Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00489	0.15	0.0	0.16	0.01	0.0	0.04	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.13	0.14	1.0
Gb_01658	0.16	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	1.0
Gb_01873	0.16	0.06	0.14	0.11	0.1	0.06	0.01	0.13	0.06	0.08	0.09	0.22	0.12	0.13	0.07	0.01	0.04	0.13	0.22	1.0
Gb_01957	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.01	0.07	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.04	1.0
Gb_02234	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.21	1.0
Gb_02366	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.86	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02464	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_02717	0.59	0.2	0.4	0.44	0.36	0.41	0.14	0.26	0.05	0.05	0.04	0.06	0.02	0.03	0.07	0.12	0.13	0.85	0.18	1.0
Gb_02724	0.3	0.11	0.41	0.07	0.1	0.09	0.04	0.04	0.03	0.04	0.07	0.02	0.0	0.03	0.06	0.03	0.0	0.63	0.15	1.0
Gb_03998	0.11	0.04	0.05	0.06	0.11	0.11	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.28	0.05	1.0
Gb_04137	0.1	0.03	0.13	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.03	1.0
Gb_04157	0.37	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.04	1.0
Gb_04585	0.18	0.02	0.12	0.27	0.14	0.06	0.02	0.13	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.86	0.57	1.0
Gb_04928	0.06	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	1.0
Gb_05004	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.08	0.03	0.04	0.07	0.04	0.04	0.04	0.01	0.02	0.04	0.04	0.08	0.09	0.24	1.0
Gb_05073	0.12	0.01	0.02	0.0	0.02	0.01	0.0	0.16	0.08	0.08	0.14	0.09	0.2	0.18	0.06	0.0	0.03	0.16	0.06	1.0
Gb_05280	0.49	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	1.0
Gb_05764	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_05766	0.08	0.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.08	1.0
Gb_06554	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_06556	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_07512	0.14	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.2	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	1.0
Gb_07561	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_07724	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0
Gb_08211	0.0	0.0	0.0	0.04	0.08	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	1.0
Gb_09214	0.08	0.05	0.01	0.03	0.05	0.26	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.09	0.03	1.0
Gb_09215	0.24	0.0	0.07	0.12	0.08	0.26	0.09	0.05	0.0	0.0	0.02	0.25	0.0	0.03	0.0	0.0	0.01	0.21	0.88	1.0
Gb_09908	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0
Gb_10038	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	1.0
Gb_10144	0.22	0.05	0.05	0.07	0.23	0.09	0.0	0.75	0.56	1.0	0.73	0.61	0.94	0.7	0.47	0.29	0.62	0.57	0.02	0.85
Gb_10627	0.16	0.06	0.07	0.1	0.07	0.06	0.01	0.08	0.08	0.09	0.07	0.06	0.04	0.04	0.07	0.1	0.1	0.33	0.09	1.0
Gb_10646	0.19	0.01	0.03	0.01	0.02	0.08	0.02	0.06	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.03	0.05	0.11	0.04	1.0
Gb_10718	0.05	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.06	1.0
Gb_10966	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11601	0.0	0.13	0.06	0.0	0.06	0.07	0.09	0.13	0.02	0.03	0.05	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.06	1.0
Gb_13261	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0
Gb_13331	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13728	0.4	0.02	0.03	0.02	0.05	0.08	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.01	1.0
Gb_14107	0.13	0.01	0.1	0.01	0.04	0.14	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.4	0.12	1.0
Gb_14271	0.18	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04	0.09	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.38
Gb_14917	0.47	0.14	0.36	0.19	0.2	0.04	0.02	0.09	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.27	0.07	1.0
Gb_15660	0.44	0.04	0.12	0.11	0.05	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	1.0
Gb_16082	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.09	0.02	0.0	0.02	1.0
Gb_16142	0.45	0.24	0.32	0.38	0.4	0.39	0.15	0.47	0.29	0.34	0.59	0.33	0.44	0.35	0.52	0.39	0.5	0.59	0.27	1.0
Gb_16592	0.12	0.02	0.14	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.11	0.15	0.12	0.05	0.09	0.07	0.04	0.0	0.02	0.12	0.09	1.0
Gb_16732	0.07	0.2	0.28	0.08	0.11	0.17	0.03	0.13	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.54	0.22	1.0
Gb_16940	0.25	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	1.0
Gb_17182	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.02	0.0	0.0	0.01	0.08	0.12	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_17490	0.15	0.05	0.15	0.06	0.07	0.02	0.1	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.05	0.08	1.0
Gb_17722	0.13	0.05	0.09	0.06	0.08	0.18	0.01	0.05	0.02	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02	0.08	0.11	0.09	1.0
Gb_17749	0.09	0.31	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0
Gb_17910	0.07	0.04	0.03	0.0	0.06	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	1.0
Gb_19069	0.22	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0
Gb_19221	0.26	0.0	0.06	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.06	1.0
Gb_20338	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.0	0.02	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.27	0.09	1.0
Gb_20699	0.1	0.02	0.13	0.07	0.06	0.1	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.05	0.03	1.0
Gb_20920	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.13	1.0
Gb_20944	0.29	0.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.19	0.02	1.0
Gb_20945	0.29	0.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.19	0.02	1.0
Gb_20970	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0
Gb_20973	0.28	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.07	1.0
Gb_21459	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_21887	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_21925	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24328	0.09	0.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.04	1.0
Gb_24651	0.06	0.17	0.15	0.07	0.06	0.01	0.08	0.09	0.05	0.06	0.2	0.04	0.12	0.06	0.18	0.0	0.0	0.01	0.35	1.0
Gb_25764	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	1.0
Gb_25896	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0
Gb_26463	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.3	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.06	1.0
Gb_26855	0.04	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0
Gb_26856	0.1	0.01	0.04	0.01	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	1.0
Gb_26857	0.17	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	1.0
Gb_26858	0.04	0.0	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.0	0.04	0.0	0.02	0.0	0.03	0.01	0.0	0.08	0.04	1.0
Gb_26863	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0
Gb_26892	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.06	0.26	0.15	0.47	0.24	0.02	0.04	0.48	0.02	0.01	0.03	0.01	1.0
Gb_26893	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.07	0.07	0.1	0.13	0.28	0.01	0.02	0.09	0.0	0.0	0.01	0.02	1.0
Gb_27791	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	1.0
Gb_27890	0.31	0.17	0.25	0.14	0.12	0.0	0.08	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.22	0.02	1.0
Gb_28209	0.0	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.02	1.0
Gb_28240	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0
Gb_28442	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.0	0.0	0.06	0.03	0.04	0.0	0.08	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.08	1.0
Gb_28490	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.2	1.0
Gb_28973	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.12	1.0
Gb_28980	0.09	0.0	0.04	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.1	1.0
Gb_30404	0.25	0.02	0.03	0.04	0.05	0.04	0.08	0.14	0.11	0.12	0.06	0.06	0.07	0.05	0.03	0.01	0.02	0.03	0.06	1.0
Gb_32178	0.33	0.07	0.14	0.12	0.12	0.15	0.03	0.07	0.04	0.04	0.06	0.04	0.04	0.03	0.07	0.03	0.03	0.27	0.13	1.0
Gb_32215	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.39	1.0	0.67
Gb_32532	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	1.0
Gb_32788	0.78	0.37	0.21	0.15	0.2	0.1	0.1	0.1	0.05	0.07	0.1	0.08	0.02	0.02	0.1	0.05	0.05	0.18	0.29	1.0
Gb_32894	0.21	0.01	0.08	0.05	0.12	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.13	1.0
Gb_34217	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	1.0
Gb_34286	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	1.0
Gb_34320	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_35552	0.05	0.1	0.15	0.03	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.13	0.09	1.0
Gb_35783	0.13	0.01	0.04	0.03	0.03	0.13	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.27	0.06	1.0
Gb_35959	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.19	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.01	1.0
Gb_36618	0.26	0.01	0.06	0.0	0.01	0.0	0.0	0.14	0.21	0.22	0.18	0.13	0.29	0.19	0.16	0.01	0.03	0.04	0.01	1.0
Gb_36619	0.08	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.03	1.0
Gb_36752	0.09	0.07	0.05	0.02	0.02	0.01	0.21	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.24	1.0
Gb_38429	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0
Gb_38462	0.2	0.0	0.03	0.0	0.04	0.0	0.0	0.45	0.38	0.54	0.24	0.32	0.54	0.55	0.29	0.07	0.12	0.73	0.03	1.0
Gb_39224	0.45	0.31	0.18	0.16	0.21	0.11	0.09	0.17	0.21	0.19	0.23	0.13	0.24	0.17	0.27	0.15	0.09	0.18	0.13	1.0
Gb_39464	0.01	0.03	0.08	0.0	0.01	0.09	0.12	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.05	0.02	1.0
Gb_39491	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.04	1.0
Gb_39671	0.24	0.03	0.08	0.15	0.06	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.13	0.06	1.0
Gb_39712	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.14	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.07	1.0
Gb_39789	0.25	0.64	0.6	0.43	0.43	0.36	0.51	0.16	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.05	0.07	0.05	0.46	0.32	1.0
Gb_39887	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.2	1.0
Gb_40870	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.1	0.01	0.08	0.02	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.0	0.0	0.04	0.01	0.01	1.0
Gb_41259	0.05	0.03	0.03	0.03	0.05	0.17	0.06	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.0	0.05	0.04	0.06	0.1	0.24	1.0
Gb_41449	0.12	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.31	0.35	0.31	0.8	0.15	0.56	0.4	0.65	0.2	0.15	0.05	0.03	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)