Heatmap: Cluster_318 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.46 0.78 0.69 0.6 0.46 0.46 0.48 0.29 0.26 0.4 0.28 0.28 0.28 0.34 0.3 0.33 0.51 0.54 0.27
0.3 0.22 0.17 0.51 0.73 0.39 0.38 0.43 0.33 0.34 0.41 0.26 0.29 0.28 0.38 0.38 0.3 1.0 0.52 0.53
0.89 0.4 0.62 0.55 1.0 0.37 0.5 0.4 0.28 0.3 0.5 0.21 0.46 0.44 0.63 0.53 0.32 0.88 0.39 0.76
0.84 0.3 0.45 0.86 0.83 1.0 0.42 0.46 0.37 0.34 0.66 0.28 0.37 0.33 0.67 0.43 0.5 0.82 0.59 0.44
1.0 0.15 0.5 0.47 0.75 0.14 0.47 0.23 0.27 0.24 0.41 0.23 0.18 0.15 0.31 0.3 0.34 0.29 0.38 0.49
0.69 0.39 0.45 1.0 0.79 0.32 0.65 0.45 0.37 0.32 0.7 0.22 0.17 0.2 0.64 0.64 0.42 0.85 0.75 0.44
0.82 0.23 0.47 0.73 1.0 0.21 0.37 0.24 0.15 0.16 0.24 0.13 0.11 0.13 0.26 0.21 0.24 0.71 0.74 0.68
0.99 0.26 0.49 0.48 1.0 0.3 0.37 0.28 0.25 0.17 0.25 0.16 0.08 0.09 0.29 0.19 0.21 0.63 0.73 0.7
0.85 0.24 0.46 0.65 0.96 0.25 0.37 0.24 0.19 0.19 0.13 0.13 0.09 0.12 0.24 0.24 0.23 0.83 0.67 1.0
1.0 0.34 0.62 0.54 0.71 0.47 0.32 0.33 0.16 0.15 0.19 0.17 0.21 0.21 0.21 0.14 0.17 0.43 0.18 0.35
0.99 0.56 0.67 0.73 1.0 0.59 0.32 0.44 0.38 0.36 0.39 0.35 0.39 0.39 0.43 0.39 0.41 0.78 0.42 0.61
0.6 0.3 0.3 0.57 0.84 0.31 0.23 0.33 0.3 0.27 0.36 0.21 0.22 0.21 0.3 0.33 0.25 1.0 0.47 0.33
0.81 0.33 0.43 1.0 0.67 0.61 0.57 0.41 0.23 0.24 0.37 0.29 0.43 0.45 0.33 0.29 0.36 0.52 0.33 0.58
0.72 0.26 0.44 0.79 0.64 1.0 0.35 0.41 0.29 0.33 0.56 0.23 0.15 0.15 0.61 0.45 0.45 0.83 0.45 0.45
0.93 0.61 0.61 0.63 1.0 0.41 0.29 0.34 0.29 0.29 0.26 0.27 0.32 0.32 0.22 0.34 0.31 0.82 0.4 0.56
0.44 0.07 0.0 1.0 0.23 0.07 0.06 0.15 0.05 0.02 0.2 0.06 0.13 0.12 0.16 0.0 0.02 0.41 0.04 0.1
1.0 0.37 0.7 0.7 0.7 0.63 0.26 0.27 0.21 0.19 0.2 0.13 0.25 0.24 0.21 0.19 0.21 0.61 0.39 0.39
1.0 0.35 0.53 0.65 0.86 0.67 0.16 0.38 0.24 0.22 0.35 0.24 0.4 0.38 0.3 0.23 0.28 0.73 0.44 0.6
0.83 0.24 0.4 0.65 0.96 0.2 0.46 0.47 0.5 0.33 0.52 0.27 0.08 0.16 0.39 0.85 0.6 1.0 0.49 0.88
0.93 0.75 1.0 0.84 0.61 0.58 0.29 0.43 0.32 0.29 0.45 0.28 0.47 0.39 0.45 0.44 0.4 0.5 0.7 0.33
0.81 0.84 0.83 1.0 0.94 0.52 0.63 0.57 0.56 0.53 0.72 0.4 0.41 0.35 0.78 0.6 0.5 0.82 0.67 0.83
1.0 0.66 0.63 0.85 0.86 0.28 0.43 0.31 0.24 0.26 0.32 0.16 0.36 0.32 0.32 0.42 0.25 0.58 0.48 0.64
0.89 0.62 0.72 1.0 0.76 0.24 0.48 0.46 0.44 0.45 0.61 0.29 0.43 0.39 0.69 0.32 0.27 0.53 0.96 0.5
1.0 0.3 0.39 0.59 0.92 0.11 0.29 0.23 0.08 0.06 0.11 0.08 0.03 0.06 0.1 0.53 0.34 0.65 0.23 0.59
1.0 0.55 0.8 0.72 0.84 0.47 0.31 0.51 0.3 0.3 0.41 0.29 0.35 0.35 0.42 0.32 0.48 0.72 0.4 0.52
0.9 0.55 0.37 1.0 0.7 0.28 0.38 0.18 0.11 0.09 0.07 0.08 0.07 0.07 0.08 0.35 0.16 0.52 0.22 0.27
0.84 0.52 0.59 0.89 0.8 0.61 0.79 0.63 0.36 0.41 0.81 0.34 0.62 0.57 0.68 0.44 0.52 1.0 0.69 0.93
1.0 0.33 0.5 0.89 0.83 0.35 0.35 0.28 0.19 0.16 0.27 0.19 0.13 0.13 0.35 0.23 0.21 0.62 0.41 0.27
1.0 0.31 0.6 0.96 0.66 0.64 0.46 0.41 0.29 0.24 0.32 0.26 0.12 0.15 0.29 0.33 0.34 0.65 0.42 0.26
1.0 0.57 0.82 1.0 0.72 0.72 0.41 0.37 0.22 0.2 0.2 0.22 0.14 0.16 0.22 0.28 0.31 0.76 0.72 0.25
1.0 0.49 0.78 0.58 0.68 0.5 0.18 0.42 0.19 0.18 0.27 0.23 0.34 0.33 0.28 0.15 0.22 0.51 0.38 0.37
0.67 0.6 0.48 0.8 0.73 0.64 0.75 0.63 0.45 0.45 0.66 0.63 0.58 0.7 0.65 0.34 0.46 0.74 1.0 0.45
0.67 0.35 0.73 1.0 0.49 0.11 0.38 0.25 0.21 0.22 0.26 0.18 0.4 0.38 0.26 0.11 0.16 0.31 0.53 0.31
0.72 0.55 0.82 1.0 0.46 0.27 0.3 0.37 0.25 0.25 0.41 0.27 0.35 0.32 0.38 0.26 0.28 0.34 0.61 0.28
1.0 0.46 0.78 0.61 0.78 0.54 0.39 0.3 0.17 0.16 0.11 0.2 0.21 0.21 0.1 0.07 0.1 0.45 0.35 0.3
0.81 0.44 0.53 0.55 1.0 0.28 0.28 0.39 0.39 0.32 0.25 0.23 0.25 0.23 0.21 0.45 0.38 0.91 0.49 0.66
1.0 0.2 0.32 0.36 0.7 0.15 0.25 0.28 0.25 0.2 0.24 0.23 0.21 0.27 0.22 0.24 0.21 0.31 0.29 0.37
1.0 0.27 0.53 0.58 0.89 0.18 0.48 0.21 0.14 0.09 0.2 0.06 0.11 0.09 0.2 0.16 0.16 0.78 0.45 0.54
0.51 0.32 0.46 1.0 0.43 0.11 0.25 0.24 0.11 0.11 0.27 0.13 0.32 0.28 0.27 0.15 0.13 0.33 0.46 0.22
1.0 0.41 0.45 0.78 1.0 0.22 0.36 0.31 0.2 0.18 0.42 0.18 0.39 0.28 0.4 0.26 0.16 0.89 0.51 0.5
0.83 0.4 0.63 1.0 0.62 0.69 0.43 0.52 0.3 0.28 0.4 0.33 0.43 0.45 0.41 0.35 0.45 0.64 0.65 0.39
0.28 0.05 0.0 1.0 0.37 0.24 0.22 0.22 0.06 0.07 0.24 0.06 0.52 0.45 0.2 0.02 0.0 0.24 0.12 0.6
0.74 0.91 0.82 0.74 1.0 0.89 0.63 0.44 0.39 0.35 0.59 0.32 0.27 0.26 0.62 0.42 0.42 0.73 0.76 0.66
1.0 0.66 0.55 0.64 0.96 0.68 0.66 0.44 0.43 0.46 0.55 0.27 0.49 0.4 0.57 0.54 0.51 0.86 0.62 0.55
1.0 0.71 0.56 0.73 0.98 0.43 0.32 0.38 0.51 0.39 0.48 0.24 0.41 0.48 0.47 0.56 0.34 0.66 0.42 0.76
0.73 0.6 0.72 1.0 0.98 0.33 0.3 0.3 0.22 0.2 0.24 0.26 0.23 0.25 0.22 0.22 0.16 0.59 0.41 0.4
0.6 0.37 0.63 1.0 0.42 0.17 0.22 0.24 0.1 0.09 0.13 0.16 0.27 0.25 0.13 0.12 0.13 0.32 0.44 0.15
0.99 0.47 0.43 0.8 1.0 0.35 0.58 0.48 0.39 0.34 0.47 0.28 0.51 0.58 0.45 0.45 0.34 0.68 0.54 0.72
0.68 0.51 0.72 0.59 0.75 0.36 0.35 0.46 0.37 0.34 0.58 0.33 0.47 0.49 0.6 0.52 0.43 1.0 0.48 0.64
1.0 0.33 0.71 0.72 0.98 0.2 0.35 0.21 0.16 0.14 0.21 0.14 0.18 0.14 0.26 0.36 0.27 0.71 0.38 0.67
0.9 0.14 0.37 1.0 0.78 0.24 0.28 0.21 0.23 0.17 0.24 0.15 0.16 0.16 0.16 0.45 0.35 0.69 0.26 0.81
0.96 0.13 0.46 0.85 1.0 0.23 0.26 0.21 0.16 0.15 0.19 0.16 0.22 0.28 0.15 0.46 0.22 0.5 0.37 0.55
1.0 0.24 0.53 0.8 0.88 0.22 0.34 0.21 0.32 0.22 0.24 0.18 0.3 0.37 0.27 0.44 0.28 0.57 0.3 0.6
0.66 0.44 0.43 0.67 1.0 0.81 0.78 0.45 0.28 0.26 0.66 0.34 0.58 0.74 0.71 0.28 0.34 0.96 0.19 0.93
0.87 0.56 0.55 0.7 1.0 0.7 0.99 0.71 0.45 0.41 0.78 0.42 0.52 0.51 0.74 0.46 0.49 0.97 1.0 0.84
0.75 0.34 0.31 0.72 1.0 0.19 0.36 0.36 0.27 0.25 0.37 0.21 0.21 0.3 0.37 0.55 0.36 0.64 0.36 0.35
1.0 0.19 0.38 0.66 0.74 0.22 0.29 0.19 0.23 0.18 0.28 0.08 0.12 0.14 0.32 0.26 0.2 0.57 0.54 0.55
0.71 0.06 0.14 1.0 0.64 0.32 0.72 0.39 0.21 0.22 0.44 0.18 0.3 0.32 0.35 0.18 0.26 0.56 0.07 0.43
0.9 0.36 0.58 0.89 1.0 0.57 0.64 0.49 0.25 0.31 0.56 0.2 0.35 0.34 0.62 0.37 0.35 0.97 0.76 0.77
1.0 0.43 0.5 0.93 0.99 0.88 0.51 0.5 0.38 0.31 0.6 0.36 0.51 0.5 0.58 0.44 0.4 0.75 0.6 0.49
0.89 0.46 0.38 0.78 0.89 0.83 0.45 0.42 0.27 0.24 0.4 0.3 0.46 0.34 0.43 0.27 0.26 0.7 1.0 0.45
1.0 0.11 0.45 0.75 0.92 0.13 0.24 0.25 0.2 0.2 0.19 0.16 0.15 0.1 0.2 0.25 0.26 0.44 0.28 0.65
0.87 0.46 0.58 0.84 0.81 0.37 0.61 0.61 0.39 0.38 0.89 0.37 0.39 0.33 1.0 0.52 0.46 0.89 0.74 0.75
0.75 0.56 0.57 0.45 1.0 0.34 0.5 0.51 0.43 0.39 0.74 0.27 0.46 0.45 0.62 0.42 0.4 0.88 0.5 0.81
0.74 0.51 0.6 0.63 0.91 0.41 0.57 0.57 0.43 0.37 0.93 0.37 0.63 0.54 0.86 0.63 0.47 0.94 0.54 1.0
1.0 0.56 0.8 0.98 0.71 0.54 0.55 0.5 0.36 0.33 0.47 0.35 0.48 0.33 0.45 0.29 0.26 0.54 0.67 0.38
0.71 0.45 0.53 0.47 1.0 0.25 0.39 0.23 0.2 0.14 0.2 0.15 0.18 0.29 0.23 0.26 0.19 0.82 0.44 0.4
0.76 0.51 0.57 0.88 0.93 0.52 0.54 0.36 0.25 0.22 0.5 0.2 0.13 0.1 0.49 0.28 0.16 1.0 0.45 0.37
1.0 0.42 0.68 0.57 0.64 0.24 0.39 0.27 0.18 0.16 0.27 0.11 0.16 0.18 0.25 0.18 0.15 0.54 0.49 0.47
1.0 0.37 0.6 0.77 0.66 0.2 0.38 0.22 0.21 0.19 0.29 0.11 0.19 0.17 0.22 0.2 0.15 0.43 0.34 0.38
0.75 0.33 0.49 0.55 1.0 0.28 0.35 0.33 0.32 0.3 0.34 0.19 0.35 0.42 0.35 0.51 0.36 0.78 0.35 0.77
0.98 0.26 0.48 0.83 1.0 0.25 0.36 0.33 0.3 0.29 0.35 0.2 0.41 0.46 0.37 0.43 0.36 0.84 0.6 0.76
1.0 0.47 0.63 0.81 0.52 0.38 0.23 0.29 0.18 0.13 0.18 0.22 0.18 0.19 0.14 0.31 0.23 0.43 0.29 0.25
1.0 0.36 0.63 0.66 0.74 0.18 0.27 0.23 0.24 0.2 0.23 0.11 0.07 0.05 0.21 0.22 0.25 0.63 0.3 0.48
0.79 0.3 0.63 1.0 0.59 0.56 0.32 0.37 0.16 0.16 0.25 0.22 0.32 0.25 0.25 0.13 0.19 0.6 0.39 0.45
0.98 0.4 0.45 1.0 0.96 0.36 0.25 0.23 0.16 0.13 0.28 0.13 0.21 0.28 0.38 0.24 0.23 0.55 0.22 0.65
1.0 0.0 0.0 0.69 0.8 0.16 1.0 0.38 0.24 0.33 0.0 0.01 0.83 0.69 0.1 0.0 0.0 0.52 0.43 0.73
0.72 0.65 0.63 1.0 0.77 0.25 0.26 0.27 0.12 0.16 0.27 0.13 0.2 0.18 0.25 0.18 0.2 0.65 0.52 0.23
1.0 0.52 0.82 0.74 0.87 0.26 0.37 0.35 0.18 0.17 0.43 0.18 0.39 0.33 0.37 0.26 0.28 0.73 0.36 0.34
0.91 0.48 0.91 1.0 0.68 0.3 0.4 0.48 0.3 0.27 0.26 0.41 0.47 0.42 0.33 0.23 0.27 0.54 0.67 0.34
0.73 0.29 0.47 1.0 0.87 0.5 0.38 0.43 0.31 0.29 0.51 0.3 0.35 0.35 0.51 0.37 0.4 0.86 0.37 0.64
1.0 0.33 0.57 0.57 0.72 0.22 0.35 0.23 0.23 0.18 0.4 0.12 0.12 0.15 0.29 0.35 0.18 0.33 0.25 0.3
0.64 0.46 0.45 0.66 0.79 0.34 0.27 0.43 0.35 0.32 0.49 0.29 0.25 0.28 0.52 0.5 0.49 1.0 0.77 0.48
1.0 0.4 0.66 0.98 0.81 0.76 0.41 0.5 0.39 0.35 0.41 0.33 0.47 0.48 0.4 0.35 0.5 0.73 0.48 0.56

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)