Heatmap: Cluster_227 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.61 0.43 0.58 0.46 0.57 0.38 0.3 0.22 0.15 0.15 0.3 0.26 0.11 0.11 0.26 0.17 0.25 0.24 1.0 0.15
0.67 0.69 1.0 0.47 0.48 0.16 0.63 0.2 0.21 0.21 0.17 0.24 0.21 0.2 0.22 0.31 0.32 0.32 0.65 0.38
0.83 0.88 0.88 1.0 0.83 0.64 0.33 0.16 0.03 0.06 0.14 0.08 0.13 0.13 0.14 0.01 0.06 0.31 0.11 0.19
0.42 0.61 0.37 0.48 1.0 0.28 0.55 0.14 0.02 0.01 0.03 0.05 0.03 0.03 0.03 0.12 0.04 0.98 0.46 0.3
1.0 0.62 0.86 0.72 0.68 0.5 0.68 0.19 0.11 0.14 0.18 0.15 0.12 0.12 0.21 0.17 0.23 0.54 0.48 0.57
0.93 0.52 0.72 1.0 0.88 0.74 0.31 0.53 0.39 0.37 0.49 0.32 0.46 0.47 0.48 0.44 0.53 0.96 0.56 0.67
0.8 1.0 0.64 0.49 0.52 0.32 0.61 0.3 0.25 0.25 0.23 0.24 0.27 0.3 0.22 0.33 0.25 0.43 0.7 0.49
1.0 0.37 0.77 0.52 0.62 0.27 0.63 0.21 0.15 0.2 0.11 0.21 0.13 0.09 0.11 0.14 0.2 0.53 0.22 0.35
0.83 0.72 0.93 0.49 0.81 0.56 0.71 0.39 0.16 0.17 0.17 0.3 0.39 0.37 0.21 0.14 0.21 1.0 0.39 0.41
0.8 0.92 1.0 0.79 0.56 0.32 0.29 0.3 0.21 0.15 0.21 0.18 0.24 0.23 0.22 0.29 0.27 0.44 0.18 0.18
0.41 1.0 0.37 0.53 0.53 0.4 0.49 0.22 0.08 0.07 0.07 0.08 0.0 0.02 0.12 0.19 0.07 0.93 0.38 0.29
0.76 0.51 0.68 0.71 0.88 0.64 0.5 0.45 0.37 0.34 0.47 0.31 0.27 0.26 0.45 0.45 0.52 1.0 0.57 0.71
0.85 0.5 0.72 0.74 1.0 0.48 0.62 0.4 0.22 0.21 0.3 0.22 0.21 0.22 0.34 0.26 0.27 0.92 0.6 0.93
0.7 0.69 1.0 0.41 0.62 0.18 0.5 0.25 0.16 0.22 0.2 0.16 0.1 0.09 0.25 0.23 0.21 0.44 0.43 0.34
1.0 0.77 0.66 0.81 0.31 0.09 0.11 0.14 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.29 0.12 0.57 0.17 0.07
1.0 0.49 0.42 0.71 0.32 0.17 0.13 0.13 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.22 0.08 0.35 0.15 0.09
1.0 0.59 0.63 0.65 0.84 0.3 0.82 0.29 0.25 0.22 0.28 0.14 0.11 0.12 0.29 0.55 0.44 0.78 0.4 0.77
0.72 0.43 0.5 0.71 0.77 1.0 0.61 0.49 0.38 0.38 0.49 0.53 0.39 0.41 0.49 0.47 0.86 0.95 0.52 0.62
0.59 0.71 0.89 1.0 0.83 0.62 0.86 0.4 0.31 0.32 0.25 0.32 0.34 0.36 0.28 0.37 0.41 0.96 0.77 0.58
0.78 0.65 0.99 0.6 0.68 0.16 1.0 0.19 0.24 0.26 0.46 0.22 0.17 0.17 0.4 0.27 0.37 0.23 0.38 0.21
0.44 0.88 1.0 0.54 0.51 0.02 0.24 0.16 0.16 0.19 0.09 0.16 0.12 0.1 0.05 0.17 0.03 0.25 0.25 0.13
0.69 0.83 1.0 0.78 0.56 0.61 0.93 0.43 0.31 0.3 0.24 0.25 0.24 0.21 0.28 0.29 0.33 0.53 0.79 0.34
0.84 0.51 0.64 0.68 1.0 0.68 0.73 0.63 0.51 0.51 0.66 0.57 0.57 0.5 0.68 0.55 0.72 0.93 0.75 0.66
0.91 0.61 1.0 0.85 0.45 0.21 0.57 0.11 0.03 0.04 0.04 0.06 0.02 0.02 0.04 0.09 0.08 0.31 0.21 0.22
0.69 0.83 1.0 0.66 0.49 0.28 0.27 0.27 0.18 0.19 0.29 0.2 0.32 0.26 0.35 0.21 0.24 0.33 0.25 0.29
0.82 0.54 0.64 0.93 0.54 0.09 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.9 0.35 0.39
0.92 0.9 0.86 0.56 0.63 0.3 1.0 0.22 0.21 0.23 0.28 0.21 0.14 0.13 0.28 0.18 0.19 0.65 0.17 0.28
1.0 0.56 0.65 0.72 0.47 0.37 0.6 0.27 0.17 0.13 0.23 0.12 0.07 0.08 0.21 0.2 0.23 0.43 0.34 0.32
0.87 0.4 0.53 0.63 0.79 0.78 0.84 0.56 0.5 0.49 0.74 0.38 0.28 0.29 0.73 0.49 0.58 1.0 0.84 0.87
1.0 0.36 0.6 0.53 0.35 0.07 0.53 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.36 0.06 0.12
0.76 0.67 1.0 0.34 0.44 0.21 0.51 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.16 0.75 0.12
0.47 0.68 0.92 0.62 0.69 0.51 1.0 0.24 0.24 0.18 0.28 0.25 0.23 0.1 0.4 0.18 0.12 0.49 0.52 0.34
0.51 0.78 0.44 0.41 0.53 0.26 0.63 0.18 0.05 0.06 0.04 0.15 0.08 0.09 0.04 0.1 0.09 1.0 0.47 0.4
1.0 0.65 0.66 0.28 0.2 0.0 0.37 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.09
0.48 0.83 1.0 0.74 0.37 0.21 0.33 0.15 0.14 0.11 0.13 0.1 0.13 0.15 0.11 0.19 0.18 0.3 0.27 0.16
1.0 0.41 0.53 0.5 0.71 0.19 0.55 0.22 0.21 0.19 0.3 0.14 0.18 0.2 0.26 0.21 0.23 0.27 0.26 0.28
0.45 0.97 1.0 0.56 0.41 0.21 0.17 0.06 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.24 0.08 0.03
0.59 0.67 0.79 0.66 0.77 1.0 0.59 0.37 0.2 0.16 0.26 0.2 0.17 0.18 0.25 0.29 0.37 0.66 0.64 0.53
1.0 0.15 0.46 0.49 0.67 0.1 0.25 0.09 0.11 0.07 0.11 0.05 0.15 0.16 0.12 0.08 0.05 0.24 0.14 0.28
1.0 0.76 0.83 0.65 0.7 0.32 0.52 0.27 0.21 0.16 0.17 0.22 0.18 0.14 0.18 0.24 0.26 0.47 0.34 0.23
0.99 0.49 1.0 0.23 0.04 0.01 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
1.0 0.86 0.87 0.66 0.6 0.59 0.67 0.3 0.24 0.23 0.13 0.27 0.32 0.29 0.18 0.18 0.16 0.47 0.45 0.27
1.0 0.51 0.83 0.86 0.72 0.14 0.74 0.08 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.38 0.39 0.22
1.0 0.65 0.88 0.64 0.77 0.49 0.77 0.39 0.23 0.21 0.33 0.28 0.3 0.32 0.36 0.44 0.46 0.95 0.73 0.81
0.67 0.73 0.89 0.62 0.65 1.0 0.71 0.18 0.07 0.07 0.06 0.14 0.09 0.11 0.06 0.12 0.2 0.39 0.53 0.23
0.79 0.9 0.89 0.93 1.0 0.68 0.88 0.38 0.25 0.24 0.34 0.21 0.37 0.38 0.43 0.45 0.41 0.74 0.48 0.47
0.8 0.61 0.64 0.61 0.64 0.29 1.0 0.3 0.21 0.15 0.19 0.2 0.09 0.08 0.24 0.42 0.37 0.6 0.82 0.25
0.4 0.2 0.28 0.46 0.75 0.05 0.65 0.31 0.19 0.15 0.1 0.12 0.08 0.23 0.08 0.39 0.22 1.0 0.25 0.21
1.0 0.37 0.67 0.56 0.42 0.1 0.72 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.72 0.01 0.08
0.39 0.42 0.29 0.43 0.53 0.41 0.62 0.26 0.13 0.14 0.19 0.18 0.19 0.12 0.2 0.15 0.13 1.0 0.44 0.34
0.83 0.71 1.0 0.67 0.95 0.5 0.66 0.21 0.1 0.11 0.21 0.08 0.1 0.09 0.19 0.05 0.07 0.52 0.58 0.37
0.81 0.31 0.59 0.79 0.9 0.61 0.5 0.43 0.32 0.31 0.32 0.37 0.36 0.38 0.3 0.32 0.47 1.0 0.42 0.8
0.59 0.77 1.0 0.45 0.24 0.04 0.13 0.1 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.36 0.01 0.05
1.0 0.62 0.72 0.68 0.73 0.48 0.56 0.38 0.26 0.23 0.55 0.17 0.44 0.36 0.3 0.16 0.18 0.54 0.77 0.59
0.8 0.92 0.69 0.75 0.82 0.76 1.0 0.45 0.32 0.28 0.42 0.29 0.28 0.26 0.43 0.49 0.38 0.82 0.6 0.74
0.84 1.0 0.86 0.99 0.96 0.54 0.59 0.42 0.32 0.32 0.35 0.32 0.53 0.51 0.35 0.17 0.21 0.61 0.62 0.5
0.91 1.0 0.94 0.51 0.74 0.39 0.97 0.18 0.15 0.15 0.22 0.15 0.09 0.06 0.15 0.05 0.19 0.6 0.14 0.29
0.29 0.22 0.38 0.79 0.58 1.0 0.61 0.2 0.04 0.06 0.13 0.1 0.04 0.04 0.13 0.07 0.15 0.79 0.93 0.25
0.75 0.46 1.0 0.79 0.61 0.42 0.7 0.43 0.42 0.49 0.43 0.37 0.31 0.37 0.45 0.53 0.72 0.55 0.73 0.44
0.78 0.9 1.0 0.64 0.56 0.18 0.5 0.18 0.07 0.05 0.14 0.12 0.07 0.07 0.09 0.07 0.08 0.45 0.92 0.34
0.74 0.82 1.0 0.92 0.81 0.78 0.93 0.38 0.19 0.22 0.25 0.28 0.37 0.28 0.25 0.18 0.25 0.85 0.57 0.44
0.52 0.34 0.42 1.0 0.46 0.0 0.16 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.32 0.14 0.07
1.0 0.97 0.93 0.46 0.52 0.28 0.52 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0
1.0 0.89 0.89 0.99 0.83 0.28 0.65 0.32 0.26 0.2 0.32 0.17 0.13 0.11 0.39 0.46 0.24 0.83 0.59 0.56
1.0 0.59 0.69 0.58 0.62 0.29 0.67 0.23 0.16 0.17 0.25 0.15 0.25 0.21 0.2 0.17 0.16 0.46 0.36 0.37
0.23 0.46 0.17 0.38 0.89 0.4 0.46 0.16 0.07 0.06 0.05 0.15 0.08 0.15 0.07 0.12 0.08 1.0 0.35 0.23
0.86 1.0 0.79 0.4 0.38 0.02 0.22 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.07 0.16
0.73 1.0 0.74 0.26 0.19 0.02 0.12 0.05 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.13 0.04 0.02
1.0 0.91 0.47 0.64 0.9 0.95 0.99 0.32 0.13 0.15 0.11 0.11 0.14 0.11 0.1 0.24 0.27 0.79 0.75 0.77
0.97 0.41 1.0 0.74 0.33 0.1 0.56 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.98 0.94 0.89 0.86 0.82 0.39 0.84 0.35 0.27 0.25 0.28 0.31 0.18 0.17 0.29 0.35 0.32 1.0 0.63 0.44
0.78 0.38 0.77 0.52 1.0 0.46 0.59 0.29 0.33 0.34 0.19 0.2 0.29 0.31 0.22 0.34 0.38 0.87 0.28 0.64
0.95 0.43 0.7 0.84 0.89 0.65 0.74 0.37 0.3 0.33 0.27 0.21 0.1 0.16 0.35 0.41 0.35 1.0 0.65 0.84
0.67 1.0 0.66 0.5 0.68 0.3 0.72 0.35 0.32 0.25 0.36 0.21 0.27 0.26 0.38 0.36 0.26 0.76 0.31 0.33
0.95 0.72 1.0 0.92 1.0 0.57 0.78 0.3 0.2 0.2 0.17 0.27 0.14 0.1 0.18 0.28 0.32 0.8 0.73 0.83
0.78 0.62 0.67 0.92 0.8 0.72 0.68 0.5 0.27 0.27 0.45 0.34 0.4 0.42 0.47 0.27 0.34 0.85 0.77 1.0
0.73 0.54 0.51 0.72 0.81 0.53 0.27 0.38 0.27 0.25 0.46 0.2 0.31 0.32 0.38 0.24 0.23 1.0 0.48 0.47
0.82 0.9 0.72 0.68 0.83 0.85 0.83 0.33 0.25 0.24 0.34 0.26 0.29 0.33 0.4 0.29 0.28 1.0 0.44 0.72
1.0 0.99 1.0 0.77 0.86 0.16 0.89 0.39 0.42 0.43 0.5 0.37 0.39 0.39 0.54 0.43 0.38 0.68 0.51 0.78
0.72 1.0 0.85 0.48 0.67 0.5 0.75 0.39 0.32 0.28 0.49 0.24 0.4 0.38 0.54 0.3 0.37 0.54 0.6 0.55
0.69 0.46 1.0 0.49 0.5 0.11 0.47 0.06 0.06 0.08 0.07 0.05 0.04 0.05 0.05 0.02 0.02 0.14 0.42 0.07
1.0 0.1 0.28 0.35 0.29 0.13 0.37 0.13 0.06 0.03 0.07 0.02 0.06 0.04 0.04 0.13 0.09 0.25 0.16 0.06
0.81 0.82 0.87 0.34 0.68 0.31 1.0 0.34 0.26 0.25 0.32 0.27 0.38 0.32 0.41 0.46 0.26 0.73 0.65 0.42
0.68 0.68 1.0 0.74 0.7 0.7 0.82 0.28 0.21 0.24 0.37 0.19 0.13 0.12 0.38 0.21 0.23 0.58 0.25 0.22
0.6 0.59 0.94 0.58 0.98 0.68 1.0 0.36 0.31 0.38 0.54 0.26 0.08 0.09 0.68 0.59 0.56 0.53 0.26 0.19
0.73 0.35 1.0 0.54 0.78 0.72 0.93 0.33 0.31 0.25 0.42 0.25 0.26 0.4 0.54 0.36 0.33 0.85 0.16 0.39
0.86 0.76 1.0 0.67 0.66 0.52 0.54 0.25 0.21 0.21 0.2 0.21 0.25 0.22 0.22 0.15 0.13 0.32 0.19 0.19
0.78 0.87 0.79 1.0 0.48 0.07 0.33 0.21 0.06 0.07 0.09 0.04 0.05 0.05 0.07 0.12 0.08 0.6 0.26 0.1
1.0 0.97 0.81 0.71 0.93 0.37 0.5 0.41 0.34 0.32 0.4 0.33 0.34 0.37 0.39 0.35 0.26 0.87 0.86 0.58
1.0 0.76 0.75 0.65 0.65 0.74 0.66 0.41 0.26 0.26 0.34 0.22 0.42 0.34 0.39 0.29 0.19 0.49 0.46 0.31
1.0 0.85 0.8 0.83 0.81 0.6 0.84 0.5 0.31 0.31 0.53 0.44 0.39 0.36 0.55 0.3 0.32 0.74 0.88 0.68
0.79 0.76 0.7 0.79 1.0 0.6 0.77 0.23 0.11 0.1 0.21 0.15 0.1 0.09 0.24 0.11 0.17 0.64 0.61 0.36
0.79 0.55 0.52 0.49 0.65 0.87 0.69 0.41 0.27 0.28 0.46 0.27 0.47 0.38 0.55 0.41 0.41 1.0 0.61 0.62
1.0 0.64 0.73 0.49 0.51 0.42 0.51 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.04 0.02 0.11
1.0 0.69 0.83 0.79 0.93 0.55 0.8 0.34 0.22 0.22 0.21 0.19 0.23 0.2 0.23 0.31 0.33 0.77 0.53 0.58
0.69 0.65 1.0 0.8 0.66 0.22 0.96 0.27 0.33 0.3 0.34 0.24 0.24 0.24 0.35 0.47 0.42 0.53 0.47 0.29
0.84 0.68 1.0 0.82 0.79 0.6 0.82 0.36 0.33 0.32 0.28 0.37 0.24 0.19 0.27 0.36 0.36 0.74 0.64 0.44
0.79 0.56 0.68 0.88 0.95 0.5 1.0 0.34 0.19 0.24 0.2 0.21 0.1 0.18 0.22 0.25 0.27 0.59 0.9 0.64
0.7 1.0 0.65 0.55 0.76 0.41 0.87 0.26 0.22 0.22 0.18 0.19 0.2 0.21 0.22 0.36 0.27 0.74 0.45 0.51
0.59 0.44 0.39 0.4 0.7 0.63 1.0 0.45 0.29 0.35 0.49 0.37 0.27 0.31 0.43 0.48 0.39 0.8 0.39 0.35
0.9 0.58 0.83 0.57 0.95 0.89 0.72 0.56 0.25 0.25 0.55 0.4 0.27 0.23 0.62 0.28 0.44 1.0 0.74 0.85
0.53 0.52 0.29 0.35 0.42 0.41 0.41 0.11 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 1.0 0.19 0.1
1.0 0.82 0.61 0.96 0.79 0.31 0.68 0.28 0.1 0.17 0.23 0.08 0.12 0.13 0.37 0.06 0.02 0.68 0.53 0.54
1.0 0.54 0.61 0.8 0.79 0.22 0.71 0.25 0.15 0.18 0.19 0.08 0.13 0.14 0.25 0.15 0.14 0.61 0.33 0.66
0.91 0.75 0.89 0.79 0.83 0.48 0.65 0.49 0.37 0.33 0.54 0.28 0.48 0.46 0.6 0.46 0.29 0.87 0.87 1.0
0.74 0.47 1.0 0.5 0.6 0.12 0.38 0.13 0.08 0.07 0.07 0.08 0.07 0.07 0.07 0.07 0.11 0.24 0.47 0.21
0.6 0.49 0.35 0.38 0.65 1.0 0.67 0.2 0.09 0.09 0.09 0.12 0.09 0.13 0.1 0.09 0.14 0.74 0.8 0.3
0.83 1.0 0.68 0.99 0.47 0.31 0.7 0.2 0.1 0.08 0.04 0.07 0.04 0.06 0.03 0.29 0.1 0.78 0.49 0.06
1.0 0.63 0.8 0.75 0.77 0.49 0.82 0.26 0.13 0.15 0.25 0.17 0.04 0.05 0.3 0.18 0.21 0.87 0.52 0.57
1.0 0.6 0.86 0.51 0.95 0.21 0.83 0.2 0.09 0.11 0.13 0.15 0.0 0.01 0.23 0.18 0.17 0.83 0.67 0.52
0.77 0.86 0.47 1.0 0.48 0.12 0.72 0.16 0.08 0.05 0.08 0.05 0.02 0.03 0.09 0.19 0.05 0.58 0.22 0.06
0.67 0.63 0.65 0.72 0.82 0.72 1.0 0.34 0.2 0.19 0.16 0.24 0.16 0.15 0.17 0.37 0.26 0.72 0.71 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)