1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_170 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
1.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.12 0.44 0.04 0.0 1.28 1.45 1.5 0.31 0.7 0.55 0.66 0.38 0.62 0.89 2.98 6.83 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 1.3 1.11 1.22 0.11 0.55 1.1 1.38 0.15 0.41 0.89 2.09 3.76 0.0
0.68 0.06 0.13 3.59 4.11 0.48 0.03 1.6 0.74 0.77 0.54 0.32 0.58 0.54 0.4 1.41 1.08 1.62 0.97 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
1.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.63 0.05 1.42 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 2.47 0.41 0.1 0.0 0.18 0.15 0.04 0.15 0.51 0.51 0.21 0.6 2.21 1.79
1.15 1.37 0.21 0.5 0.38 0.0 0.0 0.25 0.02 0.0 0.0 0.03 0.08 0.02 0.0 0.56 0.42 0.73 3.66 0.17
0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.03 0.11 0.1 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.24 0.16 0.15 0.0
1.22 0.25 0.25 3.37 1.33 1.51 0.3 2.5 0.73 0.59 0.59 0.15 0.54 0.53 0.55 3.03 1.86 4.32 0.76 0.26
2.91 1.14 0.82 6.21 0.63 0.17 0.04 3.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.17 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.25 0.36 0.04 0.0 0.21 0.0 0.12 0.11 0.18 0.16 0.04 0.07 0.0 0.0 0.14 0.05 0.0 0.04 0.71 0.14
0.12 0.17 0.02 0.21 0.09 0.0 0.07 0.06 0.12 0.0 0.09 0.01 0.12 0.04 0.15 0.03 0.0 0.09 0.32 0.0
1.01 0.0 0.17 0.27 0.0 2.0 4.05 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 24.74 4.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.11 0.0 0.07 0.15 0.08 0.06 0.09 0.03 0.02 0.0 0.02 0.01 0.04 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.17 0.04
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0
1.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 6.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.66 1.26 2.59 0.0 0.34 0.82 0.0 1.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.21 0.0 0.03 0.08 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
6.47 54.82 24.49 50.68 18.29 28.42 1.68 14.3 0.18 0.38 0.05 1.35 0.03 0.45 0.7 0.21 0.92 43.41 35.84 100.78
3.84 16.23 13.42 36.3 9.36 12.0 1.08 9.75 0.17 0.55 0.13 1.19 0.08 0.78 0.16 0.0 0.54 22.06 9.67 68.44
1.16 0.27 1.1 3.47 1.89 0.34 0.0 1.52 0.02 0.01 0.08 0.03 0.13 0.07 0.24 0.4 0.91 5.64 2.04 0.35
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.04 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.52 1.89 1.52 3.77 8.76 7.13 0.43 3.05 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 5.73 0.15 0.06
147.45 30.48 80.69 211.72 97.21 135.85 1.04 44.88 0.01 0.03 0.05 3.51 0.03 0.03 0.02 0.74 4.38 97.45 2.15 2.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.24 0.0 6.02
0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
44.24 26.17 20.66 93.3 55.35 57.58 18.52 34.69 9.37 13.02 3.36 19.79 1.39 4.24 3.18 93.58 92.12 95.9 55.97 40.26
0.03 0.0 0.02 0.11 0.13 0.06 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.11 0.29
0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0
0.35 0.76 0.88 0.28 1.46 1.33 0.06 0.8 0.34 0.19 0.0 0.14 0.04 0.09 0.15 1.66 0.64 2.89 0.47 0.87
0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.1
0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.25 0.02 0.14 0.03 0.05 0.11 0.02 0.25 0.35 0.05 0.0 0.07 0.0 0.26 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.01 0.0 0.1 0.12 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0
0.21 0.0 0.0 0.11 0.04 0.0 0.04 0.01 0.02 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03
0.34 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.25 0.0 0.0 0.4 0.04 0.0 0.0 0.9 0.36 0.29 0.14
0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0
0.12 0.0 0.21 0.11 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0
0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.03 0.0 0.0 0.09 0.06 0.0 0.24 0.05 0.04 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.57 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.76 0.35 0.0 0.11 0.0 0.21 0.05 0.07 0.0 0.22 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.09 0.07
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0
39.21 0.03 11.33 23.18 5.35 0.0 0.09 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 1.14 0.0 0.01
0.09 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.02 0.03 0.11 0.05 0.05 0.04 0.05 0.0 0.0 0.05 0.18 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)