1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_249 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 9.9 7.57 7.11 0.65 2.13 0.0 1.0 0.32 0.0 0.0 0.19 5.76 3.07 0.0 0.0 0.0 3.98 4.78 0.08
3.72 2.6 2.88 3.07 3.22 2.83 1.89 2.85 2.5 2.36 3.44 1.32 3.06 2.25 3.21 1.28 1.5 2.17 5.53 2.13
4.34 3.31 1.6 3.0 3.32 1.07 1.17 2.8 2.11 2.31 4.28 1.32 3.98 2.55 4.09 1.67 1.38 2.21 6.58 0.95
3.82 5.23 4.57 2.95 2.96 1.66 2.29 1.12 1.49 0.83 1.46 1.8 0.0 0.0 1.26 1.98 2.29 2.2 15.59 1.0
1.82 8.02 3.33 6.97 3.81 2.32 0.58 2.49 1.38 0.96 1.16 2.46 0.73 1.19 1.69 1.34 2.61 4.09 30.86 3.12
7.8 13.49 8.46 11.3 7.85 10.15 8.99 8.97 5.17 5.52 5.29 2.72 12.52 8.5 4.92 2.99 1.56 7.71 18.94 4.42
24.3 29.89 29.6 18.48 34.19 15.64 23.81 20.69 19.48 16.37 21.15 20.03 10.76 9.8 22.84 21.29 19.13 25.23 27.58 20.74
3.43 3.15 3.19 9.44 0.0 0.0 1.62 2.82 2.39 1.23 0.88 0.52 5.19 6.76 1.32 1.16 0.21 1.92 8.35 1.3
2.14 4.64 6.39 0.74 3.37 5.03 0.76 2.37 1.25 1.2 2.01 0.58 2.78 1.49 2.06 0.9 0.83 2.09 5.05 2.81
0.04 0.03 0.0 0.24 0.04 0.02 0.01 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.14 0.06 0.01 0.01 0.02 0.01 0.17 0.0
1.34 2.2 0.69 1.89 1.18 0.99 1.38 1.22 0.85 0.89 0.67 0.4 1.01 0.77 0.97 0.47 0.37 1.18 3.58 0.57
0.04 0.09 0.01 0.23 0.02 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.01 0.05 0.06 0.0 0.12 0.0
0.02 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.04 0.0 0.02 0.39 0.0
0.09 0.05 0.02 0.25 0.02 0.0 0.07 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.16 0.0
31.23 42.69 14.75 27.42 37.95 37.0 21.01 38.49 33.62 32.65 23.88 10.65 69.0 48.23 27.0 14.82 9.96 34.3 78.66 30.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
2.3 6.08 2.38 1.19 2.81 2.22 2.64 1.65 1.42 1.4 1.71 0.78 1.05 0.76 2.11 0.87 0.5 2.45 2.91 1.78
0.09 0.02 0.04 0.5 0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.02 0.01 0.0 0.14 0.06 0.0 0.01 0.02 0.07 0.33 0.01
2.55 0.42 1.22 2.29 2.6 2.47 1.09 1.43 0.94 1.08 1.27 1.09 2.98 2.1 1.43 1.84 2.13 2.89 3.33 1.03
117.19 234.36 177.99 135.93 160.1 232.06 173.31 138.85 160.69 145.94 117.31 93.63 148.23 140.31 138.06 113.76 85.72 128.55 191.92 116.87
0.64 0.0 0.0 4.07 0.59 0.0 0.04 0.71 0.01 0.0 0.14 0.0 2.22 1.72 0.16 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0
3.47 2.6 3.11 4.06 5.02 3.18 2.16 3.18 2.58 2.53 2.72 2.07 3.09 2.75 2.32 1.35 1.8 3.39 5.99 2.85
0.08 0.04 0.01 0.15 0.02 0.03 0.01 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.03 0.01 0.03 0.02 0.03 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0
0.24 0.0 0.03 0.64 0.22 0.0 0.04 0.11 0.07 0.05 0.0 0.02 0.23 0.17 0.01 0.1 0.07 0.17 0.68 0.0
0.02 0.11 0.0 0.43 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0
0.06 0.0 0.0 0.38 0.12 0.0 0.06 0.17 0.18 0.14 0.11 0.03 0.54 0.26 0.3 0.14 0.0 0.0 0.2 0.0
0.09 0.06 0.04 0.57 0.04 0.02 0.02 0.07 0.02 0.03 0.02 0.0 0.19 0.1 0.0 0.12 0.04 0.03 0.59 0.03
0.0 0.0 0.0 0.26 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0
1.0 1.43 1.09 0.74 1.44 1.33 0.67 1.02 0.64 0.54 0.9 0.17 1.04 0.59 0.58 0.29 0.09 0.96 2.03 0.49
26.23 12.84 26.31 27.0 22.45 5.65 8.77 15.14 11.0 10.22 15.21 8.83 13.37 10.84 13.63 9.97 8.59 16.38 29.75 18.03
0.0 0.0 0.01 0.12 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.07 0.0
0.01 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
14.68 13.73 10.66 17.81 25.24 16.97 14.9 16.25 10.54 9.27 13.77 8.12 22.85 18.65 14.33 7.16 6.89 22.24 34.75 9.02
12.44 13.85 11.87 12.7 8.55 13.96 7.6 10.82 6.27 6.01 9.85 7.71 8.08 5.95 8.67 5.08 5.72 10.13 29.3 6.85
0.04 0.04 0.03 0.06 0.05 0.05 0.01 0.03 0.02 0.03 0.02 0.0 0.01 0.04 0.02 0.02 0.01 0.02 0.1 0.0
0.03 0.01 0.02 0.2 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0
20.37 25.55 20.95 18.24 19.53 16.13 15.59 16.22 11.64 10.63 12.18 9.31 18.03 17.79 13.22 9.05 9.51 16.41 21.59 13.45
0.15 0.29 0.08 0.43 0.07 0.0 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.03 0.0 0.03 0.8 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.2 0.07 0.07 0.28 0.14 0.02 0.1 0.11 0.12 0.2 0.06 0.02 0.18 0.08 0.13 0.04 0.02 0.13 0.35 0.03
6.46 10.42 4.67 3.79 0.87 8.3 5.83 2.94 0.75 1.6 0.0 0.37 1.28 0.0 0.98 0.0 0.81 3.24 15.26 0.04
0.5 0.0 0.0 7.22 0.33 1.81 0.01 0.45 0.21 0.32 0.11 0.5 3.05 3.93 0.27 0.0 0.92 0.23 4.23 0.44
0.17 0.0 0.0 0.65 0.05 0.0 0.01 0.07 0.03 0.04 0.0 0.01 0.15 0.16 0.0 0.12 0.13 0.03 0.3 0.0
0.05 0.0 0.0 0.15 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.08 0.07 0.03 0.0 0.0 0.02 0.17 0.03 0.04 0.26 0.0
0.02 0.0 0.03 0.23 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.0
21.59 14.56 17.64 22.17 21.36 17.92 15.51 18.28 9.54 8.5 13.93 10.21 16.16 15.09 14.14 7.4 6.56 21.77 35.08 13.7
15.98 30.57 19.67 16.7 18.31 24.24 21.76 14.59 14.95 13.94 13.15 9.88 14.49 12.26 13.48 12.44 8.28 14.28 21.18 14.35
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.09 0.05 0.02 0.01 0.09 0.07 0.0 0.03 0.0 0.02 0.13 0.04
1.96 0.56 0.4 3.44 0.67 1.31 1.7 0.73 0.66 0.43 0.78 0.42 0.03 0.1 0.5 0.17 0.4 0.94 23.15 0.6
7.58 7.13 7.96 10.16 9.51 7.7 9.03 6.03 4.45 4.35 4.41 5.27 6.72 6.28 4.02 3.02 3.91 5.12 8.96 5.71
0.51 0.13 0.22 0.5 0.48 0.07 0.08 0.15 0.13 0.18 0.08 0.1 0.04 0.06 0.17 0.19 0.15 0.07 0.54 0.08
0.03 0.02 0.02 0.33 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.03 0.06 0.02 0.16 0.01
32.15 51.29 18.44 11.76 27.72 9.95 28.67 25.72 37.41 36.06 26.12 6.93 55.46 38.01 25.66 18.18 9.44 20.78 83.02 31.43
0.52 0.11 0.1 1.04 0.29 0.04 0.08 0.17 0.1 0.11 0.22 0.04 0.09 0.09 0.22 0.2 0.1 0.14 1.14 0.14
0.01 0.0 0.0 0.26 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 0.01
16.38 16.84 12.23 20.65 15.23 16.49 11.96 14.07 9.21 7.15 15.0 8.12 17.95 12.68 15.63 8.6 6.0 17.39 29.72 9.31
4.83 2.16 2.31 3.48 4.31 3.6 1.95 3.73 2.72 2.71 3.57 1.98 2.72 2.2 3.95 4.42 3.5 7.81 13.6 4.1
2.91 1.17 1.91 2.71 2.41 3.26 1.12 2.01 1.96 1.88 1.13 1.12 3.0 2.79 2.17 3.33 2.48 6.72 9.39 2.4
0.01 0.0 0.0 0.16 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.01
22.43 29.85 24.34 9.81 23.98 19.24 16.51 15.8 11.99 10.47 15.21 4.29 2.25 2.37 16.69 7.48 5.23 17.58 26.46 16.96
0.05 0.0 0.22 0.22 0.0 0.0 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0
0.11 0.0 0.0 0.12 0.04 0.09 0.06 0.07 0.04 0.16 0.04 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.27 0.0
0.02 0.0 0.0 0.15 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.1 0.02
0.25 0.08 0.12 0.84 0.11 0.02 0.11 0.12 0.03 0.04 0.06 0.01 0.43 0.28 0.03 0.15 0.04 0.05 0.6 0.02
0.15 0.19 0.33 0.37 0.22 0.1 0.01 0.09 0.03 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.21 0.0 0.26 0.89 0.0
20.74 17.65 19.25 21.23 28.29 24.0 18.81 21.35 18.29 18.62 19.08 18.87 22.57 21.03 20.35 14.75 16.01 27.54 25.97 19.0
0.02 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.11 0.01 0.04
0.03 0.0 0.02 0.44 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.16 0.0
0.01 0.01 0.0 0.08 0.03 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 0.05 0.0 0.01 0.01 0.04 0.02 0.01 0.0 0.11 0.0
14.7 12.02 8.4 6.24 8.71 8.0 7.66 7.08 7.34 6.21 8.35 4.03 8.47 7.04 8.51 5.0 4.04 8.69 15.41 8.73
0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.05 0.01
0.37 0.05 0.01 0.37 0.04 0.0 0.02 0.05 0.01 0.02 0.04 0.01 0.01 0.05 0.03 0.1 0.03 0.0 0.46 0.05
0.74 2.7 1.68 1.29 0.55 1.05 0.37 0.47 0.45 0.44 0.78 0.61 0.42 0.47 0.1 0.04 0.18 0.69 2.2 0.91
8.89 15.67 7.91 6.48 6.32 5.11 3.83 4.58 2.67 3.49 3.49 1.9 4.94 2.52 4.06 1.5 1.35 5.53 20.83 2.2
0.0 3.19 0.03 1.24 0.48 0.17 0.0 0.11 0.18 0.09 0.01 0.2 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 4.85 0.06
0.0 1.02 0.02 10.77 2.18 0.0 0.0 0.43 0.53 0.27 0.0 0.0 0.11 0.0 0.12 0.17 0.53 0.39 10.03 0.0
0.07 0.11 0.0 0.16 0.1 0.0 0.03 0.09 0.02 0.14 0.05 0.0 0.02 0.02 0.17 0.08 0.07 0.13 0.51 0.09
0.0 0.0 0.12 0.2 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.35 0.0
0.01 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.18 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)