Heatmap: Cluster_247 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_02220	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02720	0.5	0.24	0.44	0.23	0.41	0.58	0.08	0.22	0.03	0.04	0.04	0.05	0.01	0.01	0.05	0.09	0.07	1.0	0.17	0.82
Gb_02777	0.11	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	1.0
Gb_06717	0.16	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	1.0
Gb_07280	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07973	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_08557	0.28	0.03	0.06	0.06	0.05	0.07	0.3	0.12	0.13	0.13	0.25	0.09	0.09	0.08	0.34	0.18	0.12	0.2	0.11	1.0
Gb_08817	0.0	0.0	0.86	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0
Gb_09176	0.16	0.06	0.0	0.04	0.09	0.49	0.03	0.2	0.11	0.17	0.39	0.25	0.19	0.1	0.45	0.04	0.01	0.1	0.03	1.0
Gb_09182	0.04	0.0	0.0	0.02	0.03	0.37	0.05	0.08	0.07	0.11	0.27	0.14	0.15	0.08	0.45	0.12	0.03	0.03	0.06	1.0
Gb_09707	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_09708	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10544	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10943	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_11768	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_11794	0.04	0.12	0.12	0.05	0.04	0.14	0.1	0.09	0.03	0.02	0.1	0.08	0.04	0.05	0.1	0.01	0.01	0.31	0.01	1.0
Gb_11795	0.25	0.32	0.18	0.0	0.13	0.87	0.57	0.3	0.15	0.1	0.71	0.28	0.16	0.19	0.86	0.0	0.06	1.0	0.03	0.99
Gb_11806	0.38	0.21	0.15	0.33	0.2	0.31	0.12	0.18	0.16	0.12	0.16	0.12	0.2	0.22	0.2	0.11	0.12	0.34	0.26	1.0
Gb_13041	0.18	0.11	0.1	0.16	0.15	0.06	0.38	0.34	1.0	0.68	0.29	0.74	0.23	0.37	0.5	0.34	0.32	0.1	0.02	0.09
Gb_13042	0.38	0.25	0.25	0.11	0.09	1.0	0.56	0.13	0.03	0.06	0.06	0.25	0.07	0.19	0.04	0.05	0.05	0.91	0.03	0.63
Gb_14584	0.13	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.73	0.05	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	1.0
Gb_14594	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.02	0.03	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_16223	0.08	0.24	0.14	0.19	0.31	0.07	0.86	0.1	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.02	0.03	0.0	0.0	0.77	0.17	1.0
Gb_16399	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16409	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.67	0.0
Gb_16706	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_16782	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17539	0.41	0.23	0.18	0.32	0.19	0.22	0.45	0.12	0.06	0.06	0.14	0.19	0.04	0.06	0.15	0.09	0.08	0.61	0.15	1.0
Gb_17584	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17956	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.35	0.04	0.01	0.0	0.18	0.28	0.05	0.03	0.27	0.12	0.2	0.01	0.01	1.0
Gb_18899	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_19044	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19216	0.94	0.0	0.61	1.0	0.34	0.35	0.17	0.07	0.1	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.26
Gb_19761	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21888	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.27	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	1.0
Gb_21997	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22637	0.07	0.0	0.09	0.0	0.02	1.0	0.04	0.01	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.08	0.0	0.19
Gb_22874	0.24	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.57	0.18	1.0
Gb_23683	0.05	0.04	0.03	0.01	0.02	0.34	0.02	0.06	0.01	0.01	0.0	0.29	0.03	0.12	0.0	0.0	0.01	0.63	0.02	1.0
Gb_24387	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24700	0.32	0.54	0.12	0.0	0.14	0.0	0.68	0.01	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_25109	0.31	0.03	0.17	0.11	0.08	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.26
Gb_25199	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0
Gb_25347	0.08	0.0	0.23	0.0	0.1	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.04	0.0	0.0	0.06	0.03	0.0	0.08	0.11	1.0
Gb_25816	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26064	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26517	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_27031	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27434	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_28010	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28328	0.42	1.0	0.36	0.4	0.04	0.0	0.03	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0
Gb_28721	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.39	0.24	0.09	0.0	0.27	0.34	0.15	0.09	0.04	0.46	0.17	1.0
Gb_28848	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.25	0.03	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30998	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31136	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_32002	0.27	0.61	0.29	0.14	0.11	0.16	0.07	0.19	0.1	0.13	0.28	0.39	0.16	0.13	0.16	0.16	0.5	0.12	0.33	1.0
Gb_34802	0.0	1.0	0.25	0.0	0.17	0.12	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34970	0.7	0.87	0.4	0.35	0.95	0.11	0.18	0.34	0.2	0.06	0.29	0.08	0.4	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_35156	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36195	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37856	0.22	1.0	0.24	0.02	0.07	0.37	0.26	0.03	0.03	0.03	0.0	0.0	0.03	0.03	0.01	0.0	0.03	0.09	0.01	0.19
Gb_38277	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38337	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_38408	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38450	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38469	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.14	0.02	0.07	0.32	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39170	0.55	0.0	0.2	0.0	0.0	0.52	0.36	0.45	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.32	1.0
Gb_39319	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)