1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.11 0.08 0.0 0.99 0.06 0.0 0.13 0.15 0.08 0.07 0.34 0.01 0.3 0.14 0.24 0.07 0.11 0.03 0.55 0.15
0.02 0.08 0.04 0.56 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0
0.01 0.0 0.01 0.17 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.21 0.01
0.1 0.12 0.03 0.5 0.03 0.08 0.0 0.11 0.12 0.16 0.18 0.0 0.13 0.07 0.12 0.27 0.06 0.0 0.64 0.09
0.01 0.0 0.03 0.29 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.08 0.02
0.1 0.58 0.04 0.71 0.11 0.05 0.18 0.16 0.12 0.15 0.05 0.03 0.0 0.01 0.3 0.38 0.0 0.08 0.6 0.08
0.06 0.02 0.02 0.36 0.01 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.0 0.01 0.53 0.01
0.02 0.03 0.04 0.09 0.0 0.03 0.02 0.04 0.02 0.03 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.37 0.01
0.09 0.13 0.15 2.08 0.03 0.04 0.04 0.17 0.07 0.05 0.06 0.04 0.06 0.04 0.09 0.18 0.15 0.13 1.43 0.11
0.0 0.0 0.04 0.52 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0
1.59 1.04 0.14 2.78 0.0 0.76 0.06 0.79 0.69 0.12 0.34 0.1 0.74 0.52 0.0 1.24 0.57 0.0 1.44 1.3
0.05 0.0 0.09 0.97 0.3 0.0 0.16 0.25 0.11 0.23 0.3 0.05 0.35 0.36 0.09 0.72 0.19 0.03 0.55 0.14
0.01 0.1 0.01 0.13 0.03 0.0 0.0 0.06 0.09 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.06 0.01 0.01 0.36 0.0
0.07 0.17 0.03 0.76 0.04 0.03 0.04 0.08 0.02 0.03 0.08 0.02 0.03 0.03 0.11 0.06 0.05 0.01 0.84 0.04
0.07 0.09 0.06 0.23 0.02 0.02 0.05 0.07 0.04 0.02 0.03 0.0 0.02 0.03 0.11 0.14 0.0 0.04 0.25 0.04
0.14 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.07 0.12 0.04 0.0 0.1 0.01 0.05 0.04 0.19 0.2 0.0 0.06 0.25 0.0
0.03 0.15 0.06 0.29 0.01 0.03 0.02 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.02 0.0 0.0 0.12 0.04 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.01 0.0 0.22 0.04 0.0 0.27 0.0
0.04 0.0 0.0 0.19 0.09 0.0 0.12 0.04 0.04 0.05 0.06 0.0 0.01 0.0 0.05 0.07 0.04 0.02 0.48 0.04
0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.02 0.01 0.09 0.01
0.01 0.0 0.02 0.22 0.0 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.29 0.0
0.04 0.01 0.02 0.1 0.01 0.02 0.04 0.07 0.03 0.01 0.07 0.0 0.01 0.0 0.08 0.04 0.02 0.0 0.3 0.03
0.11 0.04 0.02 0.09 0.07 0.02 0.04 0.08 0.03 0.01 0.0 0.0 0.08 0.03 0.11 0.13 0.01 0.04 0.3 0.01
0.06 0.15 0.12 0.88 0.02 0.0 0.06 0.1 0.08 0.05 0.01 0.04 0.02 0.03 0.06 0.1 0.0 0.02 0.41 0.01
0.12 0.2 0.0 0.19 0.03 0.0 0.02 0.04 0.04 0.07 0.08 0.0 0.05 0.04 0.0 0.05 0.0 0.17 0.15 0.11
0.02 0.03 0.0 0.13 0.05 0.0 0.03 0.04 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.05 0.04 0.03 0.03 0.13 0.03
0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04 0.25 0.0 0.0 0.85 0.07
0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.08 0.22 0.1 0.66 0.08 0.03 0.04 0.06 0.06 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.08 0.0 0.07 0.54 0.0
0.03 0.09 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.06 0.04 0.0 0.1 0.02
0.07 0.07 0.01 0.09 0.06 0.04 0.03 0.05 0.05 0.03 0.12 0.01 0.03 0.03 0.08 0.18 0.05 0.03 0.18 0.01
0.04 0.0 0.0 0.55 0.04 0.15 0.13 0.12 0.08 0.12 0.15 0.0 0.09 0.16 0.19 0.5 0.13 0.0 0.62 0.07
0.15 0.0 0.05 0.17 0.05 0.0 0.06 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.11 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.02 0.01 0.22 0.01
0.32 0.41 0.22 1.1 0.31 0.17 0.13 0.24 0.2 0.16 0.11 0.03 0.04 0.03 0.3 0.21 0.21 0.0 0.42 0.07
0.0 0.0 0.02 0.18 0.0 0.04 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.01
0.04 0.02 0.02 0.26 0.02 0.04 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.02 0.27 0.02
0.02 0.0 0.0 0.25 0.0 0.03 0.02 0.07 0.03 0.07 0.11 0.02 0.14 0.05 0.13 0.05 0.08 0.03 0.46 0.08
0.19 0.0 0.05 0.53 0.18 0.06 0.12 0.19 0.1 0.04 0.23 0.03 0.12 0.11 0.18 0.15 0.07 0.0 0.71 0.24
0.11 0.04 0.01 0.56 0.08 0.08 0.02 0.13 0.04 0.13 0.08 0.02 0.23 0.09 0.1 0.16 0.05 0.04 0.42 0.07
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.04 0.0 0.17 0.0
0.1 0.07 0.05 0.44 0.14 0.02 0.02 0.12 0.12 0.08 0.04 0.05 0.03 0.02 0.11 0.11 0.07 0.07 0.96 0.17
0.11 0.02 0.05 0.26 0.02 0.01 0.02 0.05 0.03 0.07 0.0 0.0 0.02 0.02 0.07 0.13 0.01 0.02 0.12 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.08 0.0
0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.18 0.0 0.09 0.0 0.28 0.0
0.97 0.47 0.87 9.0 1.35 1.38 0.38 1.56 0.63 1.05 0.41 0.31 0.79 0.54 1.18 1.03 0.25 0.46 13.51 0.32
0.06 0.17 0.02 0.61 0.03 0.0 0.11 0.08 0.06 0.03 0.04 0.0 0.05 0.02 0.05 0.09 0.07 0.03 0.75 0.06
0.0 0.05 0.05 0.23 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.04 0.0 0.15 0.0
0.14 0.08 0.18 0.12 0.17 0.08 0.07 0.14 0.04 0.03 0.2 0.01 0.12 0.08 0.24 0.45 0.16 0.05 0.6 0.07
0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0
0.14 0.0 0.01 1.13 0.13 0.04 0.03 0.18 0.04 0.04 0.19 0.02 0.04 0.05 0.17 0.2 0.19 0.04 1.88 0.08
0.04 0.04 0.02 0.39 0.13 0.0 0.01 0.06 0.04 0.01 0.04 0.01 0.03 0.02 0.02 0.07 0.06 0.05 0.46 0.04
0.05 0.0 0.15 0.38 0.03 0.0 0.0 0.13 0.03 0.04 0.17 0.0 0.06 0.0 0.12 0.24 0.05 0.16 0.78 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0
0.02 0.03 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.04 0.28 0.03
0.05 0.0 0.01 0.58 0.1 0.01 0.03 0.09 0.02 0.04 0.04 0.01 0.09 0.08 0.02 0.18 0.07 0.01 0.4 0.04
0.07 0.01 0.03 0.22 0.04 0.01 0.05 0.05 0.03 0.02 0.02 0.01 0.06 0.03 0.06 0.12 0.07 0.03 0.22 0.03
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.15 0.02
1.29 0.0 0.19 5.8 0.0 0.54 0.44 0.79 0.41 0.51 0.85 0.04 0.31 0.22 0.63 1.0 0.2 0.13 2.66 0.35
0.01 0.01 0.01 0.18 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.1 0.05 0.0 0.13 0.02
0.08 0.08 0.05 0.4 0.05 0.02 0.04 0.08 0.03 0.01 0.05 0.01 0.02 0.01 0.03 0.08 0.01 0.02 0.23 0.02
0.08 0.03 0.03 0.33 0.02 0.02 0.03 0.06 0.03 0.03 0.04 0.0 0.02 0.04 0.04 0.09 0.03 0.01 0.11 0.02
0.05 0.09 0.04 0.14 0.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.11 0.04 0.02 0.12 0.0
0.06 0.06 0.03 0.5 0.03 0.05 0.02 0.06 0.03 0.03 0.02 0.01 0.03 0.03 0.04 0.06 0.03 0.04 0.52 0.05
0.03 0.0 0.0 0.54 0.07 0.0 0.04 0.21 0.12 0.0 0.27 0.0 0.0 0.01 0.14 0.1 0.07 0.0 0.58 0.08
0.05 0.0 0.0 0.12 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.05 0.0 0.02 0.01 0.05 0.04 0.02 0.0 0.11 0.01
0.47 0.2 0.06 0.96 0.23 0.0 0.09 0.17 0.11 0.03 0.29 0.01 0.09 0.09 0.32 0.5 0.39 0.0 0.72 0.0
0.02 0.0 0.01 0.14 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.01 0.03 0.08 0.02 0.01 0.17 0.0
0.02 0.0 0.0 0.73 0.0 0.1 0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.05 0.03 0.02 0.06 0.0 0.0 0.13 0.04
0.14 0.07 0.05 0.31 0.28 0.04 0.07 0.18 0.05 0.04 0.11 0.05 0.08 0.09 0.1 0.1 0.08 0.11 0.73 0.02
0.12 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.02 0.15 0.06 0.05 0.17 0.0 0.16 0.03 0.06 0.15 0.1 0.07 0.45 0.03
0.04 0.04 0.02 0.23 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.08 0.02
0.06 0.03 0.05 0.62 0.03 0.04 0.04 0.08 0.06 0.03 0.02 0.01 0.07 0.06 0.03 0.06 0.03 0.04 0.44 0.11
0.06 0.0 0.01 0.08 0.03 0.02 0.02 0.04 0.01 0.04 0.02 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 0.07 0.18 0.03
0.12 0.04 0.0 0.3 0.02 0.02 0.03 0.06 0.01 0.02 0.07 0.0 0.03 0.01 0.06 0.1 0.06 0.02 0.25 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.25 0.0
0.29 0.2 0.02 0.59 0.08 0.05 0.09 0.12 0.05 0.06 0.15 0.01 0.03 0.02 0.14 0.21 0.12 0.07 0.55 0.02
0.02 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0
0.26 0.4 0.16 1.4 0.03 0.0 0.18 0.5 0.41 0.22 0.63 0.01 0.39 0.2 0.61 1.12 0.29 0.15 1.0 0.23
0.04 0.04 0.06 0.24 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.23 0.01
0.93 0.38 0.67 3.58 0.5 0.27 0.35 0.67 0.55 0.49 0.29 0.08 0.89 0.83 0.69 3.59 0.37 0.0 4.19 0.35
0.0 0.0 0.01 0.1 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.08 0.0
0.01 0.05 0.03 0.46 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.16 0.0 0.05 0.0
1.15 0.4 0.32 2.12 0.58 0.04 0.39 0.66 0.41 0.4 1.04 0.18 0.33 0.13 1.46 1.72 0.33 0.32 2.3 0.53
0.11 0.0 0.06 0.23 0.0 0.03 0.04 0.11 0.03 0.03 0.07 0.0 0.1 0.05 0.03 0.07 0.05 0.09 0.5 0.05
0.1 0.03 0.05 0.19 0.06 0.01 0.04 0.1 0.05 0.05 0.08 0.01 0.1 0.07 0.15 0.26 0.07 0.04 0.29 0.03
0.06 0.02 0.01 0.08 0.04 0.0 0.04 0.05 0.04 0.03 0.06 0.01 0.04 0.02 0.06 0.07 0.03 0.02 0.31 0.03
0.18 0.04 0.13 0.77 0.07 0.0 0.04 0.13 0.06 0.13 0.14 0.0 0.07 0.1 0.06 0.43 0.12 0.05 0.59 0.06
0.25 0.21 0.15 1.46 0.22 0.13 0.08 0.2 0.09 0.04 0.11 0.07 0.1 0.07 0.2 0.19 0.06 0.02 0.95 0.02
0.16 0.0 0.0 0.18 0.14 0.0 0.05 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.05 0.23 0.09 0.1 0.25 0.12
0.07 0.17 0.08 0.44 0.13 0.11 0.12 0.11 0.09 0.11 0.49 0.0 0.18 0.02 0.12 0.18 0.11 0.0 0.52 0.03
0.02 0.0 0.0 0.17 0.02 0.0 0.0 0.05 0.08 0.03 0.18 0.0 0.0 0.01 0.07 0.07 0.0 0.2 0.39 0.03
0.06 0.0 0.01 0.2 0.05 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.04 0.01 0.08 0.0 0.03 0.11 0.02
0.03 0.0 0.09 0.17 0.0 0.0 0.02 0.06 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.02 0.02 0.02 0.09 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.01 0.01 0.09 0.0
0.11 0.0 0.04 0.54 0.07 0.0 0.02 0.08 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.21 0.0 0.0 0.4 0.08
0.12 0.03 0.15 0.11 0.11 0.13 0.06 0.13 0.07 0.05 0.08 0.03 0.1 0.03 0.02 0.08 0.09 0.11 0.28 0.09

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)