Heatmap: Cluster_146 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
6.87 13.53 15.11 3.24 0.84 124.73 2.28 1.22 3.98 7.86 0.35 2.11 3.17 11.0 0.46 7.89 2.02 2.59 2.73 1618.6
0.16 1.01 2.64 0.37 3.79 3.46 0.2 2.16 3.01 2.38 0.73 0.27 0.74 1.59 1.04 0.49 3.08 5.19 0.94 88.42
0.05 0.12 0.35 0.09 0.87 0.76 0.0 0.75 1.03 0.72 0.37 0.25 0.5 0.6 0.3 0.14 0.9 0.83 0.3 57.85
0.12 0.49 1.54 0.12 0.67 3.51 0.0 1.22 1.06 1.09 0.56 0.36 0.3 0.88 0.51 0.47 1.71 1.79 0.75 18.48
0.28 1.86 4.4 0.37 4.42 3.85 0.61 4.48 5.31 4.58 2.8 1.3 1.92 4.16 4.62 0.89 8.03 8.72 16.24 130.35
0.01 0.0 0.02 0.1 0.0 0.02 0.02 2.63 3.68 3.6 5.19 1.52 3.47 2.44 4.64 2.09 2.1 0.0 0.23 41.58
0.96 1.53 1.35 1.14 2.47 3.79 0.4 0.84 0.61 0.46 1.5 1.54 0.2 0.17 1.37 0.79 1.03 3.26 1.07 81.06
0.37 0.5 2.13 0.43 1.94 3.14 0.0 2.0 2.16 2.63 1.5 0.45 0.61 1.5 0.89 0.08 2.2 2.03 1.21 40.78
0.04 0.0 0.07 0.11 0.2 0.08 0.21 0.06 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.03 0.15 0.07 0.37 0.06 5.38
0.12 0.0 0.0 0.04 0.0 0.42 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.06 0.01 0.0 0.01 0.05 0.01 0.06 0.01 2.59
0.93 0.3 0.38 0.29 0.32 0.22 2.26 0.15 0.16 0.18 0.03 0.05 0.04 0.07 0.06 0.06 0.3 0.33 0.17 21.54
0.25 5.6 6.17 0.2 0.0 0.31 0.02 0.16 0.18 0.03 0.0 0.07 0.95 0.33 0.0 3.67 2.29 0.8 0.84 226.61
5.52 2.2 3.9 1.96 0.84 0.21 0.01 0.79 0.72 0.87 0.14 1.32 0.16 0.25 0.19 0.24 0.25 2.87 0.52 40.07
0.11 0.49 0.99 0.0 0.88 0.3 0.01 0.48 0.5 0.34 0.14 0.08 0.09 0.25 0.07 0.19 0.61 1.46 0.3 11.7
0.03 0.02 0.0 1.42 0.06 0.03 0.07 0.09 0.5 0.26 2.99 0.04 0.04 0.07 3.1 0.07 0.13 0.08 0.08 21.1
0.05 0.0 0.0 0.32 0.05 0.58 0.39 0.25 0.18 0.14 0.05 0.22 0.09 0.15 0.13 0.18 0.03 0.16 0.09 39.91
0.08 0.07 0.32 0.0 0.68 5.99 0.27 0.52 0.83 0.65 0.15 0.1 0.19 0.4 0.2 0.35 1.4 1.19 0.07 84.31
0.07 0.12 0.55 0.04 1.71 0.45 0.0 0.89 1.36 1.01 0.17 0.11 0.39 0.67 0.19 0.64 1.38 1.76 0.17 76.06
0.05 0.03 0.41 0.04 2.45 1.16 0.0 1.44 1.94 1.61 0.57 0.2 0.3 0.9 0.31 0.88 2.43 3.93 0.26 80.42
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.18 0.2 0.06 0.04 0.25 0.13 0.01 0.15 0.18 0.11 0.01 49.49
0.01 0.17 0.31 0.0 1.09 0.94 0.01 0.51 0.65 0.36 0.15 0.07 0.11 0.28 0.02 0.14 0.54 1.54 0.13 18.34
0.09 0.12 0.42 0.0 0.9 3.48 0.01 1.06 1.31 1.45 1.01 0.36 0.76 1.21 1.05 0.68 1.43 1.49 0.27 194.65
1.51 3.23 1.01 2.03 2.81 82.05 2.58 2.79 3.11 2.83 1.73 2.13 5.66 3.58 1.88 3.68 1.29 2.42 6.2 808.79
0.0 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.24 0.06 0.09 0.02 0.35 0.04 0.02 0.0 0.05 0.25 0.59 0.0 9.06
0.0 0.0 0.1 0.0 0.43 0.0 0.0 0.22 0.21 0.23 0.0 0.06 0.09 0.2 0.0 0.2 0.28 0.58 0.12 14.15
0.13 0.7 2.75 0.35 2.7 2.07 0.0 2.3 2.04 2.54 0.92 0.68 0.66 1.75 1.04 0.49 4.01 3.32 1.01 26.13
0.39 0.37 2.38 0.0 4.0 2.41 13.19 2.72 4.39 2.93 0.89 0.55 1.17 2.35 0.81 0.58 3.66 5.55 1.05 190.09
0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 1.14 0.15 0.11 0.08 0.07 0.06 0.03 0.07 0.08 0.06 0.02 0.06 0.07 0.03 11.76
0.06 0.24 1.12 0.12 2.97 1.61 0.0 1.67 2.15 1.66 0.7 0.1 0.25 0.93 0.61 0.64 2.83 3.81 0.55 20.21
0.01 0.08 0.27 0.06 0.38 0.06 0.0 0.33 0.44 0.31 0.36 0.15 0.25 0.29 0.32 0.3 0.45 0.82 0.13 125.4
0.43 0.15 0.23 0.07 0.13 2.07 1.69 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.44 0.05 22.14
0.13 0.0 0.44 0.0 2.64 0.79 0.05 0.76 1.07 0.68 0.2 0.18 0.54 0.59 0.4 0.67 1.12 1.67 0.14 90.28
0.03 0.03 0.23 0.0 0.94 0.53 0.28 0.58 0.75 0.57 0.11 0.06 0.12 0.35 0.1 0.31 1.21 1.29 0.11 13.26
0.0 0.08 0.02 0.03 0.0 0.03 0.02 0.02 0.1 0.03 0.0 0.01 0.33 0.26 0.0 0.5 0.05 0.07 0.05 46.54
0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.41 0.18 0.19 0.14 0.09 0.26 0.09 0.1 0.13 0.21 0.08 0.04 0.23 0.11 25.27
0.23 0.55 0.4 0.03 0.04 3.3 0.02 0.24 0.06 0.23 0.0 0.07 0.11 0.29 0.0 0.26 0.05 0.6 0.19 50.49
0.04 0.0 0.06 0.06 0.04 0.04 0.33 0.04 0.06 0.07 0.2 0.04 0.03 0.04 0.21 0.13 0.02 0.1 0.06 51.63
0.27 0.11 0.37 0.33 0.13 0.06 0.08 0.44 0.32 0.19 0.7 0.15 0.17 0.17 0.58 0.31 0.25 1.04 0.05 10.05
0.03 0.41 0.34 0.0 0.46 0.65 0.0 0.98 1.25 1.13 0.99 0.1 0.27 0.45 0.75 0.0 0.44 0.51 0.2 21.57
0.0 0.18 0.86 0.0 0.26 0.0 0.0 0.22 0.23 0.31 0.38 0.1 0.13 0.29 0.08 0.0 0.31 0.08 0.08 21.56
0.0 0.0 0.02 0.0 0.28 0.1 0.0 0.28 0.32 0.32 0.14 0.03 0.14 0.11 0.07 0.11 0.61 0.22 0.1 50.01
0.0 0.0 0.11 0.0 0.32 0.17 0.0 0.27 0.28 0.24 0.04 0.02 0.08 0.08 0.04 0.11 0.39 0.45 0.06 10.09
0.0 0.0 0.05 0.0 0.2 0.05 0.0 0.26 0.41 0.37 0.09 0.02 0.06 0.1 0.08 0.0 0.3 0.26 0.08 17.96
0.16 0.15 0.67 0.0 1.56 0.78 0.04 1.19 1.02 0.67 0.9 0.22 0.68 0.88 0.59 0.29 1.08 1.67 0.24 63.51
0.29 0.44 1.59 0.39 4.42 2.0 0.12 3.73 5.65 3.95 2.93 1.1 1.81 2.81 2.74 3.15 4.79 3.12 1.64 374.8
0.2 1.86 2.13 0.0 2.8 2.42 0.07 2.69 3.25 3.49 1.57 0.37 1.01 1.62 1.88 0.78 3.64 2.79 1.44 90.34
0.2 0.52 1.69 0.0 3.78 2.33 0.07 3.37 4.39 3.18 1.19 0.39 0.64 2.09 2.79 0.41 4.41 4.78 1.17 83.44
0.07 0.44 0.68 0.16 2.14 1.74 0.0 3.32 2.8 3.64 2.8 0.43 1.0 2.15 2.31 1.95 2.71 2.66 0.82 96.16
0.23 0.0 1.92 0.16 2.42 2.33 0.02 2.55 3.02 2.21 1.85 0.39 1.1 0.62 1.44 0.22 1.08 2.24 0.69 66.46
0.14 0.36 1.26 0.11 2.69 17.35 0.02 1.48 1.73 1.4 0.42 0.19 0.34 0.67 0.54 0.91 2.22 3.4 0.44 120.34
0.11 0.39 1.61 0.05 1.68 0.75 0.0 1.1 1.24 1.36 0.23 0.14 0.29 0.84 0.41 0.35 1.84 2.47 0.42 62.17
1.73 0.02 0.62 1.67 0.56 0.23 0.02 0.18 0.21 0.14 0.14 0.04 0.09 0.17 0.03 0.07 0.24 0.58 0.02 33.37

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)