Heatmap: Cluster_234 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.21 0.66 0.57 0.38 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.24 0.06 0.0
1.0 0.32 0.73 0.43 0.56 0.01 0.05 0.06 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.36 0.1 0.21
1.0 0.55 0.95 0.95 0.67 0.47 0.57 0.26 0.08 0.08 0.11 0.17 0.08 0.08 0.09 0.1 0.19 0.42 0.41 0.3
1.0 0.29 0.23 0.42 0.5 0.1 0.23 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 0.58 0.07 0.03
1.0 0.12 0.4 0.38 0.45 0.06 0.14 0.13 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.57 0.09 0.0
0.94 0.3 0.65 1.0 0.8 0.44 0.13 0.33 0.15 0.16 0.19 0.24 0.25 0.26 0.18 0.13 0.21 0.59 0.38 0.28
0.79 0.25 0.51 1.0 0.75 0.33 0.11 0.35 0.15 0.18 0.14 0.25 0.2 0.22 0.14 0.2 0.41 0.56 0.33 0.45
1.0 0.16 0.54 0.83 0.46 0.68 0.15 0.36 0.28 0.24 0.32 0.26 0.21 0.23 0.33 0.38 0.34 0.49 0.27 0.45
1.0 0.5 0.85 0.91 0.77 0.44 0.41 0.41 0.25 0.22 0.26 0.28 0.27 0.25 0.24 0.24 0.31 0.59 0.43 0.41
0.88 0.6 0.67 1.0 0.74 0.43 0.02 0.24 0.19 0.18 0.17 0.33 0.18 0.21 0.19 0.48 0.42 0.44 0.09 0.05
1.0 0.19 0.56 0.59 0.68 0.03 0.15 0.13 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.17 0.11 0.73 0.01 0.01
1.0 0.05 0.42 0.36 0.56 0.04 0.01 0.07 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.12 0.1 0.24 0.0 0.0
0.98 0.15 0.43 1.0 0.64 0.57 0.03 0.2 0.1 0.09 0.12 0.18 0.05 0.06 0.09 0.22 0.24 0.31 0.02 0.23
1.0 0.15 0.45 0.81 0.46 0.41 0.04 0.24 0.13 0.1 0.07 0.18 0.17 0.2 0.07 0.25 0.36 0.52 0.08 0.24
1.0 0.2 0.39 0.69 0.37 0.42 0.04 0.24 0.08 0.06 0.09 0.14 0.11 0.1 0.09 0.19 0.29 0.53 0.19 0.2
0.74 1.0 0.83 0.5 0.39 0.31 0.41 0.2 0.09 0.09 0.18 0.29 0.15 0.19 0.16 0.15 0.15 0.27 0.25 0.23
0.87 0.42 1.0 0.56 0.44 0.71 0.27 0.2 0.1 0.1 0.11 0.12 0.05 0.05 0.13 0.14 0.17 0.48 0.28 0.37
1.0 0.25 0.52 0.64 0.5 0.48 0.28 0.4 0.25 0.25 0.31 0.24 0.33 0.29 0.29 0.29 0.46 0.5 0.23 0.26
0.96 0.44 0.63 1.0 0.71 0.63 0.52 0.36 0.17 0.16 0.18 0.2 0.25 0.23 0.19 0.18 0.25 0.52 0.44 0.24
1.0 0.41 0.61 0.69 0.72 0.42 0.25 0.29 0.15 0.14 0.11 0.2 0.16 0.14 0.13 0.11 0.15 0.62 0.38 0.33
0.96 0.53 0.9 1.0 0.56 0.45 0.14 0.32 0.14 0.16 0.16 0.3 0.21 0.2 0.16 0.21 0.38 0.42 0.2 0.27
1.0 0.2 0.57 0.96 0.51 0.54 0.16 0.24 0.05 0.05 0.07 0.15 0.11 0.11 0.06 0.06 0.13 0.53 0.27 0.21
0.35 0.7 1.0 0.26 0.81 0.58 0.3 0.25 0.06 0.01 0.08 0.02 0.01 0.04 0.02 0.0 0.14 0.59 0.24 0.46
0.91 0.49 1.0 0.75 0.66 0.6 0.2 0.34 0.14 0.13 0.11 0.18 0.25 0.26 0.13 0.2 0.21 0.61 0.33 0.25
0.75 0.17 0.64 1.0 0.92 0.4 0.21 0.44 0.13 0.15 0.27 0.29 0.12 0.16 0.25 0.21 0.51 0.9 0.42 0.94
1.0 0.25 0.81 0.73 0.66 0.15 0.07 0.13 0.02 0.02 0.04 0.06 0.06 0.06 0.04 0.03 0.05 0.29 0.22 0.13
0.88 0.31 0.83 0.99 0.79 1.0 0.13 0.43 0.12 0.14 0.31 0.27 0.22 0.23 0.26 0.13 0.3 0.87 0.41 0.45
1.0 0.52 0.86 0.95 0.35 0.56 0.14 0.36 0.1 0.08 0.17 0.37 0.28 0.33 0.14 0.28 0.32 0.48 0.35 0.2
1.0 0.51 0.94 0.22 0.75 0.02 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.46 0.03 0.06
1.0 0.29 0.72 0.35 0.44 0.08 0.16 0.09 0.08 0.06 0.14 0.04 0.01 0.02 0.12 0.24 0.21 0.2 0.15 0.13
1.0 0.18 0.42 0.35 0.5 0.33 0.04 0.09 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.6 0.05 0.12
1.0 0.16 0.38 0.43 0.42 0.43 0.03 0.09 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.61 0.07 0.08
1.0 0.82 0.94 0.72 0.77 0.53 0.54 0.2 0.09 0.09 0.13 0.21 0.09 0.13 0.12 0.13 0.19 0.39 0.31 0.28
0.98 0.32 0.72 1.0 0.49 0.23 0.19 0.21 0.11 0.1 0.09 0.15 0.18 0.19 0.12 0.15 0.18 0.45 0.25 0.25
1.0 0.26 0.48 0.46 0.61 0.32 0.22 0.28 0.19 0.15 0.17 0.21 0.31 0.26 0.16 0.19 0.19 0.46 0.22 0.26
1.0 0.28 0.86 0.96 0.83 0.11 0.07 0.12 0.06 0.06 0.09 0.07 0.04 0.1 0.09 0.07 0.06 0.35 0.19 0.13
1.0 0.42 0.65 0.81 0.63 0.79 0.17 0.39 0.22 0.19 0.27 0.24 0.35 0.34 0.31 0.38 0.33 0.61 0.28 0.37
0.52 0.48 0.63 0.32 1.0 0.41 0.38 0.19 0.09 0.05 0.01 0.02 0.09 0.18 0.04 0.12 0.06 0.72 0.22 0.23
1.0 0.45 0.62 0.65 0.42 0.66 0.1 0.26 0.13 0.11 0.12 0.14 0.21 0.19 0.12 0.09 0.09 0.36 0.16 0.39
1.0 0.37 0.85 0.95 0.59 0.36 0.19 0.26 0.13 0.12 0.15 0.19 0.14 0.15 0.13 0.2 0.24 0.47 0.38 0.23
0.81 0.93 1.0 0.42 0.54 0.4 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.54 0.09 0.27
1.0 0.1 0.54 0.15 0.3 0.01 0.1 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.24 0.02 0.02
1.0 0.65 0.83 0.55 0.54 0.27 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.51 0.04 0.44
0.93 0.35 0.98 0.95 0.58 1.0 0.31 0.53 0.3 0.36 0.57 0.62 0.51 0.46 0.63 0.21 0.55 0.91 0.51 0.78
0.73 0.59 1.0 0.74 0.39 0.08 0.14 0.12 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.44 0.15 0.21
1.0 0.38 0.71 0.8 0.69 0.23 0.29 0.27 0.17 0.15 0.13 0.18 0.31 0.33 0.12 0.13 0.13 0.49 0.31 0.36
1.0 0.23 0.52 0.45 0.35 0.19 0.17 0.23 0.13 0.1 0.15 0.26 0.19 0.25 0.15 0.24 0.29 0.24 0.19 0.1
0.9 0.45 1.0 1.0 0.78 0.95 0.29 0.42 0.2 0.19 0.22 0.28 0.21 0.25 0.21 0.29 0.38 0.72 0.37 0.47
0.99 0.28 0.84 1.0 0.46 0.17 0.09 0.21 0.1 0.08 0.07 0.13 0.08 0.09 0.07 0.1 0.1 0.28 0.11 0.11
1.0 0.07 0.23 0.3 0.28 0.06 0.0 0.11 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.02 0.23 0.2 0.22 0.0 0.06
1.0 0.3 0.59 0.82 0.5 0.44 0.27 0.31 0.24 0.22 0.19 0.2 0.23 0.26 0.19 0.2 0.24 0.51 0.38 0.18
1.0 0.02 0.48 0.32 0.31 0.01 0.0 0.11 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.19 0.04 0.34 0.0 0.01
1.0 0.11 0.61 0.4 0.55 0.02 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.03 0.16
1.0 0.32 0.75 0.83 0.54 0.6 0.11 0.2 0.08 0.07 0.1 0.1 0.12 0.15 0.11 0.15 0.2 0.61 0.21 0.43
1.0 0.42 0.65 0.64 0.71 0.52 0.3 0.3 0.25 0.21 0.25 0.19 0.2 0.22 0.24 0.25 0.34 0.59 0.29 0.28
1.0 0.9 0.91 0.92 0.56 0.58 0.29 0.37 0.17 0.16 0.27 0.14 0.37 0.3 0.3 0.21 0.1 0.64 0.51 0.27
1.0 0.44 0.79 0.57 0.52 0.12 0.02 0.09 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.42 0.14 0.29
0.93 0.78 1.0 0.73 0.53 0.42 0.37 0.24 0.11 0.11 0.13 0.1 0.12 0.11 0.13 0.12 0.15 0.51 0.24 0.33
0.94 0.61 0.75 1.0 0.65 0.39 0.27 0.32 0.18 0.17 0.14 0.19 0.34 0.31 0.16 0.12 0.08 0.5 0.49 0.31
1.0 0.23 0.66 0.75 0.44 0.34 0.16 0.26 0.18 0.14 0.18 0.17 0.21 0.22 0.17 0.22 0.24 0.34 0.15 0.17
1.0 0.21 0.73 0.46 0.69 0.07 0.07 0.08 0.07 0.09 0.03 0.05 0.01 0.03 0.03 0.04 0.05 0.22 0.12 0.26
0.94 0.21 0.6 1.0 0.56 0.46 0.13 0.3 0.12 0.11 0.17 0.21 0.07 0.07 0.16 0.13 0.28 0.57 0.31 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)