Heatmap: Cluster_107 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.86 0.57 0.72 0.54 0.74 0.56 0.32 0.48 0.31 0.26 0.17 0.38 0.2 0.21 0.19 0.19 0.22 0.82 1.0 0.64
0.53 0.73 0.43 0.72 0.75 0.26 0.25 0.29 0.21 0.18 0.3 0.3 0.06 0.07 0.27 0.18 0.17 0.61 1.0 0.69
0.63 0.32 0.44 0.64 0.54 0.41 0.22 0.4 0.17 0.15 0.27 0.28 0.26 0.26 0.3 0.15 0.2 0.44 1.0 0.37
0.8 0.64 0.75 0.6 1.0 0.51 0.02 0.32 0.26 0.27 0.3 0.24 0.17 0.19 0.35 0.32 0.24 0.56 0.75 0.27
0.72 0.33 0.53 0.63 0.52 0.42 0.23 0.38 0.24 0.22 0.23 0.27 0.21 0.19 0.2 0.19 0.25 0.41 1.0 0.25
0.85 0.48 0.44 0.9 1.0 0.47 0.44 0.43 0.25 0.32 0.28 0.26 0.4 0.34 0.3 0.22 0.17 0.89 0.8 0.71
0.92 0.47 0.57 0.87 0.96 0.61 0.25 0.54 0.26 0.25 0.4 0.33 0.34 0.3 0.41 0.27 0.39 0.89 1.0 0.66
0.53 0.12 0.2 1.0 0.51 0.08 0.08 0.09 0.04 0.03 0.05 0.1 0.07 0.1 0.06 0.08 0.12 0.24 0.74 0.13
1.0 0.62 0.69 0.73 0.65 0.58 0.55 0.5 0.3 0.31 0.61 0.28 0.32 0.27 0.62 0.33 0.4 0.53 0.83 0.52
0.98 0.53 0.74 0.73 0.86 0.36 0.36 0.47 0.27 0.25 0.38 0.32 0.3 0.23 0.32 0.19 0.22 0.5 1.0 0.33
0.91 0.19 0.64 0.86 1.0 0.25 0.13 0.13 0.09 0.06 0.12 0.11 0.03 0.03 0.1 0.04 0.13 0.72 0.98 0.12
0.91 0.27 0.57 0.36 0.77 0.16 0.08 0.14 0.04 0.03 0.05 0.09 0.03 0.06 0.08 0.0 0.06 0.82 1.0 0.16
0.94 1.0 1.0 0.99 0.82 0.35 0.28 0.36 0.15 0.16 0.32 0.21 0.29 0.21 0.4 0.15 0.17 0.52 0.61 0.35
1.0 0.54 0.62 0.76 0.84 0.49 0.55 0.6 0.45 0.4 0.65 0.34 0.36 0.32 0.71 0.5 0.39 0.72 0.95 0.61
1.0 0.62 0.74 0.93 0.99 0.63 0.29 0.54 0.26 0.26 0.42 0.31 0.19 0.18 0.38 0.3 0.23 0.64 0.65 0.42
0.92 0.72 0.62 1.0 0.78 0.5 0.19 0.44 0.18 0.16 0.24 0.18 0.26 0.25 0.24 0.21 0.19 0.75 0.5 0.44
0.88 0.74 0.47 0.78 1.0 0.78 0.32 0.57 0.32 0.36 0.34 0.29 0.37 0.27 0.32 0.26 0.28 0.79 0.87 0.38
0.59 0.37 0.58 0.67 0.74 0.3 0.17 0.38 0.24 0.25 0.39 0.41 0.07 0.07 0.41 0.26 0.28 0.66 1.0 0.8
0.9 0.69 0.79 0.76 0.98 0.63 0.32 0.41 0.19 0.21 0.28 0.25 0.35 0.33 0.3 0.27 0.3 1.0 0.74 0.48
1.0 0.34 0.77 0.92 0.81 0.31 0.07 0.25 0.04 0.03 0.05 0.09 0.04 0.07 0.08 0.05 0.15 0.67 0.81 0.39
1.0 0.63 0.58 0.88 0.97 0.87 0.22 0.37 0.17 0.16 0.13 0.19 0.22 0.25 0.14 0.13 0.15 0.97 0.92 0.28
0.9 0.34 0.62 1.0 0.58 0.35 0.13 0.44 0.27 0.24 0.49 0.32 0.41 0.44 0.43 0.32 0.42 0.52 0.83 0.26
0.92 0.88 1.0 0.95 0.78 0.56 0.54 0.57 0.49 0.49 0.57 0.31 0.53 0.46 0.59 0.32 0.33 0.71 0.65 0.59
0.56 0.65 0.56 0.5 0.71 0.35 0.18 0.43 0.17 0.15 0.27 0.22 0.25 0.21 0.28 0.16 0.21 0.82 1.0 0.63
0.85 0.46 0.73 0.97 0.67 0.58 0.21 0.46 0.31 0.3 0.48 0.26 0.23 0.21 0.52 0.48 0.43 0.57 1.0 0.33
0.82 0.61 0.75 0.86 0.8 0.68 0.29 0.44 0.17 0.16 0.29 0.28 0.43 0.36 0.28 0.17 0.24 0.61 1.0 0.45
0.91 0.32 0.73 1.0 0.74 0.84 0.99 0.38 0.17 0.19 0.17 0.52 0.11 0.14 0.08 0.1 0.22 0.94 0.61 0.85
1.0 0.56 0.58 1.0 0.84 0.43 0.37 0.51 0.31 0.35 0.48 0.36 0.29 0.23 0.46 0.32 0.31 0.98 0.53 0.34
1.0 0.83 0.91 0.74 0.92 0.41 0.44 0.46 0.42 0.39 0.6 0.25 0.24 0.21 0.58 0.23 0.22 0.71 1.0 0.47
0.85 0.61 0.81 1.0 0.76 0.53 0.38 0.57 0.34 0.33 0.55 0.34 0.56 0.51 0.53 0.29 0.44 0.66 0.85 0.63
0.91 0.43 0.69 0.89 1.0 0.75 0.34 0.55 0.38 0.32 0.38 0.32 0.47 0.4 0.37 0.34 0.38 0.98 0.94 0.64
0.81 0.72 0.8 0.92 0.99 0.64 0.19 0.51 0.25 0.24 0.5 0.26 0.28 0.28 0.55 0.25 0.27 0.96 1.0 0.86
0.92 0.31 0.6 1.0 0.71 0.61 0.22 0.44 0.19 0.19 0.3 0.29 0.31 0.28 0.26 0.18 0.42 0.43 0.89 0.47
0.22 0.27 0.22 0.38 0.66 0.16 0.08 0.26 0.08 0.08 0.12 0.17 0.04 0.04 0.15 0.23 0.27 0.71 1.0 0.24
1.0 0.62 0.71 0.82 0.91 0.53 0.51 0.53 0.36 0.34 0.67 0.38 0.12 0.13 0.64 0.35 0.37 0.74 0.94 0.52
0.77 0.48 0.69 1.0 0.68 0.43 0.24 0.39 0.19 0.19 0.36 0.19 0.23 0.22 0.35 0.27 0.23 0.54 0.81 0.37
0.68 0.45 0.56 0.78 1.0 0.44 0.29 0.37 0.19 0.22 0.36 0.34 0.25 0.24 0.35 0.15 0.21 0.79 0.9 0.62
0.45 0.92 0.68 0.41 0.6 0.44 0.58 0.47 0.44 0.47 0.51 0.3 0.57 0.55 0.55 0.36 0.31 0.77 1.0 0.78
0.66 0.49 0.65 1.0 0.62 0.33 0.14 0.28 0.15 0.15 0.27 0.17 0.21 0.22 0.25 0.16 0.24 0.35 0.82 0.29
1.0 0.88 0.83 0.83 0.85 0.51 0.22 0.44 0.2 0.21 0.35 0.33 0.21 0.25 0.38 0.27 0.22 0.64 0.63 0.54
0.61 0.48 0.67 0.54 0.42 0.19 0.47 0.36 0.36 0.31 0.43 0.23 0.16 0.14 0.28 0.41 0.39 0.64 0.89 1.0
0.77 0.93 0.66 0.86 1.0 0.56 0.19 0.41 0.31 0.24 0.27 0.27 0.38 0.36 0.27 0.31 0.26 0.64 0.79 0.47
0.93 0.71 0.79 0.59 0.89 0.1 0.48 0.27 0.19 0.19 0.33 0.19 0.07 0.09 0.51 0.25 0.21 0.61 1.0 0.59
1.0 0.37 0.67 0.83 0.68 0.42 0.1 0.3 0.16 0.15 0.24 0.24 0.13 0.16 0.22 0.12 0.33 0.55 0.89 0.26
0.9 0.63 0.6 0.94 0.92 0.74 0.52 0.64 0.33 0.3 0.58 0.33 0.65 0.57 0.6 0.26 0.3 0.85 1.0 0.67
1.0 0.23 0.21 0.52 0.63 0.21 0.08 0.23 0.17 0.22 0.24 0.12 0.12 0.1 0.26 0.09 0.15 0.54 0.69 0.16
1.0 0.4 0.46 0.5 0.97 0.51 0.2 0.37 0.21 0.2 0.37 0.15 0.18 0.17 0.32 0.28 0.26 0.55 0.73 0.34
0.75 0.72 0.85 0.8 0.94 0.51 0.52 0.46 0.16 0.16 0.31 0.26 0.23 0.2 0.37 0.17 0.23 1.0 0.88 0.7
0.65 1.0 0.59 0.56 0.51 0.28 0.28 0.34 0.27 0.26 0.36 0.19 0.34 0.28 0.37 0.31 0.25 0.52 0.57 0.34
1.0 0.5 0.5 0.66 0.78 0.53 0.45 0.52 0.4 0.37 0.51 0.32 0.36 0.31 0.49 0.39 0.32 0.58 0.88 0.66
1.0 0.84 0.83 0.79 0.98 0.44 0.48 0.6 0.39 0.42 0.54 0.44 0.51 0.5 0.54 0.24 0.2 0.75 0.76 0.6
0.9 0.56 0.79 0.8 1.0 0.61 0.28 0.56 0.37 0.31 0.43 0.32 0.52 0.47 0.45 0.32 0.25 0.79 0.87 0.56
0.92 0.37 0.54 0.82 0.88 0.56 0.23 0.44 0.23 0.22 0.49 0.34 0.17 0.17 0.47 0.32 0.39 0.6 1.0 0.41
0.99 0.61 0.63 0.85 1.0 0.67 0.37 0.64 0.35 0.35 0.56 0.28 0.48 0.38 0.55 0.37 0.29 0.8 0.83 0.38
0.42 0.32 0.41 0.62 0.7 0.47 0.39 0.43 0.24 0.24 0.33 0.41 0.26 0.29 0.35 0.25 0.37 1.0 0.83 0.69
0.22 0.27 0.49 0.55 1.0 0.35 0.11 0.33 0.2 0.26 0.23 0.28 0.16 0.13 0.28 0.12 0.33 0.79 0.94 0.39
1.0 0.2 0.44 0.97 0.84 0.96 0.04 0.14 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.06 0.05 0.87 0.83 0.4
1.0 0.71 0.98 0.95 0.77 0.14 0.34 0.22 0.17 0.17 0.37 0.11 0.19 0.25 0.35 0.24 0.15 0.64 0.87 0.72
0.7 0.33 0.45 0.6 0.71 0.43 0.17 0.39 0.23 0.2 0.45 0.24 0.28 0.23 0.43 0.28 0.36 0.98 1.0 0.39
0.85 0.54 0.73 0.83 1.0 0.67 0.42 0.56 0.35 0.35 0.49 0.37 0.56 0.58 0.52 0.32 0.35 0.68 0.83 0.53
1.0 0.74 0.86 0.94 0.82 0.4 0.35 0.61 0.38 0.36 0.53 0.38 0.43 0.37 0.54 0.3 0.35 0.58 0.9 0.62
0.67 0.9 0.75 0.59 0.93 0.66 0.72 0.61 0.38 0.37 0.41 0.42 0.58 0.5 0.46 0.38 0.42 0.91 1.0 0.85
0.26 0.27 0.23 0.12 0.25 0.04 0.4 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.25 0.11 1.0 0.55 0.49
0.84 0.3 0.42 0.42 0.37 0.38 0.57 0.33 0.14 0.15 0.16 0.21 0.08 0.07 0.15 0.17 0.23 0.41 0.78 1.0
0.75 0.85 0.58 0.77 1.0 0.37 0.49 0.49 0.37 0.34 0.59 0.28 0.5 0.39 0.55 0.3 0.22 0.53 0.78 0.39
0.84 0.56 0.49 0.71 1.0 0.54 0.13 0.43 0.36 0.27 0.32 0.29 0.21 0.23 0.28 0.42 0.33 0.8 0.89 0.56
0.63 0.73 0.59 0.6 0.84 0.58 0.1 0.41 0.33 0.28 0.21 0.21 0.26 0.33 0.21 0.39 0.29 0.73 1.0 0.5
0.91 0.41 0.71 0.57 0.62 0.38 0.1 0.37 0.27 0.21 0.35 0.24 0.3 0.3 0.37 0.2 0.21 0.38 1.0 0.35
0.68 0.46 0.58 0.45 0.57 0.47 0.24 0.49 0.18 0.17 0.23 0.26 0.18 0.16 0.26 0.13 0.11 0.64 1.0 0.38
0.77 0.57 0.65 0.82 0.76 0.65 0.43 0.61 0.41 0.38 0.5 0.38 0.4 0.32 0.51 0.39 0.34 0.91 1.0 0.5
0.87 0.6 0.58 1.0 0.94 0.45 0.23 0.49 0.34 0.31 0.41 0.28 0.36 0.26 0.42 0.34 0.33 0.9 0.81 0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)