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Heatmap: Cluster_166 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.06 -0.54 -0.54 0.13 0.02 0.14 -0.43 0.28 -0.2 -0.32 0.46 -0.53 0.64 0.6 0.42 -0.29 -0.18 -0.39 -0.03 -0.27
0.2 -0.62 -0.48 -0.36 -0.27 -0.4 -0.23 0.26 0.19 -0.07 0.5 -0.51 0.55 0.49 0.43 0.69 -0.27 -0.88 -0.1 -0.46
0.17 0.62 0.49 -0.07 0.35 -2.81 -1.36 0.21 0.55 0.45 0.62 -0.54 0.6 0.17 0.33 0.16 -0.33 -0.88 -2.02 -1.47
-3.17 -5.52 -2.84 -3.98 -3.6 -1.36 1.53 -0.07 -0.29 -1.54 1.1 -1.03 -0.03 0.33 1.09 1.67 1.09 -1.32 0.11 -1.25
-3.16 -4.03 -4.61 -2.49 -4.5 -1.45 1.64 -0.01 0.19 -0.57 0.91 -0.94 0.47 0.99 0.77 1.57 0.44 -0.86 -0.7 -1.6
0.1 0.72 0.09 0.6 0.12 -0.26 0.61 0.05 -0.17 -0.47 -0.1 -0.35 0.16 0.11 0.12 -0.25 0.08 -0.37 -1.37 -0.89
-1.66 -0.98 -1.73 -0.93 0.08 -1.35 0.24 -0.22 0.58 0.76 -0.03 -0.62 -0.48 -0.35 0.25 0.74 1.29 -0.11 0.38 -0.01
-0.31 - -2.36 - -0.29 -2.16 1.79 0.84 -0.82 0.28 0.38 - 1.77 1.06 -0.47 0.25 - -2.52 -0.71 0.53
-1.7 -0.51 -0.82 -1.19 -0.19 0.6 0.91 0.93 0.52 0.5 0.32 0.16 0.01 -0.67 0.11 -0.61 0.48 -0.83 -0.24 -1.22
0.1 1.1 0.54 0.11 0.18 -1.78 -2.15 0.65 0.54 0.42 0.05 -0.82 0.79 -0.15 -0.2 -1.03 -0.09 -0.07 -2.42 -0.8
-1.05 -0.57 -0.86 -0.69 -0.36 -0.23 0.17 0.11 -0.03 0.28 1.01 -0.36 0.77 0.55 1.11 -1.16 -1.02 -0.36 0.22 -0.65
-0.59 -0.1 -0.06 -0.06 -0.35 -0.65 -0.59 0.42 0.19 0.05 0.58 -0.74 0.99 0.43 0.55 -0.42 -0.46 -0.13 0.09 -0.89
-1.36 -0.75 -1.83 -0.79 0.24 -1.25 -0.38 0.22 0.19 0.16 1.15 -0.3 0.45 0.38 1.06 0.05 -0.36 0.14 -0.42 -0.15
0.58 -0.99 -0.24 0.3 0.26 -1.07 -0.13 0.27 0.17 -0.03 -0.02 -0.49 0.28 0.04 -0.22 0.58 0.32 -0.65 0.19 -0.49
-1.77 -1.06 -1.22 -2.05 -0.87 -0.51 -1.42 0.58 0.39 0.51 1.36 -0.65 0.34 0.07 1.61 -0.13 -0.29 -0.58 0.08 -0.57
-2.02 -3.07 -2.16 -3.27 -1.04 -0.47 -1.57 0.21 0.55 0.42 1.84 -0.78 0.46 0.3 1.89 -0.04 -0.9 -1.26 -1.15 -0.06
-0.32 0.6 -0.57 -0.05 0.29 -0.58 0.57 0.49 -0.22 -0.27 0.84 0.33 -0.3 -0.58 0.76 -0.09 -0.16 -0.43 -1.12 -1.65
-0.16 0.17 -0.79 -0.77 -0.52 -0.07 0.77 0.39 0.2 -0.06 0.69 -0.22 -0.67 -0.97 0.74 0.28 -0.01 -0.79 0.29 -0.43
-1.47 -0.67 -1.27 -0.89 0.21 -0.9 -0.06 0.41 -0.18 0.06 0.47 0.14 0.26 0.62 0.28 0.09 1.06 -1.27 0.8 -1.29
-0.85 -0.07 -1.23 -1.02 -0.22 -0.71 -0.57 0.49 0.26 -0.26 0.8 -0.63 0.42 0.45 0.77 0.36 0.33 -0.4 0.28 -0.56
-0.09 -0.39 -0.74 -0.66 -0.08 0.04 0.14 0.16 0.21 0.05 0.34 -0.05 0.87 0.74 0.37 -0.34 -0.89 -0.34 0.09 -1.08
-0.35 -0.09 -0.44 -0.7 -0.5 -0.32 0.42 0.31 0.18 0.07 0.4 -0.41 -0.28 -0.33 0.32 0.59 0.54 -0.23 0.22 -0.44
-0.05 0.05 -0.66 0.66 0.4 -1.2 -0.66 0.39 -0.05 -0.21 0.04 -1.06 0.78 0.22 0.06 -0.57 -0.5 0.35 0.45 -0.33
-0.74 -0.46 -0.86 -0.29 -0.89 -1.24 1.11 0.2 0.34 0.32 0.68 -0.47 1.12 0.83 0.82 0.12 -0.31 -2.28 -2.2 -2.66
0.03 0.09 -0.05 -0.21 -0.54 -0.35 -0.95 0.34 0.34 0.18 0.35 -0.31 -0.08 -0.21 0.31 0.21 0.38 -0.04 -1.14 0.49
-0.07 0.5 -0.53 -0.11 -0.06 -0.31 -0.61 0.49 -0.48 -0.45 0.85 -0.3 0.81 0.31 0.74 -0.78 -0.73 -0.38 -0.11 -0.77
-0.31 -0.23 -0.71 -0.11 -0.21 0.16 0.07 0.42 0.19 -0.03 0.69 -0.56 0.29 -0.03 0.62 -0.06 -0.44 -0.49 -0.1 -0.06
-3.13 - - -0.75 -10.17 - -4.54 -0.0 -1.83 -1.16 2.74 -4.57 0.35 0.19 2.78 -1.76 -0.73 -3.09 -2.18 -1.75
-1.72 -0.49 -1.55 -1.37 -0.27 -0.61 0.58 0.09 0.26 0.36 0.8 -0.58 0.28 0.18 1.03 0.01 -0.63 0.19 0.35 -0.22
-1.63 -0.73 -1.76 -1.12 -0.33 -0.99 0.3 0.17 0.01 0.1 1.06 -0.89 0.72 0.49 1.29 -0.36 -0.91 -0.05 0.51 -0.37
-1.13 -1.47 -0.28 -0.69 -1.65 -0.76 0.65 0.67 0.53 0.29 0.2 -0.89 0.4 -0.07 0.42 0.16 -0.01 0.14 -0.15 0.67
0.12 -0.06 -0.6 0.07 -0.01 0.37 -0.23 0.21 -0.09 -0.29 -0.01 -0.11 0.49 0.33 -0.07 -0.62 -0.6 0.17 0.06 0.26
0.17 -0.17 -0.46 -0.22 0.51 -0.57 -0.05 0.42 -0.22 -0.39 0.33 -0.56 0.91 0.47 0.29 -1.24 -1.19 -0.14 0.75 -0.99
-0.52 0.42 -0.44 -0.18 -0.19 -0.45 0.38 -0.06 0.06 0.0 0.23 -1.07 0.98 0.69 0.33 -0.16 -0.57 -0.42 -0.08 -0.53
0.05 -0.14 -0.52 0.2 -0.58 -1.1 0.49 0.12 0.33 0.03 0.71 -0.99 -0.62 -0.86 0.8 0.56 -0.48 -0.4 0.52 -0.27
0.38 0.51 -0.08 0.14 0.07 0.21 -0.03 0.01 -0.28 -0.34 0.03 -0.58 -0.39 -0.81 0.25 -0.8 -0.29 0.11 0.71 0.15
-0.64 -0.36 -0.19 -0.79 -0.29 -0.04 1.02 0.44 0.25 0.49 0.1 0.09 0.17 0.04 0.07 -0.75 0.19 -0.54 -0.68 -0.06
-0.33 -0.25 -1.21 -1.59 -0.96 -1.92 1.08 0.14 0.72 0.79 0.37 -1.36 0.33 -0.32 0.33 -0.04 -1.87 -0.51 1.18 0.03
0.04 -0.64 -0.1 0.25 0.3 -1.9 0.17 0.09 0.07 -0.02 1.14 -0.57 -0.24 -0.47 0.99 -0.39 -0.91 0.62 -1.0 -0.45
-0.28 -0.09 0.12 0.15 -0.04 -1.66 1.27 -0.16 0.54 0.29 -0.03 -0.55 0.29 -0.22 0.25 0.07 -0.3 -0.61 -0.38 -0.85
-0.11 -0.01 -0.07 -0.47 0.01 -0.83 -0.04 -0.0 0.11 -0.01 0.52 -0.18 0.02 0.01 0.46 -0.31 0.29 -0.17 0.03 0.19
-0.19 0.72 0.49 -0.66 -0.09 -0.47 0.56 -0.29 0.26 -0.15 0.27 -0.74 -0.2 -0.31 -0.11 0.12 -1.03 -0.35 1.04 -0.84
-0.25 1.18 0.15 -0.17 0.11 -1.54 0.72 0.59 -0.15 0.45 0.13 0.57 0.15 -0.42 -0.05 -1.41 -1.0 -0.16 -1.92 -0.75
-1.64 -0.78 -1.4 -0.79 -0.93 -2.12 -0.18 0.1 0.94 0.88 0.72 -0.52 0.57 0.33 0.77 0.23 -0.28 0.03 0.04 -0.26
0.6 0.94 0.63 -0.98 0.46 0.5 1.14 -0.53 -0.33 -0.29 0.31 -1.13 -0.68 -1.0 0.01 -0.63 -0.59 -0.63 -0.12 -0.94
-0.94 0.39 -1.14 -0.98 -0.66 -0.64 1.23 -0.15 0.18 0.1 0.95 -0.39 -0.1 -0.46 0.85 -0.3 -0.75 -0.55 0.45 -0.22
-0.09 - - - -0.04 - -0.89 0.88 1.28 2.16 0.77 -0.45 0.77 -1.7 -0.38 - - 0.64 0.27 -0.28
-1.98 -2.81 -2.87 -2.63 -0.48 -0.28 0.58 0.76 0.47 0.44 1.18 -0.52 0.16 -0.41 1.26 -0.33 -0.54 0.01 0.57 -0.63
-1.03 0.2 -1.17 -1.33 -0.09 -0.01 -0.0 -0.17 0.31 0.19 0.45 -0.39 0.43 0.15 0.68 0.25 -0.7 0.16 0.34 -0.08
-3.84 -3.76 -2.51 -1.75 -4.47 -0.11 1.05 0.94 0.79 0.69 0.88 -0.03 0.79 0.64 1.46 -1.61 -0.12 -3.5 -1.08 -1.32
-3.49 -3.03 -2.2 -2.77 -3.43 -0.18 1.25 0.78 0.93 0.97 1.19 0.3 -0.12 -0.45 1.39 -1.5 0.0 -3.75 -0.46 -0.87
-1.12 -0.25 -1.41 -1.36 -0.46 -0.97 0.86 -0.52 0.62 0.63 1.12 -1.01 0.13 -0.22 1.14 0.41 -0.1 -1.1 -0.45 -0.3
0.48 0.21 -0.18 0.04 0.24 -0.2 -0.33 0.12 -0.31 -0.44 -0.05 -0.76 0.28 0.05 0.14 -0.48 -0.43 0.15 0.91 -0.47
0.24 0.88 0.35 0.48 -0.01 -0.52 -0.63 0.1 -0.66 -0.8 -0.03 -1.0 0.7 0.58 0.19 -1.02 -0.9 0.01 0.38 -0.66
-1.45 -0.57 -1.67 -1.01 -1.33 0.04 0.92 -0.18 0.21 0.11 0.93 -1.03 0.64 0.4 1.16 0.13 -0.4 -0.87 0.22 -0.6
-0.5 -0.53 -0.62 -0.62 -0.82 -0.75 0.66 0.0 0.35 0.2 0.69 -0.39 -0.03 0.14 0.56 0.56 0.63 -0.86 -0.07 -0.56
0.19 0.12 -0.79 0.16 0.16 0.13 0.88 0.12 0.32 -0.14 -0.12 -1.51 0.66 0.35 0.06 -0.71 -1.2 -0.26 0.47 -1.48
-0.13 -1.1 -0.6 -1.56 -0.84 -1.03 1.26 0.28 0.01 -0.02 -0.32 -1.25 0.98 1.05 0.98 -0.7 -0.78 -1.21 0.41 -0.39
-0.37 -1.01 -0.78 0.24 -0.3 -0.85 1.49 -0.02 0.38 0.36 0.33 -1.32 0.17 0.26 0.6 -0.15 -1.66 0.06 -0.08 -0.94
-0.3 -0.1 -0.08 0.02 0.36 -1.24 -0.12 0.24 -0.0 0.06 1.02 -0.38 0.37 0.16 1.0 -0.81 -1.85 -0.56 0.05 -0.55
-0.17 -1.15 -1.22 -0.97 0.05 -0.38 0.33 0.09 -0.07 -0.24 0.71 -0.44 0.61 0.66 0.53 -0.13 -0.06 0.09 -0.4 0.25
0.03 -0.27 -0.85 -0.16 0.16 -0.16 -0.11 0.15 0.14 0.08 0.31 -0.7 0.82 0.63 0.25 -0.35 -0.69 -0.12 -0.04 -0.24
-0.71 -1.7 -2.35 -0.54 -0.85 -0.81 0.8 0.16 0.26 -0.25 0.64 -0.62 1.18 1.01 0.84 0.62 0.08 -0.9 -3.95 -0.51
-0.94 0.03 -0.48 -0.23 -0.97 -1.03 -0.11 0.09 0.3 0.02 0.34 -0.15 0.86 0.67 0.41 0.64 0.06 -0.81 0.18 -1.1
-0.24 0.41 -0.37 0.17 -0.35 -0.76 0.7 0.07 0.26 0.03 0.75 -0.56 0.14 -0.4 0.72 -0.23 -0.38 -0.83 -0.14 -0.51
0.01 -0.52 -0.67 -0.45 0.09 -0.67 0.08 0.62 0.09 -0.12 0.62 0.0 0.27 0.11 0.63 -0.6 -0.31 0.27 -0.0 -0.71
-1.26 -0.16 -1.25 -1.17 -1.31 -0.79 0.66 0.3 0.17 0.16 1.12 -0.38 0.64 0.29 1.12 -0.46 -0.0 -1.45 0.1 -0.45
0.1 0.35 0.38 0.23 -0.18 -1.31 0.46 -0.16 0.48 0.3 0.37 -0.7 0.23 0.04 0.43 0.32 -1.02 -0.77 -0.27 -1.39
-0.41 -0.42 -0.9 -1.08 -0.61 -0.08 0.95 0.93 -0.12 -0.45 1.26 -0.62 -0.71 -1.12 1.11 -0.56 0.05 -1.3 -0.08 0.09
-0.08 -0.09 -0.3 -0.75 -0.15 -0.77 0.8 -0.24 0.19 -0.12 0.61 -0.59 0.09 0.19 0.53 0.28 -0.01 -0.58 0.05 -0.3
-0.75 -0.46 -1.61 -1.1 -0.54 -1.15 1.73 -0.24 0.26 0.11 0.75 -0.93 0.03 -0.55 0.87 0.4 -0.76 -0.72 0.33 -0.33
-1.47 -1.32 -1.7 -1.59 -1.82 -3.5 1.43 0.1 0.45 0.34 0.5 -0.01 0.67 0.53 0.57 -0.07 -0.16 -0.19 0.11 0.15
-0.73 -0.43 -0.96 -0.66 -0.46 0.14 -0.14 0.46 0.03 0.0 0.64 0.02 0.43 0.33 0.61 -0.13 -0.7 -0.63 0.91 -0.74
0.37 0.38 0.22 -0.71 -0.26 -1.44 0.49 0.39 0.35 0.21 0.57 -0.18 0.09 -0.32 0.42 -0.81 -0.53 -1.08 -0.44 0.3
-3.27 - - - -2.11 -1.93 -0.18 0.15 0.35 0.63 0.25 -1.86 0.66 0.35 1.66 2.19 0.7 -1.43 -1.49 -2.35
-3.57 - - - - - 0.04 0.82 0.9 0.91 1.43 -0.79 -0.43 -0.93 2.0 1.38 -0.84 -1.84 -0.09 -1.24
-0.11 0.9 0.16 -1.73 -0.27 -3.16 1.62 -0.2 0.4 -0.24 -0.59 -0.82 -0.57 -0.82 -0.34 -0.21 -0.46 0.09 0.76 0.15
-1.09 -0.24 -1.51 -0.52 0.22 -0.97 -0.23 0.42 0.36 0.11 0.8 0.03 0.57 0.63 0.68 0.13 -0.13 -0.32 -0.52 -0.98
-2.78 -3.06 -2.21 -2.9 -3.49 -1.22 1.5 0.18 -0.53 -1.26 1.16 -1.17 0.36 0.52 1.12 1.41 0.54 -0.52 0.27 -2.15
-0.31 -0.49 -0.99 -0.22 0.18 -0.98 -0.17 0.4 0.2 -0.07 1.1 -0.38 0.41 0.1 1.01 -0.04 -0.37 -0.23 -0.39 -1.09
-0.46 -0.82 -0.79 -0.62 0.07 -0.67 -0.28 0.29 0.07 0.02 0.36 -0.17 0.52 0.34 0.37 0.03 0.21 0.06 0.18 0.26
-1.98 -1.1 -1.76 -1.33 -1.55 -1.75 0.73 0.03 0.61 0.37 0.7 -0.67 0.72 0.88 0.98 0.65 -0.18 -0.75 0.26 -1.0
0.31 0.72 0.04 -0.33 0.45 -0.41 0.05 -0.07 -0.54 -0.47 -0.08 -0.24 0.25 -0.3 0.06 -0.86 -0.62 0.15 0.41 0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.