1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_82 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.58 1.77 0.52 0.19 0.37 1.05 5.06 0.3 0.52 0.54 0.86 0.05 0.27 0.16 0.93 0.33 0.15 0.53 0.75 0.55
0.58 1.77 0.52 0.19 0.37 1.05 5.06 0.3 0.52 0.54 0.86 0.05 0.27 0.16 0.93 0.33 0.15 0.53 0.75 0.55
3.6 5.01 4.25 4.03 3.62 12.75 9.31 3.29 2.18 2.22 4.5 2.41 2.36 1.8 3.84 1.71 2.03 1.66 3.9 4.23
4.5 21.86 4.43 3.16 6.44 19.17 27.89 11.1 13.0 11.47 14.12 9.73 11.92 11.97 13.76 8.52 4.5 9.78 12.61 2.34
5.2 18.59 4.2 4.38 6.98 15.99 22.15 9.59 12.89 9.84 7.88 10.27 20.25 19.82 7.29 6.49 2.97 10.11 9.65 2.98
10.11 16.3 8.39 7.83 12.43 69.15 24.65 10.94 6.26 6.09 6.03 8.81 9.15 9.3 6.22 5.25 5.56 12.77 6.98 14.15
0.84 0.81 0.72 0.45 0.53 15.96 3.23 0.1 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.11 0.09 0.68 0.25 0.17
0.06 0.14 0.05 0.06 0.01 12.96 7.45 0.25 0.11 0.07 0.12 0.36 0.79 0.43 0.07 0.0 0.46 0.12 0.02 0.08
0.37 1.27 5.95 0.31 1.01 86.49 15.64 1.74 0.62 0.81 0.73 5.42 0.13 0.21 0.64 0.13 1.85 2.78 9.38 10.62
17.26 15.34 15.19 13.76 15.74 53.95 14.65 10.25 8.74 8.75 14.88 8.75 6.61 6.81 15.19 9.92 10.3 14.84 15.88 20.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.87 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.56 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
4.79 7.8 6.53 2.42 1.29 64.75 6.59 1.08 0.18 0.08 0.3 0.79 0.13 0.45 0.32 0.41 0.55 2.24 1.25 12.98
0.68 1.98 1.17 0.31 0.39 8.52 5.45 0.07 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.4 1.34 0.67
0.12 0.48 0.0 0.7 0.22 0.12 1.31 0.04 0.0 0.06 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.27 0.0
6.94 0.26 3.04 5.33 3.16 0.35 5.0 0.58 0.07 0.0 0.06 0.27 0.02 0.0 0.0 0.07 0.13 3.86 0.82 0.8
11.96 7.48 11.43 11.01 6.88 62.58 76.04 6.08 2.19 3.41 5.12 2.95 4.89 3.99 2.96 1.67 5.35 5.62 24.93 51.74
9.99 9.86 6.89 6.57 10.02 24.46 11.53 6.02 4.79 3.75 5.15 4.26 6.41 6.44 4.97 3.79 4.56 8.12 7.76 4.99
0.26 0.49 0.1 0.6 1.67 3.95 5.25 0.67 0.42 0.49 0.36 0.49 0.3 0.3 0.44 0.26 0.24 1.41 3.6 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
19.94 49.82 19.21 14.98 20.6 103.91 51.84 18.3 16.14 16.43 27.99 11.89 22.53 16.99 29.96 15.04 14.69 22.55 31.19 35.47
17.34 16.45 14.3 13.44 20.34 79.85 29.57 15.13 14.08 15.33 11.92 12.87 7.85 7.55 13.18 9.97 10.0 20.09 30.21 25.24
0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 0.07 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.2 0.36
25.97 9.01 8.0 7.02 9.42 17.48 6.19 1.63 0.19 0.37 0.18 0.3 0.19 0.18 0.24 0.21 0.27 3.16 0.85 4.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 5.04 10.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.51 0.3
0.05 0.0 0.07 0.08 0.21 0.28 0.56 0.1 0.13 0.12 0.18 0.09 0.02 0.0 0.18 0.13 0.03 0.06 0.02 0.36
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.24 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.52 2.25 2.38 6.09 4.85 17.78 20.13 9.63 4.14 4.14 6.35 5.04 6.91 6.16 6.18 0.68 6.24 7.87 5.74 9.28
17.91 25.35 13.75 18.37 19.74 45.99 22.75 9.43 4.77 4.07 5.26 2.89 4.14 3.32 6.21 6.0 4.12 22.93 16.92 10.86
14.53 15.59 16.3 10.04 12.97 86.11 10.97 2.48 1.19 1.22 1.51 1.72 1.98 1.75 1.36 0.84 1.36 1.54 3.63 0.82
1.89 1.31 1.65 2.42 2.86 12.01 7.83 1.35 0.34 0.23 0.19 0.11 0.32 0.13 0.12 0.72 1.16 2.93 2.5 1.06
1.58 1.81 1.99 0.82 2.77 92.09 11.99 0.24 0.08 0.05 0.03 0.08 0.02 0.02 0.07 0.56 0.64 1.2 0.03 4.02
0.67 0.0 0.06 0.42 0.31 29.5 24.42 0.63 0.41 0.43 0.67 0.69 0.46 0.32 0.42 0.45 1.57 0.87 0.31 0.43
5.23 2.76 3.2 5.62 4.16 52.67 5.62 8.1 5.09 6.07 11.17 4.2 6.59 5.25 10.62 4.53 5.42 4.87 5.47 1.85
6.27 8.87 5.28 5.91 4.31 9.17 4.86 0.84 0.26 0.13 0.07 0.74 0.29 0.37 0.09 0.76 0.53 2.35 2.66 1.14
0.05 0.53 0.05 0.0 0.0 8.75 3.47 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.2
41.54 57.48 33.75 8.94 17.23 263.58 177.31 1.66 0.73 1.0 0.69 0.93 0.38 0.33 0.79 0.99 0.73 2.99 61.69 24.89
6.54 7.46 11.12 7.6 12.36 132.48 33.31 3.61 3.91 2.88 1.54 4.03 1.38 3.03 1.55 1.56 4.38 4.28 10.75 1.56
46.06 57.73 30.22 35.28 40.98 79.07 51.56 28.84 21.9 22.54 32.56 19.77 24.86 21.13 36.3 22.61 20.9 47.77 50.71 56.39
28.95 31.23 22.92 22.21 29.69 71.66 50.6 25.75 19.19 19.27 32.59 14.59 17.32 15.11 33.89 21.87 22.3 24.89 22.71 34.33
1.51 3.96 1.07 0.68 0.06 4.22 4.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.15 0.0 0.05 0.27 0.14 8.49 1.81 0.69 0.98 0.73 0.67 0.37 0.1 0.22 0.53 0.75 0.37 0.93 0.56 0.31
1.27 3.44 2.9 0.93 0.27 11.97 8.68 0.19 0.02 0.02 0.0 0.31 0.12 0.38 0.0 0.21 0.28 0.12 0.0 0.47
18.9 11.9 12.39 14.35 12.41 18.71 15.97 7.04 5.33 4.27 6.88 3.48 5.56 5.76 7.05 5.17 5.04 9.57 8.17 7.3
12.9 10.41 6.98 9.33 5.5 51.22 8.55 7.85 6.28 7.11 9.27 6.12 21.81 12.19 8.78 9.24 9.36 2.17 0.0 0.05
3.94 3.36 1.84 1.88 1.73 20.29 5.38 5.21 3.66 3.52 7.62 3.98 15.54 8.42 7.58 6.37 6.08 1.11 0.0 0.05
1.06 1.86 1.87 1.21 0.55 148.78 113.43 1.53 0.72 0.79 1.18 0.62 1.78 0.81 1.34 0.13 0.76 0.5 6.77 2.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.63 12.18 9.8 9.11 9.32 58.27 25.74 4.93 3.51 3.49 5.93 3.0 4.33 3.6 5.68 3.25 2.86 9.53 9.22 11.05
13.66 11.76 9.35 10.36 12.16 18.56 14.97 6.91 4.4 3.87 8.09 4.11 3.65 3.26 7.84 5.59 4.31 7.29 4.83 6.67
8.79 6.5 5.53 4.08 6.16 9.45 4.87 5.78 9.22 6.75 14.15 5.5 9.3 7.68 11.92 8.37 8.72 2.43 2.23 4.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.25 44.82 9.34 24.07 43.1 139.31 29.44 3.98 0.75 0.98 0.09 32.21 0.16 0.58 0.0 2.89 10.07 46.33 50.65 15.98
72.48 165.13 57.5 70.18 32.79 252.14 200.8 71.39 134.97 134.7 78.59 66.53 116.75 122.43 88.76 112.68 23.95 29.83 30.05 9.08
11.72 83.76 62.38 7.46 9.13 368.32 152.85 1.64 0.6 0.72 0.93 1.78 0.34 0.49 0.9 0.26 2.04 1.6 1.36 118.59
13.11 4.85 11.43 8.65 7.03 11.33 3.88 1.66 0.83 0.83 0.77 1.0 1.51 1.36 0.65 0.59 0.52 2.84 8.42 3.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.54 0.0 0.33 0.13 0.13 0.7 0.4 0.14 0.17 0.11 0.37 0.06 0.16 0.17 0.03 0.26 0.04 0.03 0.23 0.04
1.04 0.35 0.17 2.05 0.0 78.2 52.35 2.15 1.72 2.52 1.83 1.95 3.03 3.02 2.54 0.89 2.18 1.12 6.92 15.06
1.77 0.73 0.19 0.62 0.04 41.5 35.7 0.05 0.08 0.06 0.24 0.05 0.15 0.16 0.13 0.0 0.1 0.03 0.01 0.23
3.96 10.68 2.89 1.8 0.08 144.64 55.72 0.17 0.36 0.24 0.41 0.04 0.34 0.23 0.38 0.0 0.08 0.06 0.05 1.34
0.06 0.17 0.04 0.13 0.09 3.15 3.2 0.1 0.1 0.13 0.22 0.1 0.25 0.12 0.14 0.0 0.0 0.19 0.23 0.32
0.17 0.0 0.11 0.12 0.38 7.05 4.81 0.16 0.1 0.22 0.21 0.06 0.21 0.16 0.16 0.0 0.0 0.03 0.56 0.18
0.05 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 1.07 0.02 0.0 0.08 0.19 0.05 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0
0.54 0.29 0.41 0.0 0.0 1.1 0.24 0.27 0.31 0.22 0.76 0.11 0.0 0.05 0.12 0.21 0.0 0.23 0.63 0.0
0.34 0.23 0.56 0.17 0.38 1.03 0.56 0.21 0.19 0.38 0.19 0.01 0.21 0.28 0.18 0.06 0.13 0.05 0.25 0.0
9.03 9.9 14.77 3.94 3.08 22.22 0.59 0.27 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 1.09 0.9 0.59
2.71 2.98 2.71 2.78 2.21 4.78 2.01 1.37 1.38 1.34 2.12 1.04 1.19 1.07 1.83 1.63 1.34 1.85 1.79 1.84
21.9 2.13 4.29 3.1 5.27 113.24 75.22 3.32 0.88 3.6 0.87 4.23 0.51 0.66 1.31 2.76 3.47 10.86 9.73 71.78
1.13 0.82 0.86 0.72 0.54 1.2 0.83 0.19 0.22 0.29 0.76 0.13 0.1 0.07 0.74 0.21 0.23 0.24 0.26 1.65
8.03 4.08 7.38 8.59 5.26 5.79 9.03 4.69 3.25 2.94 2.96 3.77 4.3 3.47 2.46 2.83 3.32 3.87 3.24 4.41
0.19 0.04 0.16 0.0 0.0 0.44 2.59 0.11 0.02 0.09 0.16 0.05 0.0 0.02 0.12 0.29 0.29 0.49 0.02 0.17
5.03 4.88 4.18 2.64 2.87 17.42 7.69 1.23 1.09 0.98 1.35 1.62 1.36 1.83 1.19 0.8 1.15 0.96 0.8 0.16
3.26 0.53 1.78 2.25 1.21 6.73 2.4 1.13 1.12 0.81 1.51 0.54 0.83 0.8 1.12 0.87 0.72 0.68 2.12 0.69
0.36 0.39 0.4 0.28 0.78 59.29 17.47 0.21 0.28 0.19 0.13 0.09 0.12 0.14 0.14 0.08 0.09 0.57 0.14 0.65
0.4 0.42 0.55 0.35 0.63 59.37 13.34 0.2 0.2 0.21 0.05 0.07 0.11 0.08 0.05 0.02 0.02 0.47 0.13 0.36
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.5 4.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.09
2.3 18.03 2.31 2.41 3.82 207.03 114.55 7.25 6.49 5.63 21.71 8.48 11.73 10.81 23.78 15.2 7.41 1.75 0.87 5.53
0.11 0.0 0.04 0.0 0.0 31.76 17.51 0.38 0.03 0.02 0.07 0.09 0.04 0.01 0.0 0.0 0.04 0.1 0.42 11.91
3.38 0.59 0.98 0.88 0.38 3.38 0.93 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.19
12.99 19.47 11.43 16.43 13.33 24.47 15.87 8.48 8.29 9.07 13.66 7.0 3.48 3.0 13.13 10.1 11.5 11.74 19.22 10.95
0.09 0.2 0.31 0.57 0.0 2.46 1.15 0.04 0.02 0.0 0.14 0.07 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16
0.2 0.0 0.28 0.0 0.15 2.82 2.87 0.12 0.05 0.08 0.0 0.03 0.0 0.05 0.47 0.0 0.0 0.12 0.36 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
4.47 9.86 13.52 4.15 6.86 46.29 15.12 2.87 2.79 2.76 0.7 4.39 1.72 2.25 1.39 2.27 2.66 2.09 0.49 4.17
0.21 0.03 0.05 0.0 0.0 2.13 0.32 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 21.99 10.91 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.36
0.03 0.04 0.08 0.05 0.0 20.41 17.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.69
0.06 0.0 0.0 0.0 0.12 1.07 0.61 0.07 0.2 0.21 0.0 0.1 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.51 1.23 0.7 0.6 0.81 21.43 3.89 0.57 0.69 1.02 2.72 0.47 0.61 0.39 2.44 0.79 0.83 0.78 0.92 0.43
23.0 24.29 12.25 69.99 128.91 217.51 348.29 53.73 27.41 27.46 47.65 50.33 39.78 44.57 81.7 43.44 67.09 144.81 74.96 144.76
6.87 3.29 1.59 12.66 10.35 12.49 26.8 10.06 5.26 3.75 1.47 1.03 5.82 2.3 1.43 0.25 0.67 9.4 5.92 2.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.1 0.27 0.29 0.13 57.11 77.2 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.17
0.62 0.23 0.89 0.4 0.2 6.67 2.57 0.55 1.11 1.01 0.36 0.44 0.57 0.55 0.3 0.26 0.1 0.23 1.41 0.79

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)