Heatmap: Cluster_281 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.89 0.45 0.99 1.0 0.64 0.06 0.27 0.34 0.31 0.23 0.47 0.14 0.09 0.12 0.22 0.42 0.23 0.41 0.38 0.07
1.0 0.36 0.72 0.59 0.63 0.35 0.03 0.26 0.24 0.16 0.19 0.26 0.01 0.01 0.19 0.76 0.48 0.45 0.26 0.09
0.9 0.97 0.98 1.0 0.59 0.55 0.31 0.45 0.33 0.24 0.36 0.24 0.37 0.36 0.35 0.61 0.39 0.51 0.29 0.22
0.77 0.23 0.4 1.0 0.45 0.37 0.27 0.25 0.17 0.09 0.21 0.15 0.34 0.38 0.19 0.2 0.13 0.31 0.08 0.12
0.92 0.88 1.0 0.94 0.51 0.55 0.3 0.37 0.26 0.19 0.1 0.18 0.22 0.21 0.2 0.34 0.21 0.37 0.14 0.14
0.89 0.41 0.61 1.0 0.62 0.38 0.37 0.38 0.18 0.18 0.25 0.28 0.22 0.23 0.24 0.4 0.42 0.43 0.23 0.13
0.79 0.5 0.54 1.0 0.4 0.42 0.14 0.35 0.27 0.26 0.3 0.17 0.29 0.24 0.29 0.36 0.24 0.42 0.09 0.25
0.63 0.67 1.0 0.84 0.77 0.12 0.01 0.24 0.23 0.28 0.14 0.18 0.12 0.08 0.11 0.49 0.57 0.33 0.17 0.08
0.86 0.92 1.0 0.8 0.67 0.23 0.35 0.44 0.36 0.38 0.44 0.25 0.38 0.31 0.52 0.35 0.37 0.69 0.62 0.32
0.4 1.0 0.63 0.82 0.62 0.24 0.3 0.31 0.2 0.14 0.25 0.25 0.19 0.21 0.23 0.32 0.2 0.35 0.2 0.17
1.0 0.32 0.66 0.68 0.36 0.4 0.05 0.42 0.31 0.16 0.3 0.22 0.21 0.19 0.24 0.5 0.46 0.22 0.17 0.08
1.0 0.45 0.74 0.69 0.55 0.08 0.06 0.19 0.17 0.1 0.09 0.16 0.11 0.1 0.1 0.35 0.22 0.2 0.14 0.31
1.0 0.24 0.74 0.48 0.18 0.06 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0
0.98 0.61 0.56 1.0 0.46 0.06 0.06 0.18 0.06 0.07 0.01 0.01 0.04 0.02 0.01 0.25 0.27 0.2 0.01 0.01
0.96 0.65 0.64 1.0 0.8 0.79 0.5 0.37 0.27 0.23 0.17 0.2 0.35 0.35 0.17 0.32 0.35 0.4 0.2 0.33
0.43 1.0 0.46 0.42 0.43 0.21 0.38 0.43 0.6 0.54 0.47 0.39 0.21 0.22 0.52 0.63 0.39 0.41 0.18 0.23
1.0 0.85 0.87 0.86 0.67 0.59 0.11 0.43 0.44 0.39 0.52 0.37 0.23 0.23 0.47 0.58 0.52 0.42 0.31 0.14
1.0 0.0 0.13 0.55 0.02 0.05 0.0 0.06 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.08 0.15 0.0 0.0
0.78 0.02 0.05 0.85 0.11 1.0 0.0 0.22 0.07 0.04 0.06 0.1 0.03 0.02 0.03 0.11 0.19 0.47 0.0 0.0
0.5 0.25 0.54 1.0 0.7 0.06 0.07 0.24 0.1 0.08 0.11 0.13 0.07 0.07 0.06 0.19 0.15 0.37 0.13 0.06
0.81 0.96 1.0 0.87 0.74 0.47 0.29 0.48 0.37 0.34 0.4 0.31 0.34 0.26 0.42 0.44 0.36 0.57 0.53 0.27
1.0 0.6 0.46 0.62 0.42 0.41 0.63 0.3 0.2 0.18 0.21 0.19 0.36 0.2 0.17 0.27 0.29 0.08 0.0 0.01
1.0 0.26 0.35 0.31 0.08 0.07 0.0 0.13 0.16 0.19 0.02 0.08 0.02 0.01 0.03 0.35 0.5 0.02 0.0 0.0
1.0 0.11 0.42 0.65 0.06 0.05 0.0 0.22 0.21 0.22 0.09 0.18 0.14 0.08 0.03 0.42 0.53 0.03 0.0 0.0
0.77 0.54 0.77 1.0 0.57 0.35 0.18 0.46 0.34 0.35 0.33 0.33 0.38 0.36 0.33 0.41 0.43 0.54 0.23 0.53
0.66 0.45 0.46 1.0 0.47 0.07 0.08 0.26 0.11 0.08 0.19 0.08 0.17 0.15 0.2 0.16 0.15 0.29 0.16 0.18
1.0 0.33 0.93 0.83 0.49 0.36 0.16 0.39 0.17 0.17 0.17 0.21 0.24 0.17 0.2 0.12 0.11 0.4 0.3 0.2
0.78 0.54 1.0 0.79 0.69 0.32 0.25 0.4 0.38 0.31 0.35 0.39 0.19 0.19 0.33 0.71 0.66 0.43 0.41 0.18
1.0 0.18 0.82 0.82 0.5 0.37 0.14 0.32 0.37 0.3 0.35 0.28 0.27 0.28 0.32 0.39 0.33 0.38 0.17 0.14
1.0 0.31 0.45 0.7 0.73 0.55 0.28 0.21 0.11 0.11 0.09 0.13 0.13 0.1 0.12 0.08 0.15 0.27 0.02 0.13
1.0 0.33 0.44 0.8 0.7 0.57 0.28 0.21 0.11 0.12 0.09 0.17 0.07 0.06 0.08 0.09 0.17 0.33 0.03 0.15
1.0 0.55 0.56 0.63 0.64 0.24 0.64 0.47 0.7 0.51 0.67 0.28 0.32 0.32 0.64 0.81 0.37 0.47 0.14 0.28
1.0 0.7 0.63 0.76 0.66 0.29 0.52 0.49 0.61 0.45 0.58 0.26 0.37 0.32 0.58 0.69 0.3 0.51 0.28 0.25
0.4 1.0 0.29 0.38 0.19 0.1 0.15 0.23 0.32 0.22 0.13 0.14 0.12 0.19 0.12 0.5 0.17 0.24 0.07 0.08
1.0 0.56 0.95 0.88 0.71 0.26 0.11 0.41 0.43 0.32 0.54 0.26 0.1 0.1 0.5 0.47 0.32 0.74 0.31 0.21
0.55 0.69 0.95 1.0 0.66 0.26 0.18 0.32 0.23 0.2 0.21 0.23 0.22 0.21 0.27 0.39 0.39 0.36 0.22 0.15
1.0 0.41 0.86 0.82 0.48 0.41 0.2 0.42 0.33 0.3 0.36 0.34 0.27 0.24 0.32 0.39 0.53 0.4 0.26 0.15
1.0 0.4 0.72 0.99 0.82 0.36 0.27 0.45 0.51 0.42 0.6 0.51 0.14 0.18 0.49 0.78 0.68 0.66 0.58 0.23
0.92 0.81 0.51 0.76 0.91 1.0 0.45 0.45 0.32 0.43 0.14 0.3 0.18 0.22 0.14 0.59 0.71 0.61 0.35 0.52
0.83 0.54 0.68 1.0 0.62 0.41 0.23 0.44 0.42 0.32 0.34 0.31 0.27 0.3 0.32 0.9 0.57 0.52 0.46 0.28
1.0 0.22 0.37 0.6 0.31 0.14 0.12 0.33 0.49 0.3 0.29 0.15 0.2 0.26 0.34 0.96 0.68 0.2 0.06 0.05
1.0 0.64 0.36 0.81 0.56 0.02 0.0 0.23 0.06 0.04 0.04 0.19 0.03 0.05 0.04 0.53 0.37 0.39 0.0 0.05
1.0 0.38 0.5 0.97 0.47 0.17 0.25 0.21 0.14 0.11 0.13 0.2 0.13 0.12 0.16 0.38 0.24 0.28 0.09 0.07
0.65 0.95 0.81 1.0 0.36 0.06 0.04 0.26 0.16 0.12 0.22 0.06 0.13 0.1 0.24 0.66 0.25 0.31 0.0 0.01
0.41 1.0 0.53 0.34 0.27 0.1 0.22 0.23 0.26 0.22 0.12 0.13 0.12 0.11 0.13 0.39 0.26 0.19 0.16 0.11
0.78 1.0 0.54 0.79 0.46 0.25 0.32 0.4 0.4 0.31 0.32 0.25 0.23 0.25 0.33 0.8 0.39 0.44 0.26 0.12
0.95 0.69 1.0 0.69 0.42 0.92 0.44 0.1 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.2 0.12 0.08 0.02 0.02
0.9 0.59 0.79 1.0 0.57 0.31 0.1 0.19 0.13 0.09 0.14 0.13 0.1 0.13 0.14 0.4 0.29 0.3 0.05 0.08
0.65 0.51 1.0 0.5 0.45 0.0 0.0 0.14 0.05 0.04 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.42 0.35 0.05 0.0 0.0
0.68 0.8 0.85 0.64 1.0 0.25 0.15 0.41 0.26 0.26 0.4 0.34 0.51 0.52 0.45 0.39 0.42 0.57 0.29 0.23
1.0 0.48 0.68 0.68 0.55 0.38 0.42 0.34 0.31 0.33 0.42 0.22 0.37 0.28 0.39 0.25 0.3 0.3 0.0 0.01
1.0 0.08 0.34 0.9 0.34 0.23 0.01 0.18 0.05 0.04 0.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.35 0.18 0.4 0.04 0.02
0.49 0.87 1.0 0.28 0.47 0.02 0.16 0.2 0.25 0.19 0.14 0.14 0.1 0.09 0.17 0.32 0.28 0.23 0.14 0.24
0.92 0.53 1.0 0.77 0.84 0.17 0.16 0.35 0.36 0.35 0.11 0.2 0.08 0.14 0.08 0.71 0.73 0.78 0.3 0.05
1.0 0.4 0.83 0.82 0.54 0.09 0.18 0.31 0.45 0.35 0.2 0.13 0.15 0.2 0.3 0.59 0.3 0.33 0.26 0.13
0.98 0.64 1.0 0.68 0.62 0.0 0.17 0.21 0.26 0.19 0.11 0.07 0.01 0.02 0.11 0.48 0.33 0.18 0.06 0.06
1.0 0.51 0.61 0.66 0.42 0.15 0.2 0.17 0.26 0.29 0.24 0.17 0.13 0.08 0.19 0.31 0.33 0.23 0.06 0.07
0.72 0.85 0.72 1.0 0.49 0.24 0.18 0.23 0.2 0.16 0.19 0.23 0.29 0.32 0.22 0.61 0.36 0.23 0.05 0.13
0.88 0.69 0.81 1.0 0.68 0.19 0.34 0.32 0.34 0.3 0.46 0.21 0.23 0.22 0.42 0.38 0.41 0.38 0.22 0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)