Heatmap: Cluster_79 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.42 0.53 0.8 0.65 0.21 0.32 0.38 0.42 0.36 0.72 0.24 0.32 0.24 0.7 0.66 0.44 0.37 0.49 0.4
1.0 0.28 0.53 0.95 0.6 0.19 0.31 0.37 0.43 0.38 0.6 0.23 0.35 0.33 0.52 0.67 0.41 0.43 0.48 0.51
0.68 0.46 0.35 0.64 0.65 0.24 0.3 0.57 0.53 0.49 0.93 0.35 0.48 0.36 0.93 0.69 0.48 0.53 1.0 0.49
0.62 0.15 0.07 0.43 0.0 0.08 0.04 0.48 0.39 0.23 0.13 0.03 0.25 0.5 0.4 1.0 0.24 0.13 0.87 0.11
0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.15 0.41 0.6 0.77 0.02 0.38 0.32 1.0 0.88 0.05 0.03 0.07 0.19
0.17 0.01 0.02 0.22 0.22 0.01 0.07 0.12 0.19 0.17 0.29 0.07 0.19 0.2 0.24 1.0 0.36 0.14 0.08 0.35
0.23 0.02 0.06 0.28 0.11 0.03 0.08 0.18 0.25 0.15 0.24 0.08 0.12 0.09 0.47 1.0 0.49 0.14 0.16 0.31
0.55 0.19 0.15 0.56 0.35 0.15 0.12 0.31 0.37 0.33 0.51 0.18 0.27 0.19 0.59 1.0 0.52 0.32 0.56 0.36
0.87 0.71 0.5 0.81 0.95 0.49 0.31 0.73 0.54 0.46 0.93 0.6 0.45 0.39 0.84 0.92 0.63 0.62 1.0 0.5
0.12 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.3 0.13 0.76 0.03 0.31 0.25 1.0 0.69 0.68 0.0 0.08 0.0
1.0 0.48 0.55 0.82 0.81 0.31 0.35 0.58 0.56 0.44 0.87 0.35 0.39 0.31 0.83 0.58 0.5 0.55 0.56 0.44
0.56 0.32 0.23 0.48 0.58 0.51 0.64 0.46 0.43 0.42 1.0 0.36 0.32 0.28 0.96 0.77 0.54 0.61 0.94 0.85
0.12 0.2 0.12 0.1 0.1 0.03 0.02 0.15 0.23 0.35 0.63 0.02 0.24 0.24 0.64 1.0 0.24 0.06 0.08 0.07
0.67 0.34 0.46 0.69 0.83 0.56 0.41 0.82 0.5 0.52 0.85 0.44 0.58 0.53 0.73 0.53 0.55 1.0 0.92 0.95
0.49 0.23 0.2 0.54 0.36 0.1 0.3 0.29 0.56 0.46 0.72 0.21 0.41 0.54 0.59 1.0 0.49 0.31 0.22 0.5
0.61 0.1 0.16 0.48 0.45 0.12 0.32 0.35 0.45 0.39 0.92 0.21 0.18 0.18 1.0 0.7 0.45 0.31 0.44 0.57
0.79 0.37 0.31 0.67 0.54 0.22 0.29 0.52 0.63 0.45 0.88 0.28 0.36 0.35 0.94 1.0 0.47 0.48 0.77 0.56
0.45 0.11 0.07 0.6 0.31 0.4 0.23 0.28 0.36 0.33 0.57 0.23 0.16 0.24 0.62 1.0 0.56 0.39 0.41 0.54
1.0 0.12 0.27 0.77 0.63 0.06 0.25 0.22 0.37 0.4 0.54 0.14 0.26 0.24 0.58 0.83 0.33 0.2 0.31 0.47
1.0 0.14 0.32 1.0 0.67 0.0 0.2 0.24 0.27 0.28 0.28 0.18 0.52 0.38 0.43 0.71 0.14 0.21 0.38 0.52
1.0 0.14 0.33 0.74 0.46 0.05 0.1 0.2 0.28 0.24 0.5 0.14 0.1 0.11 0.51 0.51 0.25 0.19 0.44 0.23
0.84 0.33 0.57 0.61 0.64 0.17 0.23 0.4 0.3 0.27 0.65 0.29 0.25 0.29 0.56 1.0 0.42 0.6 0.42 0.24
0.94 0.44 0.43 0.65 0.71 0.86 0.31 0.7 0.59 0.59 1.0 0.32 0.92 0.73 0.95 0.61 0.51 0.56 0.98 0.41
0.38 0.27 0.08 0.79 0.3 0.1 0.12 0.49 0.36 0.39 0.39 0.0 0.56 0.55 0.36 1.0 0.35 0.11 0.76 0.08
0.34 0.29 0.14 1.0 0.18 0.06 0.11 0.32 0.21 0.07 0.09 0.0 0.25 0.12 0.44 0.57 0.47 0.08 0.47 0.15
0.64 0.12 0.06 0.51 0.06 0.13 0.23 0.4 0.28 0.15 0.2 0.01 0.72 1.0 0.27 0.85 0.23 0.1 0.79 0.0
0.05 0.46 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.2 0.17 0.0 0.0 0.5 0.26 0.26 0.83 0.37 0.0 0.15 0.19
0.95 0.41 0.51 0.79 0.7 0.32 0.49 0.57 0.59 0.58 1.0 0.3 0.74 0.61 0.97 0.92 0.72 0.65 0.51 0.55
1.0 0.59 0.5 0.84 0.79 0.42 0.34 0.66 0.69 0.62 0.77 0.44 0.69 0.56 0.72 0.58 0.52 0.64 0.93 0.73
1.0 0.55 0.55 0.8 0.7 0.35 0.28 0.61 0.58 0.55 0.99 0.39 0.58 0.41 0.98 0.74 0.59 0.63 0.64 0.42
0.41 0.2 0.15 0.57 0.48 0.35 0.24 0.54 0.35 0.38 0.61 0.25 0.35 0.29 0.67 0.33 0.3 1.0 0.71 0.31
0.93 0.25 0.53 0.18 0.28 0.07 0.04 0.47 0.31 0.23 0.49 0.01 1.0 0.35 0.19 0.74 0.4 0.32 0.69 0.1
0.32 0.2 0.38 0.03 0.32 0.1 0.17 0.28 0.55 0.4 0.84 0.28 0.33 0.49 0.66 1.0 0.42 0.3 0.18 0.39
0.23 0.0 0.0 0.63 0.13 0.08 0.04 0.34 0.13 0.26 1.0 0.05 0.55 0.41 0.64 0.63 0.14 0.0 0.87 0.23
0.88 0.36 0.46 1.0 0.7 0.36 0.29 0.54 0.52 0.47 0.91 0.31 0.39 0.36 0.83 0.91 0.77 0.66 0.52 0.35
0.93 0.16 0.19 0.83 0.56 0.15 0.31 0.38 0.5 0.39 0.6 0.26 0.48 0.47 0.6 1.0 0.71 0.35 0.56 0.58
0.09 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.05 0.11 0.42 0.19 0.49 0.02 0.07 0.13 0.37 1.0 0.0 0.08 0.27 0.0
0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.43 0.12 0.39 0.35 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.38 0.33
0.79 0.34 0.39 0.74 0.89 0.61 0.3 0.48 0.3 0.3 0.63 0.35 0.13 0.15 0.53 0.61 0.58 0.99 1.0 0.78
0.28 0.09 0.07 0.36 0.28 0.31 0.46 0.33 0.37 0.28 0.47 0.17 0.28 0.28 0.46 1.0 0.58 0.25 0.58 0.49
0.35 0.15 0.15 0.53 0.3 0.63 0.57 0.43 0.4 0.38 0.41 0.21 0.53 0.42 0.57 0.63 0.56 0.42 1.0 0.46
0.15 0.0 0.0 0.0 0.05 0.19 0.0 0.27 0.03 0.22 0.19 0.0 0.44 0.46 0.17 1.0 0.21 0.1 0.21 0.04
0.03 0.06 0.03 0.02 0.02 0.04 0.22 0.17 0.29 0.29 1.0 0.22 0.23 0.21 0.93 0.18 0.06 0.09 0.16 0.52
0.92 0.78 0.42 0.72 0.71 0.2 0.32 0.47 0.61 0.53 0.99 0.36 0.43 0.33 1.0 0.86 0.43 0.44 0.71 0.47
0.55 0.33 0.31 0.97 0.08 0.26 0.04 0.34 0.28 0.3 0.44 0.02 0.73 0.66 0.41 1.0 0.24 0.07 0.37 0.14
0.44 0.15 0.16 0.36 0.58 0.18 0.23 0.35 0.41 0.28 0.68 0.41 0.31 0.34 0.51 1.0 0.55 0.26 0.26 0.45
0.59 0.27 0.16 0.38 0.64 0.11 0.23 0.36 0.38 0.33 0.61 0.36 0.17 0.17 0.56 1.0 0.56 0.29 0.26 0.38
0.67 0.27 0.25 0.54 0.74 0.2 0.31 0.47 0.46 0.34 0.89 0.37 0.38 0.42 0.71 1.0 0.53 0.29 0.36 0.41
0.57 0.32 0.31 0.83 0.65 0.19 0.27 0.51 0.4 0.33 1.0 0.43 0.29 0.31 0.82 0.83 0.41 0.37 0.52 0.35
0.76 0.27 0.3 0.6 0.74 0.27 0.3 0.52 0.5 0.39 0.91 0.48 0.39 0.43 0.69 1.0 0.66 0.42 0.51 0.43
0.66 0.3 0.23 0.61 0.59 0.2 0.27 0.48 0.54 0.45 0.97 0.28 0.37 0.3 1.0 0.89 0.51 0.48 0.68 0.53
1.0 0.52 0.52 0.74 0.6 0.18 0.35 0.42 0.47 0.44 0.8 0.28 0.61 0.43 0.77 0.5 0.34 0.4 0.58 0.53
1.0 0.51 0.53 0.93 0.94 0.77 0.62 0.69 0.57 0.48 0.82 0.38 0.69 0.6 0.79 0.6 0.35 0.93 0.88 0.45
0.45 0.14 0.14 0.48 0.38 0.18 0.19 0.38 0.38 0.31 0.56 0.21 0.31 0.33 0.61 1.0 0.69 0.58 0.71 0.63
0.33 0.03 0.05 0.4 0.28 0.12 0.15 0.31 0.27 0.22 0.6 0.12 0.23 0.2 0.51 1.0 0.52 0.4 0.38 0.76
1.0 0.55 0.56 0.77 0.73 0.22 0.26 0.47 0.54 0.47 0.67 0.34 0.42 0.35 0.63 0.71 0.52 0.51 0.52 0.49
0.51 0.0 0.0 0.24 0.1 0.0 0.0 0.16 0.14 0.25 0.63 0.0 0.06 0.08 0.44 1.0 0.21 0.0 0.17 0.0
0.68 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.17 0.26 0.24 0.35 0.07 0.08 0.43 0.31 0.13 0.62 0.08 0.07 0.56 0.06
0.99 0.61 0.62 0.88 0.88 0.29 0.49 0.6 0.73 0.68 1.0 0.35 0.49 0.38 0.94 1.0 0.68 0.7 0.72 0.58
0.11 0.16 0.1 0.18 0.23 0.07 0.06 0.16 0.41 0.34 0.2 0.14 0.21 0.32 0.24 1.0 0.42 0.37 0.09 0.38
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.1 0.21 0.15 0.5 0.58 0.0 0.12 0.64 0.48 0.54 0.0 0.0 0.69 0.13
1.0 0.55 0.56 0.79 0.86 0.29 0.36 0.66 0.71 0.69 0.84 0.46 0.56 0.47 0.89 0.56 0.44 0.65 0.77 0.66

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)