Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.19 0.63 0.67 0.59 0.67 0.08 0.06 0.2 0.27 0.41 0.17 0.39 0.02 0.04 0.17 0.76 0.49 1.0 0.4 0.01
0.76 0.48 0.5 0.72 0.71 0.74 0.16 0.6 0.69 0.64 0.95 0.64 0.73 0.7 1.0 0.79 0.79 0.78 0.45 0.6
0.9 0.48 0.65 0.91 0.96 0.2 0.35 0.33 0.5 0.4 0.32 0.28 0.45 0.38 0.31 1.0 0.41 0.5 0.36 0.13
0.78 0.53 1.0 0.55 0.69 0.4 0.2 0.51 0.41 0.38 0.39 0.5 0.56 0.52 0.37 0.54 0.71 0.42 0.2 0.25
0.4 0.41 0.58 0.44 0.59 0.4 0.13 0.36 0.48 0.44 0.34 0.34 0.3 0.26 0.34 1.0 0.75 0.61 0.19 0.18
0.6 0.62 0.76 0.84 0.89 1.0 0.6 0.67 0.83 0.77 0.79 0.64 0.56 0.54 0.71 0.69 0.87 0.87 0.83 0.78
0.32 0.69 0.39 1.0 0.57 0.0 0.0 0.4 0.09 0.26 0.3 0.47 0.22 0.44 0.07 0.53 0.22 0.2 0.11 0.0
0.47 0.63 0.62 0.62 0.31 0.23 0.08 0.41 0.54 0.4 0.39 0.45 0.31 0.43 0.43 1.0 0.52 0.64 0.22 0.1
0.54 0.15 0.23 0.19 0.27 0.02 0.14 0.22 0.51 0.3 0.82 0.15 0.06 0.1 0.52 1.0 0.92 0.33 0.03 0.18
1.0 0.35 0.82 0.37 0.76 0.03 0.15 0.25 0.46 0.32 0.26 0.24 0.39 0.31 0.2 0.62 0.25 0.64 0.3 0.39
0.81 0.74 0.76 0.96 0.73 0.65 0.11 0.64 0.62 0.62 0.78 0.57 1.0 0.75 0.69 0.52 0.32 0.85 0.1 0.14
0.73 0.87 0.83 0.72 0.61 0.65 0.2 0.58 0.63 0.59 0.44 0.52 0.53 0.61 0.39 0.93 0.77 1.0 0.56 0.6
0.79 0.5 0.39 1.0 0.93 0.26 0.03 0.51 0.61 0.46 0.58 0.34 0.66 0.58 0.53 0.54 0.31 0.94 0.15 0.36
0.49 0.33 0.32 0.54 0.74 0.45 0.43 0.63 0.68 0.8 0.95 0.52 0.48 0.45 1.0 0.82 0.99 0.76 0.57 0.98
0.39 0.76 0.93 0.5 0.78 0.74 0.51 0.76 0.7 0.76 0.62 1.0 0.56 0.33 0.47 0.79 0.74 0.85 0.34 0.34
0.78 0.72 0.94 0.54 0.84 0.62 0.17 0.56 0.67 0.66 0.49 0.84 0.5 0.51 0.43 0.76 1.0 0.57 0.24 0.34
0.67 0.84 1.0 0.79 0.72 0.54 0.16 0.48 0.53 0.55 0.24 0.47 0.58 0.54 0.3 0.51 0.66 0.47 0.3 0.29
0.93 0.0 0.27 0.01 0.44 0.11 0.02 0.14 0.42 0.36 0.0 0.05 0.16 0.27 0.0 1.0 0.8 0.37 0.01 0.06
0.51 1.0 0.73 0.47 0.79 0.31 0.02 0.3 0.34 0.34 0.45 0.3 0.38 0.35 0.58 0.25 0.31 0.08 0.0 0.0
0.37 0.54 0.52 0.0 1.0 0.12 0.04 0.22 0.38 0.5 0.53 0.51 0.06 0.2 0.65 0.54 0.63 0.73 0.16 0.0
0.73 0.57 0.67 0.64 0.32 0.33 0.77 0.44 0.79 0.79 0.41 0.3 0.5 0.47 0.32 1.0 0.73 0.71 0.1 0.05
0.86 0.74 1.0 0.24 0.39 0.91 0.08 0.52 0.39 0.23 0.63 0.41 0.21 0.16 0.36 0.76 0.39 0.37 0.28 0.04
0.23 0.22 0.16 0.16 0.58 0.18 0.15 0.18 0.12 0.34 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 1.0 0.38 0.7 0.05 0.05
0.68 1.0 0.71 0.28 0.72 0.23 0.21 0.28 0.35 0.32 0.21 0.21 0.03 0.0 0.2 0.78 0.56 0.67 0.46 0.26
1.0 0.61 0.45 0.35 0.92 0.3 0.04 0.63 0.68 0.79 0.28 0.08 0.11 0.08 0.23 0.26 0.29 0.66 0.02 0.11
0.62 0.64 0.43 0.39 0.48 0.22 0.16 0.37 0.23 0.18 0.4 0.64 0.19 0.19 0.27 1.0 0.49 0.57 0.08 0.17
0.41 0.0 0.0 0.4 0.05 0.04 0.0 0.5 0.6 1.0 0.15 0.35 0.0 0.0 0.3 0.06 0.12 0.51 0.0 0.04
0.81 0.59 0.94 0.89 0.8 0.23 0.06 0.6 0.51 0.37 0.43 0.28 0.38 0.34 0.45 0.58 0.29 1.0 0.15 0.24
0.86 0.72 0.97 1.0 0.98 0.36 0.44 0.55 0.68 0.57 0.89 0.45 0.54 0.63 0.85 0.73 0.56 0.43 0.21 0.24
0.65 0.83 1.0 0.63 0.7 0.74 0.39 0.53 0.53 0.54 0.57 0.49 0.42 0.37 0.64 0.44 0.56 0.57 0.48 0.7
0.97 0.45 0.62 0.42 0.63 0.49 0.84 0.63 0.65 0.44 0.49 0.25 0.71 0.7 0.44 1.0 0.66 0.37 0.16 0.51
0.66 0.91 0.95 0.64 0.68 0.36 0.4 0.6 0.88 0.87 0.62 0.63 0.5 0.48 0.62 0.92 1.0 0.87 0.05 0.55
0.51 1.0 0.42 0.25 0.44 0.1 0.5 0.21 0.31 0.34 0.17 0.37 0.25 0.4 0.18 0.94 0.32 0.21 0.01 0.12
0.75 0.82 1.0 0.25 0.35 0.02 0.04 0.21 0.31 0.23 0.24 0.09 0.18 0.18 0.17 0.19 0.12 0.31 0.01 0.17
0.4 0.48 0.42 0.32 0.4 0.94 0.4 0.4 0.58 0.5 0.33 0.31 0.22 0.41 0.36 1.0 0.56 0.44 0.18 0.14
1.0 0.52 0.65 0.69 0.47 0.38 0.34 0.47 0.47 0.43 0.51 0.42 0.55 0.54 0.54 0.51 0.48 0.39 0.24 0.27
0.61 0.21 1.0 0.16 0.53 0.26 0.26 0.3 0.49 0.39 0.19 0.25 0.64 0.68 0.28 0.55 0.64 0.51 0.3 0.44
0.44 0.28 0.37 0.14 0.04 0.25 0.62 0.53 0.62 0.41 0.62 0.51 0.49 0.42 0.51 1.0 0.58 0.59 0.12 0.28
0.55 0.36 0.33 0.26 0.3 0.46 0.48 0.55 0.45 0.39 0.75 0.43 0.56 0.47 0.75 1.0 0.53 0.99 0.32 0.3
0.4 1.0 0.29 0.98 0.39 0.03 0.01 0.28 0.4 0.29 0.09 0.06 0.12 0.12 0.1 0.32 0.16 0.63 0.0 0.0
0.27 0.87 0.28 1.0 0.58 0.01 0.01 0.37 0.38 0.24 0.13 0.09 0.23 0.32 0.14 0.33 0.14 0.54 0.01 0.0
0.28 0.25 0.39 0.28 0.23 0.06 0.1 0.19 0.56 0.38 0.11 0.18 0.28 0.34 0.13 1.0 0.71 0.18 0.24 0.1
1.0 0.54 0.96 0.43 0.44 0.26 0.21 0.35 0.44 0.42 0.17 0.38 0.33 0.32 0.2 0.44 0.4 0.39 0.15 0.25
0.57 1.0 1.0 0.76 0.54 0.15 0.0 0.4 0.61 0.52 0.51 0.35 0.46 0.34 0.49 0.58 0.38 0.72 0.02 0.01
0.59 0.78 1.0 0.85 0.78 0.35 0.33 0.55 0.61 0.57 0.54 0.42 0.65 0.65 0.62 0.51 0.44 0.64 0.37 0.26
1.0 0.65 0.61 0.18 0.42 0.42 0.93 0.2 0.18 0.16 0.12 0.25 0.4 0.29 0.12 0.23 0.32 0.2 0.0 0.06
0.29 0.25 0.69 0.22 0.56 0.09 0.05 0.15 0.22 0.46 0.2 0.37 0.05 0.04 0.36 1.0 0.34 0.62 0.15 0.04
0.8 0.84 0.57 0.85 0.87 0.45 0.09 0.8 0.71 0.63 0.69 0.59 0.91 0.73 0.75 0.7 0.57 1.0 0.17 0.48
0.43 1.0 0.4 0.36 0.44 0.14 0.37 0.24 0.22 0.26 0.14 0.3 0.36 0.49 0.18 0.63 0.27 0.28 0.02 0.11
0.41 1.0 0.38 0.32 0.39 0.14 0.3 0.21 0.19 0.21 0.11 0.29 0.2 0.25 0.15 0.52 0.21 0.21 0.04 0.07
0.97 0.1 0.27 0.84 0.65 0.71 0.22 0.53 0.82 0.61 0.41 0.56 0.52 0.46 0.3 1.0 0.97 0.58 0.15 0.37
0.63 0.34 0.53 0.61 0.68 0.74 0.46 0.69 0.73 0.72 1.0 0.76 0.23 0.26 0.98 0.77 0.95 0.81 0.46 0.65
0.7 0.7 1.0 0.84 0.75 0.54 0.11 0.59 0.37 0.31 0.36 0.49 0.32 0.34 0.38 0.55 0.63 0.78 0.36 0.39
0.87 0.61 1.0 0.55 0.49 0.33 0.18 0.42 0.48 0.44 0.35 0.37 0.42 0.39 0.39 0.38 0.45 0.55 0.1 0.32
1.0 0.68 0.82 0.69 0.7 0.3 0.29 0.51 0.66 0.56 0.45 0.46 0.49 0.45 0.48 0.79 0.74 0.49 0.21 0.46
1.0 0.56 0.73 0.43 0.63 0.19 0.11 0.39 0.43 0.39 0.36 0.34 0.46 0.42 0.32 0.33 0.33 0.51 0.27 0.61
0.52 0.57 0.46 0.43 0.45 0.55 0.27 0.5 0.66 0.56 0.67 0.39 0.29 0.28 0.65 1.0 0.65 0.49 0.33 0.2
0.7 0.6 1.0 0.41 0.33 0.33 0.18 0.3 0.38 0.48 0.16 0.29 0.25 0.18 0.35 0.49 0.44 0.33 0.19 0.24
0.35 0.52 0.49 0.3 0.93 1.0 0.49 0.82 0.65 0.45 0.91 0.86 0.52 0.38 0.69 0.77 0.59 0.86 0.79 0.57
0.19 1.0 0.27 0.47 0.47 0.02 0.01 0.19 0.05 0.1 0.03 0.19 0.07 0.07 0.01 0.07 0.07 0.21 0.0 0.01
0.77 0.91 0.61 0.97 0.79 0.28 0.09 0.53 0.49 0.41 0.33 0.38 0.38 0.52 0.32 0.58 0.91 1.0 0.14 0.57
0.57 1.0 0.4 0.32 0.26 0.03 0.69 0.14 0.18 0.15 0.08 0.16 0.02 0.02 0.12 0.28 0.37 0.19 0.16 0.19
0.61 0.2 0.4 0.63 0.64 0.27 0.27 0.41 0.88 0.6 0.39 0.57 0.24 0.29 0.39 1.0 0.94 0.47 0.26 0.2
0.61 0.2 0.4 0.63 0.64 0.27 0.27 0.41 0.88 0.6 0.39 0.57 0.24 0.29 0.39 1.0 0.94 0.47 0.26 0.2
0.59 0.57 0.65 0.49 0.7 0.32 0.26 0.38 0.77 0.63 0.19 0.58 0.32 0.45 0.2 1.0 1.0 0.32 0.24 0.28
1.0 0.28 0.39 0.15 0.59 0.41 0.23 0.27 0.48 0.34 0.25 0.2 0.18 0.12 0.35 0.47 0.38 0.43 0.13 0.27
1.0 0.59 0.85 0.67 0.55 0.39 0.28 0.45 0.31 0.3 0.38 0.36 0.52 0.54 0.42 0.56 0.4 0.39 0.27 0.28
0.97 0.74 1.0 0.54 0.7 0.48 0.38 0.58 0.51 0.49 0.56 0.54 0.58 0.53 0.58 0.4 0.45 0.49 0.49 0.68
0.94 0.71 1.0 0.59 0.76 0.38 0.39 0.44 0.86 0.76 0.43 0.28 0.33 0.25 0.51 0.63 0.51 0.71 0.31 0.56
0.19 0.49 0.22 0.0 0.2 0.14 0.05 0.28 0.8 0.61 0.3 0.18 0.07 0.12 0.28 1.0 0.45 0.21 0.0 0.01
0.46 0.66 0.89 0.46 0.6 0.41 0.14 0.44 0.59 0.73 0.59 0.49 0.29 0.29 0.62 0.91 1.0 0.72 0.18 0.4
0.41 0.34 0.78 0.62 0.46 0.25 0.24 0.53 0.63 0.58 0.54 0.61 0.44 0.47 0.56 1.0 0.76 0.54 0.24 0.2
0.45 0.6 0.94 0.89 0.57 0.52 0.23 0.58 0.82 0.97 0.93 0.62 0.21 0.15 1.0 0.99 0.85 0.74 0.48 0.5
0.39 0.51 0.33 0.45 0.35 0.13 0.16 0.32 0.38 0.27 0.36 0.22 0.3 0.3 0.36 1.0 0.51 0.38 0.34 0.16
0.43 0.31 0.32 0.56 0.3 0.14 0.92 0.45 0.49 0.48 0.63 0.45 0.23 0.26 0.53 1.0 0.96 0.57 0.17 0.13
0.88 0.71 0.65 0.31 0.65 0.71 0.2 0.64 0.83 0.67 0.46 0.66 0.06 0.07 0.54 1.0 0.64 0.55 0.28 0.24
0.49 0.37 0.32 0.32 0.25 0.34 0.2 0.51 0.96 0.72 0.86 0.53 0.45 0.46 0.66 1.0 0.57 0.29 0.06 0.14
0.39 0.16 0.23 0.42 0.18 0.06 0.0 0.66 0.45 0.74 0.05 1.0 0.07 0.07 0.06 0.22 0.45 0.93 0.0 0.01
0.67 0.58 0.83 0.84 0.96 0.21 0.0 0.7 0.62 0.66 0.2 0.15 0.24 0.16 0.19 0.24 0.42 1.0 0.02 0.0
0.58 1.0 0.65 0.4 0.28 0.2 0.27 0.33 0.6 0.54 0.21 0.26 0.47 0.41 0.23 0.56 0.25 0.32 0.09 0.29
0.31 0.31 0.43 0.58 0.4 0.13 0.82 0.41 0.41 0.43 0.57 0.37 0.21 0.26 0.52 1.0 0.94 0.68 0.21 0.14
1.0 0.35 0.46 0.7 0.53 0.02 0.02 0.23 0.23 0.24 0.24 0.19 0.15 0.14 0.24 0.24 0.34 0.32 0.03 0.11
1.0 0.51 0.48 0.34 0.54 0.04 0.02 0.23 0.17 0.19 0.21 0.15 0.07 0.06 0.24 0.2 0.24 0.33 0.04 0.12
0.42 0.81 1.0 0.21 0.26 0.16 0.25 0.25 0.44 0.35 0.15 0.29 0.02 0.01 0.18 0.67 0.48 0.45 0.38 0.12
0.16 0.4 0.65 0.29 0.23 0.0 0.05 0.19 0.27 0.46 0.38 0.37 0.0 0.1 0.45 1.0 0.76 0.62 0.14 0.13
1.0 0.38 0.28 0.33 0.28 0.23 0.29 0.39 0.37 0.27 0.87 0.26 0.41 0.3 0.68 0.75 0.6 0.49 0.27 0.21
0.52 0.69 0.75 0.59 0.88 0.6 0.61 0.7 0.83 0.72 1.0 0.87 0.11 0.12 0.84 0.86 0.82 0.69 0.52 0.96
0.58 0.43 0.34 0.29 0.33 0.5 0.24 0.47 0.87 0.68 0.51 0.4 0.54 0.5 0.43 1.0 0.5 0.45 0.13 0.15
0.23 0.39 0.34 0.14 0.19 0.05 0.46 0.44 0.91 0.64 0.6 0.35 0.24 0.32 0.45 1.0 0.6 0.07 0.12 0.06
0.87 0.77 0.61 0.64 0.68 0.71 0.1 0.64 0.64 0.49 0.77 0.38 0.54 0.44 0.75 0.77 0.5 1.0 0.61 0.5
0.95 0.64 0.54 0.7 0.88 0.57 0.12 0.66 0.69 0.57 0.8 0.37 0.79 0.85 0.74 1.0 0.61 0.89 0.45 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)