Heatmap: Cluster_323 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00666	0.85	0.41	0.68	1.0	0.58	0.88	0.2	0.3	0.11	0.17	0.22	0.16	0.11	0.15	0.19	0.27	0.3	1.0	0.6	0.41
Gb_00896	0.64	0.33	0.6	0.59	0.73	0.68	0.24	0.35	0.13	0.15	0.17	0.27	0.22	0.22	0.18	0.21	0.39	1.0	0.54	0.53
Gb_01009	0.95	0.88	1.0	0.77	0.67	0.24	0.41	0.3	0.19	0.18	0.23	0.22	0.29	0.22	0.24	0.24	0.21	0.66	0.85	0.42
Gb_01075	0.89	0.59	0.82	0.77	0.86	1.0	0.53	0.69	0.46	0.47	0.6	0.54	0.51	0.52	0.57	0.43	0.53	0.85	0.85	0.66
Gb_01257	0.62	0.55	1.0	0.97	0.57	0.33	0.35	0.29	0.23	0.2	0.27	0.24	0.36	0.36	0.32	0.33	0.31	0.55	0.5	0.41
Gb_01709	0.75	0.35	0.67	0.68	0.91	0.27	0.1	0.18	0.05	0.05	0.04	0.09	0.02	0.02	0.05	0.14	0.14	1.0	0.74	0.62
Gb_02569	0.51	1.0	0.9	0.49	0.65	0.44	0.29	0.28	0.14	0.14	0.1	0.34	0.15	0.2	0.07	0.22	0.21	0.64	0.5	0.86
Gb_02697	1.0	0.45	0.9	0.93	0.79	0.65	0.22	0.44	0.19	0.18	0.31	0.39	0.17	0.22	0.32	0.3	0.47	0.87	0.64	0.4
Gb_03465	0.69	0.63	1.0	0.84	0.81	0.75	0.28	0.51	0.27	0.28	0.36	0.43	0.21	0.21	0.37	0.31	0.42	0.94	0.79	0.59
Gb_05545	0.58	0.39	0.66	0.6	1.0	0.09	0.15	0.17	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.04	0.09	0.08	0.78	0.57	0.11
Gb_05761	1.0	0.71	0.85	0.66	0.89	0.64	0.3	0.23	0.11	0.13	0.07	0.14	0.1	0.07	0.07	0.17	0.18	0.75	0.61	0.42
Gb_05851	0.91	0.64	1.0	0.8	0.87	0.36	0.5	0.47	0.24	0.24	0.4	0.38	0.46	0.43	0.4	0.36	0.33	0.91	0.64	0.6
Gb_07615	0.66	0.43	0.63	0.94	0.76	0.52	0.18	0.3	0.12	0.14	0.2	0.2	0.09	0.13	0.24	0.25	0.29	1.0	0.47	0.25
Gb_07701	0.72	0.46	1.0	0.66	0.72	0.57	0.43	0.33	0.19	0.19	0.23	0.26	0.13	0.11	0.24	0.21	0.28	0.62	0.47	0.56
Gb_07862	0.76	0.47	0.96	0.85	0.83	0.61	0.29	0.37	0.12	0.13	0.13	0.28	0.13	0.1	0.15	0.17	0.35	1.0	0.63	0.38
Gb_08270	0.79	0.68	1.0	0.79	0.74	0.47	0.46	0.41	0.34	0.3	0.37	0.35	0.24	0.21	0.4	0.46	0.58	0.61	0.4	0.39
Gb_08537	0.91	0.42	0.96	1.0	0.69	0.19	0.25	0.31	0.15	0.15	0.21	0.2	0.21	0.17	0.23	0.2	0.19	0.69	0.72	0.5
Gb_08546	1.0	0.4	0.94	0.87	0.82	0.23	0.25	0.44	0.34	0.31	0.39	0.31	0.24	0.26	0.37	0.43	0.42	0.75	0.44	0.35
Gb_08646	0.81	0.67	0.94	1.0	0.71	0.76	0.36	0.53	0.31	0.28	0.39	0.4	0.47	0.45	0.38	0.4	0.51	0.67	0.64	0.45
Gb_08874	0.83	0.79	1.0	0.65	0.6	0.35	0.28	0.22	0.09	0.08	0.11	0.16	0.16	0.18	0.11	0.2	0.14	0.5	0.44	0.16
Gb_09280	0.76	0.57	0.77	0.54	0.87	0.52	0.3	0.38	0.26	0.26	0.24	0.35	0.13	0.13	0.3	0.28	0.4	0.93	1.0	0.67
Gb_10041	0.8	0.69	0.76	0.98	0.94	0.35	0.17	0.3	0.2	0.22	0.23	0.23	0.13	0.15	0.22	0.48	0.29	1.0	0.61	1.0
Gb_10128	1.0	0.48	0.83	0.61	0.68	0.71	0.42	0.33	0.26	0.22	0.14	0.21	0.14	0.13	0.17	0.41	0.31	0.72	0.31	0.25
Gb_10248	1.0	0.64	0.78	0.79	0.7	0.24	0.37	0.34	0.25	0.23	0.25	0.29	0.36	0.41	0.24	0.39	0.31	0.71	0.7	0.3
Gb_10741	0.64	0.24	0.56	0.66	0.83	0.18	0.17	0.36	0.16	0.19	0.21	0.32	0.23	0.22	0.25	0.22	0.33	1.0	0.52	0.67
Gb_10891	1.0	0.31	0.54	0.59	0.68	0.73	0.37	0.38	0.19	0.19	0.35	0.23	0.24	0.25	0.35	0.26	0.35	0.59	0.53	0.47
Gb_11090	0.66	0.48	0.7	0.62	0.75	0.5	0.25	0.39	0.25	0.24	0.26	0.26	0.15	0.18	0.28	0.32	0.31	1.0	0.61	0.84
Gb_11883	0.76	0.58	0.62	1.0	0.87	0.31	0.21	0.3	0.13	0.15	0.19	0.19	0.16	0.14	0.28	0.16	0.15	0.6	0.77	0.28
Gb_12059	1.0	0.34	0.92	1.0	0.7	0.28	0.28	0.3	0.13	0.11	0.2	0.17	0.17	0.14	0.2	0.17	0.18	0.66	0.48	0.38
Gb_13546	1.0	0.42	0.7	0.51	0.65	0.56	0.41	0.35	0.18	0.18	0.23	0.28	0.17	0.15	0.23	0.22	0.26	0.46	0.48	0.35
Gb_15845	0.74	0.98	1.0	0.71	0.75	0.22	0.38	0.2	0.24	0.21	0.3	0.3	0.08	0.09	0.46	0.14	0.17	0.64	0.47	0.41
Gb_16099	0.9	0.56	1.0	0.82	0.86	0.54	0.18	0.36	0.16	0.14	0.14	0.24	0.12	0.11	0.16	0.14	0.23	0.84	0.39	0.39
Gb_16280	0.64	0.61	0.69	0.83	0.76	0.3	0.37	0.28	0.11	0.1	0.16	0.11	0.08	0.1	0.16	0.2	0.3	1.0	0.58	0.24
Gb_16516	1.0	0.62	0.96	0.54	0.67	0.32	0.45	0.33	0.2	0.18	0.21	0.22	0.35	0.31	0.24	0.29	0.25	0.84	0.7	0.49
Gb_17066	0.91	0.67	1.0	0.95	0.65	0.38	0.38	0.31	0.15	0.13	0.25	0.21	0.29	0.19	0.3	0.3	0.19	0.67	0.62	0.41
Gb_17651	0.72	0.37	0.63	0.83	0.72	0.8	0.23	0.46	0.17	0.17	0.21	0.26	0.29	0.32	0.23	0.25	0.41	1.0	0.45	0.44
Gb_17999	0.54	0.27	1.0	0.59	0.61	0.03	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.29	0.13	0.25
Gb_18205	0.88	0.76	1.0	0.71	0.88	0.9	0.25	0.45	0.21	0.21	0.28	0.25	0.19	0.17	0.29	0.24	0.42	0.88	0.65	0.49
Gb_19019	0.88	0.78	1.0	0.8	0.86	0.33	0.31	0.3	0.28	0.29	0.49	0.21	0.26	0.26	0.51	0.27	0.3	0.67	0.65	0.77
Gb_19269	0.79	0.91	1.0	0.84	0.67	0.37	0.36	0.32	0.18	0.18	0.26	0.27	0.36	0.37	0.26	0.29	0.28	0.71	0.51	0.27
Gb_19480	0.79	0.58	1.0	0.62	0.68	0.32	0.25	0.29	0.2	0.19	0.17	0.25	0.21	0.21	0.19	0.25	0.31	0.52	0.26	0.42
Gb_19859	0.71	0.63	1.0	0.71	0.63	0.32	0.26	0.32	0.31	0.27	0.41	0.25	0.2	0.24	0.39	0.33	0.33	0.43	0.45	0.34
Gb_21391	0.94	0.5	1.0	0.83	0.59	0.34	0.3	0.31	0.22	0.23	0.2	0.22	0.19	0.19	0.2	0.2	0.21	0.62	0.64	0.4
Gb_21763	1.0	0.5	0.91	0.96	0.78	0.29	0.36	0.44	0.16	0.2	0.24	0.27	0.15	0.13	0.25	0.16	0.28	0.84	0.49	0.4
Gb_21767	0.94	0.56	0.95	1.0	0.7	0.72	0.24	0.27	0.22	0.21	0.14	0.15	0.23	0.24	0.15	0.31	0.32	0.64	0.77	0.31
Gb_21907	1.0	0.67	0.97	0.74	0.79	0.72	0.42	0.33	0.15	0.17	0.14	0.21	0.12	0.1	0.12	0.15	0.25	0.68	0.61	0.23
Gb_21915	0.96	0.77	0.89	1.0	0.88	0.55	0.39	0.42	0.24	0.18	0.18	0.3	0.38	0.39	0.17	0.22	0.3	0.71	0.53	0.18
Gb_23171	1.0	0.94	0.95	0.9	0.92	0.39	0.33	0.48	0.25	0.22	0.37	0.34	0.51	0.49	0.38	0.41	0.3	0.98	0.66	0.47
Gb_23392	1.0	0.73	0.77	0.9	0.81	0.88	0.38	0.57	0.3	0.3	0.35	0.4	0.51	0.52	0.42	0.34	0.46	0.83	0.81	0.57
Gb_23951	0.98	0.75	0.9	0.7	0.93	1.0	0.44	0.61	0.55	0.49	0.61	0.53	0.66	0.63	0.62	0.68	0.73	0.97	0.9	0.7
Gb_24081	0.76	0.67	1.0	0.55	0.96	0.21	0.25	0.34	0.25	0.22	0.23	0.26	0.16	0.13	0.23	0.22	0.26	0.7	0.69	0.42
Gb_24836	1.0	0.58	0.79	0.7	0.76	0.7	0.37	0.47	0.35	0.35	0.49	0.34	0.32	0.31	0.42	0.31	0.33	0.85	0.78	0.45
Gb_25087	0.93	0.53	0.79	1.0	1.0	0.67	0.37	0.4	0.24	0.24	0.29	0.28	0.18	0.17	0.33	0.31	0.3	0.79	0.71	0.56
Gb_26038	0.65	0.51	0.76	0.53	0.71	0.54	0.15	0.35	0.14	0.16	0.19	0.31	0.12	0.11	0.19	0.12	0.18	1.0	0.57	0.68
Gb_26280	0.93	0.68	1.0	0.82	0.84	0.78	0.41	0.5	0.3	0.3	0.34	0.39	0.28	0.26	0.36	0.39	0.52	0.93	0.82	0.52
Gb_27014	0.76	0.46	0.87	0.78	0.93	0.62	0.2	0.44	0.2	0.2	0.37	0.36	0.2	0.16	0.39	0.22	0.44	1.0	0.81	0.41
Gb_27682	0.8	0.46	0.85	1.0	0.85	0.74	0.26	0.51	0.27	0.25	0.37	0.3	0.29	0.28	0.34	0.37	0.41	0.9	0.89	0.5
Gb_28183	1.0	0.51	0.8	0.87	0.69	0.56	0.35	0.38	0.24	0.25	0.27	0.28	0.16	0.17	0.27	0.38	0.37	0.68	0.54	0.47
Gb_28188	0.83	0.54	0.94	1.0	0.76	0.43	0.24	0.5	0.42	0.37	0.37	0.33	0.27	0.29	0.4	0.42	0.34	0.73	0.53	0.5
Gb_30302	0.7	0.39	0.48	0.98	1.0	0.39	0.44	0.25	0.15	0.16	0.18	0.19	0.05	0.05	0.23	0.22	0.3	0.97	0.73	0.48
Gb_30495	0.99	0.17	0.79	0.76	0.94	0.66	0.36	0.54	0.25	0.26	0.44	0.32	0.32	0.3	0.4	0.19	0.57	1.0	0.92	0.54
Gb_31041	0.92	0.81	1.0	0.77	0.73	0.85	0.44	0.42	0.26	0.25	0.21	0.27	0.39	0.38	0.22	0.32	0.22	0.73	0.71	0.46
Gb_31574	0.71	0.46	1.0	0.71	0.58	0.39	0.16	0.22	0.13	0.13	0.16	0.16	0.1	0.09	0.15	0.15	0.26	0.38	0.33	0.21
Gb_31801	0.8	0.62	0.84	0.82	1.0	0.47	0.44	0.46	0.33	0.33	0.48	0.37	0.22	0.19	0.51	0.29	0.39	0.87	0.89	0.64
Gb_31826	0.98	0.54	0.85	1.0	0.85	0.55	0.21	0.35	0.13	0.13	0.21	0.35	0.14	0.15	0.2	0.22	0.26	0.89	0.62	0.26
Gb_32363	0.84	0.6	1.0	0.78	0.7	0.63	0.24	0.31	0.21	0.2	0.16	0.21	0.15	0.16	0.17	0.31	0.36	0.62	0.41	0.41
Gb_32555	0.97	0.94	0.68	0.49	1.0	0.76	0.42	0.43	0.28	0.27	0.24	0.33	0.12	0.11	0.33	0.37	0.32	0.92	0.63	0.53
Gb_33589	1.0	0.88	0.7	0.52	0.83	0.24	0.4	0.34	0.12	0.11	0.25	0.2	0.24	0.21	0.25	0.19	0.15	0.83	0.76	0.5
Gb_34159	0.45	0.25	0.47	0.63	1.0	0.16	0.26	0.21	0.06	0.06	0.09	0.14	0.06	0.07	0.11	0.1	0.17	0.87	0.67	0.53
Gb_35790	1.0	0.6	0.78	0.98	0.72	0.57	0.22	0.31	0.23	0.22	0.14	0.2	0.08	0.06	0.13	0.15	0.15	0.99	0.69	0.4
Gb_35804	1.0	0.71	0.78	0.75	0.85	0.72	0.5	0.5	0.27	0.26	0.3	0.38	0.36	0.36	0.32	0.28	0.35	0.81	0.73	0.59
Gb_36060	0.71	0.78	1.0	0.72	0.66	0.19	0.34	0.26	0.19	0.19	0.17	0.21	0.18	0.13	0.19	0.25	0.21	0.64	0.68	0.37
Gb_36922	0.71	0.43	0.72	1.0	0.69	0.36	0.25	0.41	0.23	0.22	0.31	0.3	0.4	0.31	0.33	0.31	0.28	0.7	0.52	0.39
Gb_36986	0.92	0.74	1.0	0.9	0.86	0.21	0.44	0.33	0.22	0.21	0.29	0.3	0.38	0.33	0.31	0.32	0.26	0.78	0.59	0.49
Gb_37191	1.0	0.23	0.83	0.88	0.81	0.32	0.38	0.36	0.34	0.31	0.28	0.36	0.03	0.06	0.27	0.46	0.47	0.71	0.48	0.61
Gb_37281	0.93	0.57	1.0	0.95	0.68	0.37	0.14	0.33	0.16	0.17	0.26	0.27	0.06	0.08	0.22	0.19	0.2	0.58	0.39	0.2
Gb_37609	1.0	0.57	0.69	0.97	0.9	0.31	0.21	0.22	0.14	0.17	0.15	0.12	0.26	0.19	0.16	0.29	0.19	0.71	0.79	0.55
Gb_37710	0.63	0.36	0.61	0.71	0.82	0.57	0.31	0.23	0.08	0.07	0.07	0.1	0.07	0.07	0.07	0.27	0.17	1.0	0.51	0.26
Gb_38529	1.0	0.35	0.92	0.67	0.48	0.34	0.2	0.28	0.09	0.1	0.14	0.16	0.14	0.15	0.12	0.12	0.18	0.52	0.49	0.26
Gb_39258	0.65	0.66	0.54	0.81	0.79	0.43	0.28	0.31	0.21	0.22	0.2	0.26	0.08	0.09	0.18	0.25	0.23	1.0	0.77	0.53
Gb_39784	1.0	0.61	0.82	0.53	0.96	0.48	0.36	0.27	0.19	0.16	0.13	0.22	0.04	0.04	0.15	0.18	0.25	0.7	0.25	0.5
Gb_40085	0.84	0.62	1.0	0.73	0.6	0.47	0.5	0.33	0.38	0.31	0.45	0.24	0.22	0.22	0.44	0.49	0.37	0.68	0.44	0.41
Gb_40316	0.66	0.73	1.0	0.71	0.74	0.6	0.42	0.5	0.28	0.28	0.47	0.3	0.52	0.51	0.48	0.39	0.46	0.72	0.66	0.54
Gb_40460	0.83	0.55	1.0	0.87	0.66	0.28	0.41	0.31	0.13	0.12	0.2	0.2	0.22	0.22	0.2	0.19	0.2	0.74	0.7	0.38
Gb_41366	0.77	0.5	1.0	0.75	0.78	0.3	0.13	0.25	0.26	0.22	0.17	0.14	0.14	0.14	0.17	0.17	0.25	0.53	0.35	0.21
Gb_41494	1.0	0.59	0.79	0.61	0.73	0.55	0.38	0.52	0.22	0.25	0.29	0.32	0.34	0.33	0.33	0.19	0.23	0.88	0.88	0.47
Gb_41741	0.55	0.45	0.58	0.74	1.0	0.4	0.3	0.3	0.18	0.2	0.18	0.23	0.12	0.13	0.18	0.16	0.34	0.87	0.81	0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)