Heatmap: Cluster_155 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.82 0.63 0.55 0.84 1.0 0.62 0.7 0.47 0.38 0.35 0.66 0.32 0.22 0.23 0.61 0.43 0.35 0.7 0.91 0.69
0.96 0.49 0.51 0.84 1.0 0.58 0.74 0.57 0.42 0.4 0.7 0.3 0.48 0.41 0.69 0.4 0.41 0.97 1.0 0.7
0.69 0.71 0.39 0.81 0.72 0.3 0.53 0.38 0.25 0.21 0.48 0.24 0.32 0.32 0.45 0.45 0.42 0.52 1.0 0.19
0.68 0.4 0.48 0.62 0.78 0.56 0.54 0.41 0.29 0.3 0.28 0.2 0.35 0.37 0.33 0.28 0.33 1.0 0.67 0.68
0.66 1.0 0.58 0.67 0.7 0.54 0.37 0.2 0.22 0.23 0.48 0.13 0.06 0.07 0.53 0.29 0.21 0.46 0.75 0.58
0.75 0.48 0.55 0.68 0.85 0.72 0.6 0.47 0.27 0.29 0.38 0.35 0.29 0.28 0.36 0.27 0.35 1.0 0.83 0.93
0.56 0.46 0.49 0.66 0.83 0.34 0.8 0.43 0.3 0.3 0.43 0.3 0.26 0.27 0.46 0.43 0.44 0.9 1.0 0.59
0.93 0.41 0.56 0.8 0.97 0.7 0.56 0.49 0.31 0.34 0.53 0.28 0.2 0.16 0.53 0.31 0.36 0.98 0.76 1.0
0.76 0.3 0.53 0.5 0.71 0.66 0.53 0.41 0.37 0.36 0.35 0.2 0.36 0.31 0.49 0.21 0.27 0.56 1.0 0.38
0.49 0.22 0.26 0.55 0.66 0.3 0.44 0.34 0.41 0.45 0.67 0.44 0.5 0.41 0.87 0.76 0.3 0.52 1.0 0.58
0.46 0.4 0.34 0.58 0.76 0.46 0.68 0.27 0.19 0.19 0.38 0.21 0.13 0.14 0.37 0.28 0.27 0.61 1.0 0.71
0.91 0.42 0.52 0.97 0.92 0.63 0.72 0.55 0.45 0.43 0.8 0.32 0.32 0.33 0.85 0.41 0.39 1.0 0.9 0.65
0.88 0.44 0.53 0.86 0.87 0.86 0.63 0.48 0.32 0.27 0.45 0.26 0.24 0.24 0.45 0.4 0.41 0.83 1.0 0.67
0.48 0.51 0.3 0.45 0.72 0.45 0.41 0.25 0.16 0.16 0.3 0.15 0.13 0.13 0.32 0.21 0.19 0.55 1.0 0.48
0.73 0.36 0.57 1.0 0.87 0.54 0.99 0.5 0.33 0.3 0.5 0.33 0.35 0.35 0.46 0.41 0.61 0.67 0.82 0.38
0.9 0.49 0.58 1.0 0.93 0.95 0.83 0.78 0.55 0.55 0.85 0.49 0.84 0.77 0.85 0.55 0.58 0.88 0.71 0.8
0.6 0.52 0.41 0.61 0.73 0.47 0.61 0.51 0.44 0.43 0.72 0.38 0.38 0.35 0.68 0.54 0.47 0.64 1.0 0.49
0.49 0.17 0.17 0.48 0.44 0.13 0.24 0.26 0.33 0.34 0.68 0.15 0.34 0.27 0.74 0.53 0.35 0.27 1.0 0.3
0.99 0.92 0.54 0.69 1.0 0.84 0.97 0.5 0.33 0.34 0.88 0.27 0.4 0.38 0.84 0.4 0.37 0.83 1.0 0.61
0.33 0.23 0.12 0.45 0.53 0.2 0.41 0.27 0.3 0.26 0.59 0.35 0.3 0.31 0.67 0.5 0.27 0.49 1.0 0.48
0.29 0.14 0.21 0.17 0.5 0.28 0.36 0.27 0.34 0.27 0.5 0.29 0.18 0.21 0.63 0.37 0.1 0.28 1.0 0.37
0.32 0.34 0.17 0.28 0.45 0.23 0.31 0.26 0.26 0.21 0.45 0.24 0.32 0.24 0.47 0.31 0.13 0.39 1.0 0.29
0.71 0.61 0.51 0.66 1.0 0.39 0.65 0.48 0.39 0.36 0.59 0.31 0.33 0.31 0.59 0.4 0.33 0.85 0.75 0.71
0.6 0.33 0.33 0.74 0.83 0.58 0.8 0.48 0.3 0.29 0.51 0.29 0.36 0.26 0.5 0.4 0.41 1.0 0.92 0.61
0.74 0.65 0.68 0.68 1.0 0.63 0.5 0.38 0.32 0.32 0.49 0.26 0.4 0.35 0.52 0.23 0.28 0.43 0.77 0.4
0.83 0.62 0.58 0.76 1.0 0.59 0.67 0.51 0.34 0.34 0.4 0.34 0.44 0.38 0.42 0.38 0.32 0.88 0.7 0.58
0.74 0.55 0.57 0.75 0.89 0.79 0.74 0.51 0.34 0.37 0.66 0.34 0.43 0.35 0.72 0.34 0.68 0.72 1.0 0.52
0.38 0.36 0.18 0.34 0.49 0.28 0.51 0.29 0.32 0.31 0.47 0.23 0.27 0.22 0.48 0.35 0.3 0.35 1.0 0.3
0.61 0.37 0.33 0.53 0.58 0.23 0.45 0.33 0.3 0.25 0.59 0.21 0.32 0.29 0.58 0.27 0.19 0.43 1.0 0.44
0.76 0.43 0.51 0.81 0.73 0.62 0.65 0.57 0.35 0.32 0.44 0.33 0.36 0.34 0.48 0.46 0.43 0.69 1.0 0.75
0.54 0.45 0.44 0.72 0.88 0.64 0.79 0.54 0.3 0.3 0.48 0.38 0.48 0.44 0.46 0.33 0.39 1.0 0.98 0.65
0.82 0.46 0.53 0.78 1.0 0.72 0.67 0.41 0.33 0.29 0.44 0.32 0.28 0.27 0.41 0.33 0.32 0.72 0.75 0.64
0.8 0.66 0.44 0.83 1.0 0.63 0.74 0.52 0.39 0.35 0.51 0.32 0.52 0.5 0.5 0.34 0.33 0.88 0.71 0.78
0.89 0.48 0.45 0.71 0.75 0.78 0.72 0.3 0.21 0.2 0.24 0.3 0.18 0.2 0.25 0.27 0.31 0.8 1.0 0.55
0.62 0.35 0.44 0.96 0.73 0.57 1.0 0.28 0.22 0.2 0.25 0.36 0.04 0.09 0.44 0.48 0.37 0.76 0.84 0.48
0.89 0.65 0.39 0.77 1.0 0.49 0.76 0.55 0.49 0.41 0.57 0.37 0.42 0.39 0.57 0.56 0.45 0.82 0.96 0.67
0.57 0.47 0.47 1.0 0.7 0.7 0.59 0.35 0.18 0.21 0.36 0.21 0.28 0.22 0.34 0.25 0.33 0.41 0.69 0.38
0.68 0.78 0.67 0.6 0.93 0.6 0.93 0.29 0.32 0.34 0.27 0.18 0.06 0.08 0.37 0.56 0.39 0.88 1.0 0.93
0.29 0.34 0.21 0.32 0.51 0.38 0.49 0.27 0.2 0.2 0.45 0.13 0.22 0.15 0.58 0.39 0.23 0.83 1.0 0.6
1.0 0.52 0.54 0.86 0.89 0.76 0.62 0.46 0.38 0.35 0.56 0.28 0.43 0.39 0.57 0.38 0.38 0.68 0.97 0.54
0.72 0.47 0.54 0.64 0.85 0.26 0.82 0.39 0.37 0.33 0.48 0.26 0.26 0.22 0.45 0.53 0.37 0.66 1.0 0.7
0.73 0.54 0.4 0.71 0.77 0.33 0.4 0.33 0.33 0.3 0.44 0.19 0.25 0.21 0.43 0.4 0.23 0.7 1.0 0.45
0.8 0.51 0.42 0.77 0.83 0.6 0.78 0.41 0.4 0.35 0.59 0.28 0.21 0.18 0.69 0.81 0.47 0.67 1.0 0.54
0.41 0.35 0.32 0.54 0.51 0.27 0.27 0.36 0.27 0.23 0.4 0.2 0.34 0.34 0.36 0.17 0.31 0.37 1.0 0.43
0.63 0.59 0.55 0.64 0.91 0.8 0.65 0.43 0.27 0.26 0.41 0.25 0.21 0.21 0.44 0.21 0.26 0.91 1.0 0.74
0.55 0.56 0.41 0.65 0.67 0.37 0.43 0.35 0.19 0.2 0.3 0.27 0.22 0.17 0.32 0.14 0.21 0.51 1.0 0.34
0.84 0.89 0.77 0.87 1.0 0.53 0.81 0.45 0.5 0.43 0.48 0.31 0.32 0.39 0.46 0.45 0.35 0.82 0.98 0.75
0.72 0.54 0.49 0.74 1.0 0.59 0.44 0.44 0.3 0.31 0.43 0.31 0.31 0.28 0.45 0.27 0.28 0.95 0.86 0.65
0.73 0.43 0.54 0.73 0.85 0.61 0.74 0.61 0.49 0.47 0.84 0.38 0.53 0.48 0.82 0.49 0.49 0.92 1.0 0.97
0.64 0.67 0.47 0.64 1.0 0.53 0.73 0.52 0.35 0.36 0.69 0.34 0.45 0.4 0.68 0.29 0.22 0.75 0.79 0.58
0.69 0.46 0.43 0.75 0.76 0.56 0.45 0.46 0.26 0.22 0.53 0.27 0.38 0.38 0.53 0.31 0.35 0.72 1.0 0.43
0.73 0.24 0.43 0.61 1.0 0.43 0.46 0.53 0.29 0.3 0.56 0.34 0.55 0.48 0.56 0.51 0.46 0.75 0.55 0.61
0.53 0.37 0.33 0.52 0.75 0.42 0.62 0.38 0.29 0.31 0.47 0.22 0.21 0.2 0.45 0.45 0.44 0.92 1.0 0.92
0.62 0.39 0.37 0.62 0.87 0.62 1.0 0.44 0.25 0.28 0.49 0.26 0.34 0.3 0.48 0.26 0.38 0.64 0.8 0.47
0.75 0.61 0.49 0.5 0.87 0.61 0.79 0.51 0.43 0.43 0.55 0.32 0.29 0.27 0.57 0.39 0.32 1.0 0.95 0.77
0.83 0.46 0.31 0.87 0.74 0.29 0.56 0.48 0.55 0.52 0.91 0.29 0.62 0.43 1.0 0.93 0.49 0.52 0.78 0.56
0.73 0.61 0.58 0.75 0.85 0.41 0.74 0.43 0.29 0.29 0.45 0.28 0.33 0.27 0.44 0.29 0.2 0.69 1.0 0.44
0.92 0.57 0.71 0.8 1.0 0.64 0.58 0.66 0.48 0.41 0.56 0.46 0.74 0.63 0.56 0.44 0.43 0.74 0.75 0.64
0.77 0.35 0.42 0.82 0.76 0.44 0.46 0.3 0.19 0.22 0.24 0.17 0.14 0.19 0.29 0.5 0.39 1.0 0.94 0.51
0.43 0.45 0.27 0.46 0.55 0.45 0.52 0.28 0.2 0.18 0.33 0.19 0.24 0.25 0.34 0.3 0.28 0.39 1.0 0.35
0.88 0.45 0.5 0.83 1.0 0.73 0.51 0.55 0.32 0.3 0.5 0.29 0.52 0.46 0.52 0.37 0.36 0.91 0.84 0.64
0.77 0.5 0.57 0.75 0.73 0.74 0.65 0.46 0.34 0.36 0.43 0.29 0.44 0.43 0.46 0.38 0.48 1.0 0.98 0.83
0.88 0.36 0.51 0.86 1.0 0.55 0.59 0.31 0.22 0.23 0.32 0.19 0.21 0.22 0.34 0.31 0.24 0.75 0.79 0.83
0.84 0.36 0.47 1.0 0.84 0.65 0.62 0.5 0.22 0.21 0.43 0.34 0.23 0.2 0.43 0.16 0.28 0.6 0.72 0.5
0.56 0.5 0.35 0.59 0.68 0.61 0.75 0.38 0.27 0.23 0.34 0.21 0.37 0.35 0.36 0.29 0.25 0.63 1.0 0.4
0.86 0.6 0.67 0.79 1.0 0.42 0.85 0.64 0.48 0.44 0.7 0.36 0.45 0.42 0.74 0.42 0.36 0.76 0.85 0.82
0.86 0.54 0.51 0.85 1.0 0.76 0.6 0.59 0.3 0.28 0.48 0.3 0.28 0.28 0.44 0.35 0.37 0.77 0.94 0.45
0.6 0.5 0.58 0.77 0.82 0.44 0.54 0.38 0.22 0.22 0.3 0.28 0.18 0.2 0.3 0.27 0.27 1.0 0.89 0.62
0.93 0.51 0.51 0.98 0.96 0.63 0.69 0.5 0.53 0.52 0.66 0.31 0.52 0.47 0.68 0.45 0.41 1.0 0.81 0.88
0.93 0.42 0.63 0.69 0.91 1.0 0.73 0.51 0.35 0.33 0.61 0.39 0.39 0.39 0.72 0.36 0.34 0.77 0.76 0.65
0.68 0.58 0.45 1.0 0.99 0.53 0.97 0.44 0.24 0.22 0.39 0.23 0.52 0.46 0.43 0.23 0.26 0.84 0.76 0.77
0.58 0.35 0.23 0.65 1.0 0.49 0.86 0.34 0.2 0.21 0.35 0.22 0.28 0.24 0.4 0.26 0.22 0.76 0.7 0.74
0.64 0.37 0.28 0.72 1.0 0.74 0.95 0.39 0.26 0.21 0.52 0.2 0.21 0.24 0.5 0.34 0.24 0.76 0.56 0.66
0.88 0.2 0.51 0.76 1.0 0.58 0.91 0.54 0.45 0.41 0.73 0.24 0.55 0.47 0.83 0.56 0.41 0.84 0.94 0.82
0.62 0.36 0.56 0.76 0.7 0.48 0.59 0.41 0.35 0.33 0.47 0.2 0.41 0.31 0.53 0.32 0.28 0.65 1.0 0.54

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)