Heatmap: Cluster_132 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.32 0.76 0.16 2.95 0.23 0.25 0.08 0.47 0.29 0.54 0.63 0.1 0.98 0.15 1.01 0.47 0.95 0.12 1.39 0.2
0.58 0.17 0.04 2.91 0.25 0.09 0.16 0.47 0.37 0.38 0.19 0.01 0.9 0.36 0.34 1.69 0.42 0.18 3.77 0.16
0.12 0.0 0.05 0.5 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.05 0.0 0.02 0.07 0.06 0.03 0.56 0.0 0.0 0.45 0.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.08 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.13 0.0 0.0 0.06 0.0
0.33 0.0 0.0 0.93 0.07 0.0 0.05 0.27 0.16 0.16 0.2 0.03 0.21 0.22 0.28 0.75 0.14 0.23 0.59 0.03
0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0
0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.06 0.0 0.04 0.03 0.0 0.2 0.01 0.0 0.07 0.0
0.08 0.0 0.01 0.5 0.06 0.04 0.03 0.08 0.05 0.01 0.11 0.0 0.05 0.04 0.08 0.15 0.04 0.0 0.65 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.05 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0
0.92 0.0 0.18 2.93 0.3 0.07 0.31 0.5 0.29 0.43 0.36 0.06 0.47 0.21 0.51 1.57 0.36 0.37 5.12 0.52
1.56 0.32 0.67 3.22 1.01 0.67 0.53 0.74 0.44 0.72 0.35 0.11 0.97 0.71 0.74 2.07 0.64 0.54 3.81 0.37
0.04 0.04 0.0 0.39 0.04 0.02 0.01 0.06 0.03 0.0 0.07 0.0 0.04 0.07 0.0 0.39 0.0 0.0 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.05 0.12 0.0 0.02 0.02 0.0 0.35 0.0 0.04 0.06 0.0
0.67 0.3 0.0 1.19 0.16 0.0 0.2 0.2 0.12 0.23 0.15 0.03 0.22 0.22 0.05 1.05 0.42 0.15 0.75 0.18
0.27 0.08 0.03 1.08 0.1 0.14 0.07 0.17 0.09 0.06 0.07 0.02 0.12 0.17 0.1 0.72 0.13 0.03 1.12 0.09
0.15 0.0 0.03 0.12 0.0 0.0 0.04 0.05 0.05 0.09 0.0 0.01 0.02 0.02 0.07 0.15 0.09 0.0 0.22 0.0
0.04 0.19 0.0 0.23 0.0 0.05 0.12 0.07 0.02 0.0 0.08 0.0 0.06 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0
0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.04 0.05 0.04 0.02 0.1 0.02 0.04 0.02 0.03 0.11 0.0 0.0 0.35 0.0
0.02 0.0 0.0 0.52 0.0 0.07 0.0 0.14 0.06 0.0 0.13 0.02 0.17 0.13 0.11 0.0 0.04 0.0 0.22 0.04
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
1.37 0.99 0.58 5.46 0.93 0.47 0.64 1.03 0.56 1.61 0.25 0.02 1.38 0.8 0.72 3.71 0.51 0.95 5.31 0.28
0.07 0.0 0.0 0.82 0.02 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.36 0.0
0.32 0.0 0.07 1.49 0.05 0.12 0.09 0.18 0.22 0.06 0.04 0.03 0.34 0.34 0.22 0.84 0.07 0.09 2.38 0.04
0.03 0.0 0.06 0.15 0.02 0.0 0.01 0.03 0.02 0.02 0.04 0.0 0.12 0.07 0.02 0.18 0.0 0.03 0.19 0.02
0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.08 0.0 0.11 0.0
0.14 0.0 0.01 0.26 0.05 0.03 0.06 0.05 0.04 0.06 0.11 0.0 0.04 0.03 0.07 0.03 0.05 0.04 0.21 0.05
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0
0.06 0.0 0.0 0.19 0.06 0.03 0.0 0.04 0.04 0.05 0.02 0.0 0.06 0.06 0.05 0.17 0.04 0.03 0.06 0.1
0.33 0.14 0.08 0.47 0.05 0.05 0.01 0.16 0.12 0.06 0.1 0.02 0.34 0.16 0.14 0.36 0.04 0.09 0.51 0.25
0.02 0.04 0.02 0.26 0.0 0.02 0.01 0.05 0.09 0.04 0.03 0.01 0.11 0.13 0.02 0.36 0.03 0.01 0.1 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0
0.19 0.0 0.02 0.59 0.16 0.0 0.05 0.11 0.13 0.02 0.04 0.02 0.18 0.11 0.07 0.31 0.16 0.02 0.23 0.0
0.05 0.08 0.06 0.92 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.05 0.01 0.06 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0
0.03 0.1 0.0 0.76 0.08 0.0 0.07 0.2 0.19 0.13 0.2 0.0 0.34 0.25 0.0 1.0 0.05 0.04 0.37 0.0
0.24 0.08 0.1 0.19 0.23 0.05 0.02 0.11 0.06 0.13 0.04 0.01 0.18 0.13 0.13 0.59 0.16 0.07 0.14 0.07
0.33 0.0 0.04 1.15 0.09 0.04 0.08 0.26 0.15 0.16 0.21 0.02 0.42 0.29 0.15 0.79 0.54 0.14 0.8 0.06
0.2 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.14 0.13 0.14 0.21 0.08 0.01 0.34 0.19 0.04 0.62 0.0 0.03 0.26 0.12
3.18 2.35 1.45 7.76 2.64 1.45 0.59 1.61 0.76 0.66 0.73 0.14 2.1 1.45 0.91 4.45 1.76 0.72 12.1 0.81
0.15 0.12 0.05 0.35 0.0 0.03 0.04 0.07 0.04 0.03 0.05 0.01 0.03 0.0 0.1 0.17 0.1 0.04 0.35 0.06
0.03 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.18 0.0 0.02 0.03 0.0 0.16 0.06 0.0 0.04 0.0
0.19 0.0 0.05 0.41 0.12 0.37 0.4 0.15 0.21 0.21 0.48 0.04 0.06 0.2 0.16 0.81 0.19 0.14 0.96 0.4
0.54 0.88 0.41 3.86 0.57 0.0 1.46 0.88 0.51 0.45 1.38 0.11 0.96 1.01 0.48 1.07 0.14 0.36 1.04 0.56
0.03 0.0 0.02 0.28 0.0 0.0 0.01 0.04 0.05 0.01 0.0 0.01 0.06 0.07 0.02 0.04 0.07 0.0 0.2 0.04
0.01 0.0 0.0 0.53 0.0 0.11 0.02 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.24 0.03 0.0 0.2 0.0
0.02 0.0 0.07 0.45 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.03 0.02 0.0 0.06 0.01 0.06 0.24 0.15 0.0 0.39 0.02
0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.22 0.0
0.05 0.11 0.04 0.27 0.1 0.03 0.04 0.08 0.12 0.09 0.02 0.01 0.03 0.04 0.11 0.08 0.09 0.02 0.48 0.08
0.09 0.08 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.12 0.06
0.06 0.0 0.02 0.2 0.03 0.01 0.04 0.05 0.05 0.02 0.02 0.0 0.09 0.09 0.04 0.21 0.04 0.02 0.09 0.05
0.05 0.05 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.03 0.0 0.12 0.0
0.92 0.15 0.18 6.19 0.82 0.0 0.23 0.46 0.15 0.79 0.32 0.06 0.68 0.45 0.28 1.54 0.52 0.24 6.77 0.09
0.1 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.12 0.01 0.03 0.04 0.06 0.06 0.04 0.0 0.29 0.0
0.12 0.08 0.0 0.68 0.0 0.0 0.02 0.13 0.06 0.07 0.06 0.01 0.13 0.15 0.24 0.4 0.1 0.0 0.28 0.23
0.46 0.09 0.04 1.82 0.2 0.07 0.24 0.3 0.11 0.18 0.24 0.03 0.4 0.24 0.21 1.08 0.19 0.18 2.18 0.1
0.22 0.0 0.04 0.38 0.24 0.05 0.15 0.22 0.18 0.19 0.27 0.03 0.44 0.21 0.12 0.42 0.19 0.17 0.4 0.12
0.0 0.0 0.06 0.38 0.04 0.0 0.04 0.04 0.03 0.0 0.16 0.01 0.01 0.01 0.06 0.09 0.0 0.03 1.4 0.03
0.09 0.08 0.09 0.61 0.0 0.08 0.0 0.07 0.09 0.0 0.12 0.0 0.12 0.0 0.11 0.27 0.05 0.0 0.16 0.06
0.04 0.0 0.04 0.07 0.06 0.0 0.01 0.03 0.04 0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.06 0.03 0.06 0.08 0.13 0.05
1.36 1.07 0.34 6.66 0.84 0.44 0.56 0.8 0.35 0.41 0.41 0.06 0.94 0.69 0.41 1.76 0.46 0.44 7.95 0.21

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)