Heatmap: Cluster_258 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.44 0.46 0.41 0.4 0.44 0.34 0.45 0.26 0.18 0.18 0.25 0.2 0.25 0.24 0.26 0.21 0.21 0.41 1.0 0.35
0.25 0.28 0.21 0.31 0.47 0.45 0.37 0.33 0.25 0.27 0.42 0.26 0.27 0.28 0.45 0.25 0.32 0.82 1.0 0.69
0.22 0.25 0.22 0.32 0.46 0.56 0.41 0.25 0.13 0.14 0.18 0.19 0.1 0.1 0.21 0.13 0.16 0.62 1.0 0.5
0.32 0.34 0.24 0.46 0.6 0.17 0.37 0.29 0.22 0.2 0.3 0.22 0.31 0.32 0.32 0.28 0.22 0.86 1.0 0.61
0.25 0.28 0.22 0.29 0.42 0.1 0.2 0.08 0.06 0.06 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.19 0.12 0.27 1.0 0.06
0.4 0.69 0.42 0.36 0.58 0.25 0.76 0.14 0.07 0.07 0.07 0.06 0.05 0.04 0.08 0.13 0.08 0.8 1.0 0.63
0.43 0.36 0.31 0.48 0.59 0.33 1.0 0.15 0.09 0.08 0.18 0.09 0.07 0.07 0.11 0.32 0.06 0.68 0.78 0.78
0.6 0.39 0.53 0.29 0.71 0.32 0.41 0.25 0.21 0.2 0.26 0.17 0.16 0.14 0.25 0.19 0.18 0.47 1.0 0.58
0.71 0.4 0.61 0.38 1.0 0.42 0.54 0.37 0.29 0.25 0.48 0.22 0.35 0.42 0.43 0.3 0.28 0.57 0.82 0.86
0.2 0.38 0.21 0.28 0.43 0.06 0.23 0.17 0.05 0.05 0.06 0.11 0.03 0.04 0.07 0.07 0.04 0.81 1.0 0.41
0.41 0.51 0.56 0.56 0.62 0.45 0.34 0.31 0.25 0.25 0.35 0.25 0.21 0.25 0.34 0.29 0.36 0.61 1.0 0.64
0.23 0.15 0.12 0.22 0.27 0.14 0.33 0.11 0.04 0.04 0.09 0.08 0.03 0.04 0.14 0.1 0.09 0.52 1.0 0.55
0.28 0.34 0.2 0.31 0.48 0.06 0.52 0.13 0.06 0.07 0.07 0.06 0.06 0.06 0.08 0.05 0.08 0.45 1.0 0.22
0.51 0.36 0.36 0.6 0.64 0.4 0.58 0.27 0.18 0.14 0.2 0.17 0.2 0.24 0.21 0.17 0.2 0.82 1.0 0.63
0.31 0.39 0.45 0.39 0.44 0.41 0.37 0.37 0.25 0.28 0.34 0.36 0.29 0.27 0.37 0.35 0.27 0.57 1.0 0.54
0.43 0.6 0.25 0.47 0.54 0.55 0.36 0.24 0.17 0.16 0.29 0.14 0.03 0.02 0.31 0.21 0.21 0.61 1.0 0.27
0.38 0.35 0.39 0.44 0.51 0.33 0.41 0.28 0.17 0.17 0.23 0.18 0.16 0.17 0.26 0.23 0.21 0.6 1.0 0.33
0.77 0.3 0.43 1.0 0.63 0.18 0.76 0.25 0.19 0.15 0.23 0.15 0.2 0.21 0.22 0.4 0.38 0.47 0.58 0.27
0.66 0.3 0.35 0.59 0.67 0.24 1.0 0.39 0.26 0.24 0.44 0.24 0.28 0.26 0.42 0.29 0.31 0.95 0.8 0.65
0.2 0.21 0.17 0.21 0.5 0.12 0.27 0.16 0.15 0.13 0.24 0.09 0.18 0.15 0.22 0.18 0.12 0.34 1.0 0.33
0.43 0.5 0.48 0.47 0.55 0.11 0.34 0.18 0.16 0.15 0.23 0.14 0.06 0.07 0.31 0.13 0.06 0.41 1.0 0.48
0.44 0.74 0.51 0.46 0.49 0.54 0.5 0.3 0.17 0.15 0.21 0.2 0.22 0.2 0.21 0.18 0.16 0.53 1.0 0.61
0.49 0.88 0.47 0.49 0.52 0.18 0.19 0.24 0.18 0.17 0.26 0.15 0.21 0.2 0.29 0.27 0.17 0.62 1.0 0.94
0.51 0.32 0.33 0.35 0.44 0.27 0.41 0.23 0.12 0.11 0.18 0.17 0.21 0.21 0.16 0.13 0.16 0.46 1.0 0.28
0.64 0.41 0.39 0.74 0.77 0.31 0.8 0.28 0.2 0.18 0.33 0.21 0.21 0.21 0.36 0.23 0.21 0.72 1.0 0.56
0.47 0.17 0.38 0.46 0.45 0.18 0.33 0.13 0.05 0.06 0.08 0.07 0.06 0.08 0.08 0.04 0.08 0.46 1.0 0.27
0.42 0.56 0.26 0.47 0.78 0.44 0.48 0.23 0.13 0.14 0.22 0.16 0.19 0.17 0.24 0.18 0.17 0.75 1.0 0.65
0.28 0.17 0.24 0.27 0.34 0.07 0.53 0.08 0.04 0.04 0.06 0.05 0.04 0.04 0.07 0.04 0.04 0.41 1.0 0.37
0.42 0.44 0.32 0.43 0.54 0.43 0.32 0.3 0.15 0.14 0.24 0.19 0.18 0.18 0.23 0.16 0.17 0.51 1.0 0.63
0.39 0.32 0.37 0.25 0.43 0.08 0.35 0.11 0.05 0.05 0.04 0.02 0.05 0.05 0.08 0.03 0.03 0.45 1.0 0.62
0.36 0.29 0.3 0.39 0.46 0.42 0.12 0.17 0.05 0.05 0.07 0.12 0.07 0.11 0.11 0.1 0.24 0.64 1.0 0.41
0.46 0.44 0.5 0.44 0.7 0.5 0.19 0.24 0.07 0.07 0.1 0.13 0.11 0.19 0.13 0.11 0.3 0.91 1.0 0.67
0.8 0.42 0.61 0.48 1.0 0.57 0.2 0.22 0.06 0.1 0.07 0.15 0.08 0.19 0.1 0.19 0.41 0.95 0.81 0.78
0.76 0.71 0.5 0.65 0.81 0.39 0.83 0.32 0.23 0.23 0.36 0.23 0.12 0.1 0.35 0.36 0.26 0.73 1.0 0.59
0.55 0.61 0.42 0.39 0.53 0.29 0.32 0.24 0.18 0.16 0.17 0.17 0.18 0.17 0.18 0.33 0.24 0.6 0.94 1.0
0.21 0.44 0.28 0.29 0.55 0.35 0.38 0.23 0.15 0.15 0.18 0.17 0.18 0.19 0.22 0.15 0.13 0.48 1.0 0.32
0.65 0.68 0.65 0.43 0.92 0.53 0.63 0.33 0.27 0.24 0.45 0.3 0.28 0.29 0.39 0.35 0.28 0.58 1.0 0.57
0.54 0.38 0.41 0.38 0.46 0.2 0.34 0.28 0.27 0.26 0.37 0.18 0.16 0.16 0.38 0.26 0.14 0.54 1.0 0.61
0.29 0.46 0.31 0.14 0.64 0.05 0.4 0.11 0.03 0.04 0.04 0.1 0.02 0.03 0.04 0.08 0.08 0.59 1.0 0.96
0.25 0.41 0.28 0.25 0.37 0.2 0.12 0.18 0.1 0.11 0.09 0.09 0.15 0.16 0.13 0.16 0.13 0.42 1.0 0.6
0.26 0.16 0.15 0.29 0.39 0.35 0.32 0.16 0.12 0.11 0.13 0.09 0.09 0.06 0.17 0.08 0.11 0.41 1.0 0.37
0.41 0.44 0.25 0.41 0.41 0.27 0.23 0.27 0.22 0.22 0.29 0.14 0.22 0.2 0.31 0.2 0.16 0.59 1.0 0.36
0.49 0.35 0.48 0.48 0.53 0.29 0.37 0.21 0.11 0.12 0.13 0.13 0.12 0.13 0.16 0.16 0.19 0.58 1.0 0.55
0.35 0.33 0.28 0.38 0.63 0.26 0.24 0.18 0.11 0.12 0.09 0.12 0.08 0.1 0.11 0.25 0.29 0.47 1.0 0.48
0.36 0.33 0.24 0.29 0.58 0.21 0.2 0.18 0.11 0.12 0.11 0.12 0.07 0.05 0.1 0.21 0.27 0.42 1.0 0.46
0.49 0.34 0.41 0.53 0.6 0.57 0.48 0.11 0.07 0.05 0.07 0.06 0.05 0.08 0.08 0.14 0.15 0.48 1.0 0.74
0.31 0.24 0.18 0.31 0.31 0.18 0.34 0.18 0.1 0.11 0.16 0.16 0.13 0.13 0.18 0.19 0.14 0.6 1.0 0.59
0.54 0.43 0.35 0.4 0.45 0.11 0.25 0.17 0.13 0.12 0.26 0.14 0.04 0.04 0.24 0.28 0.17 0.72 1.0 0.5
0.42 0.42 0.45 0.54 0.56 0.15 0.6 0.23 0.12 0.13 0.28 0.16 0.05 0.05 0.29 0.19 0.17 0.58 1.0 0.36
0.42 0.41 0.31 0.33 0.48 0.2 0.29 0.2 0.25 0.23 0.22 0.11 0.21 0.19 0.25 0.2 0.13 0.5 1.0 0.33
0.23 0.19 0.15 0.38 0.46 0.32 0.37 0.2 0.1 0.1 0.16 0.12 0.1 0.1 0.18 0.12 0.18 0.51 1.0 0.35
0.26 0.27 0.22 0.21 0.38 0.28 0.24 0.19 0.12 0.13 0.17 0.16 0.07 0.09 0.19 0.17 0.13 0.4 1.0 0.36
0.66 0.55 0.53 0.55 0.71 0.19 0.51 0.28 0.3 0.25 0.24 0.22 0.13 0.13 0.29 0.43 0.24 0.51 1.0 0.64
0.49 0.27 0.31 0.34 0.34 0.12 0.98 0.15 0.03 0.04 0.11 0.02 0.02 0.02 0.22 0.05 0.07 1.0 0.64 0.62
0.32 0.35 0.24 0.39 0.5 0.31 0.45 0.27 0.23 0.21 0.29 0.22 0.15 0.12 0.33 0.11 0.12 0.6 1.0 0.28
0.13 0.14 0.14 0.13 0.43 0.36 0.13 0.09 0.05 0.07 0.07 0.06 0.04 0.05 0.1 0.07 0.11 0.49 1.0 0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)