Heatmap: Cluster_201 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
38.35 13.83 26.07 56.93 33.76 27.04 14.11 27.47 11.86 18.06 45.13 18.4 19.71 12.98 40.02 6.54 24.59 14.98 20.22 354.12
41.56 1.83 9.37 3.74 1.56 2.81 3.12 1.23 0.96 0.56 1.57 3.55 0.29 0.19 1.39 0.64 0.38 9.21 4.48 190.72
2.46 2.01 1.1 0.27 0.0 2.9 3.1 8.95 1.02 1.23 0.92 1.42 5.1 4.59 0.24 0.05 0.56 0.73 1.87 240.54
8.15 0.15 2.3 0.44 1.76 20.36 1.43 5.91 2.68 3.29 4.07 9.56 6.54 5.34 3.2 0.7 7.14 8.38 21.95 90.94
1.76 2.46 2.07 1.15 1.92 0.99 3.01 1.45 1.68 2.1 3.95 0.93 1.07 1.28 3.69 0.69 0.63 3.0 4.94 26.25
5.3 1.37 1.39 0.19 0.47 2.86 0.15 0.57 0.07 0.03 0.0 0.16 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.66 1.19 32.0
6.25 1.19 1.23 0.3 0.06 0.73 0.11 0.45 0.04 0.1 0.03 0.25 0.09 0.05 0.03 0.0 0.0 0.42 1.08 15.72
0.31 0.0 0.07 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 4.28
4.06 2.18 1.63 3.25 3.2 2.71 3.43 3.09 1.33 2.53 2.29 1.82 0.92 0.59 2.39 1.16 2.03 8.14 1.76 52.77
121.06 65.37 89.06 51.31 56.09 102.87 41.88 53.65 27.99 25.37 33.91 52.81 37.63 38.42 32.28 20.0 31.89 82.98 71.38 404.77
9.96 0.47 1.59 0.04 0.08 1.26 0.19 0.29 0.15 0.12 0.18 0.92 0.06 0.14 0.08 0.05 0.01 0.11 0.05 47.92
39.68 7.04 14.77 6.72 7.54 6.63 6.63 2.87 2.26 2.66 2.44 4.38 2.34 1.68 2.83 0.88 1.97 14.95 6.14 125.04
12.89 5.92 7.46 2.46 7.12 2.94 2.21 4.82 2.81 2.69 5.8 3.27 5.49 4.31 5.07 2.0 2.1 9.32 3.37 43.0
514.36 166.42 400.5 65.42 121.4 288.89 59.32 146.18 86.92 101.28 239.4 86.54 24.95 35.79 197.79 54.81 43.22 565.14 141.58 2059.94
10.08 0.19 0.95 0.28 0.22 2.69 1.86 0.19 0.17 0.17 0.03 0.39 0.04 0.25 0.0 0.07 0.17 0.43 0.49 29.82
1.22 0.23 0.45 0.0 0.33 2.15 0.53 1.65 1.01 0.67 0.73 1.64 0.35 0.38 0.67 3.61 6.35 9.3 3.31 36.97
44.28 8.3 29.73 18.13 16.28 34.68 2.66 13.13 4.65 3.33 7.74 8.9 2.67 2.54 5.92 4.94 9.25 24.23 20.23 101.56
14.42 6.2 6.51 3.06 6.77 43.93 13.07 11.66 3.49 5.03 5.87 11.26 5.2 6.66 5.25 2.58 5.23 17.82 8.95 173.34
9.6 7.94 2.63 1.52 5.61 35.03 21.16 2.8 0.1 0.18 0.13 5.0 0.1 0.27 0.24 0.48 0.55 1.51 0.18 216.01
17.89 0.33 8.44 3.47 3.69 8.25 2.58 3.83 1.91 2.45 2.27 6.07 0.37 0.46 1.06 0.27 1.24 31.81 5.81 99.52
0.21 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 5.53
2.89 0.0 1.94 0.16 0.85 0.32 0.0 0.08 0.25 0.37 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 19.39 5.45 67.04
118.38 28.74 144.15 7.71 44.47 29.26 3.18 15.02 5.09 4.35 1.77 12.35 1.08 3.48 7.77 2.5 0.7 218.0 20.06 1211.71
0.43 0.0 0.0 1.06 1.26 1.15 0.06 1.34 1.21 1.37 1.84 0.95 0.95 0.88 2.28 1.55 1.01 4.84 4.63 33.94
13.89 4.38 2.66 7.92 14.59 64.56 22.24 17.72 6.7 6.77 25.04 11.69 9.94 10.81 32.41 6.77 7.12 18.42 5.65 227.11
18.0 0.0 2.58 0.18 0.93 1.27 0.25 1.23 1.29 1.15 0.96 1.4 0.12 0.23 0.49 0.04 0.31 10.69 5.42 109.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.06 0.04 0.11 0.03 0.0 0.06 0.05 0.0 0.09 0.04 0.0 0.09 0.17 11.39
0.95 0.0 0.53 0.0 0.05 0.58 0.27 0.42 0.2 0.24 0.17 0.62 0.1 0.22 0.04 0.07 0.02 0.81 0.14 14.86
26.31 10.75 21.17 9.82 6.92 0.15 0.26 2.71 0.3 0.07 0.03 0.74 0.03 0.08 0.0 4.41 3.64 10.5 0.58 148.32
13.69 4.01 8.69 6.02 13.2 5.54 4.55 11.43 8.39 7.54 8.51 13.05 13.65 14.12 7.96 5.51 9.16 11.34 9.25 98.6
2.64 0.22 0.58 0.2 0.25 1.72 0.77 0.11 0.27 0.19 0.4 0.11 0.1 0.05 0.36 0.2 0.23 1.53 1.56 10.85
1.12 0.38 0.24 0.68 0.33 0.63 1.24 0.44 0.55 0.68 0.45 0.36 0.47 0.37 0.53 0.96 0.63 0.23 0.09 8.58
35.14 12.26 29.24 31.72 37.41 17.02 43.46 12.04 6.53 7.59 4.21 9.12 4.54 3.99 4.25 3.3 9.39 46.14 19.27 323.93
44.52 8.65 16.06 15.46 18.06 40.66 50.74 12.38 6.82 6.98 11.81 9.24 2.61 3.86 12.38 8.64 12.52 50.13 41.64 465.62
0.38 0.48 0.07 1.58 2.64 0.07 0.0 2.97 5.12 2.81 0.2 0.46 0.52 0.42 0.31 3.21 2.61 2.44 0.09 44.44
14.1 6.62 9.74 4.83 6.86 1.51 0.69 4.03 3.07 3.19 3.95 2.03 1.4 2.47 4.25 1.28 1.55 17.96 2.66 80.9
2.48 0.18 0.99 0.17 0.65 0.14 1.54 1.73 0.86 0.84 0.55 2.88 0.31 0.5 0.56 0.06 0.0 2.03 1.22 127.85
1.1 0.94 0.32 0.0 0.06 0.15 0.05 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.36 0.35 4.69
90.49 14.05 22.78 18.51 27.59 44.13 22.17 48.02 14.15 14.04 15.15 39.57 17.83 20.08 10.75 5.22 10.09 66.96 61.71 710.78
35.71 0.23 9.15 0.5 4.09 5.39 0.98 3.06 3.83 3.53 0.46 4.39 0.35 0.74 0.33 0.44 0.18 45.01 6.5 305.56
8.77 0.0 3.04 0.16 0.27 0.47 0.24 0.65 1.05 0.69 0.0 0.88 0.11 0.11 0.0 0.08 0.17 8.66 1.86 61.51
110.45 25.06 64.12 23.81 31.46 78.44 32.53 52.44 25.89 28.98 27.7 37.34 16.98 16.42 20.18 10.31 24.33 103.64 94.33 686.2
5.16 0.45 8.33 0.3 0.44 0.05 3.27 0.76 0.03 0.07 0.42 0.35 0.1 0.13 0.26 0.38 0.1 14.68 4.13 77.48
24.25 19.22 20.23 8.48 13.95 2.66 0.86 6.95 6.62 6.59 7.54 12.49 3.02 2.96 4.87 7.53 9.24 4.65 4.29 59.32
8.91 3.9 8.74 5.88 10.24 1.95 1.9 10.0 6.95 7.04 5.43 7.92 6.43 3.99 5.54 3.39 5.16 43.88 10.54 252.63
3.44 1.35 1.06 4.29 6.74 15.0 6.5 3.48 1.8 1.72 4.55 2.03 2.42 2.26 5.74 1.39 1.09 9.23 9.15 64.93
0.05 0.0 0.0 0.32 0.11 0.0 0.06 0.07 0.0 0.23 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.19 0.06 2.0
15.26 1.97 3.15 1.18 1.59 9.98 3.92 5.03 3.53 3.69 5.68 3.03 3.25 1.92 4.88 0.81 0.98 23.27 12.55 165.9
3.13 0.31 0.31 0.12 0.25 0.19 0.13 0.03 0.06 0.11 0.0 0.4 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 1.1 0.02 11.46
0.99 0.0 0.07 0.42 0.48 0.76 0.86 0.39 0.23 0.26 0.19 1.66 0.03 0.07 0.12 0.0 0.18 1.08 0.31 12.73
9.16 2.91 8.63 3.68 6.06 10.32 0.56 3.22 1.04 1.14 0.5 2.05 0.18 0.27 0.52 0.89 3.54 12.64 5.16 66.8
0.13 0.0 0.0 0.0 0.18 2.2 0.0 0.16 0.03 0.23 0.08 0.09 0.03 0.06 0.16 0.0 0.0 0.81 0.56 9.71
9.65 0.45 1.31 0.0 0.41 0.0 0.37 0.32 0.23 0.36 0.26 0.62 0.06 0.0 0.04 0.16 0.1 2.41 0.92 38.11
0.23 0.2 0.13 0.0 0.71 4.39 0.08 0.47 0.34 0.26 0.53 0.86 0.25 0.22 0.39 0.01 0.07 2.35 2.41 18.97
176.07 25.23 78.46 98.4 73.8 35.84 16.23 54.26 14.07 17.04 21.04 30.47 27.49 28.73 19.68 12.68 35.05 165.06 39.41 942.42
10.96 0.62 3.35 0.12 1.26 0.53 0.22 0.27 0.16 0.19 0.0 2.15 0.01 0.01 0.03 0.0 0.08 5.01 0.16 56.52
2.77 0.06 0.29 0.06 0.6 0.2 0.02 0.05 0.13 0.09 0.01 0.49 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.31 0.17 17.67
52.96 21.44 28.72 14.83 14.75 32.57 15.67 25.59 21.65 21.4 22.22 13.63 23.32 17.26 18.8 11.95 9.01 62.14 24.89 256.02
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 3.31
22.05 0.4 0.91 0.4 0.46 0.53 0.76 2.09 1.8 2.09 2.22 1.04 1.49 1.54 1.95 0.9 0.97 1.14 0.73 56.81
21.95 0.48 14.71 0.0 2.48 4.4 0.88 2.72 2.78 2.07 1.79 3.13 0.0 0.0 1.69 0.09 0.0 28.93 19.15 232.41
1.77 3.06 0.24 0.36 0.29 3.41 0.56 0.93 0.98 1.5 0.15 1.35 0.81 1.22 0.0 0.72 3.67 3.14 4.2 58.75
6.63 0.0 0.5 0.0 1.43 1.6 0.04 0.7 0.79 0.69 0.19 0.15 0.08 0.1 0.12 0.0 0.15 23.63 29.38 232.3
52.03 0.1 3.69 0.15 1.66 3.15 0.22 1.76 0.92 0.81 0.34 1.89 0.13 0.49 0.52 0.27 1.54 10.27 5.3 237.12
72.58 0.48 4.36 4.31 3.84 43.9 2.52 4.42 0.79 0.76 0.21 2.71 0.09 0.2 0.62 0.41 0.34 45.0 20.51 410.43
5.81 0.29 0.59 1.52 1.19 15.33 0.29 3.36 0.49 0.51 0.16 0.58 0.03 0.12 0.61 0.31 0.12 43.4 28.07 297.35
14.51 29.68 2.55 0.61 1.07 21.17 9.91 4.48 6.15 8.22 3.74 11.98 5.64 11.14 3.0 2.28 24.23 7.01 9.09 305.81
4.37 1.34 4.44 3.28 4.17 0.52 1.2 1.08 0.47 0.58 0.07 1.04 0.07 0.11 0.08 3.81 3.88 4.84 1.72 58.66
7.09 2.12 3.69 2.67 2.61 4.33 0.72 1.42 0.34 0.28 0.18 0.29 0.18 0.19 0.29 1.35 1.11 4.21 4.11 37.94
2.28 0.01 0.17 0.2 0.16 0.13 0.06 0.06 0.14 0.13 0.01 1.36 0.01 0.02 0.0 0.03 0.05 0.25 0.1 11.97
2.69 3.89 2.74 0.3 1.68 1.95 2.68 2.4 2.45 2.47 1.51 3.29 2.35 2.41 1.1 0.67 1.3 3.99 2.05 57.25
8.99 0.06 3.48 0.17 0.55 0.16 0.05 0.08 0.09 0.17 0.07 0.09 0.0 0.0 0.04 0.0 0.07 16.82 5.17 109.6
15.54 0.14 4.11 0.1 1.46 0.45 0.0 0.26 0.69 0.66 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 18.87 11.86 243.12
270.95 58.42 161.89 161.04 102.01 67.15 56.81 152.4 57.87 61.35 67.02 133.8 93.21 118.71 50.47 44.99 62.27 300.52 170.64 1184.2
6.49 0.04 1.32 3.19 0.18 1.63 0.07 1.36 1.13 0.55 0.22 0.53 0.74 1.59 0.16 1.25 0.83 0.41 0.38 37.17
15.12 2.18 3.16 0.37 4.67 79.8 7.24 101.36 24.12 29.8 77.93 123.2 19.78 27.63 36.65 0.91 13.95 19.41 24.77 3161.56
1.06 0.05 0.55 0.26 0.68 7.29 1.06 1.04 0.41 0.57 0.32 0.69 0.23 0.29 0.34 0.11 0.48 2.76 2.36 76.88
49.51 6.12 10.78 6.56 12.33 5.41 7.45 1.51 0.09 0.07 0.04 0.38 0.06 0.12 0.17 2.45 0.46 18.92 7.92 184.55
4.3 0.05 0.15 0.0 0.09 0.36 0.09 0.48 0.12 0.37 0.1 2.73 0.04 0.11 0.11 0.0 0.0 1.77 0.1 50.16
5.43 0.2 0.51 0.1 0.22 0.08 0.21 0.87 0.08 0.24 0.06 1.47 0.05 0.28 0.05 0.0 0.0 1.16 0.5 61.01
5.4 4.61 8.87 1.91 17.93 5.06 4.86 0.94 0.73 0.7 1.86 1.04 0.73 0.66 1.7 0.57 1.43 1.63 1.46 122.99
5.58 0.85 1.54 1.13 2.21 35.73 6.73 3.52 1.43 1.52 0.97 4.9 1.63 3.83 0.9 0.79 2.83 24.53 10.18 160.11
38.3 2.96 13.2 16.43 18.97 15.93 5.03 19.65 5.04 5.62 23.73 37.69 5.44 8.13 19.43 3.07 6.27 41.89 49.74 337.9
1.61 0.18 1.23 0.18 0.9 14.65 0.0 0.53 0.85 1.06 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.55 0.35 3.83 0.58 24.42
18.03 4.93 8.37 22.43 5.53 22.73 0.68 4.56 0.25 0.23 0.37 0.69 0.14 0.26 0.2 0.18 0.4 33.74 8.17 189.4
14.23 21.57 17.52 11.11 9.47 3.62 2.05 8.4 6.69 6.72 6.9 3.89 3.56 4.42 5.51 7.59 7.49 22.2 8.87 84.96
50.52 3.39 23.07 4.06 7.72 11.88 3.3 3.19 1.83 1.65 1.28 3.91 0.24 0.33 1.7 0.54 1.12 47.83 22.07 279.57
37.43 2.44 23.76 1.28 3.15 6.75 3.46 1.8 1.79 2.33 0.41 12.09 0.23 0.47 0.27 0.08 1.03 15.02 2.88 363.75
27.67 6.73 15.71 3.54 6.17 92.03 3.64 23.87 9.1 9.16 2.96 34.69 2.06 2.58 3.36 3.64 11.06 22.86 9.26 418.83
26.62 15.26 18.48 19.81 17.85 22.36 22.18 13.74 9.9 9.51 6.71 12.03 6.93 6.96 6.11 8.92 8.44 13.02 4.69 113.11
0.51 0.1 0.33 1.14 2.22 0.19 0.57 0.4 0.04 0.0 0.14 0.47 0.23 0.26 0.28 0.01 0.13 1.97 0.54 16.75
27.64 10.94 12.67 18.21 20.44 43.67 23.2 19.04 10.33 10.51 23.48 17.25 16.93 14.31 22.22 10.55 14.3 18.92 22.0 192.9
38.61 21.57 23.19 20.44 27.93 60.04 21.05 32.84 13.58 12.86 29.58 19.47 23.38 21.99 31.16 9.73 16.19 36.85 38.47 203.01
0.06 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.25 0.0 0.0 0.07 0.49 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 13.21
4.46 5.96 3.01 5.77 3.33 1.23 3.8 9.76 9.85 13.83 14.92 7.75 12.4 7.16 12.8 3.44 7.56 5.93 4.29 77.62
1.93 0.13 0.15 0.2 0.37 0.07 0.05 0.1 0.09 0.06 0.01 0.38 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.51 0.22 12.04
1.76 0.25 1.19 0.67 0.8 2.95 0.06 1.78 1.34 1.42 1.53 1.26 0.95 0.76 1.45 1.73 2.28 3.61 2.76 55.82
5.38 1.21 2.3 1.24 1.23 0.11 2.21 0.11 0.25 0.23 0.38 0.35 0.0 0.08 0.42 0.17 1.17 0.11 0.14 31.6
39.22 4.73 45.94 2.69 8.19 1.77 72.94 1.48 0.2 0.17 0.34 2.56 0.16 0.2 0.44 0.44 0.56 18.45 10.27 437.91
47.83 25.05 87.49 53.08 9.79 7.77 0.87 8.15 3.13 4.0 1.13 34.01 3.98 3.83 0.76 0.15 0.57 23.92 6.59 315.32
27.9 5.19 15.8 12.97 7.48 12.27 3.95 8.71 5.18 3.88 13.53 5.0 5.52 4.9 12.11 5.93 4.66 7.87 2.63 118.83
3.14 1.65 1.54 3.3 4.41 3.42 2.9 4.47 3.22 3.47 6.68 2.72 6.6 4.63 6.99 2.54 2.78 9.96 11.42 66.0
5.32 0.91 2.18 2.59 1.52 3.22 3.04 2.67 1.71 1.79 1.73 2.9 1.25 1.79 2.4 6.33 1.56 3.42 4.14 25.82
4.33 1.94 2.99 4.24 6.17 8.56 10.32 2.53 0.15 0.5 0.11 0.7 0.03 0.62 0.14 0.38 0.25 7.68 3.72 99.43
53.89 15.44 64.14 11.59 15.53 9.37 1.71 7.71 4.52 2.42 1.37 6.21 0.59 2.03 5.32 0.45 1.0 84.86 27.57 827.6
29.81 2.22 21.15 11.97 6.35 27.29 3.31 4.2 2.87 2.83 0.56 0.71 0.08 0.13 0.24 8.47 8.22 25.07 10.9 180.67
2.07 2.17 2.77 0.14 2.9 29.8 0.79 1.89 0.35 0.77 0.09 1.07 0.28 0.7 0.04 0.45 1.52 1.59 0.33 290.44
7.04 0.77 0.18 0.14 0.18 0.96 0.41 0.3 0.19 0.15 0.13 0.19 0.16 0.68 0.11 0.0 0.0 0.28 0.07 23.53
10.42 2.7 5.35 1.8 1.5 29.82 5.26 6.31 1.3 1.58 0.87 1.81 1.52 2.25 0.47 0.1 1.05 1.48 2.09 95.38
111.09 21.98 107.83 5.6 54.27 25.61 3.26 12.31 3.71 3.31 2.36 15.05 1.97 4.52 15.22 1.51 1.2 111.95 6.43 953.43
1.64 0.56 0.51 0.03 0.17 0.11 0.1 0.19 0.13 0.18 0.0 0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.08 0.14 0.15 5.99
6.91 0.0 0.0 1.13 0.37 3.53 0.05 4.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 9.92 9.92 119.84
0.35 0.28 0.08 0.06 1.93 12.12 0.16 1.13 0.94 0.64 1.22 1.75 0.28 0.31 0.5 0.06 0.03 5.72 7.05 43.04
0.28 0.0 0.13 0.06 0.03 0.03 0.2 0.03 0.02 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 1.8
9.41 0.08 0.44 0.16 0.13 0.33 0.7 1.01 0.15 0.19 0.44 0.6 1.7 0.99 0.61 0.15 0.18 0.54 0.09 46.64

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)