Heatmap: Cluster_315 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00431	0.98	0.47	0.69	1.0	0.75	0.34	0.34	0.51	0.38	0.35	0.66	0.31	0.39	0.38	0.61	0.36	0.34	0.68	0.89	0.48
Gb_01070	0.92	0.6	0.67	0.74	0.94	0.69	0.58	0.62	0.39	0.38	0.67	0.38	0.33	0.31	0.58	0.47	0.51	1.0	0.85	0.54
Gb_01256	0.98	0.7	0.7	0.95	0.9	0.77	0.49	0.52	0.3	0.29	0.5	0.33	0.23	0.2	0.52	0.39	0.39	0.97	1.0	0.81
Gb_01417	1.0	0.36	0.64	0.7	0.64	0.22	0.31	0.46	0.31	0.24	0.42	0.26	0.26	0.23	0.42	0.24	0.26	0.62	0.57	0.58
Gb_02299	1.0	0.62	0.72	0.82	0.77	0.28	0.42	0.48	0.38	0.36	0.65	0.29	0.3	0.28	0.6	0.42	0.33	0.59	0.74	0.48
Gb_04344	0.69	0.57	1.0	0.79	0.75	0.42	0.21	0.25	0.15	0.11	0.3	0.16	0.1	0.1	0.3	0.16	0.18	0.4	0.69	0.43
Gb_04400	0.89	0.77	0.81	1.0	0.97	0.73	0.54	0.62	0.39	0.34	0.72	0.45	0.3	0.28	0.64	0.35	0.45	0.84	0.9	0.63
Gb_05997	0.72	0.34	0.58	1.0	0.59	0.29	0.21	0.34	0.21	0.19	0.35	0.21	0.26	0.23	0.34	0.3	0.28	0.47	0.47	0.31
Gb_06373	1.0	0.65	0.91	0.82	0.75	0.45	0.23	0.32	0.17	0.17	0.36	0.17	0.08	0.08	0.37	0.16	0.15	0.68	0.6	0.36
Gb_07144	0.85	0.58	1.0	0.93	0.91	0.46	0.2	0.39	0.19	0.2	0.34	0.29	0.1	0.09	0.36	0.25	0.34	0.64	0.87	0.38
Gb_07451	0.93	0.4	0.85	0.84	0.86	0.99	0.34	0.47	0.21	0.23	0.33	0.31	0.33	0.34	0.36	0.23	0.41	1.0	0.86	0.52
Gb_08346	0.83	0.43	0.71	1.0	0.86	0.63	0.61	0.56	0.4	0.39	0.54	0.43	0.5	0.49	0.52	0.32	0.36	0.83	0.82	0.63
Gb_09347	0.69	0.5	0.76	1.0	0.96	0.69	0.48	0.5	0.41	0.42	0.71	0.36	0.41	0.34	0.65	0.43	0.48	0.78	0.75	0.51
Gb_09559	1.0	0.47	0.63	0.83	0.99	0.74	0.34	0.41	0.14	0.18	0.21	0.27	0.21	0.3	0.21	0.19	0.21	0.98	0.76	0.34
Gb_09565	0.76	0.53	0.65	0.95	0.73	0.41	0.27	0.4	0.23	0.23	0.41	0.32	0.22	0.27	0.45	0.3	0.29	0.57	1.0	0.41
Gb_09728	0.76	0.85	0.84	0.87	0.95	0.53	0.32	0.42	0.3	0.29	0.43	0.36	0.26	0.2	0.43	0.26	0.23	0.76	1.0	0.49
Gb_10513	0.82	0.65	0.72	0.8	1.0	0.69	0.38	0.67	0.36	0.37	0.57	0.57	0.42	0.37	0.59	0.43	0.45	1.0	0.71	0.64
Gb_11908	1.0	0.81	0.75	0.82	0.97	0.65	0.42	0.53	0.37	0.35	0.48	0.32	0.45	0.4	0.46	0.41	0.39	0.69	0.72	0.58
Gb_11942	0.96	0.7	0.98	0.91	0.79	0.62	0.24	0.4	0.13	0.12	0.23	0.22	0.31	0.28	0.26	0.13	0.18	0.74	1.0	0.41
Gb_12010	0.96	0.67	1.0	0.87	0.76	0.49	0.47	0.53	0.55	0.53	0.69	0.37	0.16	0.14	0.74	0.47	0.45	0.81	0.66	0.68
Gb_12027	0.44	0.12	0.28	0.44	0.54	0.56	0.25	0.34	0.17	0.18	0.27	0.16	0.26	0.26	0.37	0.26	0.34	1.0	0.69	0.64
Gb_12118	0.77	0.67	0.87	1.0	0.79	0.34	0.25	0.33	0.19	0.2	0.27	0.29	0.15	0.16	0.28	0.18	0.34	0.41	0.7	0.31
Gb_12529	0.95	0.53	0.82	1.0	0.95	0.44	0.3	0.41	0.28	0.25	0.35	0.24	0.24	0.22	0.38	0.22	0.3	0.84	0.87	0.69
Gb_13028	0.8	0.43	0.63	0.61	0.69	0.42	0.41	0.45	0.33	0.33	0.62	0.3	0.21	0.19	0.63	0.29	0.36	0.56	1.0	0.53
Gb_13116	0.92	0.51	0.76	0.96	0.85	0.79	0.35	0.51	0.28	0.24	0.38	0.35	0.27	0.23	0.43	0.19	0.31	1.0	0.9	0.55
Gb_13218	1.0	0.54	0.64	0.86	0.78	0.47	0.29	0.36	0.2	0.19	0.25	0.23	0.22	0.2	0.25	0.23	0.28	0.7	0.87	0.41
Gb_13488	0.98	0.58	0.78	0.73	1.0	0.59	0.67	0.52	0.43	0.42	0.53	0.39	0.25	0.25	0.58	0.4	0.39	0.89	0.85	0.69
Gb_13812	0.71	0.34	0.33	0.44	1.0	0.64	0.39	0.36	0.24	0.23	0.45	0.21	0.38	0.38	0.37	0.31	0.32	0.8	0.73	0.56
Gb_15656	0.78	0.66	0.64	1.0	0.55	0.32	0.19	0.29	0.13	0.13	0.24	0.2	0.18	0.16	0.23	0.14	0.2	0.5	0.82	0.35
Gb_16113	1.0	0.49	0.83	0.92	0.74	0.24	0.23	0.45	0.26	0.23	0.49	0.29	0.23	0.22	0.4	0.23	0.29	0.94	0.65	0.6
Gb_16352	0.9	1.0	0.66	0.97	0.82	0.43	0.34	0.38	0.19	0.21	0.3	0.2	0.23	0.28	0.36	0.28	0.26	0.83	0.87	0.26
Gb_18457	0.78	0.35	0.53	0.86	0.93	0.66	0.32	0.43	0.21	0.17	0.34	0.36	0.13	0.14	0.34	0.16	0.25	1.0	0.98	0.39
Gb_18901	0.99	0.66	0.84	1.0	0.87	0.33	0.56	0.45	0.34	0.3	0.49	0.26	0.17	0.17	0.59	0.45	0.38	0.92	0.84	0.35
Gb_18906	0.41	0.47	0.44	0.65	0.7	0.49	0.39	0.41	0.2	0.21	0.3	0.29	0.42	0.4	0.38	0.3	0.35	1.0	0.84	0.68
Gb_19067	0.73	0.74	0.58	0.93	1.0	0.83	0.45	0.46	0.29	0.31	0.47	0.27	0.44	0.4	0.54	0.32	0.33	0.7	0.65	0.67
Gb_19354	0.75	0.86	0.92	0.99	0.97	0.56	0.57	0.5	0.28	0.32	0.35	0.29	0.32	0.37	0.4	0.35	0.42	0.96	1.0	0.65
Gb_19817	0.63	0.43	0.62	0.73	0.79	0.61	0.42	0.49	0.19	0.19	0.38	0.27	0.29	0.28	0.39	0.21	0.32	1.0	0.74	0.67
Gb_20864	0.87	0.62	0.76	0.79	1.0	0.89	0.42	0.38	0.18	0.17	0.31	0.21	0.15	0.15	0.35	0.23	0.31	0.89	0.72	0.64
Gb_21497	0.92	0.46	0.57	1.0	0.89	0.93	0.46	0.47	0.13	0.13	0.27	0.24	0.24	0.22	0.3	0.19	0.29	0.93	0.84	0.46
Gb_21795	0.98	0.56	0.75	0.68	0.88	0.42	0.54	0.55	0.44	0.41	0.84	0.42	0.35	0.35	0.8	0.51	0.63	0.73	1.0	0.66
Gb_21860	0.82	0.51	0.87	1.0	0.87	0.54	0.32	0.43	0.29	0.24	0.36	0.28	0.36	0.33	0.38	0.35	0.46	0.75	0.9	0.59
Gb_22553	1.0	0.61	0.91	0.99	0.84	0.56	0.26	0.48	0.32	0.3	0.61	0.35	0.17	0.17	0.58	0.29	0.4	0.63	0.89	0.47
Gb_22843	0.73	0.54	0.6	0.91	1.0	0.66	0.35	0.42	0.29	0.33	0.53	0.3	0.26	0.27	0.52	0.4	0.45	0.71	0.74	0.65
Gb_24110	1.0	0.5	1.0	0.84	0.7	0.58	0.52	0.54	0.49	0.48	0.99	0.4	0.4	0.39	0.95	0.52	0.63	0.65	0.86	0.71
Gb_24595	1.0	0.6	0.78	0.79	0.69	0.47	0.43	0.47	0.37	0.35	0.63	0.33	0.32	0.31	0.66	0.45	0.47	0.55	0.82	0.67
Gb_25261	1.0	0.47	0.64	0.77	0.79	0.44	0.53	0.54	0.42	0.39	0.61	0.4	0.53	0.46	0.58	0.41	0.42	0.71	0.76	0.57
Gb_26058	0.93	0.59	0.63	0.77	0.82	0.77	0.46	0.56	0.31	0.33	0.37	0.31	0.18	0.18	0.43	0.39	0.51	1.0	0.7	0.47
Gb_26075	0.96	0.47	0.78	0.8	0.89	0.64	0.42	0.58	0.4	0.37	0.37	0.4	0.44	0.42	0.4	0.48	0.57	0.79	1.0	0.57
Gb_26450	0.82	0.41	0.6	0.91	1.0	0.23	0.65	0.35	0.24	0.24	0.35	0.19	0.44	0.38	0.34	0.48	0.39	0.82	0.66	0.23
Gb_28629	0.8	0.53	0.78	1.0	0.73	0.26	0.44	0.32	0.12	0.14	0.24	0.24	0.18	0.21	0.24	0.16	0.17	0.64	0.61	0.32
Gb_29760	0.88	0.37	0.6	0.84	0.87	0.82	0.41	0.6	0.33	0.34	0.44	0.42	0.56	0.5	0.5	0.37	0.42	1.0	0.78	0.57
Gb_30516	1.0	0.47	0.59	0.73	0.72	0.74	0.37	0.41	0.26	0.25	0.4	0.25	0.13	0.13	0.4	0.31	0.37	0.73	0.91	0.62
Gb_31125	0.96	0.55	0.69	0.74	0.7	0.4	0.38	0.39	0.28	0.26	0.35	0.2	0.18	0.15	0.36	0.33	0.32	0.69	1.0	0.61
Gb_31520	0.88	1.0	0.53	0.66	0.88	0.46	0.37	0.43	0.21	0.18	0.27	0.31	0.17	0.17	0.32	0.3	0.24	0.93	0.96	0.7
Gb_31715	0.9	0.39	0.72	1.0	0.84	0.51	0.3	0.46	0.22	0.2	0.43	0.25	0.23	0.24	0.45	0.26	0.31	0.76	0.67	0.54
Gb_32025	0.85	0.81	0.79	0.91	0.91	0.62	0.21	0.44	0.18	0.19	0.3	0.2	0.12	0.12	0.35	0.22	0.27	0.93	1.0	0.43
Gb_32855	0.78	0.48	0.73	1.0	0.58	0.47	0.2	0.3	0.12	0.14	0.21	0.2	0.11	0.11	0.27	0.18	0.22	0.56	0.85	0.39
Gb_32931	0.88	0.44	0.74	1.0	0.8	0.31	0.33	0.47	0.32	0.31	0.56	0.32	0.32	0.34	0.53	0.3	0.35	0.7	0.63	0.54
Gb_33567	0.81	0.68	0.55	0.78	1.0	0.21	0.12	0.13	0.05	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.06	0.06	0.5	0.64	0.06
Gb_33617	0.97	0.42	0.7	0.61	0.53	0.19	0.4	0.38	0.31	0.36	0.76	0.39	0.22	0.21	0.77	0.64	0.6	0.49	0.83	1.0
Gb_33620	1.0	0.31	0.66	0.46	0.47	0.21	0.27	0.33	0.21	0.21	0.61	0.26	0.17	0.17	0.64	0.46	0.43	0.61	0.39	0.75
Gb_34418	0.86	0.74	0.78	1.0	0.71	0.32	0.49	0.45	0.34	0.34	0.71	0.29	0.29	0.32	0.62	0.52	0.62	0.84	0.84	0.39
Gb_35125	0.91	0.45	0.83	1.0	0.74	0.47	0.21	0.37	0.18	0.17	0.27	0.24	0.22	0.22	0.26	0.25	0.36	0.68	0.92	0.44
Gb_35129	0.81	0.87	0.68	0.85	1.0	0.67	0.31	0.34	0.14	0.14	0.23	0.23	0.11	0.1	0.25	0.21	0.27	0.85	0.88	0.28
Gb_35989	0.88	0.59	0.71	1.0	0.69	0.4	0.58	0.55	0.38	0.33	0.72	0.36	0.48	0.49	0.69	0.5	0.35	0.7	0.69	0.53
Gb_36463	1.0	0.59	0.88	0.91	0.97	0.73	0.31	0.37	0.22	0.18	0.21	0.22	0.26	0.3	0.24	0.31	0.38	0.91	0.63	0.41
Gb_38202	0.66	0.44	0.7	0.86	0.68	0.36	0.28	0.37	0.24	0.27	0.21	0.29	0.22	0.21	0.24	0.23	0.28	0.55	1.0	0.34
Gb_38331	0.72	0.35	0.63	1.0	0.85	0.42	0.48	0.45	0.32	0.34	0.62	0.4	0.25	0.21	0.59	0.43	0.48	0.85	0.87	0.43
Gb_41794	0.91	0.43	0.56	0.95	1.0	0.6	0.52	0.5	0.37	0.37	0.53	0.38	0.14	0.13	0.58	0.55	0.58	0.99	1.0	0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)