Heatmap: Cluster_341 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.53 0.51 0.52 0.48 0.67 0.38 0.55 0.61 0.58 0.59 1.0 0.51 0.64 0.63 0.93 0.39 0.49 0.64 0.94 0.46
0.63 0.66 0.49 0.5 0.76 0.13 0.29 0.37 0.69 0.68 0.99 0.25 0.26 0.21 1.0 0.57 0.29 0.37 0.19 0.37
0.32 0.42 0.35 0.24 0.5 0.38 0.46 0.5 0.42 0.47 0.85 0.48 0.44 0.45 1.0 0.47 0.5 0.57 0.75 0.43
0.26 0.37 0.37 0.25 0.49 0.38 0.2 0.42 0.37 0.43 0.93 0.32 0.33 0.28 1.0 0.42 0.6 0.49 0.46 0.7
0.69 0.85 1.0 0.89 1.0 0.26 0.23 0.66 0.67 0.68 0.85 0.69 0.82 0.64 0.91 0.44 0.43 0.65 0.92 0.68
0.58 0.67 0.48 0.37 0.88 0.35 0.61 0.56 0.76 0.79 0.79 0.25 0.88 0.75 0.83 0.65 0.41 0.8 0.64 1.0
0.56 0.86 0.72 0.8 0.76 0.76 0.44 0.63 0.7 0.68 0.84 0.51 0.67 0.53 0.88 0.51 0.53 0.8 1.0 0.87
1.0 0.41 0.59 0.56 0.8 0.13 0.4 0.46 0.55 0.64 0.82 0.3 0.37 0.34 0.91 0.62 0.44 0.42 0.47 0.57
1.0 0.37 0.48 0.6 0.84 0.07 0.26 0.35 0.35 0.43 0.77 0.18 0.2 0.23 0.58 0.57 0.35 0.58 0.42 0.33
0.55 0.67 0.33 0.56 0.77 0.29 0.53 0.49 0.53 0.48 0.75 0.24 0.31 0.27 0.83 0.38 0.29 0.59 1.0 0.38
0.33 0.93 0.3 0.39 0.9 0.27 0.09 0.43 0.28 0.36 0.71 0.48 0.22 0.2 0.62 0.4 0.37 1.0 0.68 0.67
0.39 0.56 0.24 0.62 0.83 0.24 0.11 0.51 0.34 0.41 1.0 0.44 0.57 0.52 0.78 0.46 0.47 0.93 0.45 0.75
0.36 0.04 0.13 0.42 0.22 0.37 0.3 0.24 0.26 0.28 0.94 0.11 0.17 0.15 1.0 0.24 0.26 0.28 0.34 0.24
0.23 0.29 0.25 0.3 0.44 0.5 0.26 0.47 0.63 0.54 1.0 0.38 0.53 0.45 0.95 0.49 0.44 0.41 0.33 0.61
0.46 0.61 0.29 0.28 0.51 0.37 0.49 0.66 0.63 0.61 0.71 0.27 0.77 0.59 0.79 0.47 0.5 0.66 1.0 0.63
0.65 0.72 0.6 0.59 0.78 0.67 0.72 0.53 0.54 0.54 1.0 0.43 0.53 0.49 0.89 0.53 0.46 0.65 0.65 0.73
0.34 0.43 0.27 0.31 0.56 0.48 0.41 0.57 0.55 0.58 0.97 0.45 0.74 0.61 1.0 0.5 0.43 0.63 0.65 0.56
0.17 1.0 0.37 0.0 0.65 0.35 0.44 0.22 0.28 0.3 0.22 0.16 0.14 0.08 0.24 0.27 0.18 0.34 0.75 0.26
0.28 0.65 0.35 0.13 0.78 0.31 1.0 0.3 0.46 0.39 0.44 0.28 0.05 0.05 0.58 0.44 0.21 0.5 0.85 0.51
0.58 0.67 0.53 0.41 0.78 0.63 0.58 0.65 0.67 0.71 1.0 0.35 0.88 0.68 0.96 0.72 0.53 0.81 0.89 0.87
0.29 0.6 0.28 0.21 0.48 0.4 0.24 0.42 0.49 0.46 1.0 0.25 0.53 0.39 0.92 0.44 0.45 0.58 0.51 0.43
0.42 1.0 0.64 0.61 0.84 0.58 0.73 0.46 0.5 0.56 0.77 0.4 0.29 0.34 0.79 0.53 0.51 0.73 0.9 0.64
0.99 0.35 0.66 0.58 0.55 0.04 0.4 0.58 0.53 0.66 0.94 0.22 0.25 0.2 0.98 1.0 0.7 0.28 0.45 0.23
0.18 0.24 0.19 0.14 0.17 0.12 0.09 0.22 0.28 0.2 0.25 0.08 0.25 0.13 0.26 0.16 0.15 0.47 1.0 0.09
0.86 0.8 0.2 0.81 0.91 0.39 0.96 0.48 0.92 0.72 0.36 0.22 0.12 0.14 0.34 0.92 0.43 0.78 1.0 0.47
0.4 0.35 0.43 0.46 0.89 0.23 0.17 0.57 0.51 0.59 0.9 0.35 0.66 0.76 1.0 0.28 0.43 0.76 0.58 0.63
0.37 0.51 0.49 0.37 1.0 0.31 0.19 0.62 0.54 0.57 0.82 0.48 0.47 0.39 0.86 0.33 0.43 0.91 0.98 0.66
0.19 0.24 0.23 0.19 0.41 0.19 0.39 0.43 0.45 0.41 0.5 0.2 0.31 0.26 0.5 0.29 0.24 0.49 1.0 0.43
0.43 0.72 0.52 0.44 0.46 0.33 0.92 0.37 0.64 0.56 0.68 0.4 0.19 0.18 0.66 0.74 0.37 0.49 1.0 0.63
0.49 0.63 0.27 0.41 0.77 0.48 0.4 0.41 0.66 0.55 0.89 0.4 0.52 0.38 1.0 0.5 0.25 0.45 0.36 0.54
0.56 0.92 0.33 0.44 0.79 0.62 0.41 0.43 0.68 0.63 0.82 0.4 0.45 0.27 1.0 0.51 0.21 0.53 0.53 0.5
0.55 0.7 0.49 0.38 1.0 0.46 0.59 0.4 0.6 0.55 1.0 0.58 0.51 0.44 0.89 0.64 0.29 0.5 0.19 0.74
0.63 0.59 0.65 0.61 0.53 0.49 0.38 0.48 0.61 0.55 0.57 0.35 0.67 0.58 0.6 0.55 0.42 0.56 0.78 1.0
0.28 0.1 0.19 0.29 0.32 0.26 0.33 0.36 0.42 0.56 1.0 0.26 0.6 0.36 0.89 0.22 0.23 0.3 0.43 0.32
0.5 0.46 0.51 0.4 0.54 0.23 0.47 0.35 0.33 0.34 0.91 0.27 0.19 0.14 1.0 0.32 0.32 0.41 0.59 0.51
0.31 0.64 0.13 0.21 0.65 0.3 0.38 0.37 0.34 0.49 0.73 0.17 0.2 0.2 1.0 0.59 0.19 0.58 0.74 0.26
0.93 0.7 0.46 0.7 0.57 0.11 0.58 0.52 0.66 0.79 0.96 0.28 0.37 0.32 0.85 0.49 0.41 0.49 0.74 1.0
0.42 0.4 0.27 0.52 0.45 0.24 0.03 0.28 0.29 0.28 0.96 0.14 0.18 0.22 1.0 0.85 0.62 0.42 0.11 0.26
0.92 0.79 0.46 0.72 0.8 0.23 0.61 0.4 0.47 0.47 1.0 0.31 0.47 0.36 0.96 0.45 0.2 0.29 0.73 0.35
0.42 0.31 0.12 0.39 0.67 0.2 0.77 0.44 0.32 0.33 0.27 0.09 0.44 0.39 0.26 0.24 0.21 0.51 1.0 0.28
0.29 0.22 0.23 0.33 0.55 0.29 0.14 0.44 0.38 0.33 1.0 0.53 0.46 0.49 1.0 0.36 0.35 0.39 0.44 0.36
0.46 0.34 0.42 0.31 0.63 0.19 0.32 0.53 0.71 0.7 1.0 0.41 0.68 0.73 0.86 0.7 0.52 0.56 0.44 0.83
0.15 0.4 0.07 0.18 0.33 0.09 0.16 0.64 0.41 0.36 1.0 0.44 0.68 0.36 0.88 0.41 0.37 0.24 0.31 0.4
0.44 0.33 0.33 0.22 0.48 0.47 0.25 0.6 0.63 0.52 1.0 0.35 0.81 0.7 0.83 0.59 0.33 0.39 0.64 0.48
0.46 1.0 0.44 0.3 0.63 0.15 0.58 0.35 0.49 0.57 0.55 0.19 0.24 0.22 0.64 0.38 0.16 0.35 0.57 0.27
0.76 0.78 0.95 0.99 0.92 0.57 0.85 0.55 0.68 0.71 0.72 0.46 0.38 0.35 0.89 0.72 0.59 0.81 1.0 0.65
0.69 0.38 0.35 0.97 0.75 0.05 0.15 0.32 0.54 0.68 0.33 0.14 0.14 0.22 0.6 1.0 0.56 0.15 0.3 0.34
0.38 0.29 0.23 0.55 0.5 0.14 0.13 0.43 0.37 0.47 0.98 0.33 0.45 0.42 1.0 0.34 0.28 0.36 0.38 0.86
0.19 0.13 0.15 0.19 0.24 0.38 0.26 0.37 0.39 0.4 0.99 0.27 0.58 0.57 1.0 0.35 0.39 0.36 0.22 0.41
0.87 1.0 0.63 0.58 0.59 0.23 0.57 0.51 0.61 0.57 0.83 0.32 0.54 0.5 0.79 0.76 0.47 0.54 0.62 0.14
0.4 0.42 0.48 0.47 0.44 0.26 0.19 0.47 0.51 0.54 1.0 0.35 0.65 0.59 0.87 0.54 0.62 0.44 0.62 0.4
0.23 0.16 0.0 0.3 0.24 0.16 0.18 0.34 0.43 0.23 0.59 0.12 0.11 0.04 0.78 0.13 0.19 0.48 1.0 0.35
0.45 0.8 0.49 0.55 0.6 0.29 0.8 0.59 0.89 0.75 1.0 0.16 0.5 0.4 0.92 0.55 0.51 0.56 0.91 0.3
0.41 0.44 0.26 0.4 0.7 0.53 0.29 0.63 0.63 0.59 1.0 0.33 0.72 0.58 0.96 0.58 0.47 0.52 0.5 0.49
0.17 0.17 0.21 0.1 0.38 0.22 0.37 0.3 0.42 0.37 0.21 0.16 0.3 0.27 0.28 0.24 0.14 0.44 1.0 0.45
0.22 0.24 0.2 0.41 0.37 0.66 0.25 0.58 0.42 0.41 0.99 0.43 0.65 0.54 1.0 0.45 0.3 0.61 0.36 0.29
0.32 0.19 0.21 0.3 0.23 0.32 0.09 0.38 0.33 0.43 0.99 0.37 0.46 0.4 1.0 0.52 0.33 0.59 0.24 0.39
0.12 0.07 0.08 0.34 0.45 0.27 0.19 0.44 0.55 0.71 0.86 0.44 0.75 0.57 1.0 0.36 0.61 0.17 0.06 0.36
0.42 0.32 0.31 0.47 0.69 0.4 0.36 0.71 0.6 0.54 0.67 0.74 0.62 0.61 0.75 0.43 0.58 0.94 1.0 0.65
0.83 0.53 0.63 0.9 1.0 0.42 0.51 0.58 0.45 0.48 0.98 0.38 0.4 0.41 0.97 0.52 0.57 0.73 0.17 0.65
0.81 0.76 0.73 0.73 1.0 0.54 0.5 0.64 0.46 0.5 0.92 0.41 0.32 0.33 0.95 0.5 0.53 0.9 0.27 0.62
0.03 0.01 0.07 0.23 0.2 0.01 0.07 0.29 0.46 0.57 0.93 0.37 0.48 0.5 1.0 0.35 0.29 0.27 0.0 0.39
0.02 0.01 0.0 0.02 0.1 0.35 0.03 0.35 0.57 0.47 0.89 0.39 0.66 1.0 0.99 0.68 0.67 0.19 0.05 0.7
0.23 0.35 0.24 0.32 0.46 0.42 0.5 0.56 0.68 0.62 0.61 0.46 0.47 0.39 0.59 0.44 0.52 0.62 1.0 0.61
0.62 0.29 0.38 0.39 0.59 0.12 1.0 0.44 0.45 0.55 0.75 0.09 0.25 0.2 0.86 0.17 0.12 0.68 0.73 0.38
0.22 0.29 0.18 0.33 0.43 0.43 0.34 0.49 0.42 0.42 1.0 0.49 0.49 0.42 0.97 0.52 0.53 0.31 0.39 0.32
0.44 0.42 0.38 0.33 0.57 0.4 0.57 0.42 0.51 0.52 0.54 0.29 0.33 0.23 0.6 0.23 0.21 0.44 1.0 0.83
0.51 0.73 0.61 0.35 0.68 0.64 0.81 0.7 0.95 1.0 0.72 0.65 0.58 0.57 0.73 0.66 0.69 0.72 0.86 0.77
0.35 1.0 0.75 0.46 0.58 0.12 0.44 0.43 0.51 0.45 0.7 0.48 0.43 0.47 0.71 0.54 0.55 0.48 0.67 0.42
0.09 0.15 0.04 0.52 0.18 0.09 0.01 0.26 0.6 0.42 0.13 0.15 0.44 1.0 0.38 0.47 0.15 0.47 0.82 0.08
0.07 0.14 0.05 0.16 0.22 0.17 0.0 0.28 0.57 0.36 0.1 0.09 0.14 0.24 0.23 0.36 0.08 0.64 1.0 0.15
0.24 0.7 0.43 0.32 0.53 0.46 0.36 0.53 0.78 0.56 0.95 0.32 0.42 0.39 1.0 0.36 0.31 0.54 0.39 0.6
0.27 0.79 0.32 0.37 0.68 0.35 0.42 0.55 0.68 0.64 0.96 0.52 0.65 0.67 1.0 0.46 0.41 0.54 0.99 0.99
0.71 0.36 0.38 0.72 1.0 0.67 0.52 0.65 0.59 0.67 0.83 0.56 0.86 0.84 0.76 0.62 0.76 0.9 0.69 0.88
0.06 0.27 0.25 0.35 0.26 0.07 0.26 0.47 0.51 0.45 1.0 0.43 0.39 0.33 0.9 0.45 0.46 0.68 0.22 0.15
0.33 0.5 0.32 0.5 0.62 0.44 0.5 0.63 0.52 0.5 1.0 0.49 0.75 0.58 0.99 0.44 0.49 0.69 0.69 0.51
0.42 1.0 0.27 0.45 0.5 0.2 0.53 0.42 0.37 0.4 0.44 0.16 0.06 0.09 0.61 0.29 0.2 0.4 0.9 0.33
0.4 0.18 0.43 0.13 0.17 0.41 0.23 0.32 0.28 0.24 0.36 0.12 0.03 0.0 0.47 0.22 0.41 0.23 1.0 0.18
1.0 0.81 0.68 0.75 0.62 0.19 0.44 0.5 0.54 0.51 0.96 0.32 0.55 0.46 0.86 0.63 0.46 0.44 0.54 0.32
0.58 0.7 0.62 0.59 0.58 0.48 0.63 0.63 0.66 0.66 0.95 0.52 0.68 0.64 1.0 0.58 0.69 0.74 0.89 0.85
1.0 0.62 0.67 0.66 0.82 0.56 0.55 0.58 0.58 0.55 0.98 0.3 0.59 0.39 0.89 0.57 0.44 0.6 0.6 0.53
0.64 0.36 0.3 0.5 0.71 0.37 1.0 0.54 0.85 0.85 0.87 0.2 0.61 0.68 0.95 0.48 0.36 0.7 0.71 0.93
0.46 0.36 0.45 0.57 0.52 0.43 0.38 0.54 0.52 0.5 1.0 0.37 0.6 0.57 0.86 0.48 0.46 0.44 0.49 0.48
0.46 1.0 0.58 0.39 0.73 0.41 0.46 0.55 0.51 0.48 0.82 0.51 0.57 0.36 0.91 0.41 0.47 0.7 0.87 0.6
0.18 0.28 0.22 0.22 0.46 0.34 0.23 0.36 0.33 0.31 1.0 0.34 0.16 0.19 0.92 0.3 0.26 0.35 0.72 0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)