Heatmap: Cluster_296 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
24.36 49.81 28.31 30.53 41.29 143.84 40.68 23.97 19.65 21.09 20.16 23.05 24.47 29.17 21.3 23.27 19.32 30.28 33.25 20.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 115.45 0.35 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.17 0.03 5.68
1.16 0.71 0.94 0.51 0.2 102.22 0.23 0.07 0.0 0.07 0.0 0.05 0.01 0.01 0.08 0.0 0.07 0.12 0.0 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.49 0.26 0.02 0.01 0.0 0.0 0.06 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.56
1.94 1.5 1.87 0.91 0.87 59.84 1.52 0.44 0.2 0.16 0.39 0.82 0.15 0.31 0.55 0.69 0.38 0.87 0.87 5.25
17.5 15.32 15.65 18.15 13.94 224.31 8.84 4.92 1.27 0.05 0.06 0.48 0.1 0.11 0.12 3.2 0.54 22.44 4.97 5.13
0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 227.29 2.22 0.28 0.24 0.1 0.34 0.02 0.22 0.17 0.27 0.18 0.42 0.13 0.0 0.39
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.27 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 0.11 0.23 0.13 0.44 85.4 0.87 0.38 0.15 0.12 0.39 0.38 0.03 0.01 0.26 0.16 0.5 0.73 0.25 7.45
0.02 0.03 0.02 0.1 0.01 20.2 0.23 0.32 0.27 0.32 0.1 0.03 0.13 0.06 0.06 0.0 0.02 0.02 0.47 0.09
1.52 0.95 0.77 0.37 0.37 33.4 3.14 0.09 0.07 0.02 0.11 0.13 0.05 0.06 0.1 0.0 0.13 0.64 0.71 3.67
0.97 0.32 0.33 2.05 2.0 12.35 0.88 0.5 0.12 0.02 0.25 0.1 0.03 0.01 0.17 0.41 0.19 3.25 3.05 0.68
0.79 0.53 0.23 1.42 2.48 12.12 0.79 0.43 0.09 0.04 0.21 0.06 0.08 0.15 0.19 0.09 0.23 2.76 1.77 1.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 33.88 3.93 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.25 0.02
0.1 0.0 0.04 0.0 0.0 38.04 0.28 0.17 1.04 1.01 0.78 0.03 0.08 0.13 0.99 0.48 0.35 0.25 0.01 1.55
0.09 0.0 0.04 0.0 0.0 0.81 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.14 0.01 0.01 0.0 0.04
10.79 2.61 5.88 13.58 10.86 65.7 4.15 7.37 6.08 5.11 7.16 6.67 6.57 6.56 8.3 5.82 9.7 8.4 6.32 8.28
15.0 8.57 10.43 16.07 14.06 108.51 4.98 5.6 1.21 1.36 1.01 5.0 1.05 1.01 1.25 1.29 3.34 12.74 1.99 3.21
11.99 65.14 10.6 10.0 9.24 396.73 59.34 3.69 0.01 0.03 0.0 0.07 0.0 0.06 0.03 0.06 0.21 5.41 6.4 1.94
2.25 0.81 0.43 9.3 3.25 109.38 0.99 2.26 0.3 0.67 0.74 0.71 2.14 1.51 1.6 0.28 0.2 0.44 0.08 0.32
0.18 0.2 0.57 0.0 0.34 17.84 1.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.48 0.08
0.18 0.2 0.57 0.0 0.34 17.84 1.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.48 0.08
0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 13.66 1.32 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.19 0.08
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.19 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.01 0.01
0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 18.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
3.73 1.49 3.18 1.16 0.23 134.93 0.0 3.6 0.85 0.38 0.0 1.68 0.23 0.59 0.08 0.7 2.25 0.5 0.0 0.3
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 31.98 0.18 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.48 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.16 0.0 33.3 0.14 0.81 0.77 0.9 0.62 0.18 0.18 0.14 0.54 0.0 0.21 0.04 0.0 0.04
0.12 0.03 0.01 0.66 0.15 30.75 0.0 0.61 0.58 0.76 0.18 0.16 0.82 0.88 0.08 0.11 0.45 0.07 0.06 0.03
0.17 0.82 0.07 0.32 0.86 95.66 0.02 1.14 1.94 1.25 1.05 0.93 1.23 2.43 1.4 2.19 0.72 0.15 0.24 0.62
20.96 1.64 3.21 0.1 0.21 99.54 19.94 0.16 0.48 0.68 0.16 0.39 0.12 0.12 0.25 1.1 0.31 0.39 0.91 15.94
0.59 0.0 0.06 0.0 0.03 77.76 0.0 0.23 0.01 0.02 0.03 0.28 0.01 0.04 0.0 0.09 0.27 0.06 4.01 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.09 0.14 0.01 0.0 0.0 0.0 0.27 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 18.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
4.81 2.66 2.93 4.59 2.18 69.79 10.65 10.32 7.49 7.63 10.4 8.93 17.35 18.53 10.46 9.71 8.11 4.26 3.46 25.71
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 362.92 3.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.39
0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 559.07 0.45 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.53 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23
0.65 0.0 0.18 0.0 0.0 31.92 0.52 0.19 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 10.14
18.23 13.18 16.41 18.17 7.79 94.14 3.56 5.81 1.74 2.85 2.0 6.94 1.73 2.64 1.51 1.92 2.81 29.3 22.81 7.88
0.56 0.0 0.0 0.71 5.43 973.55 1.0 0.47 0.02 0.03 0.28 0.02 0.05 0.06 1.22 0.12 0.02 5.88 4.91 3.32
0.72 0.33 0.04 0.42 0.5 977.09 0.29 2.43 0.01 0.03 0.0 1.09 0.25 0.27 0.0 0.03 0.02 0.71 0.25 29.54
18.29 13.35 14.77 3.84 4.62 359.36 68.67 1.32 0.67 0.57 0.94 0.64 4.27 3.57 1.83 0.2 0.09 0.84 2.79 6.84
5.08 1.2 7.88 3.36 1.5 122.49 15.49 0.41 0.07 0.02 0.0 0.05 0.03 0.11 0.0 0.0 0.09 0.36 0.25 3.42
1.19 0.0 0.0 0.0 0.0 23.89 1.21 0.69 0.0 0.0 0.04 0.2 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 4.91
0.0 0.03 0.05 0.0 0.36 1.45 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0
0.03 0.03 0.01 0.12 0.0 98.08 1.91 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.28
0.12 0.0 0.09 0.0 0.04 5.9 0.19 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.31 0.21 0.65
0.14 0.21 0.14 0.75 1.14 241.67 2.35 8.1 4.48 4.87 2.27 8.26 6.8 6.65 2.19 1.04 4.35 0.39 0.39 4.52
0.52 1.16 0.57 3.38 4.42 306.94 19.76 0.26 0.31 0.0 0.48 0.4 0.21 0.0 0.0 0.63 0.0 3.26 5.94 1.28
6.65 2.91 11.99 2.31 5.75 102.93 0.26 2.5 0.38 1.07 0.0 0.86 0.0 0.24 0.11 0.14 1.06 4.25 0.14 1.31
0.53 0.23 0.27 0.67 0.16 37.02 0.23 0.39 0.34 0.46 0.58 0.19 0.03 0.08 0.63 0.28 0.23 0.57 0.14 0.59
3.84 1.61 4.02 3.28 2.53 146.06 0.23 0.46 0.17 0.11 0.11 0.28 0.01 0.03 0.0 0.77 0.61 3.64 4.65 5.98
0.04 0.0 0.1 0.0 0.35 158.81 0.15 1.06 0.42 0.43 0.15 0.34 0.45 0.5 0.24 0.24 1.21 0.23 0.04 0.37

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)