Heatmap: Cluster_117 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00357	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.39	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.17
Gb_01415	1.0	0.0	0.29	0.0	0.23	0.0	0.26	0.41	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.73	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0
Gb_02004	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02294	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02404	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02955	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.07	0.09	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.69	0.42	0.46	1.0	0.0	0.22
Gb_02992	0.0	0.0	0.14	1.0	0.14	0.0	0.0	0.58	0.05	0.09	0.0	0.04	0.18	0.0	0.13	0.41	0.92	0.13	0.05	0.0
Gb_05067	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05879	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.31	1.0	0.38	0.0	0.0	0.0
Gb_06719	0.83	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.48	0.51	0.44	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.02	0.18
Gb_06825	0.24	0.35	0.31	0.51	0.0	0.2	0.19	0.45	0.0	0.0	0.91	0.0	0.2	0.06	1.0	0.0	0.0	0.14	0.05	0.0
Gb_10476	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11368	0.05	0.02	0.02	0.25	0.09	0.59	0.1	0.39	0.06	0.03	0.43	0.06	0.08	0.06	0.39	1.0	0.16	0.02	0.2	0.07
Gb_11782	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12163	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0
Gb_12213	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	1.0	0.0	0.4	0.0	0.54	0.0
Gb_13737	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14450	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15695	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15912	0.15	0.0	0.0	1.0	0.0	0.35	0.0	0.15	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0
Gb_17069	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17614	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17869	0.22	0.18	0.22	0.55	0.1	0.04	0.11	0.31	1.0	0.56	0.55	0.2	0.13	0.17	0.48	0.66	0.15	0.13	0.22	0.23
Gb_18369	0.0	0.0	0.09	0.0	0.38	0.0	0.01	1.0	0.25	0.08	0.37	0.11	0.58	0.04	0.1	0.0	0.0	0.15	0.0	0.36
Gb_18882	1.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.28	0.0	0.46	0.29	0.12	0.0
Gb_19368	0.1	0.02	0.02	0.19	0.12	0.26	0.24	0.15	0.05	0.05	1.0	0.06	0.09	0.11	0.54	0.52	0.18	0.07	0.17	0.02
Gb_19634	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20663	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20828	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.12	0.17	0.29	0.0	0.0	0.19	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0
Gb_22405	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23132	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23162	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23548	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_23674	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23853	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24371	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.1	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.1	0.0	0.0	0.09	0.0
Gb_26132	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26483	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27250	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_29133	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.07	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0
Gb_29496	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29776	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_30209	1.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.12	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49
Gb_31637	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32553	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32958	0.01	0.0	0.09	0.71	0.14	0.07	0.01	0.27	0.03	0.0	1.0	0.05	0.05	0.08	0.6	0.18	0.08	0.04	0.23	0.0
Gb_33141	0.0	0.0	0.1	0.15	0.2	1.0	0.18	0.44	0.07	0.19	0.02	0.12	0.11	0.18	0.02	0.03	0.17	0.47	0.01	0.38
Gb_33220	0.04	0.0	0.0	0.0	0.08	0.09	0.0	1.0	0.1	0.23	0.22	0.11	0.1	0.06	0.0	0.0	0.27	0.0	0.01	0.0
Gb_34317	0.38	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.23	0.0
Gb_34813	0.01	0.0	0.33	0.72	0.44	0.73	1.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.52
Gb_34936	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0
Gb_35531	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.17	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35805	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36097	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_36299	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.21	0.27	0.29	0.0	0.0	0.43	1.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0
Gb_37275	0.0	0.0	0.0	1.0	0.5	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.18
Gb_37978	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38702	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39067	0.0	0.0	0.0	1.0	0.39	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18
Gb_39906	0.21	0.0	0.11	1.0	0.2	0.0	0.13	0.19	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.09	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40267	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.18	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0	1.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.26
Gb_40310	0.03	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.05	0.02	0.06	0.06	0.03	0.02	0.03	0.11	0.0	0.0	0.33	0.03
Gb_40595	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40717	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_41521	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41823	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)