1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_94 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.47 0.0 0.0 0.07 0.83 0.1 22.41 5.54 9.86 0.27 0.0 0.03 30.32 0.0 0.0 0.55 5.6 20.36
0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.15 0.05 0.0 0.03 0.02 0.11 0.0 0.13 0.0 0.04 0.0 0.17 0.07 0.0 0.0 0.11 0.0
0.12 0.0 0.0 0.15 0.11 0.0 0.0 0.26 2.88 0.41 3.17 0.09 0.19 0.0 2.57 0.19 0.07 0.08 0.83 0.08
0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.06 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.25 0.75 0.19 0.0 0.0 0.0 0.4 0.11 0.48 0.19 0.32 0.09 0.0 0.06 0.0 0.21 0.0 0.0 0.96 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.03 8.65 0.25 0.22 6.97 2.77 10.3 0.06 0.36 0.2 9.48 0.22 1.46 0.07 0.13 1.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.43 0.03 0.51 0.01 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.87 0.22 0.23 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.21 1.28 0.1 0.01 0.06 0.29 0.17 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.07 0.72 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 2.1 0.75 1.59 0.02 0.12 0.13 1.09 0.32 0.45 0.0 0.06 0.55
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.16 0.02 0.24 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 1.9 0.0 0.21 0.0 0.79 0.08 1.17 0.38 0.92 0.05 0.06 0.05 1.05 0.0 0.12 0.05 0.32 0.12
0.79 1.74 0.4 0.33 0.85 0.72 1.08 0.64 0.73 0.69 0.79 0.7 0.6 0.34 0.87 0.91 0.25 0.63 1.46 0.42
0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.24 0.17 0.13 0.02 0.02 0.02 0.25 0.06 0.0 0.01 0.04 0.13
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0
0.08 0.0 0.08 0.5 0.09 0.0 0.09 0.04 0.04 0.04 0.07 0.0 0.15 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.16 0.03 0.62 0.08 0.3 0.0 0.02 0.01 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.3 0.03
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.45 0.0 0.29 0.0 0.0 0.02 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.27 0.0 0.27 0.63 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.01 0.18 0.02 0.0 0.0 0.02 0.17 0.02 0.09 0.0 0.0 0.01 0.12 0.16 0.09 0.01 0.18 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.19 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0 0.3 0.03 0.76 0.01 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.06 0.0
0.22 0.49 1.08 0.0 0.14 0.0 0.1 0.03 0.01 0.0 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.05 0.0 0.05 0.57 0.03
2.45 1.74 6.56 0.99 1.88 0.08 0.45 0.17 0.04 0.11 0.17 0.16 0.28 0.2 0.09 0.14 0.0 1.3 5.01 0.62
3.89 0.0 0.0 0.0 1.98 0.0 0.0 1.19 15.11 8.47 1.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.58 0.0 0.0 6.97
1.9 0.01 0.77 1.24 0.06 0.0 0.54 0.11 0.01 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.66 0.16 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.67 0.0 2.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.09 0.0 0.27 0.04 0.0 0.0 0.02 0.43 0.02 0.6 0.02 0.0 0.03 0.53 0.0 0.0 0.2 0.07 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 0.0 0.18 0.18 0.17 0.2 0.16 0.23 0.17 0.28 0.21 0.03 0.4 0.4 0.05 0.18 0.2 0.2 0.51 0.04
0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.09 3.04 29.0 18.62 16.27 0.75 2.39 1.8 4.15 0.95 0.94 0.84 1.95 0.83
3.49 5.67 4.38 1.47 1.36 14.67 5.23 0.87 0.53 0.44 0.93 0.23 0.32 0.48 1.16 0.3 0.92 2.15 9.92 1.8
0.21 0.1 0.32 0.14 0.19 0.37 0.43 0.23 0.28 0.28 0.32 0.07 0.22 0.34 0.2 0.0 0.05 0.26 2.1 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
0.04 0.21 0.09 0.0 0.0 0.03 0.03 0.06 0.88 0.33 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02
0.04 0.05 0.02 0.19 0.0 0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.11 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.07 0.04 0.36 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0
0.72 0.0 0.61 0.31 0.05 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
1.34 0.03 0.46 1.31 0.06 0.0 0.5 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.05 0.01 0.39
1.84 3.92 0.0 0.0 1.75 0.0 0.0 2.12 26.51 13.73 1.72 0.0 2.94 4.53 1.65 0.0 0.0 1.54 2.47 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.06 0.02 0.02 0.01 0.07 0.0 0.02 0.0 0.08 0.06 0.0 0.04 0.14 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.22 0.0 0.0 0.03 0.05 0.04 0.12 0.17 0.04 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 4.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.3 0.13 0.0 0.3 1.34 0.39 1.19 3.84 1.55 4.69 0.14 0.17 0.36 6.7 0.0 0.15 0.26 3.26 2.5
0.94 4.86 0.74 0.0 0.0 0.0 0.88 0.56 2.37 1.65 2.1 0.44 0.08 0.21 3.53 0.0 0.0 0.16 1.18 1.76
0.12 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.05 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.09 0.0 0.05 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.45 0.1 0.55 0.01 0.0 0.0 0.65 0.0 0.05 0.0 0.02 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.37 0.68 1.73 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 2.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
5.68 0.35 1.1 1.2 0.97 1.36 1.14 1.32 105.92 44.25 208.82 0.97 0.25 0.28 143.82 3.11 30.17 5.41 4.96 66.91
0.08 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.56 0.33 1.9 0.28 0.0 0.0 1.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.21 0.0 0.05 0.17 0.05 0.07 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.5 0.06 0.0 0.24 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.22 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.03 0.01 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)