Heatmap: Cluster_200 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00115	0.0	0.0	0.18	0.06	0.04	0.0	0.0	0.3	0.07	0.02	1.0	0.01	0.16	0.3	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00430	0.97	0.37	0.89	0.58	0.63	0.17	0.18	0.63	0.4	0.41	0.94	0.42	0.65	0.41	0.98	0.63	0.5	0.55	1.0	0.15
Gb_00752	0.89	0.28	0.81	1.0	0.51	0.15	0.25	0.48	0.29	0.29	0.5	0.35	0.25	0.18	0.44	0.32	0.41	0.42	0.46	0.22
Gb_01575	0.36	0.13	0.29	0.61	0.15	0.26	0.26	0.53	0.43	0.45	1.0	0.17	0.04	0.03	0.87	0.17	0.24	0.09	0.11	0.01
Gb_02162	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	1.0	0.74	0.31	0.22	0.06	0.26	0.5	0.18	0.72	0.0	0.0	0.0
Gb_02759	0.65	0.48	0.47	0.45	0.71	0.36	0.24	0.97	0.51	0.42	1.0	0.73	0.34	0.35	0.72	0.52	0.76	0.52	0.38	0.26
Gb_02781	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0
Gb_04816	1.0	0.34	0.72	0.78	0.66	0.28	0.2	0.84	0.48	0.33	0.86	0.36	0.24	0.33	0.99	0.59	0.52	0.65	0.39	0.41
Gb_04908	0.23	0.0	0.0	1.0	0.32	0.19	0.83	0.76	0.4	0.52	0.45	0.57	0.78	0.61	0.27	0.0	0.0	0.14	0.58	0.52
Gb_05032	0.78	0.73	0.92	0.0	0.81	0.06	0.0	0.29	0.5	0.2	0.25	0.1	0.05	0.05	0.34	0.0	0.21	0.63	1.0	0.16
Gb_07060	1.0	0.52	0.62	0.78	0.81	0.32	0.58	0.6	0.5	0.43	0.87	0.36	0.35	0.32	0.79	0.56	0.36	0.67	0.61	0.63
Gb_07061	0.96	0.85	1.0	0.86	0.89	0.44	0.66	0.71	0.69	0.5	0.62	0.35	0.89	0.58	0.66	0.56	0.36	0.57	0.66	0.67
Gb_07944	0.02	0.0	0.0	0.03	0.01	0.49	0.07	1.0	0.19	0.3	0.75	0.81	0.31	0.13	0.73	0.27	0.94	0.05	0.0	0.01
Gb_08155	0.04	0.0	0.04	0.0	0.03	0.06	0.03	1.0	0.05	0.01	0.41	0.03	0.34	0.69	0.33	0.18	0.0	0.26	0.06	0.03
Gb_08435	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.7	0.05	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0
Gb_08451	0.43	0.65	0.75	0.14	0.21	0.22	0.59	0.08	0.03	0.02	0.02	0.03	0.0	0.0	0.01	0.19	0.12	0.29	1.0	0.19
Gb_08532	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.01	0.16	0.0	0.0	0.03	0.0	1.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_08544	0.37	0.94	0.31	0.11	0.72	0.19	0.35	0.85	0.89	0.88	1.0	0.3	0.45	0.43	0.63	0.64	0.42	0.58	0.99	0.47
Gb_09050	0.13	0.0	0.25	0.05	0.55	0.32	0.16	0.2	0.02	0.03	0.23	0.18	0.08	0.06	0.05	0.0	0.05	0.38	1.0	0.6
Gb_09476	0.0	1.0	0.09	0.0	0.0	0.05	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0
Gb_10617	0.5	1.0	0.9	0.36	1.0	0.12	0.35	0.35	0.47	0.45	0.51	0.17	0.15	0.15	0.55	0.27	0.06	0.49	0.93	0.44
Gb_11305	0.25	0.14	0.2	0.43	0.43	0.15	0.05	0.73	0.64	0.5	0.98	0.14	0.65	0.72	0.97	1.0	0.73	0.48	0.54	0.17
Gb_11610	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12641	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_13081	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.03	0.67	1.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13145	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_13318	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.38	0.0	0.72	1.0	0.24	0.0	0.0	0.01	0.0	0.08
Gb_13343	0.9	0.79	0.87	1.0	0.69	0.21	0.78	0.67	0.57	0.54	0.91	0.45	0.34	0.3	0.87	0.47	0.45	0.55	0.78	0.47
Gb_13816	0.32	1.0	0.46	0.44	0.21	0.1	0.14	0.36	0.12	0.13	0.52	0.14	0.65	0.58	0.56	0.07	0.27	0.27	0.02	0.13
Gb_13963	1.0	0.63	0.81	0.9	0.79	0.42	0.7	0.65	0.5	0.46	0.64	0.44	0.35	0.28	0.64	0.46	0.44	0.57	0.65	0.41
Gb_14000	0.04	0.19	0.08	0.64	0.16	0.01	0.0	0.37	0.28	0.2	0.05	0.12	0.0	0.0	0.01	0.59	1.0	0.08	0.0	0.01
Gb_14296	0.08	0.98	0.99	0.55	0.0	0.04	0.08	0.11	0.01	0.0	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	1.0	0.05
Gb_15201	0.24	0.41	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.2	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.43	0.15	0.06	0.0
Gb_15378	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16645	0.08	0.22	0.23	0.0	0.53	0.45	0.18	0.42	0.0	0.0	0.89	0.03	0.87	1.0	0.69	0.0	0.0	0.18	0.24	0.09
Gb_16751	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.72	0.0	1.0	0.23	0.13	0.08	0.04	0.42	0.55	0.08	0.12	0.16	0.0	0.0	0.01
Gb_16980	0.51	0.81	0.66	0.15	0.58	0.55	0.27	0.68	0.33	0.36	1.0	0.45	0.18	0.25	0.88	0.44	0.45	0.31	0.66	0.22
Gb_17254	0.19	0.3	0.21	0.19	0.39	0.33	0.0	0.99	0.36	0.33	0.39	0.4	0.69	1.0	0.35	0.46	0.33	0.31	0.03	0.02
Gb_17342	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.02	0.0	0.4	1.0	0.67	0.23	0.15	0.36	0.51	0.24	0.24	0.32	0.0	0.0	0.01
Gb_17848	0.08	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04	0.04	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.93	0.08	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_18167	0.92	0.62	0.62	0.81	0.84	0.3	0.54	0.73	0.57	0.49	1.0	0.32	0.69	0.47	0.84	0.26	0.53	0.78	0.46	0.34
Gb_18168	0.87	0.31	1.0	0.67	0.44	0.03	0.3	0.36	0.43	0.41	0.76	0.26	0.22	0.18	0.71	0.59	0.35	0.23	0.58	0.42
Gb_18466	1.0	0.35	0.63	0.39	0.44	0.03	0.17	0.26	0.2	0.26	0.46	0.09	0.08	0.04	0.24	0.25	0.1	0.27	0.11	0.14
Gb_18871	0.01	0.06	0.04	0.07	0.0	0.01	0.02	0.95	0.06	0.04	0.1	0.0	1.0	0.41	0.82	0.0	0.0	0.08	0.0	0.02
Gb_19543	0.54	0.6	0.47	0.45	0.99	0.23	0.71	0.3	0.21	0.31	0.36	0.17	0.14	0.17	0.33	0.12	0.12	0.4	1.0	0.54
Gb_19668	0.81	0.37	0.44	0.45	0.42	0.27	0.24	0.54	0.24	0.32	0.77	0.25	0.42	0.46	1.0	0.69	0.71	0.28	0.25	0.19
Gb_19721	0.27	0.18	0.35	0.81	0.22	0.05	0.05	0.36	0.0	0.0	0.44	0.05	0.99	1.0	0.37	0.0	0.12	0.08	0.26	0.0
Gb_19948	0.41	0.0	0.31	0.1	0.14	0.07	0.29	0.37	0.31	0.36	0.56	0.2	1.0	0.74	0.7	0.28	0.3	0.09	0.02	0.32
Gb_21217	0.45	0.47	0.84	0.24	0.7	0.27	0.23	0.44	0.31	0.19	0.79	0.17	0.13	0.13	0.7	0.57	0.47	0.59	1.0	0.26
Gb_21268	0.2	0.25	0.43	0.45	0.22	0.26	0.23	0.33	0.23	0.22	0.56	0.11	0.01	0.02	0.43	0.29	0.27	0.26	1.0	0.15
Gb_22158	0.33	0.5	0.36	0.43	0.42	0.17	0.18	0.73	0.66	0.64	1.0	0.54	0.44	0.47	0.92	0.58	0.85	0.38	0.38	0.3
Gb_22225	1.0	0.41	0.84	0.87	0.65	0.08	0.47	0.55	0.45	0.57	0.97	0.48	0.28	0.23	0.93	0.75	0.7	0.38	0.93	0.23
Gb_22248	0.25	0.0	0.11	0.35	0.86	0.01	0.11	0.23	0.15	0.17	0.65	0.4	1.0	0.89	0.89	0.0	0.39	0.12	0.13	0.24
Gb_22371	0.5	0.4	0.47	0.58	0.56	0.26	0.19	0.77	0.7	0.66	1.0	0.62	0.27	0.3	0.94	0.51	0.81	0.53	0.61	0.39
Gb_22664	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.22	0.04	0.03	0.04	0.0	1.0	0.76	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23169	0.21	0.0	0.11	0.04	0.22	0.0	0.04	0.94	0.34	0.07	1.0	0.02	0.8	0.79	0.71	0.24	0.43	0.0	0.05	0.0
Gb_23713	0.43	0.95	1.0	0.0	0.73	0.15	0.0	0.26	0.25	0.15	0.26	0.21	0.13	0.13	0.23	0.31	0.24	0.53	0.67	0.28
Gb_23716	0.31	0.33	0.58	1.0	0.47	0.17	0.1	0.32	0.16	0.19	0.43	0.13	0.41	0.5	0.33	0.21	0.41	0.24	0.09	0.07
Gb_24819	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.69	0.0	1.0	0.43	0.37	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0
Gb_25642	1.0	0.52	0.84	0.94	0.72	0.18	0.16	0.7	0.51	0.32	0.78	0.29	0.14	0.18	0.85	0.39	0.31	0.65	0.43	0.31
Gb_26296	0.73	0.31	0.8	1.0	0.51	0.13	0.21	0.47	0.37	0.38	0.57	0.4	0.14	0.15	0.51	0.5	0.54	0.39	0.66	0.37
Gb_26432	0.06	0.2	0.11	1.0	0.39	0.06	0.03	0.13	0.09	0.06	0.05	0.03	0.13	0.17	0.04	0.16	0.19	0.4	0.49	0.06
Gb_26444	0.79	0.64	0.83	0.71	0.75	0.26	0.32	0.66	0.52	0.64	1.0	0.4	0.69	0.6	0.84	0.35	0.26	0.85	0.88	0.59
Gb_27440	0.74	0.54	0.81	0.67	0.9	0.95	0.19	0.75	0.52	0.31	0.63	0.2	0.76	0.6	1.0	0.27	0.13	0.63	0.48	0.59
Gb_27757	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.41	0.28	0.27	0.94	0.34	1.0	0.85	0.55	0.36	0.17	0.0	0.0	0.4
Gb_27898	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27903	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28320	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0	0.54	0.0	0.63	0.71	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28366	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.02	0.75	0.44	0.0	1.0	0.49	0.06	0.09	0.28	0.19	0.01	0.13	0.34	0.31
Gb_28388	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.08	0.0	0.0	0.2	0.0	0.1	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0
Gb_29234	0.52	0.08	0.26	0.33	0.6	0.52	0.19	0.35	0.09	0.12	0.27	0.17	0.14	0.3	0.26	0.45	0.56	0.53	1.0	0.4
Gb_29402	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.46	0.29	0.24	1.0	0.07	0.02	0.04	0.66	0.15	0.18	0.01	0.0	0.01
Gb_29412	0.01	0.0	0.0	0.17	0.31	0.09	0.0	0.36	0.0	0.03	0.14	0.0	1.0	0.8	0.14	0.0	0.0	0.04	0.1	0.28
Gb_29766	0.74	0.71	1.0	0.83	0.63	0.35	0.55	0.61	0.54	0.46	0.64	0.42	0.27	0.22	0.75	0.43	0.49	0.61	0.78	0.32
Gb_30099	0.0	0.49	0.0	0.0	1.0	0.25	0.0	0.1	0.06	0.03	0.02	0.12	0.01	0.0	0.06	0.14	0.16	0.12	0.27	0.0
Gb_30525	0.74	0.0	0.0	0.0	0.12	0.21	0.56	1.0	0.55	0.05	0.0	0.24	0.31	0.31	0.48	0.0	0.14	0.36	0.09	0.0
Gb_30923	1.0	0.2	0.65	0.38	0.75	0.19	0.31	0.38	0.19	0.16	0.4	0.13	0.08	0.06	0.28	0.26	0.29	0.46	0.39	0.43
Gb_31195	0.34	0.56	0.15	0.99	0.11	0.0	0.03	0.5	0.16	0.32	0.29	0.15	1.0	0.36	0.18	0.9	0.67	0.5	0.56	0.0
Gb_31722	0.88	0.45	0.45	0.66	0.52	1.0	0.0	0.28	0.06	0.0	0.09	0.32	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.27	0.07	0.1
Gb_32005	0.22	0.47	0.0	0.45	0.0	0.04	0.01	0.43	0.02	0.01	1.0	0.41	0.31	0.01	0.16	0.13	0.39	0.0	0.48	0.0
Gb_32112	0.35	0.15	0.09	0.26	0.08	0.18	0.07	0.32	0.15	0.07	0.1	0.14	0.0	0.09	0.08	1.0	0.84	0.19	0.1	0.02
Gb_32460	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.01	0.0	1.0	0.05	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34314	0.2	0.17	0.0	1.0	0.08	0.0	0.04	0.34	0.03	0.04	0.59	0.0	0.68	0.2	0.47	0.12	0.0	0.0	0.22	0.0
Gb_34337	1.0	0.57	0.55	0.86	0.95	0.32	0.35	0.6	0.41	0.33	0.7	0.4	0.16	0.16	0.8	0.36	0.3	0.82	0.76	0.76
Gb_35085	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03	0.32	0.1	0.0	0.15	0.0	0.1	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0
Gb_35546	0.21	0.41	0.16	0.04	0.24	0.33	0.45	0.3	0.27	0.26	0.4	0.1	0.3	0.29	0.37	0.2	0.23	0.13	0.12	1.0
Gb_35682	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.29	0.34	0.34	0.17	0.05	0.01	0.4	0.17	1.0	0.0	0.23	0.0	0.86	0.44
Gb_35704	0.03	1.0	0.1	0.0	0.11	0.12	0.0	0.24	0.1	0.07	0.09	0.04	0.46	0.36	0.15	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0
Gb_35849	0.57	1.0	0.79	0.56	0.53	0.13	0.31	0.26	0.13	0.21	0.26	0.0	0.04	0.0	0.14	0.11	0.05	0.08	0.56	0.11
Gb_35850	0.0	0.44	0.18	0.18	0.0	0.04	0.01	0.11	0.0	0.0	0.23	0.02	0.0	0.02	0.09	0.02	0.01	0.41	1.0	0.0
Gb_36098	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.17	0.0	0.67	1.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19
Gb_37150	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.57	0.18	0.36	1.0	0.0	0.17	0.82	0.3	0.0	0.08	0.0	0.0	0.59
Gb_37197	0.57	0.05	0.45	0.58	0.7	0.3	0.2	0.6	0.27	0.27	0.91	0.31	0.12	0.22	0.72	0.52	0.7	0.51	1.0	0.33
Gb_37895	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38196	1.0	0.14	0.75	0.82	0.54	0.04	0.17	0.26	0.12	0.16	0.27	0.1	0.08	0.09	0.32	0.1	0.1	0.3	0.15	0.17
Gb_38229	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	1.0	0.43	0.0	0.76	0.27	0.06	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0
Gb_39111	0.3	0.39	0.72	0.91	0.12	0.0	0.24	0.09	0.16	0.24	0.05	0.01	0.0	0.02	0.26	0.23	0.31	0.45	1.0	0.0
Gb_39125	0.32	0.68	0.0	0.0	0.26	0.12	0.1	0.66	0.82	0.43	0.37	0.15	1.0	0.76	0.37	0.29	0.59	0.02	0.1	0.0
Gb_39617	0.66	1.0	0.56	0.0	0.83	0.1	0.0	0.32	0.46	0.25	0.33	0.12	0.27	0.26	0.38	0.36	0.26	0.62	0.91	0.25
Gb_39876	0.37	0.39	0.42	0.51	0.59	0.51	0.22	0.53	0.31	0.26	0.54	0.27	0.25	0.26	0.56	0.37	0.38	1.0	0.96	0.33
Gb_40181	0.53	1.0	0.34	0.62	0.73	0.35	0.26	0.61	0.55	0.66	0.92	0.39	0.58	0.41	0.77	0.76	0.44	0.29	0.47	0.05
Gb_40575	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	0.5	0.01	0.81	0.65	0.55	0.0	0.0	0.7	1.0	0.34	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0
Gb_40826	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40992	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.31	0.07	0.05	0.44	0.0	0.74	1.0	0.58	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41522	0.26	0.14	0.36	0.76	0.39	0.05	0.09	0.07	0.03	0.04	0.0	0.21	0.04	0.03	0.0	0.04	0.01	0.56	1.0	0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)