Heatmap: Cluster_239 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.09 0.19 0.07 0.24 0.28 1.0 0.05 0.1 0.04 0.04 0.01 0.07 0.01 0.01 0.02 0.1 0.12 0.73 0.72 0.45
0.03 0.01 0.03 0.02 0.02 1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.31 0.27 0.23
0.03 0.0 0.07 0.0 0.06 1.0 0.51 0.14 0.04 0.02 0.04 0.01 0.04 0.05 0.01 0.02 0.0 0.03 0.03 0.13
0.05 0.02 0.02 0.09 0.16 1.0 0.07 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.05 0.04 0.42 0.27
0.11 0.22 0.04 0.0 0.21 1.0 0.01 0.05 0.04 0.04 0.08 0.02 0.06 0.05 0.07 0.1 0.01 0.08 0.29 0.02
0.0 0.0 0.0 0.18 0.16 0.26 0.0 0.1 0.04 0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.23 0.39 0.48 1.0 0.13
0.08 0.07 0.05 0.13 0.41 1.0 0.36 0.08 0.05 0.08 0.44 0.04 0.01 0.02 0.58 0.13 0.1 0.56 0.5 0.19
0.09 0.05 0.04 0.0 0.34 1.0 0.23 0.11 0.07 0.1 0.42 0.06 0.0 0.01 0.88 0.2 0.13 0.41 0.12 0.23
0.11 0.12 0.05 0.38 0.24 1.0 0.04 0.06 0.01 0.01 0.02 0.11 0.01 0.01 0.03 0.07 0.19 0.3 0.37 0.44
0.29 0.36 0.31 0.26 0.36 1.0 0.2 0.13 0.04 0.03 0.05 0.06 0.04 0.04 0.06 0.09 0.08 0.86 0.39 0.78
0.01 0.03 0.03 0.54 0.12 0.08 0.04 0.13 0.03 0.04 0.09 0.08 0.01 0.01 0.02 0.2 0.36 0.12 1.0 0.2
0.12 0.1 0.07 0.34 0.09 0.06 0.22 0.17 0.07 0.05 0.03 0.12 0.01 0.02 0.04 0.4 0.28 0.38 1.0 0.32
0.31 0.74 0.37 0.32 0.74 1.0 0.67 0.47 0.3 0.26 0.36 0.32 0.24 0.26 0.43 0.36 0.35 0.9 0.81 1.0
0.18 0.02 0.01 0.36 0.55 0.61 0.15 0.16 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 1.0 0.53 0.95
0.34 0.2 0.35 0.41 0.34 1.0 0.04 0.11 0.04 0.03 0.03 0.04 0.01 0.02 0.06 0.03 0.05 0.41 0.15 0.59
0.22 0.35 0.51 0.23 0.2 1.0 0.17 0.24 0.14 0.2 0.21 0.15 0.03 0.04 0.17 0.3 0.39 0.42 0.75 0.19
0.04 0.04 0.1 0.12 0.06 1.0 0.01 0.12 0.06 0.08 0.03 0.06 0.06 0.04 0.08 0.02 0.12 0.27 0.2 0.18
0.08 0.2 0.16 0.04 0.11 1.0 0.3 0.11 0.11 0.19 0.1 0.08 0.02 0.0 0.07 0.09 0.17 0.11 0.38 0.17
0.27 0.48 0.32 0.23 0.65 0.72 0.5 0.18 0.1 0.12 0.25 0.19 0.05 0.06 0.25 0.2 0.18 0.58 1.0 0.39
0.45 0.22 0.31 0.53 0.61 0.99 0.36 0.35 0.1 0.12 0.15 0.16 0.17 0.19 0.15 0.15 0.2 0.81 0.67 1.0
0.04 0.15 0.07 0.1 0.33 1.0 0.76 0.21 0.12 0.14 0.19 0.15 0.18 0.21 0.22 0.17 0.2 0.44 0.13 0.27
0.05 0.0 0.02 0.55 0.44 0.2 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 1.0 0.31 0.5
0.08 0.02 0.06 0.07 0.11 0.62 0.0 0.09 0.01 0.01 0.01 0.05 0.0 0.01 0.06 0.04 0.07 1.0 0.62 0.66
0.21 0.5 0.26 0.32 0.72 1.0 0.54 0.3 0.14 0.18 0.31 0.37 0.27 0.25 0.33 0.22 0.29 0.61 0.61 0.68
0.16 0.35 0.24 0.9 0.46 1.0 0.53 0.27 0.14 0.13 0.11 0.01 0.28 0.31 0.31 0.0 0.11 0.43 0.31 0.37
0.15 0.26 0.2 0.16 0.2 1.0 0.18 0.06 0.03 0.02 0.04 0.03 0.01 0.01 0.07 0.03 0.05 0.3 0.49 0.28
0.43 0.18 0.38 0.35 0.58 0.62 0.93 0.2 0.05 0.04 0.14 0.11 0.07 0.06 0.21 0.15 0.2 0.6 0.32 1.0
0.33 0.23 0.22 0.35 0.35 1.0 0.21 0.27 0.19 0.19 0.48 0.2 0.14 0.14 0.47 0.22 0.19 0.32 0.56 0.31
0.38 0.06 0.21 0.16 0.18 0.15 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.61 1.0 0.15
0.42 0.05 0.13 0.53 0.42 0.88 0.24 0.07 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.55 1.0 0.52
0.06 0.06 0.03 0.12 0.16 1.0 0.16 0.09 0.01 0.01 0.02 0.02 0.19 0.04 0.02 0.03 0.1 0.12 0.15 0.35
0.06 0.0 0.03 0.11 0.21 1.0 0.38 0.1 0.03 0.02 0.07 0.03 0.24 0.11 0.07 0.07 0.19 0.09 0.11 0.52
0.29 0.2 0.34 0.4 0.55 0.97 1.0 0.25 0.08 0.08 0.24 0.16 0.04 0.04 0.33 0.18 0.25 0.75 0.71 0.94
0.2 0.41 0.13 0.33 0.61 0.69 0.45 0.38 0.28 0.23 0.34 0.32 0.35 0.39 0.39 0.35 0.28 0.64 0.44 1.0
0.64 0.0 0.0 0.34 0.0 0.4 1.0 0.09 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.28 0.0 0.17
0.11 0.06 0.04 0.07 0.1 1.0 0.14 0.09 0.01 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.04 0.03 0.09 0.16 0.12 0.26
0.12 0.02 0.09 0.07 0.17 1.0 0.24 0.07 0.05 0.03 0.04 0.02 0.02 0.03 0.03 0.09 0.08 0.21 0.46 0.28
0.23 0.28 0.29 0.28 0.36 0.68 0.32 0.36 0.11 0.09 0.25 0.52 0.12 0.09 0.24 0.5 0.38 0.93 0.69 1.0
0.3 0.42 0.35 0.19 0.54 0.58 0.26 0.38 0.11 0.11 0.16 0.31 0.05 0.07 0.12 0.45 0.36 0.86 0.58 1.0
1.0 0.62 0.69 0.82 0.65 0.86 0.28 0.28 0.44 0.49 0.38 0.26 0.2 0.19 0.32 0.48 0.44 0.38 0.71 0.2
0.08 0.52 0.13 0.19 0.33 0.61 0.03 0.07 0.04 0.03 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.12 0.1 0.63 1.0 0.38
0.26 0.16 0.3 0.03 0.11 1.0 0.1 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.7 0.46
0.2 0.03 0.07 0.29 0.26 0.78 0.17 0.07 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.72 0.67 1.0
0.4 0.31 0.36 0.65 0.52 1.0 0.06 0.14 0.04 0.08 0.13 0.13 0.09 0.04 0.16 0.07 0.1 0.48 0.79 0.16
0.03 0.1 0.03 0.15 0.27 1.0 0.01 0.08 0.05 0.05 0.11 0.11 0.02 0.03 0.19 0.16 0.12 0.32 0.62 0.5
0.21 0.52 0.15 0.45 0.86 0.72 0.42 0.27 0.2 0.36 0.43 0.18 0.32 0.19 0.42 0.07 0.18 0.68 1.0 0.89
0.15 0.44 0.15 0.05 0.1 1.0 0.38 0.11 0.04 0.03 0.07 0.09 0.07 0.07 0.04 0.03 0.04 0.51 0.81 0.54
0.61 0.42 0.46 0.72 0.71 1.0 0.18 0.45 0.27 0.25 0.38 0.32 0.27 0.24 0.4 0.29 0.35 0.78 0.72 0.48
0.26 0.22 0.25 0.15 0.16 1.0 0.04 0.09 0.06 0.09 0.05 0.05 0.05 0.04 0.1 0.04 0.06 0.17 0.5 0.32
0.39 0.44 0.42 0.07 0.42 1.0 0.4 0.33 0.24 0.25 0.34 0.33 0.2 0.22 0.29 0.49 0.44 0.69 0.9 0.74
0.13 0.09 0.18 0.17 0.39 0.28 0.27 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 1.0 0.63 0.43
0.34 1.0 0.28 0.99 0.81 0.56 0.2 0.07 0.03 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.07 0.02 0.04 0.46 0.85 0.2
0.08 0.03 0.1 0.43 0.21 1.0 0.24 0.04 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.06 0.1 0.35 0.25 0.2
0.68 0.35 0.48 0.57 0.65 0.89 0.14 0.33 0.18 0.2 0.41 0.19 0.24 0.21 0.44 0.25 0.31 0.72 1.0 0.61
0.01 0.0 0.01 0.09 0.1 1.0 0.81 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.23 0.19 0.26
0.55 0.72 0.44 0.47 0.46 0.91 0.11 0.33 0.17 0.15 0.33 0.27 0.21 0.15 0.4 0.1 0.15 0.74 0.94 1.0
0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.8 1.0 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.02 0.01 0.05 0.04 0.01 0.02 0.02 0.01
0.14 0.06 0.07 0.24 0.13 0.49 0.05 0.09 0.05 0.05 0.05 0.04 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 1.0 0.74 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)