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Heatmap: Cluster_270 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-4.82 -4.2 -5.75 -3.31 -2.28 0.91 -3.25 0.06 -0.01 0.43 0.78 0.12 -0.15 0.09 0.49 -0.22 0.56 1.14 0.57 1.01
-0.48 -0.67 -0.8 -0.9 -0.41 0.86 -0.18 0.45 0.05 -0.22 0.4 -0.18 -0.13 -0.3 0.37 0.01 0.13 0.03 0.37 0.27
-1.52 -1.55 -1.71 -0.11 0.9 1.24 -0.87 0.57 -1.65 -0.91 0.17 1.3 -1.18 -1.29 0.15 -2.33 0.8 0.15 -0.35 0.67
-0.45 -0.54 -0.83 -0.35 -0.21 1.2 0.24 0.85 -0.85 -0.9 0.12 -0.03 -0.61 -0.67 0.17 -1.41 -0.69 -0.33 1.04 0.75
-1.5 -0.26 -0.84 -1.16 0.03 0.5 -0.21 0.76 -0.01 0.22 0.49 -0.2 -0.11 -0.23 0.73 -0.49 -0.02 -0.59 0.88 -0.41
-1.67 -0.58 -0.83 -0.4 -1.17 -0.15 -1.88 1.64 -0.48 -0.82 -0.81 0.93 0.56 0.82 -0.27 -0.62 -0.21 -1.56 0.94 0.45
-1.71 -1.59 -1.24 - 0.77 0.18 -3.72 0.36 0.3 0.87 - -0.23 -4.97 - - -0.38 0.8 1.69 0.61 1.82
-2.12 -0.7 -1.35 -1.52 -0.69 0.23 -0.26 0.34 0.34 0.2 0.87 -0.03 -2.35 -2.69 0.95 -1.32 -1.04 0.99 1.34 0.7
-0.74 -0.72 -0.78 -0.93 -0.79 0.28 -0.54 0.55 -0.43 -0.47 0.6 0.43 -0.14 -0.1 0.34 -0.24 -0.66 -0.05 1.15 0.71
-0.18 -0.42 -0.53 -0.42 0.37 0.43 -1.01 0.43 -0.16 -0.29 0.07 0.21 0.06 0.12 0.13 -0.57 -0.16 0.29 0.41 0.24
-0.42 0.33 -0.01 -1.01 0.1 0.51 -1.07 0.56 -0.34 -0.37 0.06 -0.07 -0.12 -0.31 0.28 -0.65 -0.24 0.55 0.5 0.26
-0.33 0.01 -0.26 -0.64 0.18 0.62 -0.61 0.23 -0.18 -0.24 -0.1 -0.12 -0.0 -0.27 0.04 -0.26 0.11 0.32 0.06 0.66
-0.73 -0.33 -0.56 -0.11 -0.19 1.21 -0.14 0.41 -0.35 -0.39 0.53 -0.42 -1.4 -1.46 0.57 -0.23 -0.01 0.36 0.31 0.3
-0.95 -0.99 -1.81 0.15 -0.07 0.87 -0.03 0.15 0.01 0.53 -0.02 0.15 -0.11 -0.81 0.08 -1.05 -0.52 0.83 0.75 -0.02
-3.77 -3.44 -3.07 -3.87 -2.13 1.74 1.29 0.94 -1.1 -0.14 -0.22 0.14 0.13 -0.5 -0.8 -2.71 -1.15 0.45 0.67 1.28
0.2 0.87 -0.14 -0.48 0.26 0.99 0.47 -0.07 -0.15 -0.35 0.12 -0.29 -0.67 -0.87 0.11 -0.35 -0.82 -0.12 0.21 -0.71
-4.11 -6.22 -4.91 -2.68 -1.67 0.12 -4.72 0.74 0.29 -0.48 1.05 -0.28 -0.02 -0.15 1.04 0.3 0.43 1.58 0.69 -0.58
-0.04 -0.7 -1.19 -0.46 0.11 0.88 0.04 0.37 -0.59 -0.73 0.28 -0.24 0.03 -0.12 0.43 -0.07 0.21 -0.29 0.73 -0.3
-0.96 1.25 -0.69 -1.23 0.17 0.41 -0.25 0.4 0.11 0.04 0.32 -0.03 0.28 0.15 0.35 -0.8 -0.77 -0.68 -0.14 -0.27
-1.5 -1.07 -1.85 -1.2 -0.14 0.48 -1.11 0.92 0.24 -0.07 -0.65 0.48 -1.19 -0.96 -1.1 -0.42 0.17 -0.56 1.75 1.2
-1.93 -0.15 -1.61 -0.36 -0.06 0.35 -0.83 0.79 0.06 0.05 0.13 0.0 0.71 0.31 -0.1 -1.29 -1.25 -0.06 1.2 0.18
-3.92 -3.85 -2.9 -1.72 -1.74 0.35 -4.11 0.27 0.31 0.17 0.74 -1.15 0.47 0.22 1.27 -1.35 -0.54 0.11 1.74 0.7
-0.2 -1.27 -0.92 -0.35 -0.61 0.71 -0.14 0.43 0.76 -0.13 1.14 -0.76 -1.14 -1.01 0.82 0.44 0.11 -0.98 -0.02 -0.29
-1.42 -0.72 -1.25 -1.1 -0.15 1.07 -2.8 0.41 0.16 0.32 0.39 0.28 0.34 0.19 0.69 -0.41 0.08 -0.68 -0.05 0.43
-0.32 -0.85 -0.87 -0.81 -0.47 1.51 0.7 0.35 -1.03 -0.61 0.82 0.09 -0.2 -0.51 0.74 -2.5 -0.51 -0.29 -0.15 0.3
-0.63 0.58 -0.8 0.26 0.16 1.1 -0.03 0.16 -0.36 -0.29 -0.13 -0.26 0.03 -0.6 -0.02 -0.91 -0.48 -0.26 0.79 -0.17
-0.95 0.05 -0.61 -0.74 -0.13 -0.24 -0.25 0.23 0.1 0.03 0.02 -0.22 0.16 -0.28 0.18 0.05 0.17 0.09 0.86 0.43
-0.49 -0.04 -0.95 -1.08 0.24 0.38 -0.26 0.44 0.07 -0.29 -0.1 0.01 -0.14 -0.39 -0.18 0.21 0.02 -0.32 1.12 0.19
0.23 -0.78 -0.62 -1.6 -0.7 -0.64 0.55 0.3 -0.59 -0.7 0.91 0.52 -0.34 -0.65 0.76 -0.97 -0.8 0.52 0.92 0.24
-5.37 - -7.48 -1.68 -1.79 -1.89 -4.68 0.22 -0.4 -0.32 0.46 0.36 -0.73 -0.41 0.97 -0.99 -0.73 1.87 1.84 1.01
-1.95 -1.0 -1.9 -1.74 -0.76 -0.48 0.38 0.2 0.13 0.43 0.79 0.41 0.02 -0.34 0.78 -0.35 0.1 0.8 0.11 0.29
-0.76 0.09 0.08 -0.27 -0.36 -0.08 0.35 0.03 -0.07 -0.03 0.12 0.34 -0.04 -0.09 0.03 -0.31 0.13 -0.29 0.45 0.17
-0.57 -0.71 -0.61 -0.68 0.44 -0.95 -1.91 0.35 -0.18 -0.23 -0.4 1.0 0.29 0.5 -0.21 -0.85 0.27 0.53 0.74 0.22
-0.6 -0.19 -0.41 -0.3 0.33 -0.95 -1.64 0.46 -0.29 -0.37 -0.62 0.75 0.1 -0.13 -0.38 -0.84 0.26 0.63 1.2 0.21
0.65 -0.83 -0.44 -1.49 -0.87 1.43 -2.6 0.79 -1.9 -1.94 -0.95 -2.74 -2.17 -2.53 -0.6 -2.49 -3.18 -0.12 0.84 2.68
- - - - 1.47 - - 1.19 - - 1.27 - 0.93 - - - - - 2.57 2.23
0.4 1.12 0.07 -0.38 0.36 0.97 0.56 0.4 -0.76 -0.84 -0.65 -0.92 0.58 0.48 -0.68 -2.79 -1.97 -0.34 0.12 -0.86
-0.71 -1.36 -1.74 -0.61 -0.54 0.62 -1.69 0.36 -0.58 -0.53 0.5 0.18 -0.33 -0.36 0.49 -0.05 0.23 1.0 0.98 0.29
-0.45 0.85 -0.54 -0.65 0.1 0.05 0.42 0.25 -0.54 -0.6 0.36 -0.22 -0.45 -0.84 0.64 -0.91 -0.87 -0.33 1.37 -0.48
0.21 0.03 -0.24 -0.06 -0.4 1.22 -1.24 0.46 -0.39 -0.35 -0.16 -0.44 -0.18 -0.04 -0.12 -1.18 -0.33 -0.86 0.91 0.6
-0.96 -2.82 -1.63 -1.2 -0.83 1.03 1.24 0.68 -1.03 -0.8 0.41 -0.49 -1.18 -1.14 0.37 -1.29 0.04 -0.19 1.78 -0.05
-0.39 -0.99 -0.47 -0.01 -0.86 0.59 0.2 0.07 -0.17 -0.17 0.85 -0.06 -1.04 -0.93 1.16 -0.73 0.26 -0.48 0.68 -0.21
-1.5 -0.43 -1.09 -0.87 -0.61 -0.39 -0.31 0.27 -0.13 -0.2 0.32 -0.3 -0.25 -0.18 0.53 0.19 0.31 0.64 1.01 0.59
-1.59 -1.28 -1.46 -1.01 0.3 0.61 -0.9 0.58 -0.18 -0.33 -0.23 0.17 0.21 0.1 -0.4 -0.17 -0.01 0.69 1.03 0.52
-3.44 - -3.95 -1.36 0.6 1.13 1.37 0.83 -1.12 -1.67 -0.86 -0.87 -0.49 -0.47 -0.52 -2.5 -1.92 -0.29 2.16 0.73
-0.88 0.31 0.15 -0.52 0.21 0.09 -0.56 0.02 -0.25 -0.21 0.16 -0.12 -0.17 -0.19 0.15 -0.16 0.27 0.32 0.59 0.03
-3.18 -2.53 -3.24 -2.31 -1.16 0.04 -1.07 0.28 -0.36 -0.17 0.7 0.44 -0.28 -0.44 0.87 0.31 0.16 0.97 1.3 0.52
-2.49 -1.6 -2.61 -1.97 -0.63 -2.54 -0.03 0.92 0.25 0.05 0.21 0.87 0.15 0.0 0.08 0.75 0.79 -0.57 1.1 -0.35
-3.15 - -8.91 -1.48 0.25 1.48 0.73 0.66 -0.98 -1.57 -1.31 -1.46 0.25 0.52 -0.91 -3.48 -3.28 -1.08 2.54 0.09
-0.56 -0.34 -0.55 -0.5 0.09 0.58 0.56 0.38 -0.27 -0.2 0.59 -0.37 0.29 -0.14 0.57 -1.05 -1.0 -0.32 0.7 -0.31
-0.77 -2.57 -1.37 0.68 0.33 -1.34 -2.17 -0.04 -0.25 0.14 -0.1 0.62 -0.06 0.15 -0.04 -0.5 0.22 1.27 1.09 -0.87
-1.85 -0.68 -1.59 -1.29 -0.37 0.88 -1.39 0.45 -0.3 -0.48 1.17 0.35 -0.45 -0.73 1.2 -0.84 -0.38 0.08 0.88 0.11
0.04 - - - 0.17 - -0.85 1.13 -1.89 - 0.98 - 1.12 -0.39 - - - - 2.87 1.37
-1.9 -0.48 -1.95 -1.14 0.4 1.15 0.49 0.52 -0.02 -0.01 0.72 -0.06 -0.29 -0.59 0.61 -0.98 -1.33 0.12 0.14 0.31
-0.64 -0.31 -0.64 -0.79 -0.05 0.99 -1.3 0.14 -0.14 -0.35 -0.67 -0.4 -0.06 -0.04 -0.35 0.01 -0.19 1.07 0.78 0.44
-0.45 -0.31 -0.46 -1.29 -0.39 1.1 0.58 0.29 -0.14 -0.15 0.51 -0.0 -0.14 -0.61 0.42 -0.8 -0.81 -0.25 0.35 0.38
0.13 0.46 -0.16 -0.13 0.2 -0.15 0.16 -0.03 0.1 -0.31 0.04 -0.18 -0.27 -0.27 0.01 -0.38 0.04 0.1 0.41 -0.14
-1.89 -1.61 -1.84 -1.83 -1.39 2.25 -1.29 1.2 -1.66 -1.76 1.67 -0.35 -0.48 -1.2 1.56 -2.74 -2.89 -2.02 -1.05 0.39
-0.18 0.48 -0.04 0.31 0.09 0.21 0.22 0.18 -0.3 -0.23 0.13 -0.56 -1.08 -1.07 0.17 -0.12 -0.54 0.05 1.27 -1.16
-0.44 -0.56 -0.4 -0.29 0.03 1.41 -1.08 0.57 -0.83 -0.73 0.26 0.09 -0.11 -0.33 0.46 -0.98 -0.14 -0.15 0.45 0.22
-2.21 1.1 -2.44 0.21 1.06 0.13 1.95 0.61 -0.41 0.29 -0.12 -1.02 -0.97 -0.93 -0.02 - - 0.48 -1.04 -1.16
-0.1 -0.57 -0.26 -0.37 0.03 1.13 -2.12 0.28 -0.62 -1.0 0.36 0.01 -1.17 -0.94 0.31 -0.49 -0.25 0.4 1.13 0.5
-0.61 -0.2 -0.63 -0.48 -0.06 1.82 -0.71 0.62 -0.48 -0.41 0.52 -0.33 -0.04 -0.7 0.79 -1.89 -1.35 -0.88 0.37 -0.04
-0.64 0.35 -0.02 -0.3 -0.29 -0.41 -0.17 0.06 -0.34 -0.64 0.43 -0.72 -1.07 -1.04 0.5 0.53 0.11 0.25 0.8 0.66
-2.66 -1.55 -2.55 -1.08 -0.66 0.61 -0.09 0.58 -0.26 -0.17 0.51 0.41 0.41 0.29 0.49 -0.63 -0.08 0.45 0.75 0.26
-5.09 -7.54 -4.3 -4.19 -1.35 1.53 -4.21 0.1 -2.56 -2.05 -0.24 0.91 0.04 0.29 -0.5 -0.66 -1.55 2.14 1.45 0.31
-0.61 -0.42 -0.11 -1.12 -0.39 -1.18 -0.37 0.29 -0.07 0.2 0.8 0.21 0.13 -0.29 0.92 -0.73 -0.07 0.64 -0.04 0.17
-0.56 0.06 -0.75 -0.71 0.07 -0.04 0.3 0.22 0.21 -0.07 0.07 -0.12 0.35 0.3 0.06 -0.39 -0.36 0.34 0.5 -0.35
0.02 -2.22 -0.58 0.54 -0.03 1.96 -0.4 0.45 -2.71 -1.69 -2.25 0.26 0.18 -0.0 -1.12 -2.81 -1.33 0.58 0.68 0.62
-1.34 -0.87 -1.4 -2.11 -0.44 0.62 0.02 0.41 0.15 0.41 0.44 0.17 -0.19 -0.53 0.42 0.36 -0.02 0.52 0.48 -0.13
-1.9 0.09 -1.81 -2.13 -0.83 0.62 -0.29 0.11 0.49 0.29 0.74 -0.4 0.52 0.21 0.77 0.34 -0.3 -0.34 0.35 -0.61
-0.21 -1.52 -1.09 -1.13 -1.08 1.08 0.6 0.21 -0.87 -0.15 1.27 1.03 -0.04 -0.66 0.88 -3.06 0.5 -3.33 -2.73 0.55
-1.49 0.82 -0.09 -2.45 -0.78 0.11 -1.64 0.39 0.11 0.02 0.83 0.18 -1.8 -2.06 0.9 -0.94 -0.9 0.79 0.56 0.85
-3.41 -1.5 -2.54 -2.1 -2.53 -1.59 1.12 0.46 0.19 0.55 -0.46 1.21 -0.37 -0.29 -1.09 -1.51 -0.68 -3.59 1.29 1.95
-0.3 0.33 -0.2 -0.19 0.24 0.47 -0.5 0.01 -0.43 -0.53 0.4 -0.37 0.15 0.05 0.44 -0.07 -0.22 0.29 0.28 -0.7
-1.74 0.19 -1.88 -0.67 -0.62 1.13 0.42 0.19 -0.0 -0.38 0.54 -0.7 -0.42 -0.32 0.73 -0.02 -1.28 0.01 1.04 -0.22
-1.4 -0.29 -1.04 -1.03 0.55 -1.09 -0.07 0.28 0.06 0.17 0.38 0.58 -0.42 -0.3 0.56 -0.7 0.37 -0.04 0.73 0.25
0.44 0.24 -0.05 -0.76 0.79 -0.91 -1.39 0.1 0.07 -0.1 0.25 -0.17 -0.96 -1.32 0.48 -0.97 -0.15 0.68 0.32 0.64
1.25 0.7 1.13 -0.52 -0.13 -0.89 0.7 0.12 -2.35 -2.76 -1.72 -2.38 0.69 -0.2 -1.57 -3.11 -2.14 -1.08 1.54 0.64
-1.64 -1.39 -1.52 -1.28 -0.38 0.94 -0.64 0.63 -0.19 -0.14 0.45 0.22 -0.7 -1.0 0.52 -0.74 -0.13 0.17 0.94 1.17
-0.94 -0.38 -1.07 -0.84 -0.29 0.88 -0.43 0.4 0.05 -0.31 0.51 -0.09 0.4 0.04 0.39 0.14 -0.11 -0.37 0.41 -0.05
-1.14 0.51 0.1 -0.05 0.02 -0.36 0.83 0.05 0.11 -0.12 0.07 -0.34 -0.11 -0.47 0.09 -0.42 -0.91 -0.21 0.54 0.42
-0.01 -1.05 -1.19 -0.83 -0.68 1.9 -0.21 0.57 -1.26 -0.93 -0.22 -1.21 -0.45 -1.09 -0.09 -1.26 -0.7 0.06 0.91 1.32
-0.75 -1.51 -1.07 -0.61 -0.47 0.09 -0.55 0.61 -0.08 -0.14 0.88 0.22 -0.32 -0.59 1.07 -0.78 -0.59 0.29 1.22 -0.51

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.