Heatmap: Cluster_267 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00066	0.88	0.77	0.8	1.0	0.87	0.09	0.17	0.47	0.4	0.36	0.33	0.41	0.44	0.32	0.37	0.36	0.34	0.45	0.55	0.28
Gb_00454	0.74	0.62	0.77	1.0	0.74	0.33	0.47	0.45	0.34	0.33	0.34	0.28	0.48	0.47	0.31	0.27	0.34	0.45	0.44	0.35
Gb_01207	1.0	0.59	0.7	0.77	0.94	0.72	0.51	0.67	0.47	0.45	0.61	0.45	0.61	0.44	0.59	0.32	0.37	0.73	0.77	0.93
Gb_01508	0.88	0.77	0.8	1.0	0.87	0.09	0.17	0.47	0.4	0.36	0.33	0.41	0.44	0.32	0.37	0.36	0.34	0.45	0.55	0.28
Gb_02054	0.8	0.65	0.82	1.0	0.65	0.43	0.23	0.3	0.17	0.16	0.05	0.15	0.25	0.19	0.06	0.08	0.05	0.5	0.43	0.38
Gb_02056	1.0	0.58	0.66	0.72	0.82	0.49	0.3	0.53	0.21	0.21	0.24	0.18	0.52	0.39	0.27	0.1	0.09	0.62	0.47	0.53
Gb_02739	0.77	0.72	0.46	0.91	0.63	0.29	0.31	0.51	0.34	0.42	0.71	0.38	0.75	0.61	0.61	0.45	0.27	0.68	1.0	0.46
Gb_02829	0.69	0.35	0.55	0.63	0.77	0.21	0.36	0.42	0.32	0.31	0.68	0.32	0.35	0.35	0.7	0.4	0.29	0.45	0.61	1.0
Gb_02983	1.0	0.46	0.63	0.66	0.58	0.38	0.41	0.46	0.42	0.42	0.66	0.27	0.5	0.38	0.61	0.41	0.33	0.63	0.84	0.48
Gb_03243	0.78	0.56	0.54	0.71	0.66	0.36	0.36	0.51	0.38	0.36	0.53	0.37	0.55	0.46	0.59	0.29	0.26	0.34	0.3	1.0
Gb_03617	1.0	0.55	0.88	0.86	0.7	0.65	0.43	0.53	0.41	0.36	0.61	0.33	0.26	0.29	0.58	0.4	0.41	0.52	0.71	0.59
Gb_04525	0.7	0.67	0.47	0.54	0.64	0.34	0.35	0.48	0.42	0.37	1.0	0.32	0.26	0.19	0.93	0.49	0.42	0.5	0.7	0.55
Gb_04671	1.0	0.57	0.62	0.61	0.72	0.34	0.44	0.51	0.41	0.39	0.67	0.29	0.41	0.33	0.63	0.39	0.27	0.61	0.57	0.74
Gb_05266	0.92	0.69	0.85	1.0	0.81	0.5	0.38	0.62	0.34	0.32	0.34	0.37	0.49	0.43	0.35	0.29	0.42	0.57	0.83	0.32
Gb_05520	1.0	0.83	0.77	0.77	0.73	0.59	0.62	0.72	0.54	0.5	0.73	0.46	0.6	0.49	0.68	0.44	0.51	0.82	0.68	0.89
Gb_05687	0.9	0.75	0.62	0.56	0.86	0.54	0.34	0.68	0.64	0.63	1.0	0.45	0.57	0.46	1.0	0.55	0.47	0.72	0.85	0.98
Gb_05925	1.0	0.57	0.67	0.8	0.73	0.57	0.29	0.52	0.46	0.4	0.62	0.33	0.36	0.27	0.62	0.4	0.3	0.6	0.63	0.42
Gb_06138	1.0	0.72	0.58	0.89	0.89	0.39	0.29	0.56	0.34	0.32	0.56	0.34	0.56	0.52	0.59	0.27	0.35	0.78	0.75	0.48
Gb_06731	0.85	0.6	0.58	0.55	0.98	0.43	0.53	0.6	0.63	0.68	0.75	0.28	0.72	0.49	0.63	0.56	0.54	0.79	0.43	1.0
Gb_06732	1.0	0.91	0.62	0.71	0.9	0.47	0.39	0.61	0.5	0.42	0.56	0.29	0.41	0.33	0.53	0.53	0.28	0.71	0.53	0.73
Gb_06866	1.0	0.49	0.62	0.74	0.78	0.42	0.35	0.49	0.47	0.45	0.82	0.36	0.38	0.32	0.82	0.49	0.41	0.66	0.68	0.58
Gb_07736	0.91	0.86	0.79	1.0	0.76	0.38	0.6	0.71	0.47	0.41	0.82	0.41	0.84	0.73	0.76	0.34	0.33	0.55	0.87	0.36
Gb_08367	1.0	0.43	0.72	0.9	0.98	0.37	0.36	0.59	0.41	0.39	0.34	0.33	0.64	0.44	0.35	0.27	0.27	0.96	0.68	0.44
Gb_08836	1.0	0.58	0.67	0.67	0.75	0.46	0.49	0.48	0.55	0.51	0.92	0.36	0.35	0.33	0.87	0.52	0.46	0.61	0.83	0.74
Gb_09261	0.61	0.61	0.76	1.0	0.82	0.59	0.28	0.44	0.23	0.2	0.26	0.26	0.42	0.4	0.27	0.21	0.22	0.49	0.44	0.58
Gb_09562	0.94	0.63	0.85	0.89	0.84	0.41	0.79	0.59	0.57	0.58	1.0	0.45	0.51	0.48	0.91	0.67	0.74	0.6	0.79	0.74
Gb_09606	1.0	0.41	0.65	0.61	0.63	0.46	0.52	0.42	0.38	0.35	0.45	0.2	0.35	0.33	0.4	0.46	0.3	0.38	0.31	0.37
Gb_09607	1.0	0.42	0.63	0.99	0.69	0.48	0.47	0.43	0.38	0.31	0.56	0.22	0.22	0.19	0.49	0.46	0.26	0.43	0.39	0.45
Gb_09613	0.82	0.54	0.54	0.8	1.0	0.49	0.61	0.46	0.37	0.32	0.42	0.29	0.22	0.27	0.42	0.39	0.37	0.77	0.74	0.35
Gb_10311	0.91	1.0	1.0	0.74	0.83	0.57	0.5	0.53	0.48	0.48	0.77	0.44	0.6	0.6	0.63	0.51	0.52	0.72	0.5	0.62
Gb_10388	0.77	0.95	1.0	0.5	0.67	0.06	0.13	0.23	0.48	0.41	0.34	0.28	0.29	0.34	0.33	0.34	0.32	0.28	0.57	0.62
Gb_10835	0.73	0.54	0.72	0.71	1.0	0.94	0.59	0.49	0.24	0.21	0.27	0.37	0.37	0.38	0.29	0.2	0.29	0.84	0.59	0.67
Gb_11763	1.0	0.3	0.56	0.63	0.52	0.35	0.31	0.46	0.4	0.37	0.55	0.16	0.37	0.29	0.53	0.37	0.4	0.48	0.55	0.46
Gb_12440	0.63	0.61	0.61	1.0	0.64	0.38	0.56	0.65	0.48	0.41	0.69	0.36	0.64	0.53	0.72	0.52	0.45	0.56	0.91	0.41
Gb_12481	0.9	0.55	0.49	0.71	1.0	0.33	0.36	0.6	0.63	0.48	0.69	0.26	0.45	0.37	0.72	0.64	0.33	0.59	0.36	1.0
Gb_13259	0.94	0.71	0.61	0.79	0.79	0.79	0.59	0.73	0.56	0.5	0.87	0.46	0.7	0.64	0.85	0.51	0.39	0.9	0.82	1.0
Gb_13680	0.94	1.0	0.57	0.82	0.92	0.54	0.56	0.58	0.52	0.49	0.74	0.33	0.77	0.6	0.77	0.39	0.28	0.74	0.89	0.46
Gb_13811	1.0	0.72	0.88	0.87	0.93	0.44	0.49	0.49	0.32	0.28	0.38	0.33	0.59	0.54	0.37	0.24	0.24	0.67	0.61	0.48
Gb_14151	1.0	0.63	0.95	0.67	0.88	0.4	0.48	0.71	0.62	0.55	0.97	0.48	0.61	0.51	0.95	0.46	0.45	0.63	0.87	0.63
Gb_14269	0.75	0.54	0.33	0.73	0.86	0.37	0.54	0.38	0.42	0.51	0.86	0.22	0.34	0.3	0.75	0.44	0.34	0.69	0.75	1.0
Gb_14461	0.7	0.61	0.72	1.0	0.87	0.35	0.38	0.59	0.41	0.42	0.81	0.49	0.63	0.6	0.76	0.43	0.48	0.83	0.82	0.58
Gb_14863	1.0	0.55	0.67	0.75	0.67	0.38	0.49	0.57	0.46	0.46	0.75	0.28	0.67	0.52	0.78	0.35	0.3	0.54	0.55	0.59
Gb_16319	1.0	0.57	0.6	0.78	0.92	0.47	0.28	0.47	0.31	0.3	0.57	0.26	0.48	0.34	0.58	0.33	0.3	0.51	0.63	0.23
Gb_16335	0.96	0.9	0.83	0.82	1.0	0.23	0.62	0.52	0.3	0.31	0.54	0.39	0.59	0.69	0.52	0.36	0.27	0.58	0.56	0.36
Gb_16626	1.0	0.56	0.71	0.96	0.97	0.58	0.42	0.64	0.47	0.47	0.75	0.4	0.53	0.4	0.76	0.4	0.39	0.94	0.75	0.48
Gb_17875	1.0	0.99	1.0	0.86	0.82	0.47	0.58	0.58	0.52	0.44	0.86	0.56	0.59	0.57	0.83	0.41	0.45	0.57	0.84	0.54
Gb_18054	1.0	0.63	0.44	0.5	0.71	0.29	0.57	0.37	0.31	0.29	0.38	0.08	0.23	0.17	0.4	0.19	0.08	0.4	0.31	0.39
Gb_18738	0.89	0.6	0.57	0.6	0.81	0.3	0.54	0.42	0.43	0.4	0.81	0.33	0.42	0.39	0.77	0.4	0.26	0.58	0.56	1.0
Gb_18894	0.89	0.68	0.56	0.89	0.84	0.53	0.62	0.74	0.45	0.43	0.69	0.48	0.65	0.57	0.7	0.37	0.5	0.59	1.0	0.73
Gb_20287	1.0	0.65	0.81	0.79	0.72	0.19	0.23	0.46	0.43	0.41	0.76	0.28	0.22	0.18	0.76	0.38	0.28	0.36	0.8	0.47
Gb_20470	1.0	0.52	0.66	0.79	0.87	0.58	0.52	0.63	0.4	0.34	0.48	0.45	0.46	0.39	0.52	0.36	0.26	0.89	0.6	0.77
Gb_20784	1.0	0.71	0.57	0.68	0.74	0.52	0.55	0.64	0.49	0.52	0.56	0.28	0.46	0.35	0.54	0.48	0.34	0.79	0.58	0.57
Gb_21021	1.0	0.47	0.74	0.95	0.71	0.36	0.43	0.49	0.35	0.29	0.5	0.29	0.28	0.23	0.46	0.45	0.34	0.46	0.66	0.42
Gb_21433	1.0	0.47	0.64	0.82	0.91	0.48	0.31	0.56	0.42	0.39	0.7	0.36	0.37	0.36	0.66	0.46	0.5	0.7	0.8	0.61
Gb_21446	0.77	0.52	0.63	1.0	0.96	0.45	0.38	0.59	0.43	0.41	0.61	0.48	0.36	0.25	0.66	0.44	0.36	0.77	0.79	0.32
Gb_22388	1.0	0.46	0.74	0.85	0.73	0.31	0.34	0.53	0.41	0.4	0.65	0.28	0.6	0.43	0.59	0.31	0.29	0.56	0.55	0.38
Gb_22666	0.65	0.65	0.69	0.97	1.0	0.53	0.25	0.58	0.38	0.37	0.4	0.5	0.46	0.47	0.4	0.36	0.45	0.79	0.88	0.36
Gb_23629	1.0	0.51	0.76	1.0	0.86	0.5	0.63	0.64	0.51	0.51	0.69	0.41	0.56	0.48	0.65	0.52	0.44	0.61	0.53	0.43
Gb_24061	0.96	1.0	0.96	0.66	0.99	0.66	0.53	0.66	0.48	0.48	0.68	0.42	0.68	0.56	0.69	0.49	0.44	0.66	0.7	0.73
Gb_24869	1.0	0.78	0.86	0.67	0.89	0.44	0.47	0.56	0.49	0.47	0.9	0.43	0.32	0.3	0.87	0.56	0.49	0.62	0.71	0.54
Gb_25333	0.86	1.0	0.54	0.45	0.78	0.35	0.59	0.35	0.33	0.32	0.15	0.14	0.14	0.12	0.29	0.31	0.12	0.38	0.36	0.32
Gb_25334	0.79	0.56	0.31	0.33	0.69	0.21	0.5	0.47	0.48	0.44	0.59	0.09	1.0	0.64	0.64	0.25	0.15	0.31	0.16	0.63
Gb_27067	1.0	0.35	0.72	0.79	0.75	0.36	0.23	0.46	0.36	0.36	0.48	0.32	0.33	0.25	0.49	0.34	0.33	0.52	0.63	0.34
Gb_27459	1.0	0.67	0.57	0.73	0.63	0.41	0.35	0.44	0.3	0.33	0.67	0.21	0.31	0.25	0.66	0.42	0.33	0.41	0.56	0.48
Gb_27824	1.0	0.41	0.46	0.74	0.79	0.31	0.46	0.48	0.45	0.45	0.56	0.37	0.21	0.17	0.56	0.35	0.32	0.61	0.67	0.39
Gb_28061	1.0	0.78	0.8	0.69	0.91	0.55	0.49	0.75	0.55	0.55	0.63	0.38	0.54	0.37	0.64	0.43	0.32	0.81	0.62	0.53
Gb_28072	1.0	0.68	0.72	0.72	0.76	0.26	0.23	0.43	0.42	0.37	0.52	0.32	0.33	0.3	0.49	0.46	0.33	0.59	0.57	0.44
Gb_28580	1.0	0.63	0.74	0.94	0.88	0.36	0.54	0.73	0.57	0.59	0.99	0.65	0.87	0.8	0.86	0.57	0.59	0.62	0.72	0.69
Gb_29897	0.98	0.94	1.0	0.47	0.66	0.07	0.16	0.21	0.33	0.29	0.13	0.16	0.2	0.2	0.15	0.24	0.13	0.57	0.43	0.5
Gb_30106	0.88	0.26	0.44	0.77	0.86	0.33	0.44	0.63	0.39	0.4	1.0	0.29	0.73	0.64	0.91	0.53	0.39	0.67	0.73	0.91
Gb_30239	0.95	0.95	1.0	0.79	0.68	0.01	0.03	0.34	0.4	0.41	0.55	0.23	0.4	0.32	0.48	0.29	0.23	0.31	0.47	0.24
Gb_30592	0.98	0.9	0.99	0.95	0.94	0.55	0.82	0.74	0.63	0.57	0.85	0.51	0.6	0.53	0.89	0.49	0.51	0.76	1.0	0.62
Gb_30850	0.99	0.73	0.84	1.0	0.79	0.67	0.43	0.52	0.39	0.36	0.62	0.35	0.52	0.4	0.66	0.3	0.35	0.52	0.5	0.55
Gb_31063	0.94	0.64	0.78	1.0	0.64	0.44	0.6	0.55	0.42	0.4	0.57	0.41	0.64	0.61	0.49	0.37	0.35	0.47	0.35	0.44
Gb_31202	1.0	0.95	0.76	0.91	0.76	0.33	0.41	0.54	0.5	0.45	0.76	0.5	0.38	0.33	0.74	0.45	0.58	0.59	0.67	0.64
Gb_32940	0.8	0.58	0.65	0.76	0.78	0.35	0.55	0.66	0.59	0.56	1.0	0.56	0.72	0.62	1.0	0.37	0.44	0.72	0.87	0.9
Gb_34306	1.0	0.34	0.52	0.75	0.77	0.52	0.27	0.5	0.31	0.27	0.6	0.3	0.35	0.3	0.51	0.4	0.33	0.63	0.48	0.39
Gb_34757	1.0	0.47	0.54	0.63	0.88	0.37	0.3	0.52	0.44	0.43	0.45	0.27	0.62	0.48	0.48	0.31	0.3	0.78	0.63	0.34
Gb_35291	0.92	0.86	0.68	0.64	0.84	0.19	0.36	0.62	0.64	0.63	0.93	0.33	0.44	0.39	1.0	0.54	0.44	0.65	0.73	0.73
Gb_35816	1.0	0.67	0.8	0.79	0.84	0.41	0.54	0.7	0.56	0.52	0.73	0.48	0.81	0.62	0.68	0.49	0.34	0.62	0.68	0.62
Gb_36297	0.55	1.0	0.81	0.6	0.72	0.28	0.31	0.4	0.22	0.26	0.31	0.26	0.45	0.4	0.32	0.17	0.24	0.62	0.41	0.34
Gb_36810	0.94	0.74	0.94	0.88	0.96	0.59	0.67	0.7	0.52	0.48	1.0	0.46	0.59	0.54	0.94	0.44	0.53	0.62	0.83	0.63
Gb_36981	1.0	0.21	0.29	0.25	0.17	0.14	0.02	0.06	0.03	0.04	0.02	0.11	0.0	0.01	0.01	0.07	0.06	0.17	0.27	0.3
Gb_37342	0.92	0.68	0.48	0.75	0.59	0.27	0.27	0.44	0.51	0.48	1.0	0.33	0.47	0.41	0.89	0.72	0.47	0.47	0.86	0.39
Gb_37568	1.0	0.67	0.74	0.72	0.98	0.35	0.31	0.66	0.58	0.58	0.92	0.41	0.54	0.42	0.94	0.55	0.56	0.68	0.81	0.96
Gb_37906	0.78	0.6	0.76	0.89	1.0	0.43	0.44	0.55	0.35	0.33	0.41	0.28	0.39	0.35	0.44	0.3	0.39	0.59	0.65	0.39
Gb_38284	1.0	0.48	0.59	0.73	0.74	0.33	0.4	0.54	0.32	0.3	0.47	0.29	0.49	0.37	0.47	0.28	0.28	0.61	0.63	0.68
Gb_39082	0.79	0.43	0.52	0.74	0.77	0.54	0.54	0.69	0.52	0.53	1.0	0.43	0.41	0.31	0.96	0.43	0.45	0.67	0.65	0.46
Gb_39306	0.95	0.61	0.78	0.93	0.97	0.45	0.34	0.52	0.37	0.37	0.68	0.4	0.39	0.38	0.73	0.38	0.47	1.0	0.85	0.65
Gb_39654	0.63	0.95	0.57	0.74	1.0	0.53	0.74	0.45	0.18	0.19	0.22	0.18	0.32	0.27	0.26	0.16	0.18	0.54	0.59	0.11
Gb_40570	1.0	0.51	0.66	0.73	0.83	0.43	0.5	0.58	0.49	0.46	0.89	0.41	0.4	0.43	0.73	0.62	0.63	0.77	0.83	0.62
Gb_40801	1.0	0.67	0.84	0.59	0.66	0.56	0.24	0.41	0.26	0.24	0.38	0.22	0.29	0.25	0.3	0.22	0.27	0.47	0.52	0.39
Gb_41077	0.96	0.59	0.77	1.0	0.77	0.39	0.41	0.5	0.42	0.4	0.7	0.31	0.52	0.51	0.66	0.42	0.44	0.53	0.82	0.46
Gb_41160	0.95	0.96	1.0	0.62	0.94	0.4	0.33	0.55	0.34	0.34	0.58	0.42	0.29	0.28	0.5	0.49	0.46	0.66	0.45	0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)