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Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.81 -0.68 0.1 0.41 0.86 -0.84 -0.98 -0.35 0.14 -0.23 0.05 -0.99 0.14 -0.14 -0.41 0.98 0.13 -0.17 -0.33 -0.86
0.94 0.3 0.26 0.6 0.87 -0.86 -0.82 -0.23 -0.11 -0.47 -0.17 -1.05 -0.3 -0.77 -0.28 0.56 -0.38 0.11 0.57 -1.81
0.46 -0.09 0.07 0.06 0.51 -0.83 0.01 -0.13 -0.39 -0.6 0.21 -1.22 0.08 -0.08 0.4 0.22 -0.58 0.29 0.38 -0.01
0.68 -0.06 -0.18 0.28 0.42 -1.13 -0.04 -0.68 -0.07 -0.36 0.03 -1.79 -0.28 0.27 0.57 0.87 -0.99 -0.67 0.05 0.48
0.72 -1.5 -0.09 0.07 0.63 -1.21 -2.18 0.03 -0.35 -0.69 0.26 -0.97 -0.58 -0.19 0.17 0.38 0.54 0.54 -1.37 1.26
0.87 -1.63 0.38 0.01 1.07 -2.0 -1.55 -0.15 -0.21 -0.74 0.51 -0.84 -2.03 -1.37 0.18 0.13 0.6 0.58 -1.17 1.13
0.96 -0.18 0.13 0.26 0.81 -0.7 -1.89 0.06 -0.47 -1.03 0.08 -0.98 -0.97 -0.75 0.03 0.05 0.23 0.84 0.12 0.29
0.59 -0.0 -0.45 -0.01 0.39 -0.53 -0.37 -0.11 -0.06 -0.12 0.16 -0.74 -0.54 -0.23 0.15 0.28 -0.24 0.57 -0.45 0.62
0.21 -0.45 -0.96 0.04 0.23 -1.21 0.34 -0.16 -0.17 -0.24 0.5 -0.39 0.32 0.02 0.57 -0.04 0.33 -0.28 -0.96 0.66
0.69 -1.01 -0.13 -0.64 0.24 -1.21 0.41 -0.32 -0.11 -0.38 1.25 -0.68 -1.39 -1.19 1.06 0.57 0.18 -0.25 -0.63 -0.18
0.89 -0.51 -0.29 0.09 0.69 -0.97 -0.27 -0.34 -0.02 -0.18 -0.08 -1.08 0.11 0.31 -0.15 0.32 -0.22 0.28 -0.88 0.53
0.77 -1.39 -0.61 -0.27 0.64 0.34 0.1 -0.12 -0.18 -0.25 0.21 -0.38 0.04 -0.15 0.27 -0.53 -1.08 0.61 -0.28 0.4
0.85 -0.72 -0.25 0.21 1.03 -0.85 -0.2 -0.3 -0.16 -0.16 -0.04 -1.18 -0.03 0.12 -0.06 0.17 -0.15 0.34 -0.63 0.19
0.57 -0.28 -0.08 0.85 0.78 0.55 0.11 -0.06 -0.37 -0.36 -0.67 -0.63 -0.46 -0.47 -0.55 -0.82 -0.6 0.74 0.3 -0.66
0.65 -0.75 -0.4 0.36 0.7 0.35 0.54 0.16 -0.29 -0.23 0.05 -0.25 -0.72 -0.75 0.12 -0.73 -0.72 0.7 0.05 -0.65
0.79 -1.48 -0.53 0.41 0.92 0.42 0.28 -0.21 -0.27 -0.27 -0.27 -0.84 0.19 0.28 -0.34 -0.34 -0.64 0.74 -0.92 -0.4
0.55 -0.28 -0.81 -0.74 0.43 -0.1 -0.36 -0.27 -0.47 -0.61 0.74 -0.64 -1.47 -1.14 0.92 0.65 0.32 0.02 -0.1 0.56
0.38 0.1 -0.12 0.24 0.43 -0.02 -0.79 0.04 -0.15 -0.24 -0.01 -0.11 -0.31 -0.67 -0.26 0.13 0.22 0.29 -0.24 0.41
0.27 -0.12 -0.42 0.12 0.41 -0.33 -0.67 0.07 0.04 -0.09 0.17 -0.25 -0.16 -0.07 0.1 0.01 0.13 0.35 -0.77 0.51
1.09 -0.84 -0.35 0.34 1.15 -2.14 -2.07 -0.78 -0.21 -0.01 0.21 -0.45 -0.67 -0.49 0.25 0.04 -1.02 0.53 -0.79 1.12
0.84 0.49 0.57 0.04 0.25 -1.08 0.58 -0.32 -0.31 -0.37 0.7 -0.51 -1.44 -1.32 0.61 -0.05 -0.5 0.31 -0.06 -1.94
0.67 -0.14 -0.06 0.03 0.75 -1.39 -0.11 -0.38 0.29 0.34 -0.31 -0.56 -0.32 -0.37 -0.45 0.69 0.54 0.19 -1.18 -0.28
0.75 -0.48 0.12 0.13 0.77 -0.84 -0.3 -0.29 -0.04 -0.29 -0.03 -0.67 -0.03 0.09 -0.38 0.53 -0.13 0.09 -0.75 0.36
0.69 -0.03 0.22 0.31 0.08 -0.69 0.33 -0.09 0.14 -0.06 0.46 -1.02 -0.9 -0.73 0.3 0.55 -0.15 0.28 -0.79 -0.56
0.03 -1.03 -1.08 -0.05 0.48 -0.95 0.26 -0.11 -0.1 -0.19 0.73 -0.49 -1.07 -0.79 0.6 0.49 0.12 0.7 -0.56 0.56
0.88 -0.62 -0.82 0.54 0.71 -0.82 0.29 -0.49 -0.07 -0.35 -0.15 -1.07 -0.35 -0.26 0.43 0.32 -0.72 0.53 -0.58 0.37
0.64 0.24 0.59 -0.22 0.7 -2.37 -0.83 -0.2 0.12 -0.1 0.8 -0.56 -1.88 -1.28 0.11 0.86 0.24 0.12 -1.22 -0.1
0.55 - -0.8 -1.33 0.9 0.05 -0.85 -0.48 -0.51 0.15 0.08 -1.5 0.02 0.01 -0.04 0.39 0.48 0.26 -0.08 1.22
0.66 -0.81 -0.55 0.45 1.06 -2.02 -1.17 -0.56 -0.19 -0.36 0.73 -0.55 -0.36 -0.2 0.21 0.57 0.57 0.26 -1.2 -0.11
0.51 0.57 -0.1 0.36 0.34 -1.03 0.62 -0.17 -0.48 -0.61 0.06 -0.59 -0.9 -1.41 0.02 0.24 -0.67 0.39 0.65 0.0
0.49 0.27 -0.2 0.0 -0.18 -0.68 0.69 -0.11 -0.34 -0.71 0.42 -0.61 -1.11 -1.59 0.46 0.48 -0.51 0.13 0.27 0.6
0.49 -0.24 -1.13 0.17 0.36 -1.21 0.84 -0.09 -0.22 -0.64 0.72 -0.75 -0.9 -1.36 0.69 0.34 -0.4 0.12 -0.12 0.52
0.17 -0.52 -0.0 0.56 0.04 -0.74 0.64 -0.21 -0.03 -0.08 0.56 -0.55 -1.25 -1.23 0.67 0.22 -0.2 -0.27 -0.17 0.45
0.56 0.21 -0.11 -0.14 0.68 -0.82 -0.27 -0.23 -0.23 -0.21 -0.26 -0.69 0.2 0.25 -0.01 0.09 -0.3 0.13 -0.27 0.46
0.31 -0.11 -0.32 -0.46 0.22 -0.99 -0.21 -0.07 -0.04 0.07 0.94 -0.69 -0.47 -0.48 0.88 -0.0 0.17 -0.09 0.07 -0.2
0.17 -0.53 -0.65 -0.2 0.22 -0.93 -0.23 -0.13 -0.19 -0.25 1.02 -0.79 0.08 0.06 0.75 0.1 0.13 0.02 -0.15 0.03
0.96 0.05 0.53 0.22 0.37 -0.09 -0.21 -0.07 -0.21 -0.31 -0.09 -0.67 0.08 0.01 -0.11 -0.0 -0.38 -0.08 -0.26 -0.76
0.95 -0.24 0.46 0.33 0.19 -0.31 0.07 -0.13 -0.04 -0.19 0.25 -0.79 0.03 0.23 0.13 0.11 -0.13 -0.27 -2.18 -0.43
0.28 -0.6 -0.28 -0.91 0.22 -1.5 -0.03 -0.29 0.23 0.2 0.83 -0.68 -2.17 -1.32 0.92 1.2 0.53 -0.23 -1.28 0.28
0.37 0.46 -0.04 0.53 0.46 0.24 -0.91 0.09 -0.33 -0.4 -0.19 -0.02 -0.78 -0.92 -0.09 -0.1 -0.21 0.36 0.3 -0.01
0.97 -0.21 0.58 1.02 0.52 -0.63 -0.08 -0.37 -0.28 -0.46 0.03 -1.01 0.01 0.14 0.0 -0.38 -1.1 0.03 -0.84 -0.24
0.64 0.25 0.1 0.24 0.31 -0.44 -0.33 0.0 -0.07 -0.14 -0.09 -0.52 0.13 0.03 -0.03 -0.46 -0.52 0.2 0.2 -0.13
0.56 -0.24 -0.41 0.37 1.04 -0.27 -0.62 -0.34 -0.14 -0.35 0.21 -1.43 -0.88 -0.47 0.2 0.59 -0.52 -0.0 -0.05 0.58
0.97 -0.63 0.13 0.26 0.79 -2.98 -1.18 -0.82 -0.15 -0.36 -0.11 -1.05 -1.6 -0.85 -0.27 1.39 -1.07 0.55 -0.27 1.04
0.74 -0.63 -0.74 -0.28 1.13 0.56 0.28 -0.18 -0.77 -0.5 -0.25 -0.72 0.06 -0.25 0.02 -0.4 -0.66 0.34 -0.55 0.6
0.79 0.53 0.41 0.78 0.71 -0.8 0.93 -0.57 -0.37 -0.72 0.24 -1.45 -1.13 -1.42 0.26 -0.07 -1.08 -0.19 -0.72 0.18
0.74 -0.79 -0.49 0.61 0.34 -2.01 0.22 -0.53 -0.15 -0.24 0.85 -0.64 -0.91 -0.92 0.54 0.45 -0.27 0.46 -0.91 0.41
0.91 0.02 0.47 0.51 0.74 -0.77 -0.12 -0.64 -0.21 -0.29 -0.17 -1.33 -0.4 -0.06 -0.58 0.43 -0.73 0.41 -0.35 0.09
1.43 -0.85 0.44 1.07 0.46 -1.72 0.14 -0.27 -1.1 -1.56 0.7 -0.94 -0.04 -0.29 0.31 -0.34 -2.11 0.17 -0.33 -0.42
0.49 0.26 0.63 -0.15 0.36 -0.62 0.09 -0.26 0.29 0.06 -0.1 -0.84 -0.17 -0.16 -0.35 -0.01 -0.36 0.16 -0.17 0.0
0.45 0.63 0.66 0.71 0.63 -0.32 0.01 -0.24 -0.28 -0.39 -0.08 -0.63 -1.33 -1.75 -0.13 -0.94 -0.42 0.57 0.21 -0.07
0.47 -1.65 -0.87 -0.33 0.79 -0.84 -0.64 -0.12 0.24 0.28 -0.25 -0.18 -0.86 -0.74 -0.36 1.3 0.64 0.35 -0.82 0.25
0.41 -1.7 -1.54 0.69 0.9 -1.88 -0.73 -0.41 -0.63 -1.2 0.28 -1.04 -1.19 -0.95 0.48 1.07 0.37 0.1 0.71 0.75
0.26 -1.41 -0.92 -0.11 0.25 -0.54 -0.12 -0.12 0.08 0.0 1.08 -0.34 -0.26 -0.54 1.05 0.48 -0.07 -0.0 -0.46 -0.63
1.26 -1.27 -0.83 0.46 0.38 -0.43 0.22 -0.46 -0.3 -0.44 0.24 -1.12 -0.4 0.01 0.16 0.78 0.25 -0.09 -1.15 -0.09
0.4 -0.48 -0.06 -0.25 0.22 -0.95 -0.1 -0.19 -0.12 -0.11 0.77 -0.69 -0.09 -0.23 0.64 0.52 0.38 -0.2 -0.74 -0.1
0.51 -0.73 -0.35 -0.19 0.36 -0.94 -0.38 -0.05 0.16 0.14 0.35 -0.5 -0.01 -0.31 0.35 0.5 0.46 0.09 -1.58 0.4
1.04 -0.38 0.4 0.77 0.43 -0.24 -0.08 0.06 -0.54 -0.67 0.12 -0.41 -1.0 -0.84 0.01 0.02 0.31 -0.13 -0.29 -0.4
0.2 0.54 -0.37 -0.06 0.65 -0.94 -0.55 0.01 -0.47 -0.06 0.59 -0.69 -0.64 -0.81 1.02 0.52 -0.08 -0.24 0.02 -0.75
1.0 -0.05 0.75 -0.66 0.9 -0.82 0.03 -0.42 0.37 0.03 -0.17 -0.8 -0.47 -0.26 -0.32 -0.39 -0.61 -0.02 -0.42 0.29
0.71 -1.11 -0.7 -0.9 0.37 -2.37 -0.04 -0.24 0.17 0.16 0.94 -0.67 0.03 -0.22 0.66 0.68 0.06 -0.7 -0.96 0.5
1.18 -0.13 1.01 0.4 0.4 -0.48 -0.1 0.09 -0.59 -0.82 0.0 -0.75 -0.25 -0.59 0.05 -0.22 -0.3 -0.06 -0.14 -0.88
0.6 -1.75 -0.72 0.03 0.34 -0.56 0.52 -0.53 -0.24 -0.29 -0.11 -0.79 0.36 0.32 -0.06 -0.09 -0.45 0.91 -0.31 0.56
0.8 0.03 0.35 0.18 0.9 -0.31 -0.41 -0.23 -0.04 -0.51 -0.32 -0.55 -0.2 -0.34 -0.89 -0.19 -0.57 0.7 -0.53 0.4
0.85 -0.19 0.3 0.02 0.84 -0.44 -0.42 -0.25 -0.21 -0.28 -0.01 -0.14 -1.89 -2.21 0.07 -0.25 -0.41 0.8 0.04 0.56
0.76 -0.59 -0.04 0.8 0.65 -0.28 -0.15 -0.3 -0.49 -0.59 0.23 -0.5 0.07 0.1 0.09 -0.55 -0.34 0.31 -0.56 -0.03
0.76 -0.25 0.07 -0.57 0.72 -0.6 -0.01 -0.22 -0.48 -0.65 0.64 -0.56 0.11 0.13 0.55 -0.15 -0.56 0.35 -1.19 0.08
0.75 -0.11 0.17 0.81 0.71 -2.7 -0.63 -0.44 -0.02 -0.42 -0.04 -0.79 -0.75 -0.63 0.03 1.04 -0.28 -0.06 -0.4 0.24
1.0 -0.17 -0.29 0.94 0.76 -1.69 -0.39 -0.26 -0.21 -0.5 0.5 -0.82 -0.46 -0.38 -0.04 0.17 -0.37 -0.16 0.14 -0.21
0.79 0.12 0.1 1.08 0.7 -2.16 -0.59 -0.3 -0.42 -0.62 0.42 -0.9 -1.34 -1.25 0.25 0.34 -0.42 0.27 -0.04 0.26
0.97 -0.32 0.64 -0.16 0.97 -1.31 0.41 -0.5 -0.41 -0.34 0.01 -1.37 -0.74 -0.46 -0.38 0.45 0.06 -0.01 -0.82 0.49
0.69 -0.15 -0.26 -0.1 0.86 -2.27 0.06 -0.52 -0.22 -0.65 0.11 -0.65 -1.8 -0.4 0.22 -0.03 -0.34 0.69 0.13 1.03
1.35 -5.27 -0.12 1.4 1.68 -1.24 -0.12 -0.79 -0.96 -1.33 -0.45 -2.76 0.36 0.51 -0.08 -1.29 -1.03 0.22 -3.49 0.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.