Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.89 0.32 0.54 0.68 0.92 0.28 0.26 0.4 0.56 0.43 0.53 0.26 0.56 0.46 0.38 1.0 0.55 0.45 0.4 0.28
1.0 0.64 0.63 0.79 0.96 0.29 0.3 0.44 0.48 0.38 0.46 0.25 0.42 0.31 0.43 0.77 0.4 0.56 0.77 0.15
0.97 0.66 0.74 0.74 1.0 0.4 0.71 0.64 0.54 0.47 0.82 0.3 0.75 0.67 0.93 0.82 0.47 0.86 0.91 0.7
0.88 0.52 0.48 0.66 0.73 0.25 0.53 0.34 0.52 0.42 0.56 0.16 0.45 0.66 0.81 1.0 0.27 0.34 0.56 0.76
0.69 0.15 0.39 0.44 0.64 0.18 0.09 0.43 0.33 0.26 0.5 0.21 0.28 0.37 0.47 0.54 0.61 0.61 0.16 1.0
0.84 0.15 0.6 0.46 0.96 0.11 0.16 0.41 0.4 0.27 0.65 0.26 0.11 0.18 0.52 0.5 0.69 0.69 0.2 1.0
1.0 0.45 0.56 0.61 0.9 0.32 0.14 0.54 0.37 0.25 0.54 0.26 0.26 0.31 0.53 0.53 0.6 0.92 0.56 0.63
0.98 0.65 0.48 0.64 0.85 0.45 0.5 0.6 0.62 0.6 0.72 0.39 0.45 0.55 0.72 0.79 0.55 0.97 0.47 1.0
0.73 0.46 0.33 0.65 0.74 0.27 0.8 0.57 0.56 0.54 0.9 0.48 0.79 0.64 0.94 0.62 0.8 0.52 0.32 1.0
0.68 0.21 0.38 0.27 0.49 0.18 0.56 0.34 0.39 0.32 1.0 0.26 0.16 0.18 0.87 0.62 0.47 0.35 0.27 0.37
1.0 0.38 0.44 0.58 0.87 0.28 0.45 0.43 0.53 0.48 0.51 0.26 0.59 0.67 0.49 0.68 0.47 0.66 0.29 0.78
1.0 0.22 0.39 0.49 0.91 0.74 0.63 0.54 0.52 0.49 0.68 0.45 0.61 0.53 0.71 0.41 0.28 0.9 0.48 0.78
0.88 0.3 0.41 0.56 1.0 0.27 0.43 0.4 0.44 0.44 0.48 0.22 0.48 0.53 0.47 0.55 0.44 0.62 0.32 0.56
0.83 0.46 0.53 1.0 0.96 0.81 0.6 0.53 0.43 0.43 0.35 0.36 0.4 0.4 0.38 0.32 0.37 0.93 0.68 0.35
0.96 0.36 0.46 0.79 0.99 0.78 0.89 0.68 0.5 0.52 0.64 0.52 0.37 0.36 0.67 0.37 0.37 1.0 0.63 0.39
0.91 0.19 0.37 0.7 1.0 0.71 0.64 0.46 0.44 0.44 0.44 0.29 0.6 0.64 0.42 0.42 0.34 0.88 0.28 0.4
0.77 0.43 0.3 0.32 0.71 0.49 0.41 0.44 0.38 0.35 0.88 0.34 0.19 0.24 1.0 0.83 0.66 0.54 0.49 0.78
0.97 0.8 0.68 0.88 1.0 0.73 0.43 0.77 0.67 0.63 0.74 0.69 0.6 0.47 0.62 0.82 0.86 0.91 0.63 0.99
0.85 0.64 0.52 0.76 0.93 0.56 0.44 0.73 0.72 0.66 0.79 0.59 0.63 0.67 0.75 0.7 0.76 0.89 0.41 1.0
0.96 0.25 0.35 0.57 1.0 0.1 0.11 0.26 0.39 0.45 0.52 0.33 0.28 0.32 0.54 0.46 0.22 0.65 0.26 0.98
1.0 0.78 0.83 0.58 0.67 0.26 0.83 0.45 0.45 0.43 0.91 0.39 0.21 0.22 0.85 0.54 0.39 0.69 0.54 0.15
0.95 0.54 0.57 0.61 1.0 0.23 0.55 0.46 0.73 0.75 0.48 0.4 0.47 0.46 0.44 0.96 0.86 0.68 0.26 0.49
0.99 0.42 0.64 0.64 1.0 0.33 0.48 0.48 0.57 0.48 0.58 0.37 0.58 0.63 0.45 0.85 0.54 0.62 0.35 0.75
1.0 0.61 0.72 0.77 0.65 0.38 0.78 0.58 0.68 0.59 0.85 0.31 0.33 0.37 0.76 0.91 0.56 0.75 0.36 0.42
0.61 0.29 0.28 0.58 0.84 0.31 0.72 0.56 0.56 0.53 1.0 0.43 0.29 0.35 0.91 0.85 0.65 0.98 0.41 0.88
1.0 0.35 0.31 0.79 0.89 0.31 0.67 0.39 0.52 0.43 0.49 0.26 0.43 0.45 0.73 0.68 0.33 0.79 0.36 0.7
0.86 0.65 0.83 0.48 0.9 0.11 0.31 0.48 0.6 0.51 0.96 0.37 0.15 0.23 0.6 1.0 0.65 0.6 0.24 0.51
0.63 0.0 0.25 0.17 0.8 0.44 0.24 0.31 0.3 0.47 0.45 0.15 0.43 0.43 0.41 0.56 0.6 0.51 0.4 1.0
0.76 0.27 0.33 0.66 1.0 0.12 0.21 0.32 0.42 0.37 0.8 0.33 0.37 0.42 0.56 0.71 0.71 0.57 0.21 0.45
0.91 0.95 0.6 0.82 0.81 0.31 0.98 0.57 0.46 0.42 0.67 0.42 0.34 0.24 0.65 0.75 0.4 0.83 1.0 0.64
0.87 0.75 0.54 0.62 0.55 0.39 1.0 0.58 0.49 0.38 0.83 0.41 0.29 0.21 0.85 0.86 0.44 0.68 0.75 0.94
0.79 0.47 0.26 0.63 0.72 0.24 1.0 0.53 0.48 0.36 0.92 0.33 0.3 0.22 0.9 0.71 0.42 0.61 0.51 0.8
0.71 0.44 0.63 0.93 0.65 0.38 0.99 0.55 0.62 0.6 0.93 0.43 0.26 0.27 1.0 0.73 0.55 0.52 0.56 0.86
0.92 0.72 0.58 0.56 1.0 0.35 0.52 0.53 0.53 0.54 0.52 0.39 0.71 0.74 0.62 0.66 0.5 0.68 0.52 0.86
0.65 0.48 0.42 0.38 0.61 0.26 0.45 0.5 0.51 0.55 1.0 0.32 0.38 0.38 0.96 0.52 0.59 0.49 0.55 0.45
0.55 0.34 0.32 0.43 0.57 0.26 0.42 0.45 0.43 0.41 1.0 0.28 0.52 0.52 0.83 0.53 0.54 0.5 0.44 0.51
1.0 0.53 0.74 0.6 0.67 0.48 0.44 0.49 0.45 0.42 0.48 0.32 0.54 0.52 0.47 0.51 0.4 0.49 0.43 0.3
1.0 0.44 0.71 0.65 0.59 0.42 0.54 0.47 0.5 0.45 0.61 0.3 0.53 0.6 0.56 0.56 0.47 0.43 0.11 0.38
0.53 0.29 0.36 0.23 0.51 0.15 0.43 0.36 0.51 0.5 0.78 0.27 0.1 0.17 0.82 1.0 0.63 0.37 0.18 0.53
0.9 0.95 0.68 1.0 0.95 0.82 0.37 0.74 0.55 0.53 0.61 0.68 0.4 0.37 0.65 0.65 0.6 0.89 0.85 0.69
0.97 0.43 0.74 1.0 0.7 0.32 0.46 0.38 0.41 0.36 0.5 0.24 0.49 0.54 0.49 0.38 0.23 0.5 0.28 0.42
1.0 0.76 0.69 0.75 0.79 0.47 0.51 0.64 0.61 0.58 0.6 0.45 0.7 0.65 0.63 0.47 0.45 0.74 0.74 0.59
0.71 0.41 0.36 0.63 1.0 0.4 0.32 0.38 0.44 0.38 0.56 0.18 0.26 0.35 0.56 0.73 0.34 0.48 0.47 0.73
0.75 0.25 0.42 0.46 0.66 0.05 0.17 0.22 0.34 0.3 0.36 0.19 0.13 0.21 0.32 1.0 0.18 0.56 0.32 0.78
0.76 0.3 0.27 0.38 1.0 0.67 0.56 0.4 0.27 0.32 0.38 0.28 0.48 0.39 0.46 0.35 0.29 0.58 0.31 0.69
0.91 0.75 0.7 0.9 0.85 0.3 1.0 0.35 0.4 0.32 0.62 0.19 0.24 0.2 0.63 0.5 0.25 0.46 0.32 0.59
0.92 0.32 0.4 0.85 0.7 0.14 0.64 0.38 0.5 0.47 1.0 0.35 0.29 0.29 0.81 0.76 0.46 0.76 0.29 0.73
1.0 0.54 0.74 0.76 0.89 0.31 0.49 0.34 0.46 0.44 0.47 0.21 0.4 0.51 0.36 0.72 0.32 0.71 0.42 0.57
1.0 0.21 0.5 0.78 0.51 0.11 0.41 0.31 0.17 0.13 0.6 0.19 0.36 0.3 0.46 0.29 0.09 0.42 0.29 0.28
0.91 0.78 1.0 0.58 0.83 0.42 0.69 0.54 0.79 0.68 0.6 0.36 0.57 0.58 0.51 0.65 0.5 0.72 0.57 0.65
0.84 0.95 0.96 1.0 0.94 0.49 0.62 0.52 0.5 0.46 0.58 0.39 0.24 0.18 0.56 0.32 0.46 0.91 0.71 0.58
0.56 0.13 0.22 0.32 0.7 0.23 0.26 0.37 0.48 0.49 0.34 0.36 0.22 0.24 0.32 1.0 0.63 0.52 0.23 0.48
0.63 0.15 0.16 0.77 0.89 0.13 0.29 0.36 0.31 0.21 0.58 0.23 0.21 0.25 0.66 1.0 0.62 0.51 0.78 0.8
0.57 0.18 0.25 0.44 0.56 0.33 0.44 0.44 0.5 0.48 1.0 0.37 0.4 0.33 0.98 0.66 0.45 0.47 0.34 0.31
1.0 0.17 0.23 0.57 0.54 0.31 0.49 0.3 0.34 0.31 0.49 0.19 0.32 0.42 0.47 0.72 0.5 0.39 0.19 0.39
0.77 0.42 0.56 0.49 0.68 0.3 0.55 0.52 0.54 0.54 1.0 0.36 0.55 0.5 0.91 0.84 0.76 0.51 0.35 0.55
1.0 0.42 0.55 0.62 0.9 0.37 0.54 0.68 0.78 0.77 0.9 0.5 0.7 0.57 0.9 1.0 0.97 0.75 0.23 0.93
1.0 0.37 0.64 0.83 0.65 0.41 0.46 0.51 0.33 0.3 0.53 0.36 0.24 0.27 0.49 0.49 0.6 0.44 0.4 0.37
0.57 0.71 0.38 0.47 0.77 0.26 0.34 0.5 0.36 0.47 0.74 0.3 0.32 0.28 1.0 0.71 0.46 0.42 0.5 0.29
1.0 0.48 0.84 0.32 0.93 0.28 0.51 0.37 0.64 0.51 0.44 0.29 0.36 0.42 0.4 0.38 0.33 0.49 0.37 0.61
0.86 0.24 0.32 0.28 0.68 0.1 0.51 0.44 0.59 0.58 1.0 0.33 0.53 0.45 0.83 0.84 0.54 0.32 0.27 0.74
1.0 0.4 0.89 0.58 0.58 0.32 0.41 0.47 0.29 0.25 0.44 0.26 0.37 0.29 0.46 0.38 0.36 0.42 0.4 0.24
0.81 0.16 0.32 0.55 0.68 0.36 0.76 0.37 0.45 0.44 0.5 0.31 0.68 0.67 0.51 0.5 0.39 1.0 0.43 0.79
0.93 0.54 0.68 0.6 1.0 0.43 0.4 0.46 0.52 0.38 0.43 0.37 0.46 0.42 0.29 0.47 0.36 0.87 0.37 0.71
1.0 0.49 0.69 0.56 0.99 0.41 0.42 0.47 0.48 0.46 0.55 0.5 0.15 0.12 0.58 0.47 0.42 0.97 0.57 0.82
0.97 0.38 0.56 1.0 0.9 0.47 0.52 0.46 0.41 0.38 0.67 0.41 0.6 0.61 0.61 0.39 0.45 0.71 0.39 0.56
1.0 0.5 0.62 0.4 0.97 0.39 0.59 0.51 0.42 0.38 0.92 0.4 0.64 0.65 0.87 0.53 0.4 0.76 0.26 0.63
0.82 0.45 0.54 0.85 0.79 0.07 0.31 0.36 0.48 0.36 0.47 0.28 0.29 0.31 0.49 1.0 0.4 0.46 0.37 0.57
1.0 0.44 0.41 0.96 0.85 0.16 0.38 0.42 0.43 0.35 0.71 0.28 0.36 0.39 0.49 0.56 0.39 0.45 0.55 0.43
0.82 0.52 0.51 1.0 0.77 0.11 0.31 0.39 0.35 0.31 0.63 0.25 0.19 0.2 0.56 0.6 0.35 0.57 0.46 0.57
1.0 0.41 0.8 0.46 1.0 0.21 0.68 0.36 0.38 0.4 0.51 0.2 0.31 0.37 0.39 0.7 0.53 0.51 0.29 0.72
0.79 0.44 0.41 0.46 0.89 0.1 0.51 0.34 0.42 0.31 0.53 0.31 0.14 0.37 0.57 0.48 0.39 0.79 0.53 1.0
0.79 0.01 0.29 0.83 1.0 0.13 0.29 0.18 0.16 0.12 0.23 0.05 0.4 0.44 0.3 0.13 0.15 0.36 0.03 0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)