Heatmap: Cluster_159 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00022	1.63	0.16	0.39	0.28	0.55	5.37	0.66	2.0	0.67	0.59	0.59	3.78	0.95	2.13	0.2	0.04	0.27	2.07	1.56	166.88
Gb_05233	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	5.43
Gb_05658	20.55	1.61	5.98	0.43	6.15	81.02	1.82	32.88	4.88	5.19	7.61	34.95	16.73	12.93	7.55	10.03	21.22	50.23	110.37	1334.14
Gb_05987	0.02	0.0	0.01	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	29.24
Gb_05991	0.02	0.0	0.01	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	29.24
Gb_06064	0.43	0.0	0.0	0.0	0.38	0.53	0.02	0.63	0.92	0.64	0.61	0.23	0.29	0.22	0.68	0.71	0.82	1.91	0.69	25.08
Gb_07246	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.32	0.58	0.45	0.57	2.22	2.73	0.74	0.92	2.58	0.04	0.22	0.17	2.73	31.53
Gb_08213	0.84	0.79	0.12	0.23	0.07	0.41	0.01	0.68	0.01	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.94	0.13	537.59
Gb_08217	0.01	0.0	0.05	0.55	0.01	0.0	0.02	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.09	0.05	2.2
Gb_08338	7.21	2.42	2.93	3.95	6.95	4.97	4.44	4.97	6.14	5.28	7.73	5.23	4.81	5.25	7.87	6.9	4.81	10.97	3.29	55.42
Gb_08437	55.86	15.12	25.38	23.03	28.38	20.24	14.44	11.08	5.44	5.06	8.46	5.62	6.73	6.44	7.6	6.8	9.11	25.59	14.92	509.62
Gb_09350	0.65	0.13	0.57	0.48	0.81	15.86	0.61	1.76	1.35	1.51	2.17	1.68	1.1	0.68	1.57	0.55	0.75	4.24	2.02	55.94
Gb_10582	0.24	0.46	0.2	0.14	0.71	0.05	0.27	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.94	5.53	46.54
Gb_11421	5.07	0.89	2.01	0.83	0.12	5.22	1.45	1.98	0.06	0.12	0.08	0.39	0.06	0.04	0.72	0.0	0.08	18.33	1.86	192.84
Gb_11595	0.21	0.21	0.04	1.06	1.32	0.38	0.0	3.4	4.54	1.52	0.41	0.44	0.8	0.56	0.33	2.37	1.54	2.67	0.3	456.42
Gb_11792	1.38	7.3	6.51	2.18	1.43	0.65	1.44	2.8	1.93	1.38	1.62	5.89	5.5	6.62	1.52	1.06	0.91	6.06	1.44	125.09
Gb_11793	7.08	20.89	13.7	6.47	12.06	18.61	4.41	10.77	11.3	10.37	7.37	16.65	12.97	12.78	7.73	7.87	5.45	11.57	5.98	116.26
Gb_12583	8.56	2.46	5.6	2.28	3.38	1.79	0.02	2.59	3.0	3.18	7.03	7.62	2.29	2.37	6.68	5.24	4.46	12.42	1.99	59.36
Gb_12584	9.62	3.56	8.67	3.17	3.85	2.46	0.51	3.59	2.95	2.94	8.38	5.61	2.94	3.12	6.78	4.85	3.93	15.22	4.57	56.5
Gb_13544	5.05	0.2	1.32	0.0	0.31	0.05	0.2	0.33	0.4	0.35	0.86	1.22	0.24	0.2	0.59	0.09	0.18	6.32	1.41	77.23
Gb_13578	1.63	0.16	0.39	0.28	0.55	5.37	0.66	2.0	0.67	0.59	0.59	3.78	0.95	2.13	0.2	0.04	0.27	2.07	1.56	166.88
Gb_14247	18.2	0.19	2.72	0.27	0.14	1.65	1.17	0.15	0.14	0.07	0.0	1.46	0.02	0.0	0.0	0.05	0.0	3.77	0.7	192.34
Gb_14248	10.52	0.0	0.53	0.13	0.12	0.65	0.06	0.09	0.0	0.0	0.04	0.35	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	1.76	0.28	63.86
Gb_14283	105.28	16.08	31.82	16.1	27.33	58.77	20.69	24.98	12.71	12.75	8.34	12.46	18.87	16.7	7.3	5.35	13.45	76.04	21.22	611.07
Gb_14678	0.6	0.05	0.87	0.37	0.4	0.19	2.66	3.24	2.6	2.58	3.04	4.71	6.28	7.27	2.14	3.81	4.18	6.65	5.79	45.35
Gb_16138	36.68	6.36	16.79	9.07	8.59	23.42	5.68	11.08	5.24	5.78	8.88	15.69	4.29	4.96	9.26	4.06	7.18	21.35	9.62	397.9
Gb_16415	9.05	1.0	1.31	0.82	0.95	3.53	3.28	3.19	2.83	3.51	4.61	2.46	4.52	3.3	4.03	0.87	0.59	13.39	2.93	86.89
Gb_19897	0.11	0.19	0.0	0.13	0.0	0.31	1.86	0.34	0.3	0.33	0.36	0.46	0.17	0.33	0.57	0.57	0.34	0.42	0.43	25.23
Gb_20046	40.25	0.0	0.0	3.27	3.68	7.48	1.97	4.28	4.44	6.34	5.59	10.23	0.75	1.82	4.7	1.11	1.39	46.91	11.77	417.75
Gb_20302	0.41	0.09	0.03	0.06	0.06	0.08	0.02	0.08	0.04	0.01	0.0	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.27	0.11	0.05	3.17
Gb_20892	2.06	0.0	0.28	5.91	17.43	1.84	0.05	3.7	2.65	4.64	2.22	4.29	2.29	1.96	3.08	2.74	3.49	19.23	12.5	139.28
Gb_20904	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91
Gb_20921	0.53	0.0	1.78	1.52	0.98	7.17	1.33	0.63	0.1	0.27	0.0	1.71	0.05	0.02	0.21	0.24	0.27	7.85	6.12	258.78
Gb_21068	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.11	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	3.73	19.38
Gb_21070	1.44	0.69	0.96	0.47	3.51	0.3	0.35	0.15	0.02	0.0	0.07	0.02	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	3.55	5.33	135.88
Gb_21550	0.03	0.06	0.01	0.0	0.02	0.1	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	3.07	31.5
Gb_21779	1.63	0.16	0.39	0.28	0.55	5.37	0.66	2.0	0.67	0.59	0.59	3.78	0.95	2.13	0.2	0.04	0.27	2.07	1.56	166.88
Gb_24321	1.38	0.51	1.08	0.68	0.35	0.17	0.12	0.88	0.47	0.56	0.97	1.07	0.08	0.11	1.35	2.05	1.42	12.02	0.74	38.45
Gb_26414	0.92	0.07	0.09	0.0	0.11	0.54	0.04	0.11	0.01	0.04	0.06	0.19	0.03	0.03	0.03	0.0	0.0	0.12	0.11	12.63
Gb_26662	51.61	8.69	54.18	7.09	15.6	17.4	47.96	25.44	37.12	40.05	12.22	23.43	25.69	20.9	12.66	9.42	14.38	56.08	4.6	580.9
Gb_26737	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.83	27.51
Gb_26971	0.06	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.34	0.03	0.0	0.08	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.08	0.0	0.16	3.24
Gb_27883	0.7	0.11	0.12	0.25	0.21	0.03	0.38	0.06	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.16	0.0	0.85	0.04	9.52
Gb_29302	2.1	2.82	5.65	2.52	3.23	3.81	24.02	7.01	4.68	3.77	2.85	3.77	3.57	4.0	2.08	2.61	5.45	13.85	2.7	160.08
Gb_29789	0.15	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.07	0.01	0.02	0.04	0.0	0.04	0.02	7.36
Gb_30884	0.27	0.0	0.09	0.0	0.06	0.11	0.87	0.05	0.0	0.04	0.06	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.39	49.62
Gb_30885	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.47	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.05	20.44
Gb_34146	0.17	0.0	0.12	0.09	0.0	0.04	0.02	0.07	0.07	0.06	0.08	0.01	0.03	0.03	0.02	0.33	0.35	0.16	0.05	2.85
Gb_34631	5.75	0.0	1.0	1.82	4.45	2.13	0.23	0.83	0.28	0.16	0.18	0.54	0.41	0.48	0.49	0.68	0.93	13.65	3.0	78.23
Gb_35080	0.03	0.0	0.04	0.06	0.02	0.05	0.05	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.06	0.02	0.02	0.05	0.0	0.11	0.05	1.45
Gb_36380	0.12	0.0	0.05	0.0	0.05	0.11	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	3.02
Gb_37137	0.0	0.08	0.08	0.0	0.0	0.09	0.04	0.22	0.12	0.14	0.0	0.09	0.04	0.17	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	26.15
Gb_38052	34.79	10.64	35.59	12.29	17.66	1.91	1.52	4.13	1.83	3.2	3.14	1.91	1.05	0.58	1.29	0.65	2.93	6.4	2.8	184.93
Gb_40328	3.93	0.0	0.06	0.0	0.17	0.33	1.17	0.81	0.29	0.29	0.1	0.86	0.12	0.16	0.0	0.09	0.3	8.31	2.64	83.26
Gb_40488	1.03	1.16	0.87	1.24	0.19	0.08	0.74	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.1	65.3
Gb_41020	2.65	0.44	4.75	0.96	1.17	22.42	13.7	0.99	0.65	0.82	0.13	7.18	0.1	0.12	0.26	0.04	0.69	11.8	7.42	287.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)