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Heatmap: Cluster_65 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-2.26 -2.85 -2.62 -2.08 -2.53 -1.89 -5.75 1.09 0.27 0.09 0.81 -0.19 1.6 1.36 0.66 1.26 0.95 -2.11 -5.62 -6.89
-0.71 -1.14 -0.39 0.51 -0.13 -0.79 -2.24 0.42 0.32 -0.05 0.02 0.04 0.27 0.49 -0.16 1.24 1.27 -0.16 -2.8 -2.74
-0.8 -1.92 -1.83 -0.57 -0.5 -1.51 -1.55 0.47 0.9 0.58 0.97 0.14 0.52 0.41 0.9 0.46 0.32 -1.09 -0.57 -0.71
-2.2 -1.8 -1.59 -0.75 -2.07 -1.53 -4.92 0.57 0.9 0.5 0.98 0.39 0.85 0.63 0.91 1.21 0.9 -1.22 -4.9 -5.43
-2.27 -3.06 -2.53 -1.67 -1.42 -2.03 -2.39 0.62 0.67 -0.16 1.23 0.48 1.11 0.88 1.08 1.14 0.81 -1.19 -4.07 -4.23
-2.62 -4.02 -3.22 -1.9 -3.11 -2.61 -2.69 0.43 0.47 0.31 1.78 0.2 0.83 0.73 1.78 0.91 0.51 -2.99 -4.01 -4.44
-0.11 0.36 0.46 0.44 -0.2 -2.11 -2.58 0.15 0.42 -0.12 0.37 -0.12 0.2 0.31 0.39 1.14 0.34 -0.91 -1.65 -2.28
-0.57 -0.98 -0.47 0.25 -0.93 -1.91 -3.13 0.15 0.66 0.22 0.49 -0.0 0.45 0.52 0.53 1.43 0.97 -0.83 -3.7 -2.19
-1.11 -1.56 -2.83 -0.67 -1.23 -1.19 -2.59 0.37 0.4 0.37 0.16 -2.29 2.51 2.0 0.03 -1.44 -1.61 -1.38 -1.53 -4.57
-1.08 -0.52 -2.5 -0.51 -1.19 -1.15 -1.59 0.43 0.78 0.88 0.61 -2.3 1.79 1.48 0.46 -0.23 -1.77 -0.5 -1.07 -2.75
0.35 -0.15 0.67 0.48 -0.12 -2.01 -1.63 0.17 0.08 -0.13 0.34 -0.41 0.07 -0.02 0.39 0.86 0.4 -0.17 -1.03 -1.46
0.43 -0.28 0.04 0.85 -0.11 -1.37 -1.93 0.16 0.2 -0.19 0.28 -0.58 0.14 0.1 0.46 1.02 0.41 -0.43 -1.03 -1.93
0.06 -0.3 0.15 0.58 -0.47 -1.76 -1.42 0.26 0.27 0.0 1.16 -0.18 -1.41 -0.81 1.24 0.75 0.44 -0.91 -1.06 -1.84
0.36 -0.15 0.12 0.65 -0.6 -1.41 -2.17 0.11 0.44 0.11 0.16 -0.34 -0.13 -0.1 0.08 1.56 0.78 -1.11 -1.76 -2.75
-0.77 0.19 -0.52 -0.25 -0.29 -1.25 -0.76 0.29 0.53 0.53 0.63 -0.24 0.91 0.98 0.45 -0.39 -1.24 -0.6 -0.12 -1.17
0.59 -0.99 -0.02 0.4 -0.34 -0.67 -2.35 0.46 0.11 -0.35 0.45 -0.42 0.52 0.43 0.22 1.24 0.46 -0.9 -1.94 -2.08
0.45 -0.82 -0.25 0.96 -1.37 -1.69 -6.21 0.39 0.37 -0.21 0.14 -0.32 0.66 0.57 -0.04 1.59 0.78 -1.64 -3.92 -4.7
-0.14 0.4 0.36 0.42 -0.31 -0.56 -1.39 0.06 0.17 -0.16 -0.07 -0.46 -0.11 0.11 -0.12 1.27 0.53 -0.05 -0.91 -1.85
-0.01 -0.51 -0.32 -0.19 -0.12 -0.28 -1.24 0.2 0.48 0.27 0.46 -0.1 0.29 0.25 0.51 0.74 0.64 -0.63 -1.8 -1.24
-8.43 -6.31 - -6.77 -4.58 -0.03 -2.9 0.64 1.13 1.03 0.26 -0.97 2.02 1.08 0.25 0.63 -0.18 -4.59 -9.9 0.59
-0.23 -0.56 -0.68 0.27 -0.68 -0.95 -2.07 0.26 0.41 0.09 0.42 -0.31 0.73 0.73 0.38 1.28 0.47 -0.74 -2.49 -1.67
-0.13 -0.97 -0.55 -0.27 -1.05 -0.88 -2.87 0.39 0.9 0.55 0.8 0.02 0.07 0.12 0.79 1.16 0.73 -0.99 -2.82 -3.39
-0.19 -0.41 -0.26 0.9 -1.07 -1.25 -4.43 0.41 0.28 -0.07 0.58 -0.05 1.09 1.08 0.4 0.53 0.08 -0.91 -3.14 -4.15
0.47 -0.44 -0.22 0.97 -1.12 -0.82 -3.61 0.48 0.6 0.19 -0.07 -0.71 0.37 0.47 -0.12 1.28 0.78 -1.14 -3.53 -4.15
0.26 -0.34 -0.23 0.7 -0.55 -0.92 -3.27 0.42 0.34 -0.06 0.55 0.05 0.02 -0.09 0.48 1.23 0.59 -0.45 -3.19 -3.23
-2.24 -1.52 -1.71 -1.98 -1.24 -1.1 -3.87 0.8 0.76 0.17 1.12 0.42 0.67 0.57 0.56 1.42 1.06 -1.42 -4.05 -3.23
-1.22 -1.1 -0.88 -0.54 -1.29 -0.65 -2.05 0.29 0.57 0.05 0.54 -0.13 0.52 0.79 0.46 1.81 0.85 -1.42 -2.98 -2.92
0.34 -4.77 -3.06 0.36 0.02 -2.19 -1.83 -0.03 0.45 0.11 0.96 -0.2 0.95 1.41 0.66 0.59 0.06 -0.99 -2.16 -3.36
0.46 0.08 0.03 0.16 -0.32 -0.8 -1.91 0.42 0.37 0.23 0.97 -0.17 0.06 -0.19 0.86 0.41 -0.24 -1.4 -1.22 -1.24
0.06 -0.9 -0.33 0.61 -0.92 -0.39 -2.63 0.57 0.46 0.06 0.47 -0.1 -0.09 -0.27 0.43 1.29 0.95 -0.85 -2.44 -2.4
0.3 0.1 0.19 0.55 -0.4 -0.56 -1.49 0.18 0.07 -0.3 0.34 -0.22 0.43 0.25 0.32 0.8 0.29 -0.74 -0.94 -1.65
-0.27 -0.49 -1.15 -0.27 -0.96 -2.4 -4.35 0.44 0.68 0.29 0.19 -0.13 0.1 0.13 0.15 2.11 0.69 -0.03 -6.79 -6.53
0.27 -0.21 0.05 0.69 0.49 0.13 -1.66 0.11 0.24 -0.13 -0.15 -0.61 0.51 0.5 -0.32 0.57 -0.19 -0.33 -1.12 -1.05
-0.26 -0.8 -0.25 0.09 -0.21 -1.41 -1.21 -0.14 0.13 -0.16 0.78 0.08 0.48 0.75 0.22 1.11 0.88 -0.48 -3.41 -1.73
-1.01 -3.07 -2.31 -1.07 -1.73 -1.27 -2.58 0.53 0.8 0.27 0.04 -0.73 1.21 1.14 -0.13 2.0 0.89 -1.34 -4.85 -3.32
-0.62 0.11 -0.41 -0.39 -0.17 -0.55 -0.41 0.22 0.43 0.34 0.02 -0.09 -0.13 -0.29 -0.13 1.36 0.78 -0.18 -0.89 -1.57
0.85 0.18 0.3 1.03 -0.88 -1.5 -2.04 0.1 0.11 -0.06 0.25 -0.71 0.65 0.53 0.25 0.66 0.13 -1.25 -1.93 -2.51
-0.22 -0.1 -0.2 0.19 -0.03 -0.88 -2.53 0.51 0.18 -0.04 0.52 0.11 0.35 -0.04 0.55 0.47 0.46 0.16 -0.77 -1.72
-0.13 -0.61 -0.32 0.33 -0.03 -1.01 -2.49 0.43 0.36 0.1 0.66 0.42 -1.02 -0.75 0.65 0.72 0.7 0.48 -1.36 -1.37
-0.95 -5.14 -3.54 -3.38 -3.82 -2.11 -3.39 0.88 0.42 0.46 0.66 0.02 2.31 1.61 0.6 -0.75 -0.33 -1.91 -3.63 -1.2
-1.65 -2.25 -3.04 -2.46 -2.17 -2.01 -2.66 0.63 0.63 0.56 -1.56 0.31 2.25 1.4 -1.51 -1.54 0.38 -0.77 0.49 0.03
-1.85 -1.51 -1.92 -0.71 -2.52 -1.07 -3.69 0.48 0.79 0.51 0.13 0.03 1.24 1.31 0.1 1.51 0.9 -1.28 -5.35 -5.47
0.76 -0.3 0.43 1.56 -0.93 -1.03 -3.14 0.07 0.2 -0.25 0.03 -1.0 0.37 0.35 -0.02 1.14 0.16 -1.19 -3.05 -3.59
-0.29 -0.11 -0.61 0.2 -0.55 -1.09 -4.63 0.42 0.36 0.15 0.92 -0.21 0.25 0.29 0.8 1.14 0.52 -0.49 -2.97 -2.86
-0.04 -1.29 -0.61 0.2 -0.29 -1.58 -2.2 0.4 0.54 0.1 0.53 -0.5 0.73 0.75 0.42 0.97 0.56 -0.73 -0.92 -2.2
-0.12 0.19 0.43 0.55 -0.22 0.52 -1.17 0.06 0.24 -0.27 0.18 -0.25 0.08 0.28 0.1 0.51 0.06 -0.11 -1.38 -1.97
0.43 -0.38 -0.11 0.47 -0.8 -1.35 -1.15 0.28 0.43 0.17 0.15 -0.4 0.22 0.24 0.24 1.22 0.85 -0.83 -2.58 -2.27
-0.37 -2.9 - -0.77 -0.8 -2.18 -2.19 0.55 -0.36 -0.17 0.89 -0.38 1.86 1.6 1.57 -0.19 -1.46 -1.13 -2.57 -2.15
-1.21 0.08 -1.42 0.12 -0.8 -0.2 -0.5 0.21 0.62 0.33 -0.21 -0.14 0.16 0.33 -0.27 1.12 1.02 -0.08 -0.93 -1.69
-2.64 - -4.53 -1.9 -2.04 -2.37 -6.21 0.78 0.56 -0.01 1.34 -0.29 1.48 1.49 0.95 1.22 0.62 -3.08 -6.09 -
-2.21 -3.73 -2.49 -2.6 -3.79 -2.82 -5.5 0.94 0.39 0.31 0.95 -0.3 1.5 1.52 0.66 1.27 1.05 -3.01 -6.34 -4.98
-2.3 -4.88 -2.26 -3.11 -2.82 -2.77 -9.49 1.07 0.26 0.82 0.83 -0.42 2.53 1.56 0.63 -0.74 -0.93 -4.11 - -3.26
-0.12 0.31 0.45 -0.18 -0.2 -0.74 -2.3 0.61 0.48 -0.08 0.33 -0.46 1.34 1.03 0.24 0.22 -1.26 -1.28 -2.83 -2.69
0.01 -0.39 -0.06 -0.01 -0.14 -0.24 -1.81 0.49 0.34 0.18 0.41 -0.01 0.47 0.26 0.36 0.69 0.16 -0.52 -1.43 -1.15
-0.33 0.44 -0.05 0.33 -0.67 0.09 -3.75 0.26 0.54 0.01 -0.16 -0.18 0.48 0.54 -0.21 1.15 0.57 -0.15 -3.55 -4.77
-0.89 -0.57 -0.42 -0.21 -0.37 0.29 -2.44 0.3 0.7 0.14 0.48 -0.03 0.31 0.22 0.33 1.22 0.77 -0.93 -3.03 -1.67
0.59 -0.86 0.19 0.85 -0.55 -1.19 -3.18 0.39 0.3 0.11 0.51 -0.36 0.13 -0.02 0.51 1.1 0.42 -0.57 -3.27 -2.39
-0.94 -1.11 -1.87 -0.25 -1.51 -1.93 -3.49 0.46 0.66 0.46 0.48 -0.58 1.14 1.33 0.34 1.64 0.27 -1.39 -3.31 -5.44
-2.08 -3.72 -2.62 -0.91 -1.27 -2.0 -4.17 0.63 0.44 0.37 0.71 -0.49 2.03 1.31 0.68 -0.01 -0.65 -0.23 -0.73 -1.02
-0.15 0.02 0.1 0.6 -0.88 -0.48 -2.03 0.34 0.59 0.06 0.35 -0.3 -0.02 0.07 0.3 1.35 0.42 -0.84 -1.82 -3.41
0.11 -1.91 -0.24 0.48 -1.48 -1.07 -2.68 0.26 0.87 0.23 0.77 -0.67 0.83 0.7 0.52 0.98 0.58 -1.32 -3.72 -3.14
-0.39 0.16 -0.18 0.56 -0.56 -0.54 -1.73 0.29 0.32 0.06 0.4 -0.09 0.11 0.13 0.31 1.06 0.55 -0.02 -2.01 -2.84
-0.11 0.13 -0.27 0.03 -0.52 -0.36 -1.74 0.78 0.05 -0.15 0.2 -0.01 0.91 0.91 0.29 0.54 -0.06 -0.13 -2.94 -3.08
0.41 0.64 0.38 0.75 -0.65 -1.64 -2.07 0.0 0.37 -0.0 0.28 -0.52 0.64 0.64 0.18 0.98 -0.02 -1.55 -3.71 -3.32
0.57 0.97 0.69 0.5 -0.56 -1.35 -1.84 0.19 0.5 0.14 0.26 -0.66 -0.38 -0.7 0.27 1.17 0.25 -1.22 -2.81 -3.58
-0.31 -0.32 0.08 0.16 -0.15 -0.25 -1.23 0.3 0.2 -0.07 0.36 -0.38 0.58 0.6 0.34 0.49 0.44 -0.53 -1.08 -1.13
0.68 -0.08 0.22 1.11 -0.71 -1.27 -3.13 0.22 0.24 -0.16 -0.11 -0.9 0.62 0.65 -0.11 1.21 0.28 -1.06 -2.92 -2.91
-1.23 -1.63 -1.82 -0.58 -2.2 -1.86 -3.24 0.5 0.77 0.34 1.11 -0.17 1.34 1.48 0.78 0.78 0.27 -2.2 -4.21 -4.91
-1.07 -1.38 -1.62 -0.49 -1.19 -1.46 -2.56 0.48 0.89 0.55 0.85 -0.1 1.11 1.2 0.25 1.09 0.53 -1.7 -3.81 -3.93
0.08 -0.01 0.2 0.05 -0.02 -1.16 -2.31 0.25 0.51 0.31 0.47 -0.28 0.53 0.62 0.33 0.94 0.13 -1.04 -2.76 -2.36
0.65 0.14 0.53 1.16 -0.13 -0.57 -1.79 0.28 -0.08 -0.13 0.24 -0.27 0.05 -0.15 0.17 0.53 -0.05 -0.81 -1.36 -1.89
-0.5 -0.16 -0.26 0.1 -0.85 -1.81 -1.73 0.41 0.75 0.44 0.17 0.04 0.6 0.54 0.14 1.34 0.67 -1.21 -2.92 -3.45
0.63 -0.19 0.53 0.9 -0.56 -1.11 -2.82 0.15 0.01 -0.46 0.15 -0.54 0.51 0.53 -0.02 0.92 0.55 -0.5 -2.2 -2.27
-3.01 -3.36 -3.17 -0.87 -2.3 -1.77 -3.18 0.64 1.15 1.09 0.78 0.34 0.77 0.72 0.88 1.16 0.76 -1.76 -2.91 -3.97
-0.93 -0.91 -0.4 -1.72 -0.06 -2.08 -1.55 -0.16 0.23 0.42 0.58 -0.52 1.48 0.92 0.95 0.73 0.06 -0.75 -2.44 -0.62
0.72 -0.94 0.23 0.8 -0.62 -0.59 -3.91 0.38 -0.05 -0.87 0.23 -0.66 0.35 0.61 0.07 1.41 0.76 -0.97 -3.64 -3.18
- - - - - - -5.94 0.21 0.8 -0.2 0.16 -2.38 3.06 2.49 -0.6 -2.45 -3.83 - - -6.6
-6.73 -3.81 -5.23 -2.94 -3.57 -6.96 -9.84 0.96 1.04 0.22 0.64 -1.9 2.66 2.23 0.31 -2.26 -4.96 -4.62 -3.21 -4.53
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-0.34 -0.85 -0.87 -0.28 -0.91 -1.47 -2.59 0.16 0.37 -0.06 0.8 -0.56 0.74 0.72 0.66 1.5 0.92 -1.15 -3.03 -2.09
0.24 -1.12 -0.43 0.61 -1.36 -0.96 -6.62 0.67 0.72 0.25 0.16 -0.45 0.09 0.07 0.02 1.48 0.97 0.03 -9.21 -7.89
0.26 -1.02 -0.35 -0.15 -1.01 -0.89 -2.51 0.14 0.58 0.42 0.44 0.1 0.38 0.5 0.34 1.3 0.75 -0.92 -2.54 -2.19
-0.36 0.21 0.41 0.46 -0.32 -1.06 -2.57 0.07 0.36 -0.01 -0.21 -0.27 0.25 0.67 -0.23 1.46 0.62 -0.74 -2.72 -2.29
-0.32 -1.11 -0.54 0.11 -0.85 -0.34 -2.79 0.6 0.4 -0.01 0.51 0.18 0.97 0.8 0.37 0.87 0.75 -1.23 -3.15 -3.84
0.35 0.22 0.29 0.58 -0.11 -0.49 -2.0 0.13 -0.17 -0.38 0.6 -0.48 0.3 0.13 0.5 0.67 0.17 -0.56 -1.05 -1.56
-1.3 -1.49 -1.36 -0.72 -1.41 -1.38 -1.91 0.25 0.32 -0.05 1.09 -0.09 1.27 1.07 1.02 0.74 0.81 -1.05 -2.98 -2.56
-1.96 -1.19 -1.04 0.4 -1.36 -1.68 -1.92 0.35 0.55 0.35 1.3 0.16 0.85 0.74 1.03 0.4 0.71 -1.66 -6.24 -2.95
-0.37 -1.74 -0.88 -0.03 -1.48 -1.18 -4.25 0.19 0.69 0.27 0.45 -0.36 0.88 0.95 0.42 1.59 0.77 -1.43 -2.78 -3.37
-0.12 -1.75 -0.47 0.22 -1.0 -1.9 -3.86 0.42 0.73 0.33 0.69 -0.24 0.59 0.82 0.47 1.13 0.79 -1.05 -2.37 -3.36
-0.47 -0.35 -0.17 0.79 -0.8 -1.75 -4.09 0.51 0.36 -0.07 1.13 -0.21 -0.08 0.37 1.03 0.71 0.69 -0.78 -2.95 -
0.03 0.19 0.15 0.58 -1.01 -1.25 -2.22 0.07 0.39 -0.04 0.44 -0.34 1.05 0.72 0.33 0.56 0.32 -0.47 -3.07 -3.67
-0.09 -0.57 -0.22 0.58 -0.62 -0.78 -2.65 0.26 0.44 -0.17 -0.09 -0.41 -0.25 0.05 -0.14 1.86 1.21 -1.07 -2.18 -3.5
-0.89 -1.03 -1.05 0.08 -0.31 -1.18 -1.79 0.16 0.63 0.24 0.29 -0.28 1.3 1.27 0.3 0.85 0.4 -1.09 -3.18 -2.45
0.33 -2.05 -0.79 0.66 -0.46 -0.88 -3.51 0.63 0.55 0.15 0.52 -0.13 -0.03 -0.25 0.43 1.37 1.04 -0.71 -3.71 -5.27
0.36 -0.87 -0.05 0.45 -0.42 -1.37 -1.98 0.25 0.52 0.33 0.67 -0.78 0.63 0.26 0.56 0.61 0.23 -0.48 -1.07 -1.85
0.31 -0.41 0.43 0.13 -0.39 -0.8 -2.77 0.61 0.74 0.38 0.43 -0.25 -0.77 -0.85 0.42 1.17 0.65 -0.38 -3.02 -2.23
-7.04 -7.09 -7.51 -4.88 -4.02 -1.61 -7.42 0.11 1.43 0.8 -0.43 -0.34 2.43 2.1 -0.17 -0.53 -1.0 -0.9 -3.1 -3.73
0.19 0.19 0.21 -0.19 -0.89 -1.42 -1.09 0.34 0.31 -0.11 -0.28 0.09 1.22 1.45 -0.31 0.35 -0.06 -1.12 -2.35 -2.25
0.5 0.05 0.11 0.46 -0.19 -0.39 -1.08 0.3 0.25 -0.13 0.18 -0.66 0.14 -0.12 0.13 1.01 0.26 -0.35 -0.89 -2.1
0.14 -0.03 0.58 0.55 -0.28 -0.99 -0.95 0.13 0.19 -0.44 0.38 -0.61 0.52 0.52 -0.14 0.92 0.47 -1.2 -1.29 -1.83
0.52 -0.44 0.6 1.01 -0.52 -1.18 -2.35 0.32 0.25 -0.09 0.23 -0.45 0.1 -0.18 0.18 0.69 0.7 -0.47 -1.03 -2.74
-0.21 -0.33 -0.21 -0.7 -0.45 -0.49 -1.5 0.4 0.55 0.3 0.01 0.17 0.86 0.32 0.21 1.1 0.29 -0.61 -1.43 -1.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.