1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
1.95 0.57 1.21 0.98 0.99 0.13 0.58 0.12 0.1 0.09 0.01 0.03 0.02 0.06 0.0 0.13 0.5 0.35 0.01 4.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.51 0.86 0.94 0.54 0.37 0.42 1.51 0.14 0.13 0.46 0.74 2.74 0.0 0.14 1.4
1.46 1.75 0.68 1.96 2.22 1.2 0.03 0.38 0.08 0.22 0.04 0.07 0.07 0.55 0.04 0.71 0.84 1.64 0.78 0.11
2.73 0.0 0.0 3.41 0.41 0.11 1.03 0.67 0.16 0.11 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.12 0.1 0.43 0.03 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.68 2.24 2.5 1.13 0.19 0.27 0.04 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.29 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.53 1.96 4.47 3.54 1.38 0.0 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0
3.45 2.81 6.1 3.35 1.81 1.98 1.61 1.66 0.74 0.45 0.83 1.18 0.19 0.11 0.75 0.55 0.53 1.19 6.41 25.61
2.37 0.0 1.41 1.49 0.26 0.74 0.43 1.1 0.39 0.08 0.0 0.38 0.07 0.09 0.27 0.0 0.54 0.79 1.35 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.04 0.0 0.02 0.09 0.0 0.03 0.06 0.0
0.05 0.05 0.07 0.0 0.02 0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 11.66
4.27 2.27 5.63 2.36 0.81 0.13 0.64 0.74 0.07 0.01 0.05 0.38 0.01 0.02 0.0 0.03 0.11 0.56 0.02 1.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.19 0.26 0.03 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.53 0.27
14.04 3.15 4.29 13.01 4.52 4.77 0.07 4.85 0.75 1.16 8.82 4.31 2.71 1.93 8.17 9.43 11.14 4.59 0.55 1.55
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.02 0.0 0.07 0.14 0.0 0.03 0.13 0.0 0.16 0.1 0.13 0.0
0.1 0.0 0.05 0.0 0.03 0.03 0.01 0.05 0.15 0.04 0.22 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.06 0.0 0.02 0.06
6.97 0.28 3.55 3.8 0.42 0.01 0.03 0.31 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.08 0.04 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 0.17 0.08 0.0 0.0 0.08 0.18 0.04 0.0 0.58 0.06 0.23 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.76 0.47 0.99 0.09 0.07 0.31 0.17 0.51 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 2.56 1.39 0.18 0.0 0.01
0.26 0.0 0.19 0.7 0.37 0.02 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.4 0.0 0.0
13.07 1.24 3.98 14.44 4.4 0.33 1.54 4.16 6.72 5.02 5.47 2.25 3.17 2.7 3.55 10.24 11.66 0.72 0.01 0.11
0.02 0.34 0.0 0.28 0.22 0.43 0.03 0.26 0.07 0.2 0.11 0.16 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.1 0.07 0.02
4.52 2.96 4.62 3.84 1.01 0.53 0.08 0.49 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.69 0.74 0.15 0.0 0.0
1.49 0.95 1.41 0.39 0.2 0.35 0.29 0.16 0.24 0.03 0.0 0.27 0.08 0.02 0.06 0.59 0.6 0.57 0.18 4.18
37.69 6.1 12.31 23.52 17.2 5.49 2.45 13.64 12.37 17.96 2.07 23.52 2.25 3.15 0.96 6.99 21.63 10.98 0.47 82.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.05 0.0 0.0 0.02 1.15 0.0 0.32 0.07 0.1 0.04 0.12 0.04 0.03 0.08 0.03 0.05 0.08 0.02 0.08
2.65 2.13 2.3 3.73 1.84 0.08 2.48 1.83 0.9 0.55 0.53 0.37 3.12 2.37 1.01 2.35 2.19 0.3 0.0 0.02
0.03 0.02 0.03 0.02 0.05 0.04 0.02 0.02 0.03 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.07 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.15 0.0 5.54 0.0 0.39 0.04 0.48 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 3.97 0.27 0.48 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.22 1.81 0.04 1.09 0.03 0.05 0.06 0.29 0.01 0.02 0.0 0.41 0.36
0.32 0.07 0.19 0.0 0.03 0.0 0.02 0.39 0.18 0.07 0.09 0.08 0.08 0.11 0.52 0.49 0.46 0.0 0.2 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.62 0.93 0.54 0.5 0.16 0.07 0.08 0.22 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02 0.05 0.21 0.14 0.0 0.74
11.43 3.71 8.98 6.86 1.62 0.0 0.33 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0
3.73 2.3 3.27 5.14 4.24 2.62 7.55 3.05 1.27 1.06 0.98 1.23 0.65 0.76 1.12 1.73 1.91 4.24 8.93 19.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.7 0.1 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.06 2.3
6.63 2.58 3.01 2.25 1.01 0.0 0.53 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0
4.09 3.78 3.9 1.65 0.84 0.0 0.44 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0
7.12 3.36 10.8 4.89 2.31 4.12 0.53 2.61 0.79 1.1 0.75 0.8 0.81 0.89 0.25 1.68 1.26 1.14 1.91 0.39
1.41 0.8 1.35 1.79 0.53 0.03 0.06 0.14 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.35 0.0 0.0 0.67 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.09 0.1 0.25 0.2 0.0 0.0 0.0 0.1 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.0 0.09 0.09 0.06 7.49 0.0 0.68 0.02 0.05 0.3 0.87 0.05 0.01 0.02 0.0 0.32 0.05 0.06 0.14
7.74 3.23 7.28 1.61 2.4 4.06 3.81 1.81 1.94 1.49 1.21 7.86 0.4 0.82 1.06 2.64 2.88 0.6 0.02 20.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.13 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.07 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.08 0.06 0.0 0.13 0.0
0.66 0.54 0.75 0.52 0.19 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0
0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.13 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.03 0.22 0.08 0.17 0.08 0.02 0.05 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
1.59 0.0 0.29 3.36 0.0 0.0 0.14 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.13 0.03 0.02 0.04 0.05 0.01 0.08 0.04 0.1 0.03 0.03 0.01 0.02 0.0 0.04 0.07 0.02 0.02 0.09 0.54
0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.03 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.12 0.01 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.21 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.72 0.0 1.27 1.79 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 3.18 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.0 0.17 2.19 0.0 0.7 0.45 0.44 0.0 0.08 0.07 0.0 0.27 0.0 0.16 0.0 0.0 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.63 5.84 5.47 2.43 1.42 0.0 0.16 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.01 0.0
0.12 0.35 1.7 0.2 0.19 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
13.29 1.02 3.94 13.32 3.05 1.4 8.53 2.93 0.86 0.48 2.95 1.98 0.97 0.65 2.74 0.94 5.41 2.73 0.0 0.03
11.08 1.9 12.71 16.83 5.76 3.65 2.09 3.35 1.25 0.61 0.93 1.24 0.79 0.55 0.75 1.4 2.29 5.39 6.92 1.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.03 0.24 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.07 0.56
0.03 0.0 0.0 0.0 0.26 1.43 0.0 0.41 0.26 0.32 0.24 0.11 0.03 0.04 0.19 0.0 0.25 0.05 0.15 0.08
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.06
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.77 5.5 3.15 1.4 0.8 0.0 0.09 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0 0.0
2.03 0.54 0.22 0.11 0.17 0.08 1.74 0.11 0.01 0.04 0.03 0.0 0.03 0.01 0.03 0.07 0.0 0.18 0.0 0.0
1.09 0.54 0.27 0.0 0.6 0.0 0.09 0.72 0.52 0.57 0.57 0.73 0.04 0.24 0.0 1.62 2.5 0.24 0.0 0.14

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)