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Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
- - - - - 2.91 3.64 - - - - - - - - - - -7.16 - -
0.68 0.35 0.4 0.15 0.46 -0.65 0.24 -0.47 -0.54 -0.54 0.32 -1.0 -0.31 -0.64 0.37 -0.38 -0.68 0.11 0.37 0.2
1.42 -0.7 0.19 0.72 0.57 0.16 1.14 -0.4 -0.73 -1.06 -0.33 -1.48 -1.12 -1.07 -0.37 -0.77 -1.77 0.13 0.14 0.42
1.33 -0.25 0.26 0.97 0.28 -0.14 0.89 -0.29 -0.7 -1.11 -0.68 -1.58 -0.05 0.06 -0.63 -1.13 -2.1 -0.03 0.54 -0.19
1.12 0.06 0.31 0.97 0.61 0.34 0.9 -0.44 -1.06 -1.56 -0.74 -1.26 -2.0 -1.88 -0.5 -1.09 -1.93 0.38 1.06 0.01
- - - 0.65 -0.9 - 3.99 -3.78 - - - -3.0 - - - - - - 0.83 -
-0.3 -1.15 -1.2 -0.35 0.11 0.46 0.56 0.08 0.33 0.17 0.73 -0.84 -0.04 -0.27 0.7 -0.2 -0.25 -0.18 0.43 -0.82
-4.66 - -3.7 - - -0.26 4.06 -4.67 -5.3 - - - -3.28 - -3.88 -2.19 - - 0.65 -1.34
0.32 0.42 0.48 0.45 0.44 -0.44 0.66 -0.19 -0.37 -0.23 0.37 -0.69 -0.41 -0.59 0.32 -0.66 -0.86 -0.33 -0.12 0.02
1.42 0.12 0.73 0.75 -0.43 -5.45 2.86 -0.74 -6.28 -5.14 -4.81 -4.21 -7.04 -4.85 -5.52 -4.45 -6.21 1.59 -1.21 -0.83
0.24 0.72 0.05 0.31 0.54 -0.54 0.63 -0.21 -0.54 -0.44 -0.35 -0.54 -0.77 -1.12 -0.34 -0.95 -0.78 0.3 0.93 0.45
- - - 3.85 - - 2.41 -2.02 - - - - - - - - - - - -
0.96 1.43 0.6 0.06 -0.03 -0.45 0.55 -0.93 -0.22 -0.59 -0.55 -1.42 -0.56 -0.59 -0.59 -0.28 -1.06 -0.09 -0.21 0.49
- - - - - 2.32 3.9 -4.08 - - - - - - - - - - - -
0.08 0.13 -0.1 -0.15 -0.18 -0.19 1.06 -0.17 0.11 -0.04 0.28 -0.87 0.09 -0.38 0.31 -0.26 -0.15 -0.49 -0.31 0.19
-2.41 -4.8 -5.8 - -5.77 -4.17 4.08 -4.97 - - -5.98 -6.34 - -6.39 -6.03 - - - -3.2 1.34
0.96 0.18 0.31 0.91 0.52 -0.43 0.12 -0.16 -0.4 -0.57 -0.09 -0.95 -0.92 -1.06 -0.19 -0.47 -0.69 0.02 0.89 -0.58
0.69 0.07 -0.01 0.34 0.14 -0.73 0.77 -0.27 -0.2 -0.36 0.45 -0.9 -0.42 -0.76 0.46 0.25 -0.31 -0.34 -0.02 -0.34
0.66 1.27 0.46 0.48 0.3 -0.5 0.45 -0.42 -0.49 -0.79 -0.1 -1.02 -1.04 -1.63 0.2 -0.19 -0.77 -0.21 0.61 -0.59
1.07 0.05 0.22 0.03 0.5 -1.42 0.78 -0.31 -0.49 -0.14 0.31 -0.88 -1.08 -1.37 0.5 -0.58 -0.45 -0.25 0.5 0.05
0.3 -0.26 -0.58 0.17 0.06 -0.26 0.29 -0.04 -0.32 -0.42 0.56 -0.54 -0.26 -0.79 0.51 -0.07 -0.06 -0.24 0.42 0.49
0.99 -0.01 0.55 0.87 0.5 -1.07 -0.15 -0.23 -0.44 -0.58 -0.08 -1.08 0.01 -0.08 -0.03 -0.61 -0.65 -0.15 0.28 -0.15
0.25 0.24 -0.07 -0.53 0.29 -1.21 0.38 -0.28 0.14 0.19 0.14 -0.4 0.45 0.26 0.27 0.15 -0.29 -0.41 -0.01 -0.58
-0.18 -1.32 -0.53 -0.4 -2.01 -1.52 4.04 -4.09 - - - -5.38 -5.35 -5.57 - - - -4.12 -3.56 -
0.27 0.4 -0.39 0.15 0.36 -0.76 0.76 -0.27 -0.38 -0.35 0.24 -1.05 -0.1 -0.34 0.38 -0.11 -1.04 -0.0 0.69 -0.11
0.22 -0.35 -0.31 0.55 0.57 0.07 0.78 -0.02 -0.24 -0.52 -0.14 -0.86 0.32 0.12 -0.18 -0.44 -0.83 -0.25 0.41 -0.23
0.14 0.59 -0.77 -0.12 0.23 -0.08 0.94 -0.44 -0.37 -0.41 0.4 -1.1 -0.62 -1.22 0.47 0.03 -0.58 -0.24 0.7 0.25
0.81 0.34 0.15 0.51 0.65 -1.07 0.82 -0.34 -0.42 -0.4 -0.2 -1.21 -0.54 -0.74 -0.23 -0.24 -0.82 0.05 0.41 0.17
0.69 0.94 0.39 0.34 0.43 -0.36 0.83 -0.48 -0.36 -0.61 -0.34 -1.28 -0.08 -0.22 -0.18 0.06 -0.65 -0.3 -0.74 -0.21
0.15 1.13 -0.43 -0.64 -0.19 -0.06 1.57 -0.58 -0.47 -0.61 -0.91 -1.42 0.02 -0.11 -0.55 -0.98 -2.14 -0.28 1.18 0.16
0.17 0.5 -0.5 -0.25 -0.01 0.04 1.77 -0.72 -0.1 -0.21 -0.63 -1.41 -0.44 -0.27 -0.48 -0.44 -1.49 -0.43 0.61 0.49
- - - - - - 2.31 - - - - - - - - - - - - 3.91
-0.23 1.5 -0.55 -0.43 -0.5 -0.59 0.88 -0.55 0.24 0.09 0.54 -1.04 -3.33 -3.01 0.78 0.26 -1.11 -0.64 0.81 -0.32
-0.51 0.73 -1.66 -1.03 -0.15 -1.74 0.89 -0.4 0.09 0.07 1.11 -1.08 0.06 -0.25 1.25 0.64 -1.43 -0.77 -0.18 -0.68
0.5 0.67 -0.18 0.21 0.46 -0.55 0.95 -0.41 -0.66 -0.88 0.23 -0.89 -0.78 -0.79 0.06 -0.32 -0.73 0.31 0.59 -0.04
- - - - - - 4.32 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.32 - - - - - - - - - - - - -
-4.32 -3.19 -4.36 -0.65 -2.19 -3.15 3.42 -1.75 - - - - - - - - -2.27 2.64 0.39 -4.44
0.83 0.39 -0.08 0.71 0.27 -1.04 0.45 -0.45 -0.35 -0.61 0.28 -1.52 -0.62 -0.98 0.32 -0.38 -1.08 -0.61 1.22 -0.13
0.19 0.32 -0.57 0.18 0.65 0.23 0.9 -0.56 -0.42 -0.58 -0.35 -1.13 -0.14 -0.32 -0.38 -0.77 -1.26 0.14 1.11 0.15
-0.13 -0.53 -0.48 -0.1 -0.2 0.07 0.57 -0.11 0.13 -0.01 0.45 -0.39 0.04 -0.15 0.35 -0.56 -0.49 -0.11 0.74 -0.01
-0.48 -1.92 -2.09 1.79 -2.0 -0.56 -0.08 -0.09 - -2.34 - - - - - - -2.97 2.73 2.13 0.27
0.23 -0.09 0.29 0.28 -0.01 0.1 0.52 -0.17 -0.94 -1.04 -0.22 -0.71 -0.5 -0.6 -0.07 -0.38 -0.61 0.52 1.24 0.07
0.55 0.34 0.0 0.45 0.36 -0.47 0.18 -0.45 -0.64 -0.85 0.26 -1.02 -0.41 -0.71 0.19 -0.06 -0.4 -0.14 0.92 0.15
1.05 -0.02 0.3 0.66 0.71 -0.81 0.36 -0.45 -0.59 -0.79 0.13 -1.06 -1.32 -1.56 0.08 -0.26 -0.8 0.3 0.69 0.07
0.55 0.12 -0.32 0.12 -0.01 -0.3 0.56 -0.24 -0.47 -0.6 0.65 -0.62 -0.13 -0.19 0.6 -0.56 -0.72 0.06 0.15 0.1
0.29 -0.28 -0.55 -0.01 0.52 -0.33 0.37 -0.19 -0.16 -0.37 -0.15 -0.58 0.16 -0.05 -0.2 -0.03 -0.65 0.45 0.72 0.09
0.74 -0.04 0.4 0.93 -0.12 0.77 2.19 -0.11 -1.22 -2.3 -1.81 -4.25 0.08 -1.31 -0.98 0.03 -1.82 -2.58 -2.11 0.46
-0.06 -0.05 -0.53 -0.05 0.35 0.34 0.59 -0.33 -0.5 -0.52 0.06 -0.62 -0.6 -1.08 0.26 -0.21 -0.03 0.34 0.97 0.11
-0.12 -0.77 -1.04 0.26 0.4 0.17 0.59 -0.44 -0.54 -0.67 0.26 -0.59 -0.22 -0.15 0.42 0.03 0.16 0.14 0.16 0.57
0.25 0.22 -0.66 0.44 0.75 -0.75 1.21 -0.25 -0.86 -0.63 -0.88 -1.46 -0.67 -1.17 -0.72 -0.4 -1.03 0.96 1.13 0.06
0.53 -0.95 -0.65 0.46 0.71 0.76 0.17 -0.32 -0.47 -0.77 0.15 -0.96 -0.36 -0.59 0.09 -0.05 -0.44 0.05 0.49 0.25
0.54 -0.34 -0.33 0.25 0.54 0.02 -0.19 -0.58 -0.89 -0.75 0.52 -0.6 -1.28 -1.16 0.48 -0.24 0.14 0.15 1.17 -0.05
0.6 0.11 -0.41 0.28 0.46 -0.62 0.09 -0.33 -0.28 -0.45 0.1 -1.09 -0.14 -0.37 0.09 0.31 -0.52 0.22 0.61 0.09
0.72 0.17 -0.14 0.38 0.49 0.13 0.03 0.04 -0.37 -0.59 -0.47 -1.06 0.65 0.37 -0.51 -0.81 -0.96 0.09 0.47 -0.45
0.13 -0.53 -0.68 -0.38 0.32 0.31 0.41 -0.25 -0.45 -0.44 0.42 -0.7 0.12 -0.08 0.42 -0.38 -0.28 0.45 0.11 0.43
0.76 0.06 0.02 0.66 0.34 -0.4 0.16 -0.25 -0.42 -0.51 0.25 -0.68 -0.09 -0.36 0.19 -0.43 -0.49 0.09 0.08 -0.0
0.5 -0.76 -0.65 -0.11 0.08 0.55 0.77 -0.27 -0.08 -0.04 -0.07 -1.5 0.17 -0.22 0.15 -0.2 -1.16 -0.01 0.63 0.26
0.05 -0.32 -0.41 -0.04 0.26 -0.43 1.58 -0.34 -0.6 -0.71 -0.01 -1.07 -0.44 -0.6 0.06 -0.77 -0.77 0.11 1.14 0.09
0.17 -0.21 -0.47 0.25 0.05 0.21 0.62 -0.2 -0.38 -0.5 0.54 -0.68 -0.83 -1.23 0.58 -0.11 -0.31 -0.15 0.92 -0.11
1.03 0.65 0.86 0.75 0.44 -0.76 0.35 -0.48 -0.94 -0.82 -0.2 -0.95 -0.49 -0.85 -0.17 -1.15 -0.68 -0.37 0.57 0.0
-7.12 - -5.97 - -5.96 -4.29 4.32 - - - - - - - - - - - - -
-0.14 0.48 -0.28 -0.39 -0.58 -1.6 1.68 -0.4 0.14 0.04 0.12 -1.39 0.21 -0.01 0.25 -0.22 -0.71 -0.78 0.1 0.12
0.27 0.45 0.94 0.26 -0.05 -2.46 2.67 -1.02 -0.95 -1.24 -1.87 -2.08 -2.02 -1.54 -1.39 -0.6 -3.65 -1.21 0.87 -0.2
1.05 0.47 0.5 0.43 0.9 0.21 0.61 -0.36 -0.3 -0.55 -0.58 -1.19 -0.29 -0.26 -0.7 -0.04 -1.65 -0.08 -0.51 -0.59
0.68 0.56 -0.24 0.47 0.53 0.33 -0.04 -0.16 -0.64 -0.74 -0.02 -1.28 0.24 -0.22 0.03 -1.07 -1.37 0.02 0.78 -0.27
0.62 0.16 -0.02 0.59 0.29 -0.19 -0.07 0.1 -0.33 -0.42 -0.01 -0.92 -0.02 -0.16 0.0 -0.47 -0.64 0.07 0.32 0.18
0.34 0.57 -0.4 0.07 0.51 -0.02 0.43 -0.09 -0.58 -0.6 -0.11 -0.75 -0.27 -0.69 -0.07 -0.52 -0.97 0.3 0.92 0.2
0.29 -0.37 -0.39 -0.17 0.31 -0.56 0.86 -0.46 -0.41 -0.52 0.36 -0.77 -0.33 -0.27 0.32 -0.04 -0.27 0.23 -0.33 0.95
-0.04 -0.32 -1.32 0.01 0.11 -0.03 0.27 -0.36 -0.31 -0.32 0.19 -0.92 -0.05 -0.58 0.39 -0.01 -0.67 0.15 1.31 0.41
0.73 -0.26 -0.26 0.69 0.6 -0.53 0.53 -0.09 -0.45 -0.74 -0.04 -0.75 -0.27 -0.35 -0.09 -0.01 -0.39 0.38 0.31 -0.48
0.43 -0.08 -0.18 0.11 0.25 -0.26 0.87 0.01 -0.03 -0.16 0.48 -0.66 -0.35 -0.72 0.54 -0.51 -0.72 -0.18 -0.18 0.1
0.24 0.95 -0.65 0.12 -0.27 -0.15 0.11 -0.48 -0.04 -0.22 0.1 -1.13 0.08 -0.11 0.16 0.2 -0.67 0.05 0.51 -0.11
-0.02 -0.51 -0.68 -0.23 0.06 0.78 1.81 -0.22 -0.79 -0.83 0.47 -0.68 -0.95 -1.08 0.5 -0.05 -0.34 -0.48 -0.01 -0.56
0.36 -0.39 0.0 0.19 0.49 -0.11 0.48 0.01 -0.44 -0.54 0.32 -0.47 -1.13 -1.19 0.23 -0.4 -0.14 0.43 0.57 0.17
0.9 -0.01 -0.15 0.77 0.47 -0.71 -0.07 -0.33 -0.46 -0.69 0.28 -1.26 -0.18 -0.33 0.25 0.24 -0.32 -0.08 0.34 -0.39
-0.95 0.11 -0.93 0.48 0.46 -1.58 2.18 -0.25 -0.67 -0.63 0.26 -0.64 -0.21 -0.36 0.07 -1.6 -1.57 -0.54 0.37 -0.09
0.53 0.35 0.21 0.01 0.33 -0.38 0.24 -0.11 -0.33 -0.55 -0.15 -0.97 0.01 -0.35 -0.07 -0.16 -0.67 0.1 0.76 0.08
-0.2 0.05 -0.23 0.44 0.13 -1.07 0.9 0.06 0.06 -0.19 0.35 -0.64 -0.2 -0.43 0.36 0.66 0.22 -0.22 -0.78 -1.05
0.44 - - 3.11 - - 3.18 -2.72 - - - -0.38 - - - - - - - -
1.11 0.16 0.32 0.8 0.68 -1.27 0.09 -0.43 -0.28 -0.34 -0.09 -1.08 0.15 -0.2 -0.07 -0.44 -1.11 -0.54 0.1 -0.02
-4.24 -7.56 -7.14 -7.02 -7.6 -0.04 4.21 -5.94 -8.89 -6.7 -6.0 -9.09 -8.89 -8.59 -5.86 - -8.61 -3.56 -3.09 -2.66
0.86 0.07 -3.9 -1.19 - -3.56 3.55 -2.04 - - - - - - - - - 0.02 - 1.84
-1.02 -0.62 -1.65 -1.21 -0.61 -0.59 0.52 0.29 0.66 0.36 0.53 -0.13 0.48 0.28 0.49 0.34 0.18 -0.28 0.03 -0.64
0.5 -0.19 -0.03 0.06 0.35 -0.8 0.41 -0.17 -0.38 -0.39 0.49 -0.73 -0.25 -0.55 0.51 -0.26 -0.49 -0.03 0.8 -0.21
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0.16 0.57 -0.13 -0.16 0.06 -0.91 0.63 0.01 0.12 0.09 0.43 -0.85 -0.33 -0.71 0.54 -0.1 -1.15 -0.17 0.58 -0.39
0.14 -0.21 -0.53 0.19 0.67 -0.02 0.12 -0.07 -0.3 -0.27 0.19 -0.5 -0.06 -0.22 0.23 -0.52 -0.52 0.49 0.44 -0.09
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1.96 0.34 0.99 1.16 0.64 -0.27 -0.6 -0.79 -1.02 -1.04 -0.23 -1.5 -0.65 -1.12 -0.3 -1.3 -2.2 -0.53 0.06 -0.93
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0.44 -0.3 0.09 0.94 0.08 -0.87 0.19 -0.0 -0.29 -0.35 0.16 -0.82 -0.1 -0.46 0.14 -0.04 -1.36 0.04 0.84 -0.2
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0.48 0.35 0.59 -0.16 0.54 -0.6 1.36 -0.52 -0.48 -0.38 -0.37 -0.84 -0.95 -0.67 -0.06 0.27 -0.08 -0.55 -1.75 0.57
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-2.68 - - - - 3.09 3.43 -3.77 -4.36 -3.52 -3.75 -3.58 -5.05 -5.1 - - - - - -3.8
1.05 -0.04 -0.07 1.01 0.57 -0.39 0.19 -0.25 -0.68 -0.83 -0.0 -1.0 -0.31 -0.63 -0.11 -0.49 -0.64 0.22 0.38 -0.16
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1.08 0.77 0.76 0.4 0.73 0.23 0.35 -0.25 -0.35 -0.6 -0.47 -1.01 -1.7 -1.55 -0.27 -0.06 -1.31 -0.37 0.37 -0.61

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.