0.34 0.53 0.31 0.39 0.02 0.15 0.1 0.01 0.01 0.0 0.04 0.01 0.01 0.01 0.03 0.05 0.44 0.46 1.0
0.36 0.36 0.44 0.42 0.78 0.08 0.69 0.34 0.14 0.11 0.22 0.47 0.16 0.17 0.2 0.11 0.09 0.86 0.42 1.0
0.38 0.85 1.0 0.39 0.87 0.09 0.54 0.47 0.1 0.12 0.21 0.39 0.23 0.14 0.21 0.13 0.09 0.94 0.46 0.9
0.98 0.38 0.59 0.44 0.43 0.78 0.02 0.34 0.12 0.14 0.17 0.15 0.1 0.08 0.14 0.1 0.16 0.61 0.11 1.0
0.44 0.37 0.44 0.36 0.35 0.11 0.36 0.21 0.11 0.12 0.09 0.15 0.17 0.16 0.11 0.09 0.11 0.37 0.66 1.0
0.69 0.44 0.48 0.4 0.51 0.16 0.06 0.13 0.02 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.04 0.07 0.76 0.18 1.0
0.6 0.51 0.73 0.51 0.49 0.17 0.54 0.2 0.09 0.11 0.15 0.11 0.06 0.03 0.11 0.04 0.15 0.33 0.69 1.0
0.85 0.36 0.4 0.7 1.0 0.29 0.44 0.45 0.28 0.31 0.3 0.19 0.25 0.21 0.3 0.45 0.4 0.69 0.52 0.67
0.09 0.02 0.05 0.01 0.03 1.0 0.09 0.04 0.01 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.05 0.01 0.03 0.11 0.1 0.86
0.41 0.14 0.26 0.59 0.96 1.0 0.14 0.28 0.12 0.14 0.19 0.22 0.12 0.14 0.21 0.14 0.34 0.35 0.21 0.84
0.2 0.24 0.13 0.18 0.18 0.87 0.32 0.1 0.05 0.04 0.04 0.12 0.03 0.04 0.05 0.04 0.05 0.17 0.08 1.0
0.32 0.56 0.48 0.4 0.47 0.16 0.11 0.15 0.17 0.22 0.28 0.23 0.15 0.16 0.3 0.11 0.1 0.32 0.24 1.0
0.22 1.0 0.17 0.7 0.61 0.06 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.02 0.43
0.22 0.13 0.14 0.28 0.32 0.43 0.23 0.17 0.06 0.08 0.19 0.1 0.1 0.12 0.23 0.05 0.09 0.31 0.52 1.0
0.37 0.84 0.52 0.46 0.91 0.04 0.67 0.03 0.03 0.02 0.02 0.05 0.01 0.02 0.02 0.04 0.02 0.3 0.8 1.0
0.42 0.57 0.29 0.51 0.79 1.0 0.45 0.38 0.25 0.26 0.49 0.25 0.38 0.37 0.5 0.25 0.26 0.78 0.7 0.69
0.23 0.11 0.21 0.31 0.3 0.25 0.09 0.13 0.03 0.03 0.06 0.03 0.0 0.01 0.06 0.12 0.11 0.53 0.26 1.0
0.56 0.35 0.3 0.41 0.6 0.26 0.49 0.31 0.17 0.16 0.31 0.19 0.28 0.29 0.32 0.15 0.19 0.58 0.59 1.0
0.55 0.48 0.39 0.31 0.51 0.31 0.39 0.25 0.14 0.14 0.16 0.16 0.17 0.13 0.17 0.13 0.16 0.6 0.63 1.0
0.29 0.36 0.34 0.61 0.45 0.35 1.0 0.3 0.09 0.08 0.11 0.12 0.09 0.09 0.1 0.1 0.14 0.43 0.43 0.77
0.32 0.37 0.28 0.17 0.31 0.44 0.34 0.12 0.02 0.03 0.03 0.09 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.58 0.11 1.0
0.96 0.5 0.65 0.41 0.77 0.07 0.38 0.25 0.14 0.14 0.35 0.25 0.2 0.13 0.27 0.16 0.15 0.43 0.21 1.0
0.5 0.48 0.56 0.54 1.0 0.05 0.0 0.17 0.08 0.07 0.05 0.02 0.1 0.05 0.04 0.05 0.04 0.58 0.11 0.11
0.92 0.39 0.79 0.52 0.5 0.79 0.39 0.35 0.21 0.21 0.27 0.2 0.16 0.12 0.25 0.22 0.26 0.48 0.23 1.0
1.0 0.53 0.71 0.88 0.67 0.16 0.2 0.47 0.34 0.31 0.55 0.46 0.26 0.27 0.42 0.4 0.34 0.33 0.24 0.97
0.51 0.64 0.39 0.16 1.0 0.25 0.53 0.27 0.24 0.2 0.29 0.22 0.09 0.14 0.52 0.37 0.17 0.92 0.81 0.94
0.53 0.31 0.4 0.69 0.62 0.33 0.26 0.27 0.18 0.24 0.16 0.2 0.15 0.18 0.2 0.24 0.17 0.67 0.82 1.0
0.8 0.43 0.43 0.63 1.0 0.37 0.44 0.5 0.34 0.32 0.48 0.35 0.35 0.35 0.52 0.45 0.45 0.86 0.84 0.97
0.85 1.0 0.69 0.68 0.84 0.69 0.63 0.43 0.4 0.43 0.37 0.35 0.23 0.23 0.34 0.63 0.56 0.93 0.9 0.96
0.79 0.21 0.34 0.91 0.56 0.03 0.12 0.11 0.02 0.03 0.06 0.06 0.01 0.03 0.04 0.03 0.1 0.49 0.46 1.0
0.73 0.25 0.44 0.44 0.41 0.04 0.12 0.12 0.03 0.05 0.06 0.05 0.01 0.01 0.06 0.06 0.11 0.53 0.75 1.0
0.91 0.45 1.0 0.62 0.43 0.69 0.41 0.18 0.17 0.07 0.09 0.07 0.05 0.05 0.14 0.2 0.15 0.59 0.41 0.79
1.0 0.19 0.85 0.35 0.82 0.08 0.23 0.15 0.14 0.18 0.06 0.07 0.08 0.07 0.06 0.23 0.16 0.85 0.29 0.9
0.18 0.24 0.17 0.25 0.49 0.47 0.6 0.17 0.07 0.06 0.27 0.2 0.09 0.08 0.17 0.24 0.3 0.59 0.9 1.0
0.59 0.45 0.42 0.52 0.73 0.15 0.25 0.26 0.15 0.15 0.15 0.17 0.19 0.17 0.17 0.17 0.18 0.53 0.33 1.0
0.46 0.74 0.39 0.26 0.53 0.38 0.49 0.21 0.15 0.14 0.16 0.17 0.38 0.36 0.14 0.13 0.12 0.56 0.59 1.0
0.83 0.86 0.83 0.8 1.0 0.74 0.36 0.44 0.17 0.17 0.19 0.2 0.32 0.28 0.18 0.15 0.19 0.76 0.49 0.91
0.41 0.69 0.38 0.3 0.59 0.55 0.46 0.32 0.24 0.23 0.27 0.32 0.26 0.23 0.32 0.29 0.27 0.87 0.67 1.0
0.86 1.0 0.93 1.0 0.7 0.87 0.48 0.31 0.14 0.14 0.18 0.17 0.22 0.18 0.22 0.13 0.18 0.68 0.85 0.82
0.35 0.23 0.33 0.21 0.62 0.41 0.22 0.15 0.12 0.12 0.16 0.1 0.07 0.08 0.15 0.13 0.2 0.34 0.21 1.0
0.22 0.11 0.08 0.14 0.24 0.14 0.11 0.12 0.05 0.08 0.26 0.13 0.19 0.16 0.26 0.02 0.05 0.2 0.35 1.0
0.36 0.12 0.11 0.1 0.13 0.93 0.22 0.13 0.06 0.04 0.01 0.06 0.09 0.07 0.05 0.03 0.06 0.25 0.19 1.0
0.29 0.2 0.15 0.18 0.23 0.7 0.17 0.21 0.15 0.17 0.28 0.15 0.1 0.08 0.28 0.15 0.16 0.3 0.45 1.0
0.59 0.46 0.41 0.62 0.75 1.0 0.51 0.49 0.43 0.44 0.66 0.42 0.65 0.65 0.66 0.29 0.33 0.84 0.7 0.96
0.5 0.3 0.36 0.67 0.94 0.56 0.28 0.23 0.12 0.14 0.16 0.18 0.07 0.07 0.19 0.18 0.26 0.87 0.64 1.0
0.91 0.76 0.58 0.64 0.75 0.33 0.75 0.38 0.38 0.33 0.54 0.5 0.29 0.29 0.56 0.48 0.4 0.47 0.38 1.0
0.31 0.09 0.17 0.36 0.5 0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.22 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)