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Heatmap: Cluster_223 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.52 0.25 -0.14 0.47 0.71 -0.47 -0.42 -0.08 -0.32 -0.52 0.06 -0.62 -0.55 -0.72 0.05 0.23 -0.23 0.19 0.68 -0.42
0.23 -1.11 -1.46 0.53 0.5 -1.17 -0.79 -0.52 -0.43 -0.49 -0.03 -1.16 -0.21 -0.55 0.18 0.86 0.35 -0.13 1.62 -0.36
0.84 0.01 0.23 0.53 0.57 -0.21 -0.42 -0.12 -0.3 -0.58 0.21 -0.73 -0.41 -0.59 0.2 -0.12 -0.27 -0.07 0.3 -0.25
1.17 -0.95 -0.46 1.08 0.63 -1.91 -0.63 -0.51 -0.35 -0.56 0.23 -1.06 -0.38 -0.35 0.1 0.88 0.28 -0.15 -0.58 -0.21
0.89 -0.07 -0.25 0.54 0.42 -0.93 -0.76 -0.3 -0.32 -0.46 0.36 -1.11 -0.93 -1.21 0.45 0.53 -0.14 0.29 0.69 -0.22
0.17 -0.64 -0.86 0.13 0.25 -0.56 -0.32 0.04 -0.23 -0.16 0.52 -0.61 0.29 0.01 0.54 0.03 -0.0 0.19 0.18 0.11
0.65 -0.34 -0.03 0.45 0.7 -0.25 -0.19 0.05 -0.49 -0.45 -0.43 -0.54 0.37 0.09 -0.39 -0.76 -0.85 0.68 0.36 -0.15
0.78 -0.04 -0.15 0.39 0.61 -0.31 -0.37 -0.1 -0.3 -0.32 0.13 -0.94 -0.46 -0.8 0.09 0.25 -0.04 0.27 0.44 -0.43
0.33 -1.01 -0.62 0.61 0.74 -0.78 -0.36 -0.53 0.01 -0.19 0.39 -0.87 -0.63 -0.29 0.23 0.69 0.03 0.15 -0.16 0.41
0.66 -1.39 -1.17 0.27 0.82 -0.84 0.56 -0.44 -0.57 -1.1 -0.03 -1.14 -0.29 -0.19 0.1 0.32 -0.18 0.5 0.35 0.77
0.67 0.32 -0.39 0.39 0.94 -0.77 -0.82 -0.25 -0.11 -0.46 -0.32 -0.91 -0.37 -0.27 -0.24 0.37 -0.7 0.21 0.64 0.17
0.69 -0.53 -1.29 0.35 1.09 -0.18 -0.67 -0.25 -0.41 -0.63 0.12 -0.81 -0.02 -0.25 -0.46 -0.34 -0.6 0.29 1.2 -0.08
0.49 0.42 -0.81 0.66 0.82 -0.7 -1.09 -0.07 -0.52 -0.55 0.05 -0.87 -1.02 -0.96 -0.09 0.03 -0.36 0.17 1.29 0.02
0.4 0.01 -1.51 -0.37 0.79 -1.68 -0.96 -0.13 -0.2 -0.59 0.43 -1.13 -0.21 0.29 -0.11 0.33 0.23 0.36 0.87 0.25
0.62 -0.37 -0.45 0.37 0.47 -0.63 -0.94 -0.16 -0.21 -0.21 0.5 -0.77 0.14 -0.31 0.38 0.23 -0.27 0.16 0.38 -0.23
0.93 -0.54 -0.15 0.63 0.63 -1.13 -0.79 -0.06 -0.04 -0.2 0.64 -1.09 -1.02 -0.82 0.58 0.44 -0.32 0.26 0.29 -1.25
0.32 -0.08 -0.19 0.69 0.71 0.01 -0.3 -0.05 -0.36 -0.46 -0.04 -1.01 -0.23 -0.32 -0.05 -0.17 -0.35 0.64 0.01 0.09
0.21 -0.21 -0.27 0.25 0.36 -0.02 -0.27 -0.01 -0.24 -0.32 -0.16 -0.71 -0.14 -0.1 -0.14 -0.14 -0.14 0.39 0.55 0.46
-0.27 -0.24 -0.89 -0.09 0.49 -0.43 -0.25 0.21 0.01 -0.07 0.88 -0.5 -0.61 -0.74 0.9 -0.07 -0.24 -0.58 0.45 0.33
0.12 -0.45 -0.67 0.61 0.81 -0.48 -0.82 0.18 -0.65 -0.78 -0.15 -0.69 0.68 0.52 -0.05 -0.54 -1.0 0.06 0.74 0.26
0.29 -0.87 -1.08 0.34 0.42 -0.33 -0.74 -0.12 -0.14 -0.22 0.56 -0.79 -0.09 -0.32 0.6 0.16 -0.17 0.52 0.07 0.35
0.86 0.25 -0.05 0.8 0.41 -0.77 -0.52 -0.44 -0.5 -0.6 0.34 -1.3 -1.17 -1.71 0.32 0.37 0.17 -0.16 0.74 -0.12
1.15 -0.43 -0.45 1.12 0.35 -0.3 -0.38 -0.48 -0.47 -0.74 -0.19 -1.05 -0.49 -0.72 -0.09 0.27 -0.45 -0.05 1.0 -0.48
0.8 -0.58 0.01 0.26 1.41 -0.04 -0.59 -0.0 -0.64 -0.73 -0.32 -0.75 0.38 0.2 -0.17 -1.08 -1.08 -0.07 0.58 -0.48
0.77 0.02 -0.07 0.74 1.39 0.02 -0.54 -0.18 -0.82 -0.68 -0.23 -0.8 -0.62 -0.63 -0.2 -1.72 -1.47 0.12 1.12 -0.41
0.65 0.02 -0.04 1.02 0.97 0.18 -0.75 -0.2 -1.02 -1.09 -0.51 -1.02 0.4 0.04 -0.31 -1.8 -1.89 0.0 1.3 -0.95
0.4 -0.34 -0.74 0.52 0.71 -0.21 -0.35 -0.13 -0.52 -0.57 0.37 -0.78 -0.67 -0.97 0.34 -0.08 -0.42 -0.03 1.05 0.33
0.39 0.14 -0.32 0.42 0.29 -0.31 -0.42 -0.19 -0.16 -0.13 0.5 -0.92 -0.73 -1.04 0.51 -0.04 -0.24 0.21 0.75 -0.19
1.05 -0.16 -0.04 0.7 0.45 -0.05 -0.37 -0.35 -0.43 -0.59 0.2 -0.94 -0.46 -0.59 0.29 0.01 -0.26 0.12 0.26 -0.44
0.78 -0.54 0.01 0.4 0.42 -0.17 -0.53 -0.22 -0.6 -0.42 0.81 -0.47 -1.09 -1.23 0.83 -0.47 -0.45 0.19 0.42 -0.0
0.44 -0.15 -0.05 0.51 0.32 -0.42 -0.6 -0.26 -0.2 -0.26 0.64 -0.95 -0.56 -0.72 0.55 0.06 -0.04 0.17 0.45 -0.28
0.89 -0.07 0.0 0.67 0.51 0.33 -0.52 -0.22 -0.66 -0.83 0.1 -0.98 -0.35 -0.75 0.12 -0.4 -0.7 0.33 0.61 -0.03
0.92 -0.74 -0.36 0.71 0.49 -0.02 -0.29 -0.28 -0.47 -0.69 0.44 -1.04 -0.36 -0.52 0.41 0.02 -0.41 0.15 0.11 0.15
0.82 -1.18 -0.38 0.81 0.55 -0.47 -0.23 -0.41 -0.2 -0.39 0.48 -0.94 -0.22 -0.22 0.26 0.27 -0.13 0.09 -0.79 0.33
-0.05 -1.39 -1.35 -0.31 0.96 0.33 -0.49 -0.03 -0.28 -0.34 0.31 -0.33 -0.37 -0.33 0.34 -0.28 -0.08 1.24 0.49 -0.88
0.81 0.66 -0.04 0.65 0.76 0.36 -0.55 -0.12 -0.87 -0.85 0.06 -0.93 -1.01 -1.29 0.03 -0.94 -0.91 0.01 1.22 -0.83
0.98 -0.18 -0.46 1.01 0.78 -2.27 -0.63 -0.68 -0.45 -0.97 0.29 -1.2 -4.71 -3.61 0.05 0.82 -0.6 1.04 0.28 0.55
0.78 0.53 -0.17 1.07 0.64 -2.31 -0.82 -0.76 -0.5 -1.04 -0.22 -1.16 -4.13 -2.5 0.32 0.71 -1.18 1.01 -0.0 0.9
0.99 -0.35 -0.23 0.98 0.96 -1.95 -1.03 -0.69 -0.72 -1.09 -0.04 -1.58 -2.11 -1.88 0.13 0.77 -0.86 0.73 0.55 0.79
0.58 -0.69 -0.66 0.25 0.43 -0.41 -0.73 0.03 -0.34 -0.4 0.82 -0.53 -0.59 -1.0 0.85 0.09 -0.19 0.3 0.29 -0.03
0.36 -0.14 -0.03 0.77 1.11 -0.0 -0.44 -0.22 -0.63 -0.58 0.19 -0.77 -0.2 -0.62 0.3 -1.31 -0.89 -0.59 0.57 0.57
0.24 -0.26 -0.53 0.22 0.64 -0.63 -0.53 -0.1 -0.3 -0.51 0.08 -0.48 0.32 0.19 0.14 -0.21 0.19 0.02 0.68 -0.14
0.45 0.05 0.52 0.5 0.71 -0.19 -0.12 -0.17 -0.59 -0.63 -0.78 -0.95 -0.84 -0.69 -0.87 -0.6 -0.22 0.57 0.68 0.76
0.57 0.07 -0.12 0.36 0.64 -0.31 -0.36 -0.3 -0.31 -0.44 0.16 -0.84 -0.4 -0.57 0.2 0.03 -0.45 0.15 0.68 0.04
0.65 -0.41 -0.04 0.47 0.72 -0.19 -0.56 -0.24 -0.68 -0.67 0.53 -0.52 0.21 0.18 0.45 -1.14 -0.71 0.16 0.51 -0.68
0.75 0.07 0.63 0.19 0.92 0.92 -0.32 -0.43 -2.14 -1.91 -0.69 -1.96 -2.06 -1.47 -0.36 -2.07 -1.35 -0.05 1.95 0.06
0.91 -0.09 -0.12 0.47 0.63 -1.67 -0.71 -0.4 -0.38 -0.56 0.1 -1.04 0.43 0.19 0.12 -0.17 -0.79 -0.49 1.15 -0.6
0.58 -0.32 -0.42 0.52 0.3 -0.59 -0.89 -0.11 -0.64 -0.64 0.84 -1.06 -0.58 -1.09 0.84 0.07 -0.25 0.2 0.97 -0.56
0.68 -0.2 0.24 0.81 0.65 -0.1 -1.06 -0.17 -0.46 -0.41 0.16 -0.6 -0.26 -0.49 0.28 -0.28 0.04 -0.0 0.19 -0.48
0.54 -1.49 -1.59 0.78 1.06 -0.81 -0.94 -0.44 -0.6 -0.83 -0.06 -1.15 -0.53 -0.47 -0.08 0.65 0.21 0.09 1.35 -0.18
0.55 -0.44 0.03 0.52 0.44 -0.9 -0.67 -0.22 -0.23 -0.36 0.54 -0.74 0.01 -0.01 0.5 -0.52 -0.94 0.73 -0.5 0.36
0.7 -0.59 -0.46 0.66 0.57 -0.87 -0.8 -0.04 -0.2 -0.45 0.41 -0.36 -0.1 -0.25 0.41 0.0 -0.29 0.23 0.17 -0.16
0.27 0.19 -0.34 0.15 -0.05 -0.62 -0.88 -0.14 -0.04 -0.04 0.54 -0.61 -0.54 -0.75 0.42 0.44 -0.02 -0.14 0.99 -0.36
0.31 -0.37 -0.21 0.53 0.67 0.26 -0.56 -0.07 -0.48 -0.64 0.21 -0.82 -0.33 -0.51 0.2 -0.84 -0.36 0.79 0.29 0.32
0.22 -0.49 -0.65 0.14 0.45 -0.81 -1.14 -0.08 -0.1 -0.19 0.54 -0.58 -0.25 -0.32 0.58 0.29 -0.15 0.12 0.68 0.21
0.46 -0.77 -0.22 0.14 0.25 -0.21 -0.59 -0.21 -0.45 -0.51 0.66 -0.56 -0.29 -0.66 0.55 -0.36 -0.33 0.32 0.12 0.99
0.7 -0.0 0.27 0.95 0.46 -0.79 0.2 -0.44 -0.33 -0.57 0.28 -1.25 -0.97 -0.94 0.27 0.33 -0.13 -0.04 -0.13 -0.0
0.78 -0.93 -0.21 0.66 0.87 -0.27 -0.54 -0.09 -0.45 -0.42 0.28 -0.86 0.09 -0.08 0.26 -0.41 -0.6 0.16 0.46 -0.57
0.29 -0.4 -0.56 0.23 0.14 -0.41 -0.23 -0.22 -0.51 -0.48 0.94 -0.74 -0.38 -0.46 0.95 0.28 -0.11 -0.06 0.41 -0.27
0.57 -1.08 -0.79 0.87 0.91 -0.43 0.03 -0.48 -0.43 -0.53 0.13 -0.95 -0.24 -0.07 0.02 -0.12 -0.23 0.43 -0.27 0.56
-0.2 -1.0 -1.53 0.06 0.07 -0.5 -0.28 -0.21 0.05 -0.06 0.68 -0.62 0.2 0.05 0.69 0.3 -0.15 0.22 0.53 0.01
0.77 0.69 0.01 0.36 0.81 -0.94 -0.98 -0.75 -0.48 -0.62 0.26 -0.93 -1.56 -1.21 0.64 -0.25 -0.5 -0.02 1.03 0.03
0.72 -0.11 0.27 0.43 0.6 -0.11 -0.63 -0.14 -0.43 -0.57 0.5 -0.59 -0.33 -0.55 0.41 -0.14 -0.35 0.06 -0.14 -0.07
0.45 -1.1 -0.75 0.47 0.35 -0.03 0.25 0.17 -0.16 -0.41 -0.01 -0.62 -0.47 -0.67 0.09 -0.36 -0.6 0.47 0.98 0.16
0.66 -0.68 -0.41 0.34 0.54 -0.12 -0.86 0.01 -0.4 -0.43 0.61 -0.9 0.23 -0.1 0.58 -0.53 -0.75 0.24 0.53 -0.36
0.22 -0.27 -0.15 0.16 0.67 -0.03 -0.14 -0.15 -0.54 -0.58 0.35 -0.71 -0.16 -0.13 0.3 -0.41 -0.57 0.37 0.4 0.36
1.14 -0.41 -0.18 0.57 0.52 -0.18 -0.47 -0.22 -0.33 -0.66 0.18 -0.92 -0.15 -0.46 0.04 0.12 -0.48 -0.02 0.47 -0.21
0.95 -0.25 -0.29 -0.16 0.42 -0.24 0.08 -0.36 -0.7 -0.84 0.19 -1.47 0.09 -0.01 0.32 -1.26 -0.88 -0.05 1.39 -0.05
0.67 0.3 0.02 0.6 0.9 -0.16 -0.06 -0.38 -0.71 -0.95 -0.87 -0.21 -0.69 -0.72 -1.03 -0.79 -0.36 0.05 0.69 0.93
0.02 -0.12 -0.59 0.09 0.73 -0.61 -0.67 0.06 -0.15 -0.29 0.15 -0.59 0.11 -0.16 0.27 -0.2 -0.33 0.38 0.65 0.19
0.68 -0.65 -0.07 0.48 0.89 -1.28 -0.12 -0.36 -0.34 -0.56 0.36 -0.92 -0.6 -0.71 0.28 -0.16 -0.23 0.27 0.19 0.67
0.58 -0.04 0.06 0.67 0.74 -1.39 -0.13 -0.36 -0.21 -0.53 0.23 -0.82 -0.59 -0.5 0.03 -0.37 -0.53 0.32 0.51 0.39
0.87 -0.88 -0.24 0.88 0.78 -1.0 -0.02 -0.4 -0.27 -0.59 0.09 -0.78 -0.74 -0.66 0.15 -0.17 -1.17 0.4 0.5 0.53
0.73 -0.46 -0.69 0.9 0.81 -0.78 -0.33 -0.38 -0.61 -0.61 0.06 -0.56 -0.38 -0.26 0.55 -0.74 -0.59 0.3 0.36 0.43
0.85 -0.24 -0.48 0.93 0.7 -0.79 -0.21 -0.39 -0.63 -0.52 -0.31 -0.83 -0.32 -0.7 -0.08 -0.98 -0.17 0.0 1.1 0.35
0.62 0.24 -0.61 0.56 0.68 -0.44 -0.35 -0.41 -0.87 -0.66 -0.0 -0.45 0.12 0.13 -0.1 -0.59 -0.4 0.13 0.84 -0.09
0.27 -0.24 -0.42 0.55 0.51 -0.59 -0.62 0.02 -0.32 -0.34 0.36 -0.63 -0.2 -0.31 0.38 0.1 -0.24 0.47 0.29 -0.06
0.58 -0.07 -0.13 0.72 0.58 -1.34 -0.61 -0.24 -0.28 -0.37 0.65 -0.87 -0.69 -1.06 0.54 -0.13 -0.25 -0.09 0.84 -0.26
0.64 -1.17 -0.3 0.76 -0.01 -1.13 -1.3 0.14 -0.37 -0.34 0.33 -0.75 0.41 0.26 0.21 -0.5 -0.46 -0.07 0.46 0.74
0.75 -0.09 -0.11 0.88 0.57 -0.88 -0.73 -0.37 -0.21 -0.32 0.46 -0.88 -0.45 -0.56 0.52 -0.34 -1.19 0.23 0.22 0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.