Heatmap: Cluster_241 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.94 0.77 0.99 0.67 0.46 0.4 0.67 0.62 0.57 0.96 0.52 0.53 0.52 0.88 0.78 0.77 0.46 0.65 0.34
0.69 1.0 0.62 0.77 0.54 0.27 1.0 0.4 0.85 0.68 0.88 0.35 0.3 0.31 0.94 0.77 0.35 0.5 0.54 0.74
0.54 0.31 0.44 0.48 0.52 0.19 0.72 0.55 0.66 0.6 1.0 0.34 0.6 0.52 0.9 0.87 0.61 0.33 0.55 0.3
0.53 0.83 0.45 0.52 0.71 0.5 0.85 0.46 0.51 0.48 0.59 0.25 0.6 0.53 0.6 0.46 0.33 0.59 1.0 0.67
0.89 0.94 0.8 0.94 0.87 0.39 0.72 0.71 0.72 0.66 0.96 0.48 0.76 0.64 0.89 1.0 0.87 1.0 0.73 0.63
0.84 0.69 0.65 0.78 1.0 0.31 0.92 0.6 0.54 0.52 0.66 0.31 0.67 0.54 0.56 0.71 0.45 0.72 0.79 0.53
0.48 0.37 0.32 0.41 0.56 0.41 1.0 0.58 0.61 0.57 0.84 0.44 0.6 0.57 0.91 0.6 0.42 0.49 0.56 0.52
0.66 0.33 0.32 0.34 0.32 0.08 0.67 0.39 0.59 0.54 0.82 0.21 0.24 0.26 0.84 1.0 0.5 0.19 0.5 0.25
1.0 0.37 0.53 0.76 0.57 0.02 0.5 0.33 0.42 0.37 0.55 0.25 0.15 0.15 0.56 0.45 0.3 0.25 0.46 0.21
0.14 0.17 0.15 0.09 0.16 0.16 0.46 0.15 0.26 0.27 0.9 0.11 0.1 0.11 1.0 0.2 0.26 0.19 0.3 0.62
0.62 0.61 0.44 0.45 0.55 0.07 0.89 0.32 0.59 0.58 0.91 0.23 0.06 0.08 1.0 0.78 0.25 0.45 0.88 0.29
0.57 1.0 0.45 0.54 0.64 0.38 0.93 0.66 0.69 0.61 0.77 0.37 0.99 0.68 0.85 0.8 0.45 0.64 0.56 0.6
0.54 0.59 0.43 0.54 0.56 0.22 0.8 0.38 0.31 0.29 0.74 0.26 0.16 0.12 0.72 0.24 0.31 0.55 1.0 0.49
0.55 0.28 0.3 0.29 0.36 0.04 0.38 0.27 0.58 0.58 0.62 0.15 0.12 0.12 0.58 1.0 0.59 0.24 0.29 0.58
1.0 0.68 0.7 0.61 0.54 0.12 0.58 0.49 0.59 0.5 0.92 0.32 0.47 0.34 0.84 0.47 0.41 0.38 0.59 0.29
0.74 0.63 0.47 0.65 0.72 0.43 0.59 0.59 0.62 0.6 1.0 0.4 0.53 0.44 0.98 0.78 0.67 0.76 0.83 0.57
0.57 0.56 0.39 0.3 0.51 0.29 0.75 0.37 0.56 0.51 0.93 0.29 0.25 0.19 1.0 0.66 0.36 0.4 0.61 0.61
0.66 0.37 0.37 0.32 0.3 0.03 0.64 0.4 0.67 0.51 0.71 0.2 0.32 0.28 0.72 1.0 0.55 0.26 0.36 0.08
0.72 0.6 0.6 0.54 0.67 0.52 0.43 0.57 0.52 0.54 1.0 0.41 0.49 0.41 0.97 0.48 0.47 0.59 0.62 0.73
0.64 0.28 0.59 0.6 0.6 0.24 0.83 0.51 0.72 0.69 1.0 0.26 0.27 0.27 0.8 0.75 0.38 0.55 0.78 0.47
0.12 0.28 0.15 0.14 0.28 0.53 0.84 0.2 0.28 0.35 0.84 0.13 0.32 0.26 1.0 0.13 0.14 0.36 0.31 0.99
0.53 0.43 0.33 0.38 0.63 0.36 0.88 0.54 0.64 0.61 0.96 0.36 0.48 0.38 1.0 0.62 0.55 0.64 0.79 0.47
1.0 0.77 0.91 0.66 0.36 0.12 0.98 0.36 0.45 0.42 0.79 0.2 0.2 0.16 0.71 0.51 0.46 0.2 0.55 0.26
0.33 0.34 0.42 0.53 0.37 0.2 0.4 0.32 0.33 0.37 1.0 0.24 0.2 0.21 0.92 0.21 0.32 0.34 0.76 0.52
0.71 0.65 0.57 0.41 0.73 0.46 0.78 0.56 0.49 0.51 0.85 0.38 0.64 0.47 0.87 0.33 0.31 0.59 1.0 0.63
0.3 0.8 0.47 0.23 0.38 0.24 0.99 0.38 0.65 0.58 0.9 0.17 0.38 0.32 0.9 0.54 0.38 0.44 0.39 1.0
0.8 0.25 0.56 0.58 0.65 0.16 0.67 0.52 0.66 0.62 1.0 0.27 0.39 0.32 0.82 0.75 0.6 0.46 0.37 0.62
0.32 0.25 0.31 0.32 0.27 0.17 0.42 0.09 0.23 0.2 0.93 0.08 0.03 0.03 1.0 0.17 0.21 0.15 0.26 0.23
0.41 0.45 0.25 0.35 0.32 0.09 0.59 0.3 0.46 0.38 0.96 0.29 0.18 0.21 1.0 0.59 0.25 0.24 0.17 0.07
0.24 0.22 0.16 0.16 0.17 0.16 0.56 0.21 0.3 0.3 0.91 0.14 0.2 0.17 1.0 0.34 0.29 0.21 0.52 0.35
0.44 0.36 0.21 0.1 0.49 0.0 0.8 0.25 0.42 0.39 0.71 0.1 0.27 0.18 0.89 1.0 0.38 0.19 0.68 0.21
0.26 0.26 0.19 0.22 0.23 0.24 0.46 0.24 0.33 0.23 0.8 0.16 0.34 0.25 0.77 0.12 0.08 0.27 0.55 1.0
0.99 0.9 0.71 1.0 0.87 0.28 0.92 0.54 0.51 0.44 0.62 0.33 0.38 0.3 0.67 0.52 0.51 0.71 0.64 0.22
0.2 0.23 0.19 0.19 0.22 0.23 0.43 0.24 0.28 0.26 0.89 0.23 0.26 0.25 1.0 0.23 0.21 0.33 0.39 0.6
1.0 0.9 0.92 0.87 0.99 0.56 0.55 0.92 0.69 0.51 0.87 0.53 0.5 0.42 0.85 0.69 0.43 0.63 0.96 0.74
0.94 0.31 0.38 0.73 0.58 0.09 0.76 0.51 0.67 0.53 1.0 0.32 0.4 0.35 0.89 0.59 0.55 0.4 0.67 0.14
0.69 1.0 0.61 0.53 0.85 0.23 0.91 0.41 0.54 0.51 0.65 0.29 0.39 0.43 0.65 0.53 0.31 0.46 0.65 0.39
0.3 0.24 0.33 0.4 0.45 0.26 0.85 0.45 0.36 0.45 0.95 0.47 0.27 0.39 1.0 0.52 0.44 0.76 0.52 0.31
1.0 0.2 0.52 0.7 0.44 0.07 0.69 0.52 0.68 0.87 0.85 0.3 0.29 0.26 0.64 0.82 0.77 0.3 0.4 0.21
1.0 0.84 0.91 0.85 0.82 0.16 0.78 0.53 0.63 0.82 0.86 0.36 0.39 0.27 0.97 0.6 0.45 0.75 0.73 0.88
0.61 0.6 0.6 0.71 0.56 0.48 0.52 0.63 0.69 0.6 1.0 0.4 0.52 0.51 0.84 0.55 0.61 0.43 1.0 0.31
1.0 0.59 0.74 0.73 0.9 0.15 0.99 0.67 0.71 0.66 0.96 0.36 0.82 0.71 0.71 0.49 0.44 0.73 0.65 0.33
0.74 0.29 0.68 0.44 0.29 0.07 1.0 0.5 0.69 0.71 0.94 0.28 0.49 0.44 0.94 0.62 0.44 0.29 0.7 0.2
0.98 0.86 0.87 0.85 0.86 0.6 0.66 0.68 0.64 0.61 1.0 0.5 0.46 0.44 0.9 0.61 0.63 0.6 0.88 0.71
0.65 0.43 0.5 0.67 0.42 0.1 0.59 0.41 0.55 0.44 0.62 0.17 0.23 0.19 0.59 1.0 0.72 0.27 0.58 0.16
0.48 1.0 0.49 0.76 0.52 0.08 0.86 0.3 0.34 0.31 0.87 0.19 0.15 0.14 0.83 0.46 0.32 0.38 0.65 0.43
0.84 0.4 0.53 0.93 0.65 0.27 0.67 0.73 0.74 0.58 1.0 0.43 0.37 0.32 0.94 0.98 0.97 0.5 0.71 0.39
0.85 0.33 0.55 0.6 0.58 0.06 1.0 0.51 0.67 0.63 0.88 0.23 0.37 0.31 0.78 0.76 0.61 0.28 0.7 0.16
0.63 0.14 0.41 0.44 0.28 0.03 1.0 0.31 0.54 0.5 0.47 0.16 0.23 0.29 0.54 0.62 0.49 0.15 0.26 0.1
0.12 0.12 0.1 0.07 0.11 0.05 0.17 0.08 0.32 0.3 0.89 0.06 0.03 0.05 1.0 0.46 0.6 0.1 0.22 0.47
0.67 0.63 0.4 0.71 0.64 0.25 0.67 0.45 0.68 0.7 0.66 0.29 0.52 0.47 0.73 0.69 0.51 0.69 1.0 0.26
0.79 0.38 0.37 0.69 0.57 0.18 1.0 0.41 0.51 0.47 0.71 0.24 0.33 0.27 0.62 0.6 0.46 0.52 0.57 0.28
0.01 0.01 0.08 0.01 0.01 0.15 0.7 0.15 0.25 0.27 0.84 0.02 0.07 0.04 1.0 0.05 0.09 0.06 0.1 0.42
0.64 0.38 0.57 0.38 0.39 0.11 1.0 0.33 0.38 0.35 0.53 0.14 0.16 0.16 0.66 0.54 0.4 0.2 0.37 0.24
0.45 0.93 0.43 0.4 0.74 0.15 1.0 0.36 0.47 0.45 0.23 0.09 0.8 0.61 0.25 0.35 0.14 0.45 0.55 0.42
1.0 0.42 0.62 0.69 0.6 0.15 0.96 0.46 0.65 0.53 0.74 0.27 0.37 0.34 0.54 0.65 0.46 0.44 0.46 0.22
1.0 0.29 0.38 0.71 0.55 0.1 0.61 0.31 0.54 0.47 0.69 0.18 0.29 0.28 0.64 0.63 0.25 0.32 0.44 0.52
0.94 0.37 0.33 0.86 0.81 0.18 0.7 0.39 0.47 0.49 1.0 0.24 0.15 0.16 0.98 0.61 0.36 0.43 0.86 0.54
0.64 0.2 0.43 0.4 0.48 0.06 0.42 0.49 0.63 0.74 1.0 0.28 0.35 0.32 0.87 0.67 0.6 0.27 0.87 0.47
0.87 0.69 0.58 0.63 0.89 0.87 1.0 0.7 0.59 0.52 0.76 0.46 0.4 0.32 0.8 0.48 0.47 0.86 0.87 0.56
0.58 0.62 0.46 0.66 0.55 0.28 0.47 0.59 0.47 0.41 0.6 0.52 0.32 0.42 0.65 0.67 0.73 0.55 1.0 0.59
0.65 0.45 0.4 0.52 0.68 0.42 0.5 0.58 0.62 0.48 1.0 0.36 0.57 0.55 0.95 0.73 0.45 0.62 0.66 0.62
0.65 0.65 0.33 0.64 0.59 0.34 0.27 0.42 0.62 0.63 1.0 0.28 0.29 0.23 0.94 0.86 0.43 0.33 0.61 0.54
0.5 0.21 0.27 0.47 0.44 0.24 0.54 0.42 0.42 0.45 0.88 0.27 0.5 0.43 1.0 0.37 0.31 0.43 0.48 0.43
0.57 0.23 0.39 0.41 0.37 0.05 0.52 0.36 0.47 0.51 1.0 0.21 0.21 0.18 0.84 0.74 0.56 0.39 0.53 0.24
0.81 0.65 0.55 0.64 0.92 0.47 1.0 0.68 0.72 0.71 1.0 0.38 0.91 0.82 0.98 0.76 0.49 0.85 0.93 0.92
1.0 0.49 0.76 0.66 0.58 0.29 0.47 0.4 0.56 0.5 0.67 0.28 0.49 0.39 0.63 0.6 0.51 0.46 0.46 0.64
1.0 0.43 0.54 0.5 0.48 0.31 0.49 0.45 0.47 0.41 0.59 0.29 0.4 0.37 0.53 0.34 0.26 0.46 0.46 0.25
0.96 0.39 0.67 0.78 0.61 0.05 0.74 0.6 0.62 0.6 1.0 0.31 0.49 0.41 0.85 0.64 0.51 0.35 0.78 0.39
0.39 0.3 0.26 0.42 0.44 0.24 0.29 0.45 0.36 0.35 1.0 0.24 0.36 0.28 0.98 0.37 0.32 0.41 0.66 0.46
0.69 0.26 0.5 0.62 0.53 0.09 0.97 0.5 0.61 0.64 1.0 0.31 0.38 0.36 0.85 0.85 0.55 0.35 0.67 0.25
0.69 0.59 0.61 0.52 0.42 0.06 0.73 0.3 0.5 0.59 1.0 0.22 0.36 0.26 0.96 0.87 0.84 0.29 0.68 0.74
0.42 0.38 0.36 0.44 0.43 0.36 0.53 0.49 0.46 0.43 1.0 0.27 0.47 0.41 0.98 0.38 0.38 0.48 0.68 0.38
0.79 0.92 0.83 0.93 0.88 0.43 1.0 0.49 0.48 0.46 0.51 0.3 0.84 0.76 0.58 0.28 0.26 0.38 0.97 0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)