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Heatmap: Cluster_202 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.09 -0.08 -0.24 -0.0 -0.28 -1.17 -1.03 0.01 0.05 -0.0 0.7 -0.51 -0.18 -0.5 0.5 1.03 1.1 -0.61 -0.52 -1.08
-0.24 -0.12 -0.31 -0.05 0.05 -1.04 -0.73 0.19 0.56 0.35 0.79 -0.38 -0.44 -0.77 0.8 0.56 0.18 -0.33 -0.39 -0.48
0.13 0.6 0.23 0.33 0.38 -1.22 -1.88 0.19 0.25 -0.02 -0.04 -0.4 0.19 -0.08 -0.06 0.61 0.37 0.38 -1.0 -1.97
-0.4 -0.02 -0.69 -0.57 -0.14 -0.63 -1.18 0.04 0.44 0.19 0.19 -0.31 0.55 0.58 0.14 0.83 0.46 -0.1 -0.29 -0.95
-0.13 -0.64 -0.67 0.07 0.04 -1.56 -1.36 0.29 0.7 0.51 0.32 -0.29 -0.44 -0.58 0.34 1.34 1.05 -0.88 -2.09 -0.69
0.19 -0.27 0.27 0.55 -0.47 -2.08 -2.33 0.07 0.69 0.33 0.74 0.02 -0.88 -0.46 0.84 0.94 0.34 -0.44 -1.54 -1.81
0.75 -0.52 0.37 0.66 -0.04 -1.8 -2.28 -0.02 0.13 -0.09 0.65 -0.79 -0.13 -0.13 0.53 0.84 0.73 -0.58 -1.31 -1.59
0.76 -0.53 0.21 0.62 0.01 -0.51 -1.91 0.07 0.13 0.1 0.66 -0.48 -2.27 -1.99 0.72 0.62 0.67 0.19 -0.36 -1.91
0.59 -0.82 -0.34 0.32 -0.36 -1.48 -1.45 -0.14 0.41 0.23 1.25 -0.43 -0.71 -0.99 1.02 0.8 0.7 -0.65 -1.38 -1.63
0.36 0.41 0.08 0.61 -0.09 -1.79 -6.18 -0.34 0.31 -0.12 0.77 -0.6 -1.51 -1.14 0.84 1.44 0.75 -0.14 -1.77 -4.44
-0.68 1.01 -1.27 -0.74 -1.47 -1.66 -2.23 0.05 0.5 0.11 0.95 -0.11 0.06 0.02 0.75 1.15 0.7 0.19 -2.2 -3.0
0.23 -0.4 0.39 0.19 -0.16 -0.45 -3.12 0.22 0.25 -0.16 0.33 -0.54 0.29 0.26 0.16 0.43 0.88 -0.39 -0.35 -1.29
-0.53 -0.07 -0.74 -0.73 -0.45 -0.73 -1.64 0.73 0.91 0.26 1.33 -0.26 -1.98 -2.17 1.49 0.82 -0.14 -0.89 -0.49 -2.26
0.0 -0.42 -0.07 0.41 0.08 -0.18 -2.37 0.15 0.17 -0.41 0.25 -0.59 -0.31 -0.09 0.17 1.41 0.6 0.0 -1.15 -0.99
-0.28 0.51 -0.51 -0.45 -0.24 -0.93 -1.55 0.39 0.61 0.34 0.8 0.09 -0.86 -0.88 0.81 0.78 0.31 -0.22 -0.25 -2.35
0.76 0.33 -0.12 0.6 0.07 -1.86 -2.25 0.11 0.45 -0.04 0.08 -0.51 -0.15 -0.12 0.13 0.8 0.3 0.14 -0.44 -2.62
0.24 -0.59 -0.53 0.39 -0.2 -2.81 -1.54 0.13 0.21 -0.03 1.06 -0.6 -0.32 -0.41 0.86 1.03 0.88 -0.59 -0.52 -2.46
0.4 0.42 0.78 0.13 -0.55 -2.35 -0.79 -0.18 0.14 0.03 1.03 -0.82 -1.35 -1.47 0.82 0.84 0.33 -0.21 -0.48 -1.78
0.24 -0.42 0.04 0.83 -0.1 -0.81 -1.29 0.01 0.69 0.54 0.16 -0.5 -0.3 -0.43 0.42 0.3 0.12 0.29 -0.84 -1.1
0.01 0.3 0.21 0.2 -0.36 -1.43 -1.12 -0.06 0.51 0.28 0.24 -0.23 -0.11 -0.22 0.23 0.85 0.79 -0.43 -0.79 -1.36
0.62 -1.25 -0.22 0.53 -0.1 -0.2 -2.04 0.31 0.12 -0.29 0.3 -0.5 0.46 0.33 0.14 0.46 0.35 -0.04 -0.59 -0.78
0.08 -0.1 -0.31 0.05 -0.13 -1.25 -1.28 -0.42 0.23 -0.08 1.18 -0.95 -1.61 -1.26 0.97 1.09 0.88 -0.25 0.03 -2.08
0.41 1.08 0.07 0.94 0.39 -0.36 -0.36 0.01 0.09 -0.33 -0.09 -0.41 -1.22 -0.56 -0.16 0.48 -0.48 0.11 -0.51 -1.89
0.76 -1.17 -0.15 0.7 -0.41 -1.0 -2.22 0.01 0.33 0.13 0.96 -0.62 -2.14 -1.84 0.96 1.26 0.75 -0.81 -0.88 -1.95
0.68 -1.57 -0.72 0.67 -0.17 -1.2 -2.0 -0.06 0.43 0.05 0.87 -0.55 -0.3 -0.04 0.53 1.2 0.84 -1.04 -1.6 -1.7
0.02 0.16 -0.63 0.44 -0.82 -0.25 -3.48 0.24 0.47 -0.04 0.63 -0.44 -0.37 -0.3 0.62 1.35 0.57 0.09 -2.41 -2.89
0.53 -0.24 0.29 0.35 -0.46 -1.33 -1.34 0.36 0.68 0.53 0.97 -0.27 -1.44 -1.34 0.79 0.57 0.24 -1.48 -2.1 -0.28
0.15 -0.71 0.66 -0.09 -0.12 -2.47 -3.63 0.14 0.27 0.29 0.71 0.15 -0.64 -0.16 0.62 1.12 1.12 -1.71 -5.85 -0.87
0.65 -0.7 -0.08 0.53 -0.36 -3.05 -2.8 -0.2 0.33 0.16 1.06 -0.97 -0.61 -0.8 0.86 0.99 0.57 -0.65 0.21 -2.2
0.23 -1.46 -1.14 -0.1 -1.05 -3.17 -3.07 0.26 0.73 0.3 1.02 -0.59 -0.3 -0.51 1.3 1.34 0.79 -1.07 -1.25 -1.15
0.64 -0.11 -0.07 0.66 0.08 -2.63 -0.74 -0.62 0.33 0.0 0.44 -1.46 -1.2 -1.0 0.14 1.24 1.12 -0.06 -0.27 -2.47
0.69 -0.09 0.15 0.81 0.06 -1.62 -1.24 0.11 0.31 -0.16 0.14 -0.61 -0.82 -0.68 0.12 1.03 0.5 -0.08 -0.28 -1.67
-0.39 -0.37 -0.04 0.2 -0.22 -1.52 -2.98 0.16 0.32 0.05 0.54 0.02 -0.01 -0.04 0.42 1.14 0.94 0.25 -1.62 -2.31
0.91 -0.89 -0.02 0.88 -0.3 -1.73 -1.96 0.0 0.54 -0.05 0.44 -0.88 -0.08 -0.21 0.39 1.2 0.24 -0.49 -1.59 -1.27
-0.9 -1.69 -1.32 -0.22 -1.03 -1.22 -1.01 0.13 0.56 0.41 0.89 -0.67 0.02 0.25 0.62 1.48 1.13 -0.62 -1.06 -1.92
-0.36 0.73 0.32 0.22 -0.03 -0.01 -1.23 0.32 -0.25 -1.02 0.35 -0.54 -0.98 -0.76 0.16 0.92 0.53 -0.11 0.19 -0.81
-0.03 -1.52 -1.3 -0.09 -0.19 -2.15 -1.88 0.26 0.28 0.19 0.82 -0.69 0.82 0.65 0.59 0.68 0.49 -0.44 -0.83 -0.21
-0.63 -0.57 -0.22 0.12 -0.02 -1.17 -0.56 0.37 0.63 0.62 0.57 0.4 0.05 -0.33 0.3 0.5 0.28 -0.54 -0.58 -1.35
0.09 -0.7 -0.87 0.3 -0.1 -0.52 -1.96 0.01 0.35 0.05 0.79 -0.39 -0.15 -0.5 0.7 1.0 0.49 -0.21 -0.4 -0.8
-0.0 0.94 -0.36 -0.13 -0.28 -1.32 -1.67 0.22 0.43 0.47 0.57 0.19 -0.65 -0.5 0.68 0.51 -0.01 -0.42 -0.37 -1.1
0.03 0.04 0.2 0.54 -0.39 -1.31 -1.62 0.29 0.16 -0.04 0.64 0.02 -0.76 -0.98 0.45 0.78 0.98 -0.77 -0.19 -1.49
-0.09 -0.17 -0.25 -0.27 -0.62 -0.17 -0.65 0.04 0.59 0.49 0.5 -0.15 -1.24 -1.16 0.83 1.11 0.59 -0.52 -0.43 -1.6
0.25 0.07 0.04 0.3 0.23 -1.25 -1.69 0.38 0.69 0.32 0.61 0.28 -0.62 -0.64 0.49 0.41 -0.03 -0.44 -0.73 -1.55
1.19 0.69 0.42 0.39 0.37 -1.62 -1.62 -0.25 0.23 -0.22 -0.2 -0.98 -1.13 -0.91 0.02 0.99 0.32 -0.97 0.3 -1.89
0.78 -0.22 0.56 0.36 -0.2 -2.8 -1.21 -0.13 0.34 0.17 0.31 -0.68 -0.39 -0.48 0.28 0.93 0.79 -0.88 -0.49 -1.08
0.9 0.6 1.25 0.9 -0.69 -0.77 -1.45 -0.43 0.22 -0.51 -0.44 -0.8 -1.71 -1.79 -0.74 1.27 0.33 -0.34 -0.1 -1.78
0.63 -0.36 0.13 0.55 -0.06 -1.76 -1.27 -0.46 0.24 0.04 0.64 -0.99 -1.1 -1.06 0.46 1.36 0.63 -0.15 -0.51 -1.27
0.43 -0.38 0.44 0.47 -0.29 -1.94 -1.99 -0.04 0.41 0.25 0.84 -0.55 -0.35 -0.59 0.74 0.69 0.43 -0.67 -0.35 -1.52
0.33 -0.39 0.39 0.34 -0.11 -1.14 -0.8 -0.08 0.31 0.24 0.6 -0.55 -0.33 -0.52 0.64 0.82 0.32 -0.53 -0.58 -1.15
-0.27 -0.11 -0.34 0.07 0.17 -0.13 -4.99 0.66 0.43 -0.0 0.07 0.55 -1.08 -0.63 0.23 0.77 0.49 0.79 -1.19 -1.73
0.35 -0.04 0.26 0.65 -0.02 -0.62 -1.39 0.24 0.93 0.51 -0.05 -0.11 -2.07 -1.92 0.08 0.8 0.0 -0.12 -0.22 -1.1
1.0 -0.64 0.23 1.0 0.08 -2.76 -1.06 0.13 0.52 -0.01 0.17 -0.84 -0.2 0.03 -0.03 0.63 -0.25 -0.05 -0.39 -1.69
-0.54 -1.7 -0.66 -0.37 -0.43 -0.09 -1.25 0.6 0.11 -0.09 0.56 -0.09 0.45 0.46 0.46 0.56 1.4 -1.14 -0.55 -2.31
0.24 -1.04 -0.28 0.36 -0.28 -0.77 -1.85 0.11 0.47 -0.01 1.03 -0.54 -0.66 -0.64 0.83 1.26 0.6 -0.53 -0.84 -2.82
0.14 -0.46 0.24 1.0 -0.82 -1.02 -2.85 0.09 0.43 0.15 0.96 -0.57 -0.63 -0.51 0.8 1.1 0.7 -0.89 -2.46 -3.74
-0.14 -0.86 -0.46 -0.45 -0.45 -2.24 -0.91 0.04 0.7 0.42 0.95 -0.45 -0.32 -0.1 1.0 1.0 0.62 -0.46 -0.89 -1.28
-0.01 0.45 0.35 -0.21 0.19 -0.14 -2.16 0.28 0.11 -0.06 0.25 -0.19 -1.29 -1.26 0.39 0.65 0.62 0.25 -0.29 -0.61
-0.12 -0.42 -0.53 0.17 0.12 -0.3 -2.27 0.36 0.24 -0.1 0.76 -0.1 -1.05 -1.14 0.79 0.91 0.63 -0.07 -0.33 -0.9
-0.14 -0.81 -0.52 -0.15 0.15 -0.93 -2.42 0.27 0.38 -0.05 0.45 -0.21 0.42 0.5 0.47 0.98 0.51 -0.25 -1.13 -0.79
-0.16 -1.43 -1.04 -0.01 0.06 -0.68 -2.34 -0.02 0.22 0.0 0.57 -0.41 0.67 0.79 0.58 0.94 0.6 -0.36 -1.36 -0.8
-0.33 -1.19 -0.69 -0.16 -0.19 -1.38 -1.57 0.16 0.28 -0.05 0.53 -0.04 -0.0 0.17 0.36 1.43 0.51 -0.02 -0.17 -0.88
0.76 0.24 0.42 0.51 0.18 -0.41 -1.66 0.05 0.51 0.18 -0.56 -0.83 -0.61 -0.86 -0.32 0.75 0.37 0.18 -0.45 -1.03
0.92 0.81 -0.01 0.91 0.26 -0.36 -3.46 0.17 0.65 0.23 0.11 -0.88 -0.38 -0.47 -0.1 0.62 -0.31 -0.51 -1.89 -2.44
1.03 0.57 -0.36 1.46 0.47 -0.12 -4.0 0.12 0.01 -0.23 -0.66 -1.18 0.45 0.26 -0.5 0.09 -0.44 -0.18 -1.46 -2.12
0.8 0.32 0.37 0.81 -0.12 -1.58 -1.27 -0.01 0.32 -0.03 0.46 -0.6 -0.73 -1.0 0.42 0.75 0.23 -0.47 -0.67 -1.34
0.35 -0.83 -0.17 0.74 -0.56 -2.43 -1.76 0.14 0.67 0.22 0.63 -0.56 -1.65 -1.7 0.54 1.09 1.3 -0.57 -0.47 -1.75
0.86 0.14 0.18 0.37 0.27 -0.06 -0.82 0.09 0.27 -0.21 0.52 -0.43 -2.89 -2.63 0.45 0.33 -0.22 0.04 0.41 -1.03
-0.03 -0.53 0.04 0.35 -0.28 -1.65 -1.7 0.32 0.21 -0.02 0.64 -0.27 0.23 0.21 0.34 0.73 1.03 -0.81 -0.9 -1.34
0.78 0.09 0.04 0.81 0.18 0.08 -1.51 0.21 -0.07 -0.23 0.15 -0.3 -1.19 -1.25 0.13 -0.32 -0.07 0.48 0.28 -0.53
0.2 -0.06 0.38 0.44 0.05 -0.75 -1.63 0.01 0.2 -0.09 0.01 -0.2 -0.17 -0.7 -0.04 1.14 0.35 -0.56 0.4 -1.49
0.39 -0.26 0.2 0.37 0.03 -1.63 -1.33 -0.23 0.3 0.2 0.88 -0.62 -1.48 -1.49 0.76 0.94 0.93 -0.42 -0.83 -1.28
0.17 0.87 0.87 0.75 -0.17 -0.36 -2.72 -0.14 0.44 0.04 0.08 -0.21 -2.24 -2.0 -0.16 0.51 0.7 -0.04 -0.33 -1.59
-0.25 0.61 -0.03 -0.04 -0.53 -0.05 -1.67 0.65 0.3 -0.1 0.67 -0.25 -0.96 -1.14 0.8 0.57 -0.04 -0.01 -0.02 -1.31
0.63 -0.68 -0.17 0.73 0.3 -0.44 -2.31 0.26 0.33 -0.1 0.66 -0.59 -0.58 -0.49 0.64 0.75 0.23 -0.59 -1.27 -0.75
0.37 -0.11 -0.14 -0.02 -0.59 -1.5 -1.63 0.11 0.73 0.54 1.0 -0.71 -0.99 -0.91 0.79 0.92 0.16 -0.86 -0.36 -0.65
0.29 -0.23 -0.12 -0.01 -0.09 -0.65 -1.29 0.21 0.27 0.07 0.58 -0.03 -1.42 -1.43 0.4 1.12 0.75 -0.43 0.19 -1.65
-0.04 0.55 0.31 0.33 0.47 -0.26 -1.17 0.04 0.3 0.28 0.41 -0.23 -2.33 -2.28 0.2 0.69 0.29 0.09 -0.09 -1.53

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.