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Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-0.15 -0.91 -0.15 -0.56 0.61 0.04 -0.39 -0.12 -0.22 -0.26 -0.29 -0.49 -0.25 -0.22 -0.28 0.11 0.71 0.72 -0.1 0.77
0.06 0.26 0.86 0.18 0.26 0.15 0.13 -0.09 -0.37 -0.37 -0.28 -0.02 -0.3 -0.53 -0.25 -0.55 -0.45 0.46 0.1 -0.16
0.93 0.16 0.04 0.74 1.29 1.3 1.04 0.78 -1.44 -1.76 -2.56 -0.25 0.71 0.42 -3.13 -6.18 -3.55 -0.58 -10.22 -3.75
-0.91 -0.29 -0.34 -0.99 -0.26 -1.23 0.11 -0.06 0.13 0.58 0.77 -0.14 -0.2 -0.22 0.52 -0.05 -0.06 -0.05 0.54 0.42
0.04 0.35 0.07 -1.07 0.36 -0.29 -0.29 -0.21 -0.22 -0.15 -0.35 0.04 -0.22 -0.26 -0.2 -0.2 -0.02 0.72 0.27 0.63
-0.35 -0.3 0.07 -0.63 0.11 -0.15 0.42 -0.28 0.16 0.18 0.32 -0.94 0.03 0.18 0.06 0.37 0.2 0.3 -0.61 0.02
0.01 0.38 -0.37 -1.4 0.64 0.23 -0.2 -0.04 -0.51 -0.66 0.43 -0.64 -0.22 -0.43 0.72 -0.26 -0.11 0.6 -0.29 0.38
0.53 0.12 0.05 -0.43 0.15 -0.37 -0.51 -0.44 -0.34 -0.81 0.38 -1.02 -0.38 -0.41 0.36 0.4 0.73 0.61 -1.84 0.69
0.34 0.29 0.31 -1.41 0.77 -0.33 -1.25 0.04 0.05 -0.05 -0.28 0.02 -0.12 -0.04 -0.35 -0.06 0.19 0.58 -0.71 0.29
0.89 -1.07 0.23 - 0.11 1.18 1.48 -0.15 -0.69 0.65 0.52 -1.12 -2.4 -1.63 0.43 -1.54 - -0.06 - 1.14
-1.03 0.09 -0.19 -0.19 0.21 1.29 0.08 0.05 -0.59 -0.45 -0.67 -0.5 0.4 0.51 -0.36 -0.65 -0.16 -0.08 0.42 -0.12
0.34 -0.39 0.65 - 1.96 0.61 0.27 0.0 -0.08 -0.03 -1.26 -0.99 -3.72 -1.83 -0.53 0.2 -0.65 0.75 - 0.5
0.11 1.07 0.77 -0.53 0.31 -0.17 0.67 -0.29 0.32 0.45 -0.84 0.05 0.37 0.13 -1.03 -0.04 -1.34 -0.3 -1.41 -1.99
-0.44 0.69 -0.2 0.06 -0.25 -0.22 -0.17 -0.29 -0.78 -0.78 1.09 -1.05 0.3 0.05 1.11 -0.83 -0.76 0.33 -0.74 0.16
0.06 -0.02 0.66 0.17 0.47 -0.31 0.16 -0.08 -0.12 -0.14 -0.31 0.26 -0.69 -0.91 -0.32 -0.11 0.1 0.52 -0.28 -0.04
-2.65 -0.28 -1.01 -2.56 0.01 -0.96 1.18 -0.26 0.63 0.82 0.0 0.43 0.23 0.1 -0.21 -1.29 -0.62 0.33 0.24 0.54
0.07 0.28 0.6 -0.1 -0.22 -0.61 0.01 -0.16 -0.19 -0.4 -0.2 0.12 0.31 0.38 -0.07 0.31 0.14 0.12 -0.58 -0.53
0.07 0.95 -0.18 -1.09 0.72 0.69 0.72 -0.39 -0.94 -0.64 -0.47 -0.98 0.15 -0.29 -0.02 -0.44 -0.43 0.72 -1.33 0.21
-0.48 0.6 0.41 -0.45 0.11 -0.94 -0.4 -0.04 0.05 0.24 0.53 0.13 -0.2 -0.24 0.26 0.07 -0.33 -0.11 -0.32 0.17
-0.21 -0.54 1.47 0.01 -0.11 0.57 0.73 -0.14 -0.06 -0.14 -0.49 -0.9 -1.13 -1.14 -0.03 -0.68 0.17 -0.25 0.04 0.12
0.76 -0.54 -0.09 0.58 0.68 0.5 -0.08 -0.21 -0.4 -0.32 -0.12 -0.97 -0.14 0.3 -0.19 -0.54 0.07 0.48 -2.92 0.13
0.65 -0.65 0.2 -0.72 0.78 0.61 -1.04 0.04 -0.25 -0.42 -0.51 -0.11 0.53 0.59 -0.34 -0.55 -0.1 0.73 -2.31 -0.22
0.06 -0.34 0.55 - 0.41 0.26 1.02 -0.05 0.18 -0.08 -1.23 -0.48 -0.42 0.2 -0.83 0.44 0.59 0.04 -1.07 0.16
-0.95 -0.44 -1.47 -1.87 0.33 0.68 -0.74 0.25 -0.34 -0.26 0.92 -0.51 -1.38 -1.49 0.98 -0.48 0.41 0.84 0.69 0.1
-1.04 0.53 -0.21 0.33 -0.63 -0.52 -0.44 -0.01 0.42 0.18 -0.01 -0.27 0.2 0.28 -0.12 0.62 -0.1 0.06 -0.03 -0.29
0.18 -0.25 0.38 0.16 0.15 0.66 0.18 0.21 -0.36 -0.25 -0.31 -0.61 0.18 -0.01 -0.34 -0.44 -0.33 0.18 -0.2 0.12
0.52 -0.8 0.18 -1.67 0.49 0.14 1.32 -0.45 -0.14 -0.23 -0.16 -0.19 -0.89 -1.21 0.25 -0.14 -0.11 0.22 -0.57 0.53
-0.37 -0.01 -0.34 -0.73 0.02 -0.12 -0.29 -0.43 0.15 0.33 0.49 -1.03 0.45 0.4 0.45 -0.29 -0.06 0.39 -0.54 0.31
-0.69 0.19 -0.15 -0.99 0.04 -0.75 0.14 -0.04 0.26 0.34 -0.24 0.06 0.4 0.46 -0.11 -1.25 -0.63 0.38 0.07 0.81
-2.35 -0.31 -1.38 -1.94 0.1 -0.11 -0.06 0.2 0.02 -0.13 0.59 -0.31 0.07 0.3 0.36 0.28 -1.73 0.91 -0.37 1.18
-0.24 -0.2 -0.32 0.59 0.56 0.22 -0.42 0.04 -0.41 -0.75 0.38 -0.84 -0.15 -0.19 0.33 -0.46 -0.66 0.77 0.13 0.22
-1.38 -0.27 -0.69 -0.61 -0.06 -1.51 -0.64 0.05 0.01 0.18 0.8 0.34 0.42 0.27 0.9 -0.11 -0.19 -0.11 0.22 0.1
0.07 0.91 0.12 -1.12 0.47 0.16 -0.12 -0.34 -0.46 -0.76 0.03 -0.69 -0.68 -0.66 0.23 -0.21 0.41 0.1 0.06 0.69
-1.25 -0.42 -0.78 -0.8 -0.18 0.8 -4.82 -0.34 -0.94 -1.32 -1.0 1.15 -0.4 -0.56 -0.53 0.29 -0.32 1.35 -0.69 1.71
0.46 -0.45 0.48 0.36 0.08 1.43 0.13 0.46 -0.72 -1.06 -2.4 -0.76 -0.36 0.1 -0.52 -1.77 -1.62 0.69 0.43 -0.0
0.07 0.09 -0.05 0.54 0.71 0.01 -0.31 -0.21 -0.83 -0.3 0.12 -0.06 -0.71 -0.61 0.73 -0.0 -0.11 0.34 -0.37 -0.22
-0.25 0.41 0.25 0.15 0.03 -0.48 0.39 -0.26 -0.24 -0.04 0.4 -0.04 -0.67 -0.78 0.53 -0.34 0.1 0.12 -0.39 0.24
-0.88 -0.2 0.04 0.08 0.31 -0.03 -0.16 0.03 -0.36 -0.17 -0.41 0.37 0.63 0.27 -0.14 -0.81 -0.92 0.62 0.09 0.37
0.34 0.22 0.37 -0.19 -0.09 -0.17 -0.15 0.16 -0.48 -0.48 0.21 -0.01 0.04 0.27 0.12 -0.25 0.57 -0.29 -0.75 -0.16
0.06 -1.36 -0.38 0.3 0.45 -0.86 -0.04 0.54 -0.55 -0.31 0.47 0.23 -0.45 -0.33 0.24 -0.7 0.91 1.02 -1.16 -1.03
-0.48 -0.21 -0.1 -0.25 0.42 0.04 0.11 -0.02 -0.32 -0.27 -0.16 0.52 0.39 0.43 0.01 -0.77 -0.74 0.7 -0.46 0.08
-0.01 0.32 0.29 -0.81 0.12 -0.04 0.18 -0.04 -0.21 -0.01 0.42 -0.31 -0.31 -0.65 0.33 -0.16 0.26 0.11 -0.46 0.25
0.23 0.27 0.13 0.43 0.1 -0.52 -0.31 -0.2 -0.43 -0.61 -0.26 -0.49 0.24 0.48 -0.07 -0.36 -0.25 0.39 -0.22 0.56
0.06 0.9 0.19 -0.49 0.23 -0.69 1.3 -0.17 -0.17 -0.0 0.21 -0.83 -1.69 -1.59 -0.16 0.13 -0.37 0.55 -0.39 -0.22
-1.55 0.08 -0.67 -0.21 0.66 0.94 -0.01 0.04 -0.57 -0.4 -0.58 -0.33 0.82 0.57 -0.72 -1.13 -0.59 0.82 0.1 -0.19
-0.22 0.04 -0.05 -0.38 0.61 0.39 -0.83 0.2 -0.61 -0.47 -0.12 -0.32 0.17 -0.03 0.04 -1.14 -0.2 0.39 -0.18 1.06
1.64 0.19 0.49 - 0.52 0.41 -0.39 0.08 -1.2 -1.46 0.18 -0.86 -0.48 -0.67 -0.06 -0.01 0.26 0.46 - 0.49
1.14 0.98 0.91 -1.92 0.37 0.24 -0.59 -0.25 -1.27 -0.94 0.25 -0.35 0.12 0.17 0.02 -0.7 -1.0 0.11 -0.96 -0.2
0.31 -0.65 0.09 -1.36 0.65 0.41 0.09 -0.49 -0.99 -0.25 -1.17 0.06 -0.37 0.39 -0.37 -1.23 -0.5 0.86 -1.15 1.54
-0.19 0.24 -0.28 -0.01 0.49 0.32 -0.12 -0.4 -0.21 -0.26 -0.38 0.41 -1.55 -1.36 -0.12 -0.14 -0.5 0.54 0.47 0.92
-0.36 0.36 -0.16 -0.28 0.3 0.47 0.0 -0.43 -0.45 -0.42 -0.69 0.23 0.02 0.06 -0.34 -0.49 -0.84 0.44 -0.5 1.26
0.7 -0.3 0.2 -1.3 0.26 -0.78 0.49 -0.26 0.33 0.32 -0.14 0.0 0.18 0.1 0.25 -0.18 -0.48 -0.01 -0.72 -0.04
-0.99 0.13 0.02 -0.06 -0.33 -1.5 0.76 0.21 0.08 -0.27 0.79 -0.42 0.6 0.43 0.69 -0.71 -0.21 -0.63 0.27 -2.05
1.22 -0.4 0.89 0.33 -0.01 0.35 0.65 0.47 -0.59 -0.29 -0.57 -0.71 0.09 -0.11 -1.26 -1.57 -0.68 0.35 -0.86 -0.71
0.21 0.47 0.08 0.14 -0.2 0.47 -0.26 -0.05 -0.2 -0.24 -0.04 -0.25 0.46 0.21 0.25 -0.93 -0.47 0.04 -0.7 0.16
-0.23 0.07 -0.54 -0.63 -0.01 0.5 0.19 -0.3 -0.17 0.05 0.14 -0.64 0.19 -0.01 0.36 -0.69 -0.52 0.24 0.02 0.85
0.27 0.48 1.07 - 1.12 -0.11 1.49 -0.16 -0.22 -1.95 -1.72 -0.42 -4.02 -2.52 -1.77 0.6 0.52 0.55 -0.76 -0.34
-0.13 0.24 0.59 -0.7 -0.09 -1.29 0.6 -0.3 0.07 -0.17 0.58 -0.77 -0.15 -0.5 1.16 -1.44 -2.41 0.38 -1.88 1.09
-0.81 0.92 -0.26 -1.46 0.19 -0.06 -0.59 -0.26 -0.65 -0.49 0.51 0.3 0.31 -0.17 0.78 -0.46 -1.12 0.31 -0.23 0.68
0.62 -0.37 0.28 -0.41 0.7 0.21 -0.35 0.15 -0.51 -0.46 -0.27 -0.49 -0.27 -0.36 0.02 -0.51 0.16 0.71 -2.23 0.84
-2.41 -2.99 -2.52 -1.45 0.58 -0.3 0.66 -0.13 0.38 0.2 0.23 -0.21 -0.57 -0.01 0.48 -0.34 -1.68 1.2 -0.36 1.38
-2.33 -0.49 -2.73 -1.27 0.59 0.32 0.12 0.04 0.0 -0.3 0.45 -0.46 -0.61 -0.73 0.21 -0.4 -1.12 1.07 0.76 1.2
-0.6 -0.66 -0.22 0.25 0.31 -1.86 -0.25 0.09 -0.16 -0.2 0.07 0.32 0.38 0.31 0.07 -0.68 -0.06 0.33 -0.03 0.82
-0.69 1.1 0.08 -0.72 0.26 -0.51 0.08 -0.42 -0.3 -0.27 -0.08 0.1 0.36 0.29 -0.08 -0.36 -0.16 0.0 -0.24 0.31
0.8 -0.05 0.45 - 0.71 0.64 -0.84 -0.4 -0.13 -0.31 -0.98 -0.4 0.36 -0.2 0.06 -0.2 0.03 0.84 - 0.62
-0.27 -0.13 0.07 -0.6 0.35 -0.3 -0.43 0.07 -0.43 -0.39 0.24 -0.01 -0.02 -0.02 0.2 0.04 0.15 0.53 -0.06 0.4
-0.28 0.68 0.24 -2.48 -0.44 0.13 0.42 -0.01 0.65 0.78 0.22 -1.17 -0.72 -0.49 0.58 -0.0 -0.49 -0.01 -1.1 0.24
-0.51 0.2 -0.2 -0.65 0.37 0.34 0.28 -0.02 -0.41 -0.26 0.44 0.32 -1.3 -1.42 0.32 -0.61 -0.05 0.56 -0.25 0.79
0.37 -0.76 -0.0 -0.36 0.08 0.65 -0.17 0.36 -0.31 -0.06 0.39 -0.27 -0.02 -0.37 0.25 -0.46 -0.07 0.45 -1.14 0.24
-0.43 -0.39 0.33 0.66 -0.14 -2.08 -0.69 -0.12 0.24 0.62 0.36 -0.41 -0.17 -0.33 0.28 0.57 0.28 -0.82 -0.04 0.1
0.45 -0.46 0.19 -1.3 0.26 -0.13 -0.15 -0.33 -0.06 -0.68 0.45 -0.73 -0.19 -0.71 0.2 -0.24 0.16 0.87 -0.81 1.0
-0.29 0.31 0.88 -3.4 0.49 -0.81 1.02 -0.37 -0.58 -0.9 -0.46 -0.66 -0.69 -0.21 -0.33 0.61 0.12 0.72 -1.4 0.8
1.59 -1.09 1.47 - 0.77 - -0.35 -0.74 -0.64 -0.73 0.39 -0.71 -0.36 -0.85 0.91 -0.55 -1.03 0.88 - 0.34
0.58 0.69 0.7 -0.24 0.59 -1.31 -0.86 -0.22 0.0 0.07 0.25 -0.28 -0.14 -0.07 0.08 -0.11 0.16 -0.06 -1.47 -0.41
-0.53 0.21 0.23 0.01 -0.15 -0.71 -0.05 -0.03 0.23 0.16 0.36 -0.41 -0.23 -0.09 0.38 0.78 -0.13 -0.02 0.03 -1.13
1.12 -0.12 1.26 -0.16 0.17 -1.64 0.21 -0.35 -0.23 -0.5 -0.7 -0.28 -0.23 -0.63 -0.17 -0.36 -0.08 0.23 -1.73 0.71
0.14 -0.3 -0.25 -0.42 0.46 1.21 -0.4 0.4 -1.45 -0.94 -1.36 0.41 0.09 0.06 -1.13 -1.17 -1.54 1.58 0.1 -0.48
0.13 -1.08 -0.74 -1.09 0.46 1.21 -0.38 0.2 -1.3 -0.79 -1.32 0.36 0.4 0.84 -1.49 -1.42 -1.09 1.57 -0.26 -0.04
-0.45 0.55 0.07 -0.38 -0.23 0.22 0.02 -0.25 0.01 0.16 0.07 -0.47 0.57 0.48 0.2 -0.37 -0.83 -0.03 -0.33 0.11
0.14 0.31 0.75 0.07 0.41 -0.86 -0.12 -0.29 -0.16 -0.53 0.11 -0.11 -0.18 -0.16 0.23 -0.46 -0.03 0.43 -0.16 -0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.