Heatmap: Cluster_305 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00009	0.94	0.53	0.71	0.84	0.45	0.14	0.22	0.66	0.61	0.61	0.97	0.38	0.69	0.7	0.93	1.0	0.65	0.27	0.23	0.29
Gb_00423	0.89	1.0	0.94	0.9	0.8	0.2	0.34	0.5	0.43	0.37	0.51	0.31	0.39	0.33	0.44	0.48	0.42	0.6	0.61	0.31
Gb_02339	0.79	0.44	0.81	1.0	0.68	0.34	0.33	0.56	0.41	0.34	0.34	0.44	0.45	0.5	0.39	0.17	0.27	0.45	0.72	0.34
Gb_02737	0.79	0.81	0.72	0.45	0.54	0.17	0.36	0.68	0.48	0.45	0.89	0.46	0.35	0.29	0.94	0.68	0.42	0.58	1.0	0.33
Gb_03198	0.77	0.74	0.82	0.81	0.94	0.8	0.37	1.0	0.84	0.7	0.77	0.71	0.87	0.9	0.59	0.88	0.62	0.81	0.86	0.47
Gb_03389	0.37	0.8	0.37	0.5	0.55	0.45	0.35	0.78	0.73	0.6	0.86	0.38	0.92	0.87	1.0	0.8	0.41	0.51	0.8	0.34
Gb_03546	0.91	0.68	0.71	0.68	0.74	0.47	0.52	0.79	0.79	0.76	1.0	0.5	0.76	0.63	0.98	0.7	0.59	0.63	0.94	0.62
Gb_04174	1.0	0.43	0.75	0.67	0.35	0.5	0.25	0.58	0.55	0.41	0.85	0.27	0.42	0.3	0.76	0.61	0.44	0.18	0.34	0.25
Gb_04837	0.47	0.65	0.48	0.47	0.79	0.68	0.45	0.82	0.63	0.58	0.86	0.61	1.0	0.95	0.84	0.41	0.47	0.8	0.86	0.47
Gb_04965	1.0	0.21	0.64	0.73	0.41	0.09	0.13	0.39	0.33	0.26	0.31	0.39	0.27	0.24	0.28	0.55	0.77	0.19	0.3	0.13
Gb_05572	0.85	0.62	0.76	1.0	0.77	0.28	0.26	0.46	0.39	0.31	0.55	0.27	0.55	0.49	0.48	0.36	0.19	0.44	0.76	0.31
Gb_08768	0.95	0.66	0.7	1.0	0.55	0.26	0.33	0.65	0.42	0.41	0.97	0.36	0.48	0.35	0.99	0.43	0.38	0.37	0.59	0.18
Gb_08916	0.8	0.37	0.4	0.28	0.39	0.16	0.39	0.57	0.32	0.36	0.35	0.24	1.0	0.56	0.38	0.28	0.19	0.18	0.22	0.14
Gb_09138	1.0	0.55	0.9	0.73	0.8	0.48	0.38	0.7	0.57	0.55	0.72	0.47	0.76	0.57	0.74	0.66	0.55	0.77	0.8	0.76
Gb_09192	1.0	0.51	0.79	0.71	0.53	0.33	0.23	0.63	0.42	0.34	0.63	0.41	0.64	0.5	0.67	0.44	0.43	0.25	0.16	0.16
Gb_09230	0.73	1.0	0.47	0.45	0.42	0.13	0.19	0.3	0.13	0.16	0.18	0.21	0.13	0.11	0.28	0.26	0.12	0.38	0.79	0.27
Gb_09744	0.87	0.62	0.96	0.71	0.69	0.46	0.27	0.75	0.71	0.63	0.95	0.68	0.68	0.65	1.0	0.77	0.6	0.63	0.78	0.31
Gb_09878	0.98	0.67	1.0	0.82	0.78	0.46	0.43	0.67	0.49	0.48	0.69	0.51	0.35	0.32	0.61	0.37	0.46	0.61	0.58	0.38
Gb_10746	1.0	0.73	0.93	0.83	0.74	0.27	0.25	0.62	0.49	0.43	0.5	0.46	0.55	0.51	0.55	0.65	0.48	0.52	0.76	0.38
Gb_10977	0.86	0.71	0.71	0.63	0.67	0.41	0.25	0.76	0.69	0.66	0.82	0.35	0.66	0.46	0.69	0.67	0.31	0.79	1.0	0.44
Gb_10994	0.68	0.55	0.69	1.0	0.5	0.34	0.36	0.53	0.36	0.34	0.63	0.38	0.3	0.28	0.76	0.17	0.3	0.55	0.53	0.23
Gb_11261	0.49	0.97	0.55	0.58	0.59	0.13	0.14	0.57	0.5	0.43	0.38	0.39	0.29	0.29	0.37	0.42	0.31	0.51	1.0	0.53
Gb_11839	0.88	0.42	0.76	1.0	0.44	0.5	0.45	0.45	0.24	0.22	0.59	0.18	0.19	0.19	0.47	0.21	0.3	0.41	0.72	0.22
Gb_13758	0.69	0.54	0.66	1.0	0.34	0.19	0.49	0.72	0.56	0.51	0.85	0.39	0.91	0.91	0.93	0.55	0.47	0.24	0.32	0.26
Gb_14419	0.32	0.86	0.6	0.85	0.61	0.41	0.47	0.72	0.77	0.58	0.68	0.47	1.0	0.87	0.64	0.52	0.63	0.56	0.57	0.4
Gb_14547	0.5	0.31	0.5	0.41	0.29	0.18	0.12	0.5	0.68	0.59	1.0	0.35	0.56	0.52	1.0	0.61	0.48	0.22	0.25	0.15
Gb_15633	0.79	0.6	0.87	0.82	0.66	0.38	0.44	0.86	0.74	0.72	0.97	0.59	0.69	0.59	1.0	0.39	0.42	0.61	0.96	0.23
Gb_17987	0.77	0.81	0.91	1.0	0.55	0.19	0.29	0.7	0.76	0.67	0.96	0.44	0.31	0.26	0.91	1.0	0.64	0.47	0.54	0.35
Gb_18423	0.28	0.72	0.37	0.4	0.49	0.29	0.21	0.89	0.71	0.58	0.85	0.51	0.84	0.61	0.95	0.51	0.35	0.57	1.0	0.46
Gb_19847	0.88	1.0	0.73	0.77	0.82	0.51	0.21	0.54	0.54	0.51	0.6	0.34	0.43	0.35	0.56	0.6	0.56	0.83	0.61	0.76
Gb_20285	1.0	0.69	0.79	0.97	0.83	0.51	0.32	0.69	0.42	0.36	0.45	0.36	0.63	0.47	0.47	0.42	0.51	0.58	0.74	0.4
Gb_21790	0.86	0.47	0.63	1.0	0.63	0.18	0.24	0.51	0.55	0.45	0.64	0.34	0.69	0.82	0.56	0.81	0.66	0.32	0.16	0.44
Gb_21792	0.9	1.0	0.93	0.98	0.6	0.24	0.22	0.68	0.49	0.41	0.75	0.43	0.68	0.67	0.73	0.69	0.61	0.43	0.36	0.37
Gb_21961	0.39	0.27	0.38	0.46	0.21	0.02	0.21	0.47	0.49	0.4	1.0	0.29	0.75	0.69	0.97	0.45	0.26	0.18	0.16	0.17
Gb_25644	1.0	0.46	0.73	0.82	0.69	0.28	0.17	0.62	0.46	0.4	0.55	0.38	0.69	0.55	0.58	0.41	0.48	0.79	0.56	0.43
Gb_25727	1.0	0.65	0.64	0.93	0.95	0.45	0.31	0.81	0.6	0.56	0.73	0.49	0.66	0.52	0.64	0.49	0.36	0.67	0.77	0.48
Gb_26567	0.84	0.46	0.64	0.77	0.65	0.89	0.3	0.89	0.36	0.32	0.77	0.45	0.44	0.34	0.77	0.44	0.42	1.0	0.91	0.6
Gb_27026	0.86	0.76	0.8	1.0	0.65	0.41	0.35	0.85	0.45	0.38	0.81	0.62	0.89	0.75	0.79	0.79	0.92	0.75	0.42	0.44
Gb_27077	1.0	0.56	0.65	0.9	0.68	0.32	0.28	0.73	0.49	0.51	0.52	0.45	0.35	0.28	0.49	0.64	0.59	0.47	0.5	0.35
Gb_27709	1.0	0.41	0.61	0.85	0.69	0.5	0.22	0.51	0.38	0.31	0.5	0.24	0.42	0.32	0.46	0.45	0.39	0.44	0.61	0.23
Gb_31497	1.0	0.71	0.99	1.0	0.75	0.4	0.51	0.65	0.46	0.4	0.57	0.39	0.34	0.27	0.61	0.29	0.43	0.41	0.68	0.33
Gb_31724	1.0	0.81	0.88	0.36	0.48	0.19	0.2	0.64	0.54	0.42	0.75	0.33	0.4	0.33	0.7	0.73	0.56	0.3	0.22	0.24
Gb_31998	0.74	0.42	0.72	1.0	0.47	0.26	0.37	0.46	0.55	0.47	0.52	0.48	0.5	0.37	0.45	0.74	0.67	0.2	0.32	0.26
Gb_32287	0.77	0.56	0.66	0.65	0.73	0.84	0.43	0.81	0.82	0.66	0.89	0.62	0.71	0.65	0.82	0.88	0.75	0.83	1.0	0.6
Gb_32424	1.0	0.67	0.93	0.93	0.76	0.28	0.31	0.52	0.43	0.39	0.72	0.26	0.3	0.27	0.75	0.64	0.48	0.55	0.81	0.44
Gb_33113	0.9	0.58	0.76	1.0	0.64	0.31	0.4	0.66	0.66	0.48	0.72	0.41	0.29	0.28	0.78	0.7	0.56	0.66	0.6	0.25
Gb_33229	1.0	0.39	0.62	0.87	0.68	0.33	0.36	0.64	0.46	0.47	0.74	0.37	0.57	0.57	0.72	0.43	0.57	0.45	0.74	0.4
Gb_33314	0.67	0.54	0.49	0.54	0.61	0.39	0.32	0.47	0.47	0.46	1.0	0.31	0.42	0.36	0.93	0.43	0.37	0.4	0.69	0.2
Gb_34166	0.59	0.48	0.46	0.83	0.8	0.46	0.41	0.97	0.54	0.51	0.81	0.37	1.0	0.7	0.76	0.38	0.42	0.63	0.97	0.47
Gb_34295	0.99	0.64	0.99	1.0	0.84	0.2	0.17	0.57	0.48	0.4	0.63	0.36	0.42	0.43	0.6	0.53	0.44	0.69	0.63	0.53
Gb_34328	0.78	0.61	0.91	0.85	0.64	0.42	0.37	0.69	0.35	0.37	0.51	0.52	0.46	0.34	0.56	0.47	0.54	0.61	1.0	0.61
Gb_34360	1.0	0.32	0.74	0.75	0.55	0.05	0.13	0.47	0.51	0.25	0.39	0.26	0.18	0.21	0.29	0.62	0.49	0.28	0.4	0.25
Gb_34503	0.84	0.86	0.89	0.68	0.79	0.31	0.44	0.66	0.64	0.65	0.89	0.37	1.0	0.77	0.88	0.51	0.38	0.44	0.72	0.48
Gb_35245	0.78	0.61	0.52	0.98	0.72	0.28	0.29	0.58	0.56	0.56	1.0	0.36	0.67	0.66	0.93	0.49	0.42	0.53	0.74	0.46
Gb_36475	0.94	0.43	0.68	0.74	0.8	0.41	0.42	0.8	0.91	0.57	0.88	0.52	0.94	0.99	0.81	0.98	1.0	0.62	0.33	0.44
Gb_37544	0.58	1.0	0.55	0.55	0.69	0.45	0.24	0.56	0.41	0.39	0.71	0.39	0.66	0.49	0.66	0.24	0.3	0.28	0.59	0.28
Gb_39428	0.8	0.73	1.0	0.79	0.88	0.53	0.38	0.93	0.49	0.48	0.58	0.54	0.47	0.41	0.59	0.4	0.62	0.62	1.0	0.43
Gb_39974	1.0	0.48	0.54	0.74	0.51	0.5	0.43	0.58	0.58	0.5	0.56	0.41	0.28	0.24	0.53	0.67	0.54	0.42	0.32	0.24
Gb_41177	0.64	0.34	0.35	0.33	0.34	0.09	0.22	0.25	0.2	0.23	0.17	0.08	0.1	0.07	0.15	0.15	0.02	0.25	1.0	0.3
Gb_41440	1.0	0.42	0.51	0.57	0.46	0.16	0.13	0.45	0.5	0.52	0.71	0.17	0.48	0.37	0.72	0.57	0.33	0.16	0.1	0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)