Heatmap: Cluster_283 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.51 0.0 1.46 4.23 5.35 1.26 1.56 0.82 0.27 0.75 1.1 1.45 0.51 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.29 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.0 0.15 0.25 0.24 0.09 0.07 0.34 1.41 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.11 0.03 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.22 0.0 0.37 0.32 0.0 0.13 0.17 0.03 0.05 0.05 0.1 0.1 0.06 0.14 0.0 0.09 0.0 1.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.02 0.05 0.0 0.0 0.02 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.3 0.52 1.03 0.62 0.26 0.17 0.67 0.79 0.48 0.24 0.25 0.14 0.1 0.14
0.18 2.59 2.94 1.16 1.51 1.54 8.39 4.5 3.39 1.99 2.68 1.96 1.7 0.96 3.63 2.31 6.32 1.16 2.58 2.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.13 0.0 0.06 0.04 0.08 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
34.52 26.57 66.92 23.82 77.53 12.59 11.95 47.98 43.63 20.4 40.73 7.5 2.97 1.31 14.35 62.86 9.74 30.67 58.67 181.64
3.42 0.82 1.47 1.55 0.54 0.0 0.0 0.74 0.56 5.63 0.11 1.53 0.0 0.07 0.0 0.09 0.12 0.2 0.0 0.0
1.66 0.9 0.25 2.49 0.55 2.48 0.04 12.32 33.52 34.68 4.12 1.42 9.3 10.11 3.41 5.4 6.83 3.24 0.06 0.43
0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.01 0.01 0.03 0.03 0.55 0.02 2.74 3.49 3.22 2.72 3.07 2.0 2.4 1.68 3.22 2.61 0.64 0.0 0.62
0.03 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.05 0.04 0.06 0.04 0.0 0.06 0.06 0.0 0.05 0.02 0.05 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.19 0.25 0.0 0.0 0.07 0.03 0.11 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.5 0.15 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.24 0.36 0.11 0.02 0.09 0.03 0.13 0.0 0.05 0.0 0.08 0.09
0.58 0.46 0.0 0.9 0.46 0.46 3.67 2.61 5.0 7.3 5.38 2.37 0.94 3.43 7.5 1.03 1.8 0.78 0.57 0.93
52.08 3.71 27.16 92.75 63.79 4.37 164.46 67.75 21.65 62.7 111.14 69.48 4.25 5.13 73.32 18.43 146.88 96.16 8.4 14.23
0.32 0.11 0.05 0.41 0.34 0.02 0.0 0.34 0.61 1.02 0.05 0.01 0.14 0.02 0.03 0.24 0.75 0.59 0.0 0.01
0.15 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.26 0.46 0.81 0.07 0.0 0.28 0.07 0.03 0.11 0.17 0.34 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.15 0.0 0.29 1.17 0.0 0.0 0.32 0.49 0.49 0.82 0.43 0.36 0.58 0.89 0.33 0.37 0.42 0.08 0.06 0.17
0.33 0.39 0.25 0.27 0.26 4.96 0.1 19.78 17.27 24.49 4.73 12.09 10.02 12.78 4.21 26.53 33.05 0.03 0.01 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.09 0.16 0.0 0.1 0.81 5.99 7.17 6.31 0.03 0.85 2.16 5.97 0.0 0.0 2.85 0.14 0.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.81 15.36 6.68 6.01 11.27 13.26 4.34 43.5 70.79 84.92 55.27 33.35 46.24 41.66 81.25 53.06 17.06 22.74 45.62 20.78
0.13 0.02 0.02 0.07 0.04 0.0 0.0 0.21 0.66 0.85 0.12 0.01 0.03 0.05 0.16 0.06 0.25 0.01 0.02 0.15
0.06 0.0 0.02 0.0 0.02 0.13 0.03 0.08 0.13 0.23 0.08 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.3 0.0 0.0 0.01
0.02 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.94 1.68 2.34 0.0 0.39 0.38 0.05 0.03 0.86 0.92 0.01 0.0 0.0
0.36 0.0 0.4 0.19 0.5 0.19 0.1 4.02 7.22 9.34 0.14 3.06 4.47 3.92 0.42 0.83 1.57 0.37 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.47 0.68 1.15 0.69 0.21 0.05 0.15 0.46 0.14 0.15 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.17 0.29 0.44 0.27 0.09 0.08 0.13 0.15 0.04 0.05 0.16 0.01 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.63 0.39 0.0 0.0 0.0 2.41 1.28 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58
21.31 19.11 12.64 18.84 17.09 16.63 10.14 30.17 51.89 40.67 37.27 28.96 25.33 30.32 34.79 43.35 32.51 5.4 9.2 14.42
0.16 0.0 0.0 0.14 0.18 0.36 0.03 0.51 1.1 1.45 0.8 0.6 0.57 0.44 1.23 0.52 0.3 0.66 0.22 0.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 1.12 0.0 10.15 16.39 26.58 8.83 12.46 4.21 2.42 10.14 13.47 20.82 0.57 0.0 0.04
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.27 0.41 0.02 0.14 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.01 0.02
0.15 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.66 8.37 11.98 0.07 2.08 0.63 0.08 0.08 0.38 0.0 0.15 0.0 0.0
1.3 4.27 0.0 2.6 0.6 0.29 0.36 36.46 61.32 38.46 28.87 7.68 66.73 60.04 30.97 0.01 0.0 36.7 19.72 0.94
7.21 0.0 7.13 0.0 10.72 0.0 15.26 4.24 18.4 22.47 20.53 4.85 3.18 1.36 38.1 11.59 5.04 19.3 0.0 0.0
0.54 0.57 0.21 0.22 0.0 0.41 0.0 9.94 22.8 41.92 5.77 18.08 27.54 21.7 5.74 0.05 1.31 0.02 0.01 0.06
0.12 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.29 0.71 1.23 0.12 0.26 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.07
0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.06 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.28 0.42 1.21 0.0 1.67 0.96 1.94 3.16 2.13 1.79 1.72 0.9 1.28 0.05 0.37 0.51 0.0 0.68
4.19 1.26 4.27 10.0 16.61 2.04 37.81 10.23 11.92 20.79 53.42 9.41 5.84 3.23 40.54 4.01 18.64 9.8 4.33 11.04
0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.44 0.85 0.39 0.0 0.0 0.0 2.41 1.28 0.68 2.11 0.0 0.0 0.0 0.58
0.2 2.06 1.11 3.43 17.37 97.86 4.97 21.74 49.32 98.31 15.28 11.58 24.9 9.52 29.78 18.52 9.12 6.78 0.46 31.44

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)